MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010263	AAT	2	6	52946	52951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932618
1002	NC_010263	TAA	3	9	52957	52965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932618
1003	NC_010263	A	7	7	52964	52970	100 %	0 %	0 %	0 %	165932618
1004	NC_010263	A	6	6	53003	53008	100 %	0 %	0 %	0 %	165932618
1005	NC_010263	ATG	2	6	53037	53042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932618
1006	NC_010263	ATC	2	6	53102	53107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932618
1007	NC_010263	TGA	2	6	53113	53118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932618
1008	NC_010263	AAG	2	6	53125	53130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932618
1009	NC_010263	ACG	2	6	53149	53154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932618
1010	NC_010263	AAT	2	6	53162	53167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932618
1011	NC_010263	ATTG	2	8	53173	53180	25 %	50 %	25 %	0 %	165932618
1012	NC_010263	TTA	2	6	53259	53264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932618
1013	NC_010263	TAT	2	6	53272	53277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932618
1014	NC_010263	ATT	2	6	53381	53386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932618
1015	NC_010263	TTAT	2	8	53387	53394	25 %	75 %	0 %	0 %	165932618
1016	NC_010263	TGCT	2	8	53469	53476	0 %	50 %	25 %	25 %	165932618
1017	NC_010263	GTG	2	6	53478	53483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932618
1018	NC_010263	CTA	2	6	53502	53507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932618
1019	NC_010263	AT	3	6	53527	53532	50 %	50 %	0 %	0 %	165932618
1020	NC_010263	TCG	2	6	53554	53559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932618
1021	NC_010263	GTGA	2	8	53576	53583	25 %	25 %	50 %	0 %	165932618
1022	NC_010263	CAT	2	6	53642	53647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932618
1023	NC_010263	GCA	2	6	53678	53683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932618
1024	NC_010263	TTGAT	2	10	53736	53745	20 %	60 %	20 %	0 %	165932618
1025	NC_010263	TGA	2	6	53746	53751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932618
1026	NC_010263	AGA	2	6	53791	53796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932618
1027	NC_010263	TGA	2	6	53800	53805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932618
1028	NC_010263	CGT	2	6	53813	53818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932618
1029	NC_010263	ATT	2	6	53819	53824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932618
1030	NC_010263	GCA	2	6	53843	53848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932618
1031	NC_010263	A	6	6	53852	53857	100 %	0 %	0 %	0 %	165932618
1032	NC_010263	AGA	2	6	53992	53997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932618
1033	NC_010263	ATA	2	6	54123	54128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932618
1034	NC_010263	TAT	2	6	54172	54177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932618
1035	NC_010263	AAG	2	6	54310	54315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932618
1036	NC_010263	CCGC	2	8	54343	54350	0 %	0 %	25 %	75 %	165932618
1037	NC_010263	GTTC	2	8	54354	54361	0 %	50 %	25 %	25 %	165932618
1038	NC_010263	GACC	2	8	54372	54379	25 %	0 %	25 %	50 %	165932618
1039	NC_010263	TGA	2	6	54427	54432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932618
1040	NC_010263	AT	3	6	54466	54471	50 %	50 %	0 %	0 %	165932618
1041	NC_010263	CTC	2	6	54504	54509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932618
1042	NC_010263	CGT	2	6	54560	54565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932618
1043	NC_010263	ATT	2	6	54580	54585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932618
1044	NC_010263	TGA	2	6	54586	54591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932618
1045	NC_010263	TGC	2	6	54627	54632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932618
1046	NC_010263	TGA	2	6	54640	54645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932618
1047	NC_010263	TAAAG	2	10	54763	54772	60 %	20 %	20 %	0 %	165932618
1048	NC_010263	ATTAT	2	10	54836	54845	40 %	60 %	0 %	0 %	165932618
1049	NC_010263	TAA	2	6	54862	54867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932618
1050	NC_010263	ATT	2	6	54929	54934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932618
1051	NC_010263	TGA	2	6	54943	54948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932618
1052	NC_010263	ATT	2	6	54960	54965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932618
1053	NC_010263	AAT	2	6	55037	55042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932618
1054	NC_010263	AAAT	2	8	55092	55099	75 %	25 %	0 %	0 %	165932618
1055	NC_010263	TAA	2	6	55367	55372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932619
1056	NC_010263	TAA	2	6	55408	55413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932619
1057	NC_010263	TAA	2	6	55418	55423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932619
1058	NC_010263	ACT	2	6	55426	55431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932619
1059	NC_010263	ATA	2	6	55458	55463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932619
1060	NC_010263	TCT	2	6	55472	55477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932619
1061	NC_010263	TAAG	2	8	55492	55499	50 %	25 %	25 %	0 %	165932619
1062	NC_010263	GTT	3	9	55535	55543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932619
1063	NC_010263	T	6	6	55597	55602	0 %	100 %	0 %	0 %	165932619
1064	NC_010263	AT	3	6	55651	55656	50 %	50 %	0 %	0 %	165932619
1065	NC_010263	A	6	6	55713	55718	100 %	0 %	0 %	0 %	165932619
1066	NC_010263	AGT	2	6	55732	55737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932619
1067	NC_010263	TTA	2	6	55742	55747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932619
1068	NC_010263	A	6	6	55766	55771	100 %	0 %	0 %	0 %	165932619
1069	NC_010263	ATTGCT	2	12	55843	55854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	165932619
1070	NC_010263	GA	3	6	56022	56027	50 %	0 %	50 %	0 %	165932620
1071	NC_010263	TTA	2	6	56048	56053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932620
1072	NC_010263	GCA	2	6	56087	56092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932620
1073	NC_010263	ATAA	2	8	56119	56126	75 %	25 %	0 %	0 %	165932620
1074	NC_010263	T	6	6	56163	56168	0 %	100 %	0 %	0 %	165932620
1075	NC_010263	AGC	2	6	56182	56187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932620
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1078	NC_010263	ATT	2	6	56224	56229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932620
1079	NC_010263	TAC	2	6	56268	56273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932620
1080	NC_010263	TGC	2	6	56305	56310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932620
1081	NC_010263	ATT	2	6	56351	56356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932620
1082	NC_010263	ATTTAT	2	12	56430	56441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932620
1083	NC_010263	TCC	2	6	56479	56484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932620
1084	NC_010263	CAT	2	6	56538	56543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932620
1085	NC_010263	TAG	2	6	56547	56552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932620
1086	NC_010263	ATAAGG	2	12	56629	56640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	165932620
1087	NC_010263	T	7	7	56704	56710	0 %	100 %	0 %	0 %	165932620
1088	NC_010263	CCG	2	6	56756	56761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932620
1089	NC_010263	GCA	2	6	56783	56788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932620
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1091	NC_010263	T	6	6	56834	56839	0 %	100 %	0 %	0 %	165932620
1092	NC_010263	GCA	2	6	56873	56878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932620
1093	NC_010263	TAC	2	6	56887	56892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932620
1094	NC_010263	ATC	2	6	56980	56985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932620
1095	NC_010263	AAT	2	6	57265	57270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932621
1096	NC_010263	T	7	7	57270	57276	0 %	100 %	0 %	0 %	165932621
1097	NC_010263	TTTGC	2	10	57318	57327	0 %	60 %	20 %	20 %	165932621
1098	NC_010263	ACTT	2	8	57331	57338	25 %	50 %	0 %	25 %	165932621
1099	NC_010263	T	6	6	57382	57387	0 %	100 %	0 %	0 %	165932621
1100	NC_010263	GAT	2	6	57410	57415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932621
1101	NC_010263	TAA	2	6	57451	57456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932621
1102	NC_010263	GTA	2	6	57554	57559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932621
1103	NC_010263	ATG	2	6	57667	57672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932621
1104	NC_010263	AAT	2	6	57701	57706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932621
1105	NC_010263	CCA	2	6	57712	57717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165932621
1106	NC_010263	T	6	6	57745	57750	0 %	100 %	0 %	0 %	165932621
1107	NC_010263	TTGC	2	8	57789	57796	0 %	50 %	25 %	25 %	165932621
1108	NC_010263	ATAA	2	8	57821	57828	75 %	25 %	0 %	0 %	165932621
1109	NC_010263	ACC	2	6	57856	57861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165932621
1110	NC_010263	ATAA	2	8	57875	57882	75 %	25 %	0 %	0 %	165932621
1111	NC_010263	GCT	2	6	57905	57910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932621
1112	NC_010263	AAT	2	6	57918	57923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932621
1113	NC_010263	TAA	2	6	57940	57945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932621
1114	NC_010263	CATC	2	8	58012	58019	25 %	25 %	0 %	50 %	165932621
1115	NC_010263	TAT	2	6	58050	58055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932621
1116	NC_010263	TCTTGG	2	12	58079	58090	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	165932621
1117	NC_010263	ATG	2	6	58102	58107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932621
1118	NC_010263	ATTT	3	12	58188	58199	25 %	75 %	0 %	0 %	165932621
1119	NC_010263	ATT	2	6	58249	58254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932621
1120	NC_010263	ATA	2	6	58258	58263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932621
1121	NC_010263	ATA	2	6	58334	58339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932621
1122	NC_010263	TAT	2	6	58672	58677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932622
1123	NC_010263	A	7	7	58711	58717	100 %	0 %	0 %	0 %	165932622
1124	NC_010263	TAA	2	6	58814	58819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932622
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1126	NC_010263	TTG	2	6	59319	59324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932623
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