MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_010263	TAT	2	6	77112	77117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932643
1503	NC_010263	TTTAT	2	10	77131	77140	20 %	80 %	0 %	0 %	165932643
1504	NC_010263	GTAATA	2	12	77194	77205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	165932643
1505	NC_010263	AT	3	6	77212	77217	50 %	50 %	0 %	0 %	165932643
1506	NC_010263	TAAA	2	8	77231	77238	75 %	25 %	0 %	0 %	165932643
1507	NC_010263	TAAA	2	8	77255	77262	75 %	25 %	0 %	0 %	165932643
1508	NC_010263	A	7	7	77551	77557	100 %	0 %	0 %	0 %	165932644
1509	NC_010263	TAT	3	9	77590	77598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932644
1510	NC_010263	GTC	2	6	77622	77627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932644
1511	NC_010263	TAT	2	6	77713	77718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932644
1512	NC_010263	TTA	2	6	77748	77753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932644
1513	NC_010263	CCT	2	6	77897	77902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932644
1514	NC_010263	CAA	2	6	77904	77909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932644
1515	NC_010263	GGT	2	6	77984	77989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932644
1516	NC_010263	T	6	6	78047	78052	0 %	100 %	0 %	0 %	165932644
1517	NC_010263	GTA	2	6	78074	78079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932644
1518	NC_010263	T	7	7	78084	78090	0 %	100 %	0 %	0 %	165932644
1519	NC_010263	ATA	2	6	78093	78098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932644
1520	NC_010263	AAG	2	6	78117	78122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932644
1521	NC_010263	ATT	2	6	78202	78207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932644
1522	NC_010263	TAA	2	6	78223	78228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932644
1523	NC_010263	TGTT	2	8	78241	78248	0 %	75 %	25 %	0 %	165932644
1524	NC_010263	TGTT	2	8	78258	78265	0 %	75 %	25 %	0 %	165932644
1525	NC_010263	TA	3	6	78266	78271	50 %	50 %	0 %	0 %	165932644
1526	NC_010263	GTC	2	6	78426	78431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932644
1527	NC_010263	GCTTA	2	10	78463	78472	20 %	40 %	20 %	20 %	165932644
1528	NC_010263	ATT	2	6	78511	78516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932644
1529	NC_010263	TTCT	2	8	78528	78535	0 %	75 %	0 %	25 %	165932644
1530	NC_010263	T	6	6	78545	78550	0 %	100 %	0 %	0 %	165932644
1531	NC_010263	AGC	2	6	78580	78585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932644
1532	NC_010263	GGAT	2	8	78680	78687	25 %	25 %	50 %	0 %	165932644
1533	NC_010263	AGG	3	9	78745	78753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932644
1534	NC_010263	ATT	2	6	78754	78759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932644
1535	NC_010263	A	6	6	78785	78790	100 %	0 %	0 %	0 %	165932644
1536	NC_010263	TAA	2	6	78797	78802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932644
1537	NC_010263	ACAAT	2	10	78827	78836	60 %	20 %	0 %	20 %	165932645
1538	NC_010263	TACT	2	8	78895	78902	25 %	50 %	0 %	25 %	165932645
1539	NC_010263	ATG	2	6	78975	78980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932645
1540	NC_010263	T	6	6	78998	79003	0 %	100 %	0 %	0 %	165932645
1541	NC_010263	AT	3	6	79018	79023	50 %	50 %	0 %	0 %	165932645
1542	NC_010263	GTA	2	6	79037	79042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932645
1543	NC_010263	GGA	2	6	79060	79065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932645
1544	NC_010263	CTG	2	6	79107	79112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932645
1545	NC_010263	TAA	2	6	79222	79227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932645
1546	NC_010263	AAT	2	6	79242	79247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932645
1547	NC_010263	AGC	2	6	79300	79305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932646
1548	NC_010263	GCT	2	6	79307	79312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932646
1549	NC_010263	CT	3	6	79335	79340	0 %	50 %	0 %	50 %	165932646
1550	NC_010263	GGT	2	6	79394	79399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932646
1551	NC_010263	GTTAT	2	10	79452	79461	20 %	60 %	20 %	0 %	165932646
1552	NC_010263	CAG	2	6	79509	79514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932646
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1554	NC_010263	AT	3	6	79596	79601	50 %	50 %	0 %	0 %	165932646
1555	NC_010263	TCT	2	6	79634	79639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932646
1556	NC_010263	A	6	6	79686	79691	100 %	0 %	0 %	0 %	165932646
1557	NC_010263	A	9	9	79740	79748	100 %	0 %	0 %	0 %	165932646
1558	NC_010263	GTAGA	2	10	79758	79767	40 %	20 %	40 %	0 %	165932646
1559	NC_010263	AAC	2	6	79975	79980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932646
1560	NC_010263	GAT	2	6	80144	80149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932646
1561	NC_010263	CTT	2	6	80178	80183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932646
1562	NC_010263	A	8	8	80314	80321	100 %	0 %	0 %	0 %	165932646
1563	NC_010263	TAC	2	6	80356	80361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932646
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1566	NC_010263	A	7	7	80624	80630	100 %	0 %	0 %	0 %	165932646
1567	NC_010263	A	7	7	80638	80644	100 %	0 %	0 %	0 %	165932646
1568	NC_010263	A	6	6	80658	80663	100 %	0 %	0 %	0 %	165932646
1569	NC_010263	ATT	2	6	80671	80676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932646
1570	NC_010263	ACT	2	6	80693	80698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932646
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1572	NC_010263	ACA	2	6	80890	80895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932646
1573	NC_010263	ATTT	2	8	80907	80914	25 %	75 %	0 %	0 %	165932646
1574	NC_010263	CTA	3	9	81012	81020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932646
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1581	NC_010263	ATCA	2	8	81170	81177	50 %	25 %	0 %	25 %	165932647
1582	NC_010263	ATA	2	6	81190	81195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932647
1583	NC_010263	AT	3	6	81220	81225	50 %	50 %	0 %	0 %	165932647
1584	NC_010263	AT	3	6	81248	81253	50 %	50 %	0 %	0 %	165932647
1585	NC_010263	ATA	2	6	81256	81261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932647
1586	NC_010263	TAT	2	6	81313	81318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932647
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1589	NC_010263	AATC	2	8	81419	81426	50 %	25 %	0 %	25 %	165932647
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1593	NC_010263	A	6	6	81551	81556	100 %	0 %	0 %	0 %	165932647
1594	NC_010263	TAG	2	6	81571	81576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932647
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1598	NC_010263	ACT	2	6	81725	81730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932648
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1601	NC_010263	A	7	7	81764	81770	100 %	0 %	0 %	0 %	165932648
1602	NC_010263	TAG	2	6	81802	81807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932648
1603	NC_010263	CAA	2	6	81830	81835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932648
1604	NC_010263	TA	3	6	81847	81852	50 %	50 %	0 %	0 %	165932648
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1607	NC_010263	ATCT	2	8	81939	81946	25 %	50 %	0 %	25 %	165932648
1608	NC_010263	AT	3	6	81985	81990	50 %	50 %	0 %	0 %	165932648
1609	NC_010263	TA	3	6	82031	82036	50 %	50 %	0 %	0 %	165932648
1610	NC_010263	ATT	2	6	82037	82042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932648
1611	NC_010263	CCT	2	6	82049	82054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932648
1612	NC_010263	TTA	2	6	82064	82069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932648
1613	NC_010263	CAATG	2	10	82110	82119	40 %	20 %	20 %	20 %	165932648
1614	NC_010263	A	6	6	82178	82183	100 %	0 %	0 %	0 %	165932648
1615	NC_010263	TAT	2	6	82212	82217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932648
1616	NC_010263	AGA	2	6	82258	82263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932648
1617	NC_010263	TAT	2	6	82357	82362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932648
1618	NC_010263	AT	3	6	82361	82366	50 %	50 %	0 %	0 %	165932648
1619	NC_010263	AT	3	6	82393	82398	50 %	50 %	0 %	0 %	165932648
1620	NC_010263	GAA	2	6	82476	82481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932649
1621	NC_010263	ATA	2	6	82512	82517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932649
1622	NC_010263	A	6	6	82556	82561	100 %	0 %	0 %	0 %	165932649
1623	NC_010263	ATAAA	2	10	82573	82582	80 %	20 %	0 %	0 %	165932649
1624	NC_010263	AAT	2	6	82605	82610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932649
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1626	NC_010263	TAT	2	6	82625	82630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932649
1627	NC_010263	ATA	2	6	82636	82641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932649
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