MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_010263	CTT	2	6	1238379	1238384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933893
24003	NC_010263	TCC	2	6	1238441	1238446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165933893
24004	NC_010263	AAAC	2	8	1238460	1238467	75 %	0 %	0 %	25 %	165933893
24005	NC_010263	AGC	2	6	1238500	1238505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933893
24006	NC_010263	CAT	2	6	1238511	1238516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933893
24007	NC_010263	CAA	2	6	1238523	1238528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933893
24008	NC_010263	CTG	2	6	1238616	1238621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933893
24009	NC_010263	TCA	3	9	1238625	1238633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933893
24010	NC_010263	GCTT	2	8	1238659	1238666	0 %	50 %	25 %	25 %	165933893
24011	NC_010263	CTA	2	6	1238685	1238690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933893
24012	NC_010263	T	8	8	1238771	1238778	0 %	100 %	0 %	0 %	165933893
24013	NC_010263	TA	3	6	1238791	1238796	50 %	50 %	0 %	0 %	165933893
24014	NC_010263	ATA	2	6	1238817	1238822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933893
24015	NC_010263	AAT	2	6	1238830	1238835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933893
24016	NC_010263	T	7	7	1238842	1238848	0 %	100 %	0 %	0 %	165933893
24017	NC_010263	TAATA	2	10	1238899	1238908	60 %	40 %	0 %	0 %	165933893
24018	NC_010263	AAT	2	6	1238920	1238925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933893
24019	NC_010263	TTC	2	6	1238968	1238973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933893
24020	NC_010263	T	6	6	1239028	1239033	0 %	100 %	0 %	0 %	165933893
24021	NC_010263	TTA	2	6	1239060	1239065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933893
24022	NC_010263	A	7	7	1239193	1239199	100 %	0 %	0 %	0 %	165933894
24023	NC_010263	T	6	6	1239202	1239207	0 %	100 %	0 %	0 %	165933894
24024	NC_010263	ATT	2	6	1239214	1239219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933894
24025	NC_010263	GAT	2	6	1239256	1239261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933894
24026	NC_010263	AAG	2	6	1239329	1239334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933894
24027	NC_010263	ATT	2	6	1239398	1239403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933894
24028	NC_010263	TCC	2	6	1239405	1239410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165933894
24029	NC_010263	TATGAT	2	12	1239454	1239465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	165933894
24030	NC_010263	T	6	6	1239510	1239515	0 %	100 %	0 %	0 %	165933894
24031	NC_010263	AGA	2	6	1239519	1239524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933894
24032	NC_010263	CTAT	2	8	1239593	1239600	25 %	50 %	0 %	25 %	165933894
24033	NC_010263	TAA	2	6	1239636	1239641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933894
24034	NC_010263	CAA	2	6	1239649	1239654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933894
24035	NC_010263	ATA	3	9	1239680	1239688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933894
24036	NC_010263	GAT	2	6	1239736	1239741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933894
24037	NC_010263	TAAAA	2	10	1239747	1239756	80 %	20 %	0 %	0 %	165933894
24038	NC_010263	A	6	6	1239753	1239758	100 %	0 %	0 %	0 %	165933894
24039	NC_010263	TCC	2	6	1239774	1239779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165933894
24040	NC_010263	A	8	8	1239806	1239813	100 %	0 %	0 %	0 %	165933894
24041	NC_010263	TCA	2	6	1240065	1240070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933895
24042	NC_010263	AT	3	6	1240076	1240081	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
24043	NC_010263	ACT	2	6	1240224	1240229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933895
24044	NC_010263	ATT	2	6	1240239	1240244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933895
24045	NC_010263	TAA	2	6	1240328	1240333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933895
24046	NC_010263	CCG	2	6	1240411	1240416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933895
24047	NC_010263	ATT	2	6	1240452	1240457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933895
24048	NC_010263	CT	3	6	1240473	1240478	0 %	50 %	0 %	50 %	165933895
24049	NC_010263	CTT	2	6	1240497	1240502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933895
24050	NC_010263	GAA	2	6	1240512	1240517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933895
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24052	NC_010263	ATA	2	6	1240530	1240535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933895
24053	NC_010263	ACG	2	6	1240548	1240553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933895
24054	NC_010263	TAT	2	6	1240577	1240582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933895
24055	NC_010263	AT	3	6	1240646	1240651	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
24056	NC_010263	AGC	2	6	1240751	1240756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933895
24057	NC_010263	TAAT	2	8	1240798	1240805	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
24058	NC_010263	AT	3	6	1240853	1240858	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
24059	NC_010263	AG	3	6	1240866	1240871	50 %	0 %	50 %	0 %	165933895
24060	NC_010263	TAA	2	6	1240891	1240896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933895
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24062	NC_010263	TAA	2	6	1240967	1240972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933895
24063	NC_010263	TA	3	6	1241003	1241008	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
24064	NC_010263	AT	3	6	1241082	1241087	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
24065	NC_010263	GTTA	2	8	1241144	1241151	25 %	50 %	25 %	0 %	165933895
24066	NC_010263	TA	3	6	1241159	1241164	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
24067	NC_010263	TAA	2	6	1241201	1241206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933895
24068	NC_010263	ATCA	2	8	1241218	1241225	50 %	25 %	0 %	25 %	165933895
24069	NC_010263	A	9	9	1241240	1241248	100 %	0 %	0 %	0 %	165933895
24070	NC_010263	TA	3	6	1241278	1241283	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
24071	NC_010263	GATA	2	8	1241294	1241301	50 %	25 %	25 %	0 %	165933895
24072	NC_010263	TA	3	6	1241300	1241305	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
24073	NC_010263	TAA	2	6	1241345	1241350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933895
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24077	NC_010263	CAAT	2	8	1241632	1241639	50 %	25 %	0 %	25 %	165933896
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24084	NC_010263	TTAA	2	8	1241806	1241813	50 %	50 %	0 %	0 %	165933896
24085	NC_010263	TAA	2	6	1241823	1241828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933896
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24087	NC_010263	TGA	2	6	1241844	1241849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933896
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24092	NC_010263	TAT	2	6	1242161	1242166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933898
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24102	NC_010263	GGC	2	6	1242959	1242964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933900
24103	NC_010263	TCT	2	6	1243041	1243046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933900
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24105	NC_010263	TAA	2	6	1243150	1243155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933900
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24108	NC_010263	CAAA	2	8	1243292	1243299	75 %	0 %	0 %	25 %	165933900
24109	NC_010263	ATA	2	6	1243345	1243350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933900
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24111	NC_010263	A	6	6	1243394	1243399	100 %	0 %	0 %	0 %	165933900
24112	NC_010263	TTGA	2	8	1243412	1243419	25 %	50 %	25 %	0 %	165933900
24113	NC_010263	TAA	2	6	1243430	1243435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933900
24114	NC_010263	T	6	6	1243484	1243489	0 %	100 %	0 %	0 %	165933900
24115	NC_010263	ATATA	2	10	1243494	1243503	60 %	40 %	0 %	0 %	165933900
24116	NC_010263	TA	3	6	1243562	1243567	50 %	50 %	0 %	0 %	165933901
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24118	NC_010263	AAT	3	9	1243625	1243633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933901
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24237	NC_010263	TA	3	6	1249255	1249260	50 %	50 %	0 %	0 %	165933911
24238	NC_010263	ATA	2	6	1249301	1249306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933911
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24240	NC_010263	TAC	2	6	1249386	1249391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933911
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24475	NC_010263	GATA	2	8	1262192	1262199	50 %	25 %	25 %	0 %	165933929
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