MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010263	T	7	7	245967	245973	0 %	100 %	0 %	0 %	165932813
5002	NC_010263	TGA	2	6	246056	246061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932813
5003	NC_010263	TCT	2	6	246062	246067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932813
5004	NC_010263	AAG	2	6	246090	246095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932813
5005	NC_010263	TCC	3	9	246140	246148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932813
5006	NC_010263	TTG	2	6	246158	246163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932813
5007	NC_010263	AGC	2	6	246197	246202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932813
5008	NC_010263	T	6	6	246205	246210	0 %	100 %	0 %	0 %	165932813
5009	NC_010263	CAT	2	6	246226	246231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932813
5010	NC_010263	ATTG	2	8	246239	246246	25 %	50 %	25 %	0 %	165932813
5011	NC_010263	AGT	2	6	246278	246283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932813
5012	NC_010263	T	6	6	246320	246325	0 %	100 %	0 %	0 %	165932813
5013	NC_010263	TAA	2	6	246369	246374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932813
5014	NC_010263	TAATT	2	10	246385	246394	40 %	60 %	0 %	0 %	165932813
5015	NC_010263	TACTTC	2	12	246509	246520	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	165932814
5016	NC_010263	CTA	2	6	246546	246551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932814
5017	NC_010263	T	6	6	246552	246557	0 %	100 %	0 %	0 %	165932814
5018	NC_010263	CAT	2	6	246558	246563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932814
5019	NC_010263	GCA	2	6	246578	246583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932814
5020	NC_010263	TCTTT	2	10	246654	246663	0 %	80 %	0 %	20 %	165932814
5021	NC_010263	CTT	2	6	246714	246719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932814
5022	NC_010263	TGA	2	6	246739	246744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932814
5023	NC_010263	T	6	6	246771	246776	0 %	100 %	0 %	0 %	165932814
5024	NC_010263	TAAAC	2	10	246785	246794	60 %	20 %	0 %	20 %	165932814
5025	NC_010263	GCA	2	6	246800	246805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932814
5026	NC_010263	T	6	6	246806	246811	0 %	100 %	0 %	0 %	165932814
5027	NC_010263	TCA	2	6	246842	246847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932814
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5029	NC_010263	GCTT	2	8	246937	246944	0 %	50 %	25 %	25 %	165932814
5030	NC_010263	AGG	2	6	247024	247029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932814
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5032	NC_010263	ATC	2	6	247123	247128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932814
5033	NC_010263	TAG	2	6	247155	247160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932814
5034	NC_010263	TAG	2	6	247164	247169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932814
5035	NC_010263	TAA	3	9	247240	247248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932814
5036	NC_010263	CTT	2	6	247260	247265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932814
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5039	NC_010263	T	7	7	247351	247357	0 %	100 %	0 %	0 %	165932814
5040	NC_010263	CTT	2	6	247362	247367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932814
5041	NC_010263	CTA	2	6	247395	247400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932814
5042	NC_010263	TAC	2	6	247402	247407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932814
5043	NC_010263	T	6	6	247470	247475	0 %	100 %	0 %	0 %	165932814
5044	NC_010263	ATC	2	6	247483	247488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932814
5045	NC_010263	CTA	2	6	247544	247549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932814
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5048	NC_010263	T	6	6	247678	247683	0 %	100 %	0 %	0 %	165932814
5049	NC_010263	TTG	2	6	247752	247757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932814
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5051	NC_010263	GCA	2	6	247877	247882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932814
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5053	NC_010263	CAT	2	6	247956	247961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932814
5054	NC_010263	AAT	2	6	248010	248015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932814
5055	NC_010263	CAG	2	6	248019	248024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932814
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5057	NC_010263	T	6	6	248034	248039	0 %	100 %	0 %	0 %	165932814
5058	NC_010263	AATG	2	8	248044	248051	50 %	25 %	25 %	0 %	165932814
5059	NC_010263	TAT	3	9	248076	248084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932814
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5061	NC_010263	AT	3	6	248200	248205	50 %	50 %	0 %	0 %	165932814
5062	NC_010263	GTTA	2	8	248218	248225	25 %	50 %	25 %	0 %	165932814
5063	NC_010263	TAT	2	6	248278	248283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932814
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5065	NC_010263	TATT	2	8	248511	248518	25 %	75 %	0 %	0 %	165932815
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5069	NC_010263	CGAT	2	8	248607	248614	25 %	25 %	25 %	25 %	165932815
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5102	NC_010263	TGA	2	6	249724	249729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932815
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5105	NC_010263	ATG	2	6	249840	249845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932815
5106	NC_010263	TA	3	6	249890	249895	50 %	50 %	0 %	0 %	165932815
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5111	NC_010263	CATGG	2	10	250888	250897	20 %	20 %	40 %	20 %	165932816
5112	NC_010263	TCT	2	6	251154	251159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932817
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5121	NC_010263	TAA	2	6	251642	251647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932818
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5123	NC_010263	TA	3	6	251687	251692	50 %	50 %	0 %	0 %	165932818
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5240	NC_010263	AAAG	2	8	256903	256910	75 %	0 %	25 %	0 %	165932824
5241	NC_010263	TAA	2	6	256951	256956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932824
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5244	NC_010263	TGT	2	6	257089	257094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932824
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5246	NC_010263	TA	3	6	257126	257131	50 %	50 %	0 %	0 %	165932824
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5495	NC_010263	TTC	2	6	273956	273961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932843
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5497	NC_010263	TCA	2	6	274083	274088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932843
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