MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010168	TCA	2	6	29349	29354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838796
502	NC_010168	GCC	3	9	29433	29441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838796
503	NC_010168	GTA	2	6	29444	29449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838796
504	NC_010168	TCT	2	6	29452	29457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838796
505	NC_010168	GCCA	2	8	29496	29503	25 %	0 %	25 %	50 %	163838796
506	NC_010168	CAA	2	6	29558	29563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838796
507	NC_010168	CCA	2	6	29571	29576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838796
508	NC_010168	CACGGC	2	12	29643	29654	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163838796
509	NC_010168	GAA	2	6	29708	29713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838796
510	NC_010168	ATG	2	6	29763	29768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838796
511	NC_010168	CGA	2	6	29779	29784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838796
512	NC_010168	CGG	2	6	29920	29925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838796
513	NC_010168	TCCA	2	8	29928	29935	25 %	25 %	0 %	50 %	163838796
514	NC_010168	ATT	2	6	29936	29941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838796
515	NC_010168	CTC	2	6	29987	29992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838796
516	NC_010168	TTA	2	6	30189	30194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838796
517	NC_010168	CGC	2	6	30524	30529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838797
518	NC_010168	TCG	2	6	30566	30571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838797
519	NC_010168	CAT	2	6	30581	30586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838797
520	NC_010168	AGA	2	6	30612	30617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838797
521	NC_010168	CGG	2	6	30654	30659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838797
522	NC_010168	GCGG	2	8	30715	30722	0 %	0 %	75 %	25 %	163838797
523	NC_010168	GGC	2	6	30750	30755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838797
524	NC_010168	GGC	2	6	30796	30801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838797
525	NC_010168	GCA	2	6	30871	30876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838797
526	NC_010168	ACT	2	6	30904	30909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838797
527	NC_010168	GGC	2	6	30943	30948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838797
528	NC_010168	TAC	2	6	31071	31076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838797
529	NC_010168	AGA	2	6	31106	31111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838797
530	NC_010168	TAC	2	6	31128	31133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838797
531	NC_010168	CCT	2	6	31294	31299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838798
532	NC_010168	AGC	2	6	31387	31392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838799
533	NC_010168	TCC	2	6	31429	31434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838799
534	NC_010168	GCGACC	2	12	31501	31512	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163838799
535	NC_010168	GGTC	2	8	31577	31584	0 %	25 %	50 %	25 %	163838799
536	NC_010168	GCCT	2	8	31633	31640	0 %	25 %	25 %	50 %	163838799
537	NC_010168	CAG	2	6	31712	31717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838799
538	NC_010168	ACCA	2	8	31750	31757	50 %	0 %	0 %	50 %	163838799
539	NC_010168	CCT	2	6	31790	31795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838799
540	NC_010168	TGG	2	6	31818	31823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838799
541	NC_010168	CCT	2	6	31892	31897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838799
542	NC_010168	ATC	2	6	31947	31952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838799
543	NC_010168	ACCA	2	8	31959	31966	50 %	0 %	0 %	50 %	163838799
544	NC_010168	CAT	2	6	32022	32027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838799
545	NC_010168	TGA	2	6	32048	32053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838799
546	NC_010168	GCA	2	6	32092	32097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838799
547	NC_010168	CGCAA	2	10	32108	32117	40 %	0 %	20 %	40 %	163838799
548	NC_010168	TCG	2	6	32132	32137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838799
549	NC_010168	GCT	2	6	32179	32184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838799
550	NC_010168	AGT	2	6	32199	32204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838799
551	NC_010168	CGC	2	6	32237	32242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838799
552	NC_010168	GTG	2	6	32254	32259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838799
553	NC_010168	CCG	2	6	32328	32333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838799
554	NC_010168	GCG	2	6	32347	32352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838799
555	NC_010168	CGT	2	6	32363	32368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838799
556	NC_010168	TCA	2	6	32829	32834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838800
557	NC_010168	GAT	2	6	32852	32857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838800
558	NC_010168	GCG	2	6	33005	33010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838801
559	NC_010168	GAG	2	6	33108	33113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838801
560	NC_010168	CCA	2	6	33121	33126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838801
561	NC_010168	GCG	2	6	33181	33186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838801
562	NC_010168	CCG	2	6	33196	33201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838801
563	NC_010168	ATG	2	6	33291	33296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838801
564	NC_010168	CTG	2	6	33338	33343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838801
565	NC_010168	GTGCC	2	10	33379	33388	0 %	20 %	40 %	40 %	163838801
566	NC_010168	CGT	3	9	33404	33412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838801
567	NC_010168	CGT	2	6	33463	33468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838801
568	NC_010168	TGC	2	6	33472	33477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838801
569	NC_010168	TGC	2	6	33605	33610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838801
570	NC_010168	GCA	2	6	33789	33794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838801
571	NC_010168	TCA	2	6	33913	33918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838801
572	NC_010168	CT	3	6	34053	34058	0 %	50 %	0 %	50 %	163838801
573	NC_010168	GCC	2	6	34061	34066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838801
574	NC_010168	GCC	2	6	34172	34177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838801
575	NC_010168	CAA	2	6	34186	34191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838801
576	NC_010168	CCA	2	6	34234	34239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838801
577	NC_010168	TGG	2	6	34508	34513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838802
578	NC_010168	TCG	2	6	34528	34533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838802
579	NC_010168	GCC	2	6	34756	34761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838802
580	NC_010168	ACT	2	6	34990	34995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838803
581	NC_010168	GAC	2	6	35121	35126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838803
582	NC_010168	CGC	2	6	35199	35204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838803
583	NC_010168	TTG	2	6	35207	35212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838803
584	NC_010168	CGC	2	6	35238	35243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838803
585	NC_010168	CAGC	2	8	35251	35258	25 %	0 %	25 %	50 %	163838803
586	NC_010168	GCA	2	6	35355	35360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838803
587	NC_010168	CAG	2	6	35386	35391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838803
588	NC_010168	GC	4	8	35408	35415	0 %	0 %	50 %	50 %	163838803
589	NC_010168	TCA	3	9	35511	35519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838803
590	NC_010168	CACAG	2	10	35529	35538	40 %	0 %	20 %	40 %	163838803
591	NC_010168	CTT	2	6	35608	35613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838803
592	NC_010168	CACC	2	8	35691	35698	25 %	0 %	0 %	75 %	163838803
593	NC_010168	CGT	3	9	35716	35724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838803
594	NC_010168	ACG	2	6	35734	35739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838803
595	NC_010168	TCAG	2	8	35811	35818	25 %	25 %	25 %	25 %	163838803
596	NC_010168	CCG	2	6	35836	35841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838803
597	NC_010168	ATT	2	6	35870	35875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838803
598	NC_010168	AAC	2	6	35879	35884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838803
599	NC_010168	CAG	2	6	35917	35922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838803
600	NC_010168	AGTT	2	8	35971	35978	25 %	50 %	25 %	0 %	163838803
601	NC_010168	GCG	2	6	35991	35996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838803
602	NC_010168	CGG	2	6	36035	36040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838803
603	NC_010168	TGC	2	6	36102	36107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838803
604	NC_010168	CAC	2	6	36218	36223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838803
605	NC_010168	CCAT	2	8	36276	36283	25 %	25 %	0 %	50 %	163838803
606	NC_010168	CAT	2	6	36295	36300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838803
607	NC_010168	CGC	2	6	36319	36324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838803
608	NC_010168	CTG	2	6	36346	36351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838803
609	NC_010168	CAG	2	6	36362	36367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838803
610	NC_010168	CCG	2	6	36396	36401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838803
611	NC_010168	TGC	2	6	36414	36419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838803
612	NC_010168	AAAGC	2	10	36568	36577	60 %	0 %	20 %	20 %	163838803
613	NC_010168	CCG	2	6	36662	36667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838803
614	NC_010168	GGT	2	6	36745	36750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838804
615	NC_010168	ATC	2	6	36809	36814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838804
616	NC_010168	TCG	2	6	36870	36875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838804
617	NC_010168	GTG	2	6	36922	36927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838804
618	NC_010168	CTCG	2	8	37015	37022	0 %	25 %	25 %	50 %	163838804
619	NC_010168	AAT	2	6	37091	37096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163838804
620	NC_010168	ACT	2	6	37128	37133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838804
621	NC_010168	CGT	2	6	37156	37161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838804
622	NC_010168	CAG	2	6	37177	37182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838804
623	NC_010168	GCA	2	6	37224	37229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838804
624	NC_010168	GTT	2	6	37240	37245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838804
625	NC_010168	AAG	2	6	37332	37337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838804
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652	NC_010168	GCCG	2	8	38844	38851	0 %	0 %	50 %	50 %	163838805
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1000	NC_010168	AAC	2	6	60225	60230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838833

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