MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010263	A	6	6	221058	221063	100 %	0 %	0 %	0 %	319717302
4502	NC_010263	TAA	2	6	221102	221107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319717302
4503	NC_010263	AATA	2	8	221130	221137	75 %	25 %	0 %	0 %	319717302
4504	NC_010263	ATT	2	6	221164	221169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319717302
4505	NC_010263	GGT	2	6	221183	221188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319717302
4506	NC_010263	A	6	6	221307	221312	100 %	0 %	0 %	0 %	319717302
4507	NC_010263	AAT	3	9	221314	221322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319717302
4508	NC_010263	AGA	2	6	221352	221357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319717302
4509	NC_010263	TCA	2	6	221377	221382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319717302
4510	NC_010263	TAT	2	6	221406	221411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319717302
4511	NC_010263	GGAG	2	8	221421	221428	25 %	0 %	75 %	0 %	319717302
4512	NC_010263	ATG	2	6	221438	221443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319717302
4513	NC_010263	CTT	2	6	221452	221457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319717302
4514	NC_010263	AT	3	6	221498	221503	50 %	50 %	0 %	0 %	319717302
4515	NC_010263	CAG	2	6	221516	221521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319717302
4516	NC_010263	TTA	2	6	221548	221553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319717302
4517	NC_010263	TA	3	6	221750	221755	50 %	50 %	0 %	0 %	165932787
4518	NC_010263	AAT	2	6	221768	221773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932787
4519	NC_010263	AAATTA	2	12	221802	221813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932787
4520	NC_010263	AAT	2	6	221814	221819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932787
4521	NC_010263	AGA	2	6	221849	221854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932787
4522	NC_010263	TAA	2	6	221855	221860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932787
4523	NC_010263	AGT	2	6	221867	221872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932787
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4525	NC_010263	TATT	2	8	221893	221900	25 %	75 %	0 %	0 %	165932787
4526	NC_010263	TTA	2	6	222157	222162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932788
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4529	NC_010263	TCC	2	6	222229	222234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932788
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4532	NC_010263	AGT	2	6	222322	222327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932788
4533	NC_010263	TAT	2	6	222364	222369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932788
4534	NC_010263	CTT	2	6	222372	222377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932788
4535	NC_010263	CTA	2	6	222417	222422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932788
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4537	NC_010263	TAAT	2	8	222441	222448	50 %	50 %	0 %	0 %	165932788
4538	NC_010263	TAA	2	6	222459	222464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932788
4539	NC_010263	AG	3	6	222507	222512	50 %	0 %	50 %	0 %	165932788
4540	NC_010263	ACC	2	6	222520	222525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165932788
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4542	NC_010263	CT	3	6	222652	222657	0 %	50 %	0 %	50 %	165932788
4543	NC_010263	TA	3	6	222676	222681	50 %	50 %	0 %	0 %	165932788
4544	NC_010263	CAT	2	6	222744	222749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932788
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4548	NC_010263	ATT	3	9	222871	222879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932788
4549	NC_010263	T	6	6	222878	222883	0 %	100 %	0 %	0 %	165932788
4550	NC_010263	TTG	2	6	222988	222993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932788
4551	NC_010263	TTG	2	6	223156	223161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932788
4552	NC_010263	ATC	2	6	223177	223182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932788
4553	NC_010263	T	6	6	223346	223351	0 %	100 %	0 %	0 %	165932788
4554	NC_010263	GAAT	2	8	223356	223363	50 %	25 %	25 %	0 %	165932788
4555	NC_010263	AT	3	6	223413	223418	50 %	50 %	0 %	0 %	165932788
4556	NC_010263	T	6	6	223437	223442	0 %	100 %	0 %	0 %	165932788
4557	NC_010263	CTT	2	6	223446	223451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932788
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4560	NC_010263	CAT	2	6	223518	223523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932788
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4562	NC_010263	T	6	6	223542	223547	0 %	100 %	0 %	0 %	165932788
4563	NC_010263	TAA	2	6	223563	223568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932788
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4593	NC_010263	TTGC	2	8	225000	225007	0 %	50 %	25 %	25 %	165932788
4594	NC_010263	AT	3	6	225011	225016	50 %	50 %	0 %	0 %	165932788
4595	NC_010263	A	6	6	225100	225105	100 %	0 %	0 %	0 %	165932788
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4598	NC_010263	T	7	7	225604	225610	0 %	100 %	0 %	0 %	165932789
4599	NC_010263	A	7	7	225613	225619	100 %	0 %	0 %	0 %	165932789
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4602	NC_010263	GACC	2	8	225724	225731	25 %	0 %	25 %	50 %	165932789
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4605	NC_010263	TAATAT	2	12	225841	225852	50 %	50 %	0 %	0 %	165932789
4606	NC_010263	CAT	2	6	225878	225883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932789
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4610	NC_010263	AGA	2	6	226247	226252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932790
4611	NC_010263	TA	4	8	226256	226263	50 %	50 %	0 %	0 %	165932790
4612	NC_010263	AAC	2	6	226293	226298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932790
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4617	NC_010263	TAT	2	6	226544	226549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932790
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4994	NC_010263	TC	3	6	245533	245538	0 %	50 %	0 %	50 %	165932813
4995	NC_010263	AGC	2	6	245546	245551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932813
4996	NC_010263	GTT	2	6	245743	245748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932813
4997	NC_010263	CCATG	2	10	245761	245770	20 %	20 %	20 %	40 %	165932813
4998	NC_010263	T	6	6	245787	245792	0 %	100 %	0 %	0 %	165932813
4999	NC_010263	TGC	2	6	245850	245855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932813
5000	NC_010263	AGT	2	6	245891	245896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932813

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