MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010168	GCG	2	6	60384	60389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838834
1002	NC_010168	TTG	2	6	60390	60395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838834
1003	NC_010168	GCGG	2	8	60416	60423	0 %	0 %	75 %	25 %	163838834
1004	NC_010168	ACG	2	6	60527	60532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838835
1005	NC_010168	GGC	2	6	60698	60703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838835
1006	NC_010168	TCA	2	6	60714	60719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838835
1007	NC_010168	GCT	2	6	60728	60733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838835
1008	NC_010168	TTA	2	6	60749	60754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838835
1009	NC_010168	AGC	2	6	60769	60774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838835
1010	NC_010168	CCG	2	6	60844	60849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838835
1011	NC_010168	GCC	2	6	60922	60927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838835
1012	NC_010168	AGA	2	6	61039	61044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838836
1013	NC_010168	GCG	2	6	61101	61106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838836
1014	NC_010168	ACC	2	6	61206	61211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838836
1015	NC_010168	GAC	2	6	61242	61247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838836
1016	NC_010168	ATG	2	6	61522	61527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838836
1017	NC_010168	GCC	2	6	61563	61568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838836
1018	NC_010168	CTGG	2	8	61645	61652	0 %	25 %	50 %	25 %	163838836
1019	NC_010168	GTT	2	6	61679	61684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838836
1020	NC_010168	AGC	2	6	61826	61831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838837
1021	NC_010168	CAT	2	6	61847	61852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838837
1022	NC_010168	CG	3	6	61862	61867	0 %	0 %	50 %	50 %	163838837
1023	NC_010168	GCTG	2	8	61915	61922	0 %	25 %	50 %	25 %	163838837
1024	NC_010168	CAGC	2	8	61927	61934	25 %	0 %	25 %	50 %	163838837
1025	NC_010168	CGA	3	9	61985	61993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838837
1026	NC_010168	CGC	2	6	61994	61999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838837
1027	NC_010168	GCG	2	6	62053	62058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838837
1028	NC_010168	ATC	2	6	62116	62121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838837
1029	NC_010168	GTT	2	6	62427	62432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838838
1030	NC_010168	CCGGGG	2	12	62604	62615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838838
1031	NC_010168	CAAG	2	8	62696	62703	50 %	0 %	25 %	25 %	163838838
1032	NC_010168	AACC	2	8	62720	62727	50 %	0 %	0 %	50 %	163838838
1033	NC_010168	GCC	2	6	62755	62760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838838
1034	NC_010168	AACTC	2	10	62774	62783	40 %	20 %	0 %	40 %	163838838
1035	NC_010168	GAGC	2	8	62902	62909	25 %	0 %	50 %	25 %	163838838
1036	NC_010168	GCC	2	6	62933	62938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838838
1037	NC_010168	CAC	2	6	62940	62945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838838
1038	NC_010168	ACA	2	6	62952	62957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838838
1039	NC_010168	GTT	2	6	62983	62988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838838
1040	NC_010168	GT	3	6	63135	63140	0 %	50 %	50 %	0 %	163838839
1041	NC_010168	AC	3	6	63146	63151	50 %	0 %	0 %	50 %	163838839
1042	NC_010168	ATG	2	6	63183	63188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838839
1043	NC_010168	GC	3	6	63223	63228	0 %	0 %	50 %	50 %	163838839
1044	NC_010168	GCG	2	6	63304	63309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838839
1045	NC_010168	TGG	2	6	63319	63324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838839
1046	NC_010168	GCG	2	6	63354	63359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838839
1047	NC_010168	TCA	2	6	63382	63387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838839
1048	NC_010168	CGC	2	6	63404	63409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838839
1049	NC_010168	GC	3	6	63485	63490	0 %	0 %	50 %	50 %	163838839
1050	NC_010168	GTG	2	6	63565	63570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838839
1051	NC_010168	CCA	2	6	63609	63614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838839
1052	NC_010168	CAC	2	6	63626	63631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838839
1053	NC_010168	GCAA	2	8	63662	63669	50 %	0 %	25 %	25 %	163838839
1054	NC_010168	GTAC	2	8	63687	63694	25 %	25 %	25 %	25 %	163838839
1055	NC_010168	ATC	2	6	63699	63704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838839
1056	NC_010168	CAC	2	6	63898	63903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838839
1057	NC_010168	GGA	2	6	63944	63949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838839
1058	NC_010168	GGCC	2	8	63991	63998	0 %	0 %	50 %	50 %	163838839
1059	NC_010168	GAA	2	6	64038	64043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838839
1060	NC_010168	TCT	2	6	64084	64089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838839
1061	NC_010168	GAA	2	6	64164	64169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838839
1062	NC_010168	CAT	2	6	64208	64213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838839
1063	NC_010168	CAGG	2	8	64218	64225	25 %	0 %	50 %	25 %	163838839
1064	NC_010168	CAT	2	6	64263	64268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838839
1065	NC_010168	GC	4	8	64289	64296	0 %	0 %	50 %	50 %	163838839
1066	NC_010168	GAT	2	6	64305	64310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838839
1067	NC_010168	GTG	2	6	64335	64340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838839
1068	NC_010168	CAC	2	6	64405	64410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838839
1069	NC_010168	CCA	2	6	64451	64456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838839
1070	NC_010168	CG	3	6	64497	64502	0 %	0 %	50 %	50 %	163838839
1071	NC_010168	GCA	2	6	64595	64600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1072	NC_010168	GAA	2	6	64638	64643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838839
1073	NC_010168	TCTA	2	8	64870	64877	25 %	50 %	0 %	25 %	163838839
1074	NC_010168	GAG	2	6	64887	64892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838839
1075	NC_010168	A	6	6	64895	64900	100 %	0 %	0 %	0 %	163838839
1076	NC_010168	CGA	2	6	64922	64927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1077	NC_010168	AC	3	6	65001	65006	50 %	0 %	0 %	50 %	163838839
1078	NC_010168	GCC	2	6	65077	65082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838839
1079	NC_010168	CAG	2	6	65128	65133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1080	NC_010168	CCT	2	6	65198	65203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838839
1081	NC_010168	TATC	2	8	65208	65215	25 %	50 %	0 %	25 %	163838839
1082	NC_010168	CGT	2	6	65237	65242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1083	NC_010168	GAC	2	6	65247	65252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1084	NC_010168	TGC	2	6	65305	65310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1085	NC_010168	GGC	2	6	65402	65407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838839
1086	NC_010168	GAC	2	6	65409	65414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1087	NC_010168	TGC	2	6	65422	65427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1088	NC_010168	GAT	2	6	65435	65440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838839
1089	NC_010168	GTT	2	6	65465	65470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838839
1090	NC_010168	CGA	2	6	65483	65488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1091	NC_010168	TGCGC	2	10	65553	65562	0 %	20 %	40 %	40 %	163838839
1092	NC_010168	CGC	2	6	65602	65607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838839
1093	NC_010168	GCA	2	6	65612	65617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1094	NC_010168	A	6	6	65652	65657	100 %	0 %	0 %	0 %	163838839
1095	NC_010168	ACC	2	6	65781	65786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838839
1096	NC_010168	GCTC	2	8	65805	65812	0 %	25 %	25 %	50 %	163838839
1097	NC_010168	GCT	2	6	65813	65818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838839
1098	NC_010168	GCG	2	6	65870	65875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838839
1099	NC_010168	GCG	2	6	65880	65885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838839
1100	NC_010168	ACT	2	6	65903	65908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838839
1101	NC_010168	TAC	2	6	66192	66197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838840
1102	NC_010168	AGA	2	6	66205	66210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838840
1103	NC_010168	CGC	2	6	66211	66216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838840
1104	NC_010168	CA	3	6	66322	66327	50 %	0 %	0 %	50 %	163838840
1105	NC_010168	AGT	2	6	66421	66426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838840
1106	NC_010168	GC	3	6	66532	66537	0 %	0 %	50 %	50 %	163838840
1107	NC_010168	CG	3	6	66557	66562	0 %	0 %	50 %	50 %	163838840
1108	NC_010168	GATC	2	8	66637	66644	25 %	25 %	25 %	25 %	163838840
1109	NC_010168	CCG	2	6	66672	66677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838840
1110	NC_010168	ATT	2	6	66711	66716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838840
1111	NC_010168	CCG	2	6	66843	66848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838840
1112	NC_010168	T	6	6	66913	66918	0 %	100 %	0 %	0 %	163838840
1113	NC_010168	GAAAC	2	10	67014	67023	60 %	0 %	20 %	20 %	163838840
1114	NC_010168	CGG	2	6	67051	67056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838840
1115	NC_010168	CG	3	6	67238	67243	0 %	0 %	50 %	50 %	163838840
1116	NC_010168	CG	3	6	67285	67290	0 %	0 %	50 %	50 %	163838840
1117	NC_010168	GAA	2	6	67356	67361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838840
1118	NC_010168	GCC	2	6	67372	67377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838841
1119	NC_010168	GGC	2	6	67403	67408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838841
1120	NC_010168	AGC	2	6	67471	67476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838841
1121	NC_010168	TC	4	8	67477	67484	0 %	50 %	0 %	50 %	163838841
1122	NC_010168	GCA	2	6	67528	67533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838841
1123	NC_010168	TGG	2	6	67592	67597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838841
1124	NC_010168	CTG	2	6	68016	68021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838842
1125	NC_010168	AGCAGT	2	12	68140	68151	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163838843
1126	NC_010168	GCT	2	6	68431	68436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838843
1127	NC_010168	GCA	2	6	68463	68468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838843
1128	NC_010168	CCCG	2	8	68480	68487	0 %	0 %	25 %	75 %	163838843
1129	NC_010168	CGT	2	6	68534	68539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838843
1130	NC_010168	AGA	2	6	68557	68562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838843
1131	NC_010168	AACTA	2	10	68615	68624	60 %	20 %	0 %	20 %	163838843
1132	NC_010168	GAC	2	6	68704	68709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838844
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1134	NC_010168	TAC	2	6	68852	68857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838844
1135	NC_010168	ATC	2	6	68916	68921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838844
1136	NC_010168	GGC	2	6	68963	68968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838844
1137	NC_010168	ATGT	2	8	68969	68976	25 %	50 %	25 %	0 %	163838844
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1141	NC_010168	ACTC	2	8	69226	69233	25 %	25 %	0 %	50 %	163838844
1142	NC_010168	TCA	2	6	69346	69351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838844
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1147	NC_010168	CCA	2	6	69710	69715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838845
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1154	NC_010168	CGCAC	2	10	70005	70014	20 %	0 %	20 %	60 %	163838846
1155	NC_010168	GGCT	2	8	70015	70022	0 %	25 %	50 %	25 %	163838846
1156	NC_010168	CAT	2	6	70031	70036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838846
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1159	NC_010168	TGA	2	6	70497	70502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838846
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1163	NC_010168	GCT	2	6	70710	70715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838846
1164	NC_010168	GCT	2	6	70738	70743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838847
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1168	NC_010168	A	6	6	70791	70796	100 %	0 %	0 %	0 %	163838847
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1239	NC_010168	CAG	2	6	74362	74367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838852
1240	NC_010168	TGGA	2	8	74420	74427	25 %	25 %	50 %	0 %	163838852
1241	NC_010168	GAA	2	6	74458	74463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838852
1242	NC_010168	TG	3	6	74504	74509	0 %	50 %	50 %	0 %	163838852
1243	NC_010168	GGT	2	6	74547	74552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838852
1244	NC_010168	ATGGCG	2	12	74600	74611	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	163838852
1245	NC_010168	CCG	2	6	74720	74725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838852
1246	NC_010168	CCG	2	6	74747	74752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838852
1247	NC_010168	GAT	2	6	74844	74849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838852
1248	NC_010168	CCA	2	6	74893	74898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838852
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1376	NC_010168	CGG	2	6	82623	82628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838862
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1497	NC_010168	GCC	2	6	90539	90544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838872
1498	NC_010168	TGC	2	6	90605	90610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838872
1499	NC_010168	TCG	2	6	90623	90628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838872
1500	NC_010168	GCC	2	6	90644	90649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838872

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