MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010168	TCA	2	6	90720	90725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838872
1502	NC_010168	GT	3	6	90882	90887	0 %	50 %	50 %	0 %	163838872
1503	NC_010168	GCCG	2	8	91010	91017	0 %	0 %	50 %	50 %	163838872
1504	NC_010168	GCT	2	6	91018	91023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838872
1505	NC_010168	GTGC	2	8	91169	91176	0 %	25 %	50 %	25 %	163838873
1506	NC_010168	CAG	2	6	91201	91206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838873
1507	NC_010168	ACC	2	6	91209	91214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838873
1508	NC_010168	TCT	2	6	91258	91263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838873
1509	NC_010168	GAG	2	6	91422	91427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838873
1510	NC_010168	TGC	2	6	91453	91458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838873
1511	NC_010168	CCA	2	6	91551	91556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838873
1512	NC_010168	GGGGT	2	10	91917	91926	0 %	20 %	80 %	0 %	163838873
1513	NC_010168	CAT	2	6	92014	92019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838873
1514	NC_010168	GTG	3	9	92124	92132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838873
1515	NC_010168	GTT	2	6	92228	92233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838873
1516	NC_010168	CGA	2	6	92278	92283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838873
1517	NC_010168	GCT	2	6	92339	92344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838873
1518	NC_010168	AGC	2	6	92378	92383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838873
1519	NC_010168	CGG	2	6	92460	92465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838873
1520	NC_010168	AGTTG	2	10	92775	92784	20 %	40 %	40 %	0 %	163838874
1521	NC_010168	GCC	2	6	92818	92823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838874
1522	NC_010168	TCC	2	6	92845	92850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838874
1523	NC_010168	TGT	2	6	92903	92908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838874
1524	NC_010168	TCT	2	6	92929	92934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838874
1525	NC_010168	CG	3	6	93060	93065	0 %	0 %	50 %	50 %	163838874
1526	NC_010168	CAC	2	6	93236	93241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838874
1527	NC_010168	AGG	2	6	93287	93292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838874
1528	NC_010168	GCC	2	6	93337	93342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838874
1529	NC_010168	GCC	2	6	93346	93351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838874
1530	NC_010168	GCC	2	6	93384	93389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838874
1531	NC_010168	GCT	2	6	93413	93418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838874
1532	NC_010168	TCGCGA	2	12	93445	93456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163838874
1533	NC_010168	AGCT	2	8	93497	93504	25 %	25 %	25 %	25 %	163838874
1534	NC_010168	CG	4	8	93518	93525	0 %	0 %	50 %	50 %	163838874
1535	NC_010168	GAA	2	6	93534	93539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838874
1536	NC_010168	GA	3	6	93827	93832	50 %	0 %	50 %	0 %	163838875
1537	NC_010168	GAC	2	6	93838	93843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838875
1538	NC_010168	TTG	2	6	93898	93903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838875
1539	NC_010168	GCG	2	6	94061	94066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838875
1540	NC_010168	ATC	2	6	94142	94147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838875
1541	NC_010168	GTGC	2	8	94170	94177	0 %	25 %	50 %	25 %	163838875
1542	NC_010168	GATA	2	8	94256	94263	50 %	25 %	25 %	0 %	163838875
1543	NC_010168	CAA	2	6	94300	94305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838875
1544	NC_010168	ACGC	2	8	94355	94362	25 %	0 %	25 %	50 %	163838876
1545	NC_010168	ATG	3	9	94372	94380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838876
1546	NC_010168	GAG	2	6	94429	94434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838876
1547	NC_010168	CTT	2	6	94473	94478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838876
1548	NC_010168	CCA	2	6	94486	94491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838876
1549	NC_010168	TCAG	2	8	94615	94622	25 %	25 %	25 %	25 %	163838876
1550	NC_010168	CTA	2	6	94630	94635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838876
1551	NC_010168	CTG	2	6	94659	94664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838876
1552	NC_010168	TCG	2	6	94675	94680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838876
1553	NC_010168	GGCT	2	8	94736	94743	0 %	25 %	50 %	25 %	163838876
1554	NC_010168	CATC	2	8	95050	95057	25 %	25 %	0 %	50 %	163838877
1555	NC_010168	GTG	2	6	95145	95150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838877
1556	NC_010168	ATA	2	6	95204	95209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163838877
1557	NC_010168	CGT	2	6	95311	95316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838878
1558	NC_010168	CAT	2	6	95371	95376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838878
1559	NC_010168	ATC	2	6	95441	95446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838878
1560	NC_010168	GTC	2	6	95447	95452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838878
1561	NC_010168	GC	3	6	95481	95486	0 %	0 %	50 %	50 %	163838878
1562	NC_010168	TTC	2	6	95546	95551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838878
1563	NC_010168	TCA	2	6	95559	95564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838878
1564	NC_010168	CAT	2	6	95603	95608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838878
1565	NC_010168	GCA	2	6	95752	95757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838879
1566	NC_010168	GTCG	2	8	95762	95769	0 %	25 %	50 %	25 %	163838879
1567	NC_010168	CTG	2	6	95784	95789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838879
1568	NC_010168	GCAG	2	8	95810	95817	25 %	0 %	50 %	25 %	163838879
1569	NC_010168	CAAA	2	8	95932	95939	75 %	0 %	0 %	25 %	163838879
1570	NC_010168	AAC	2	6	95983	95988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838879
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1572	NC_010168	CGG	2	6	96362	96367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838880
1573	NC_010168	TTC	2	6	96372	96377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838880
1574	NC_010168	ATC	2	6	96417	96422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838880
1575	NC_010168	GTG	2	6	96435	96440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838880
1576	NC_010168	GCT	2	6	96452	96457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838880
1577	NC_010168	CAA	2	6	96458	96463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838880
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1580	NC_010168	GTTT	2	8	96643	96650	0 %	75 %	25 %	0 %	163838880
1581	NC_010168	GAT	2	6	96721	96726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838880
1582	NC_010168	AGCG	2	8	97041	97048	25 %	0 %	50 %	25 %	163838882
1583	NC_010168	GCA	2	6	97128	97133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838882
1584	NC_010168	GC	3	6	97191	97196	0 %	0 %	50 %	50 %	163838882
1585	NC_010168	CCA	2	6	97221	97226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838882
1586	NC_010168	CTG	2	6	97229	97234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838882
1587	NC_010168	AAC	2	6	97262	97267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838882
1588	NC_010168	GGC	2	6	97298	97303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838882
1589	NC_010168	GGC	2	6	97580	97585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838882
1590	NC_010168	CTT	2	6	97591	97596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838882
1591	NC_010168	AAGC	2	8	97613	97620	50 %	0 %	25 %	25 %	163838882
1592	NC_010168	GAC	2	6	97655	97660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838882
1593	NC_010168	GCA	2	6	97716	97721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838882
1594	NC_010168	CAC	2	6	97745	97750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838882
1595	NC_010168	A	7	7	97785	97791	100 %	0 %	0 %	0 %	163838882
1596	NC_010168	CGA	2	6	97813	97818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838882
1597	NC_010168	GGC	2	6	97825	97830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838882
1598	NC_010168	TAC	2	6	97865	97870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838882
1599	NC_010168	ACG	2	6	97944	97949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838882
1600	NC_010168	CAG	2	6	97966	97971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838882
1601	NC_010168	TCC	2	6	98028	98033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838882
1602	NC_010168	ACG	2	6	98043	98048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838882
1603	NC_010168	GTA	2	6	98078	98083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838882
1604	NC_010168	CAC	2	6	98089	98094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838882
1605	NC_010168	TCT	2	6	98130	98135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838883
1606	NC_010168	CGGCT	2	10	98196	98205	0 %	20 %	40 %	40 %	163838883
1607	NC_010168	GCC	2	6	98332	98337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838883
1608	NC_010168	GAC	2	6	98483	98488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838883
1609	NC_010168	AGT	2	6	98565	98570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838883
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1612	NC_010168	CCG	2	6	98704	98709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838884
1613	NC_010168	TGGC	2	8	98715	98722	0 %	25 %	50 %	25 %	163838884
1614	NC_010168	GCC	2	6	98733	98738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838884
1615	NC_010168	GCG	2	6	98795	98800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838884
1616	NC_010168	ATC	2	6	98814	98819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838884
1617	NC_010168	GCTT	2	8	98827	98834	0 %	50 %	25 %	25 %	163838884
1618	NC_010168	GC	3	6	98857	98862	0 %	0 %	50 %	50 %	163838884
1619	NC_010168	TTGC	2	8	98980	98987	0 %	50 %	25 %	25 %	163838884
1620	NC_010168	GCG	2	6	99027	99032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838884
1621	NC_010168	GCC	2	6	99108	99113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838885
1622	NC_010168	AAC	2	6	99150	99155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838885
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1867	NC_010168	CCG	2	6	114663	114668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838901
1868	NC_010168	GAT	2	6	114706	114711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838901
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1986	NC_010168	CAG	2	6	121856	121861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838907
1987	NC_010168	GC	3	6	121895	121900	0 %	0 %	50 %	50 %	163838907
1988	NC_010168	ATG	2	6	121918	121923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838907
1989	NC_010168	T	7	7	121926	121932	0 %	100 %	0 %	0 %	163838907
1990	NC_010168	TGC	2	6	122183	122188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838908
1991	NC_010168	CTGTT	2	10	122201	122210	0 %	60 %	20 %	20 %	163838908
1992	NC_010168	AGCC	2	8	122308	122315	25 %	0 %	25 %	50 %	163838908
1993	NC_010168	GTTCAT	2	12	122318	122329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	163838908
1994	NC_010168	AT	3	6	122328	122333	50 %	50 %	0 %	0 %	163838908
1995	NC_010168	AGCGA	2	10	122349	122358	40 %	0 %	40 %	20 %	163838908
1996	NC_010168	GC	3	6	122415	122420	0 %	0 %	50 %	50 %	163838908
1997	NC_010168	GC	3	6	122430	122435	0 %	0 %	50 %	50 %	163838908
1998	NC_010168	TGC	2	6	122558	122563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838908
1999	NC_010168	CGG	2	6	122680	122685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838908
2000	NC_010168	CTG	2	6	122693	122698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838908

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