MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010168	TGC	2	6	322283	322288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839153
5502	NC_010168	GCC	2	6	322302	322307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839153
5503	NC_010168	TTG	2	6	322330	322335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839153
5504	NC_010168	ATG	2	6	322395	322400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839153
5505	NC_010168	CG	3	6	323135	323140	0 %	0 %	50 %	50 %	163839154
5506	NC_010168	GGT	2	6	323165	323170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839154
5507	NC_010168	CGTG	2	8	323197	323204	0 %	25 %	50 %	25 %	163839154
5508	NC_010168	GT	3	6	323257	323262	0 %	50 %	50 %	0 %	163839154
5509	NC_010168	CGG	2	6	323292	323297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839154
5510	NC_010168	GTA	2	6	323321	323326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839154
5511	NC_010168	TGG	2	6	323345	323350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839154
5512	NC_010168	GGT	2	6	323380	323385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839154
5513	NC_010168	CTT	2	6	323422	323427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839154
5514	NC_010168	AGG	2	6	323575	323580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839155
5515	NC_010168	TGA	3	9	323601	323609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839155
5516	NC_010168	TCC	2	6	323719	323724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839155
5517	NC_010168	ACCC	2	8	323757	323764	25 %	0 %	0 %	75 %	163839155
5518	NC_010168	ATC	2	6	323789	323794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839155
5519	NC_010168	CGG	2	6	323832	323837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839155
5520	NC_010168	GCC	2	6	323856	323861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839155
5521	NC_010168	GTG	2	6	323877	323882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839155
5522	NC_010168	TCA	2	6	324054	324059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839155
5523	NC_010168	GTT	2	6	324061	324066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839155
5524	NC_010168	GTA	2	6	324098	324103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839155
5525	NC_010168	GGT	2	6	324113	324118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839155
5526	NC_010168	TCGAC	2	10	324150	324159	20 %	20 %	20 %	40 %	163839155
5527	NC_010168	ATT	2	6	324175	324180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839156
5528	NC_010168	A	6	6	324249	324254	100 %	0 %	0 %	0 %	163839156
5529	NC_010168	TCAGC	2	10	324289	324298	20 %	20 %	20 %	40 %	163839156
5530	NC_010168	GTT	2	6	324342	324347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839156
5531	NC_010168	CACACC	2	12	324407	324418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839156
5532	NC_010168	CGC	2	6	324443	324448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839156
5533	NC_010168	TTG	2	6	325040	325045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839157
5534	NC_010168	CT	3	6	325057	325062	0 %	50 %	0 %	50 %	163839157
5535	NC_010168	GCT	2	6	325080	325085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839157
5536	NC_010168	CAG	2	6	325207	325212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839157
5537	NC_010168	GCGA	2	8	325317	325324	25 %	0 %	50 %	25 %	163839157
5538	NC_010168	TGG	2	6	325392	325397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839157
5539	NC_010168	GC	4	8	325420	325427	0 %	0 %	50 %	50 %	163839157
5540	NC_010168	CTTG	2	8	325449	325456	0 %	50 %	25 %	25 %	163839157
5541	NC_010168	TGA	2	6	325502	325507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839157
5542	NC_010168	CT	3	6	325579	325584	0 %	50 %	0 %	50 %	163839157
5543	NC_010168	ATT	2	6	325597	325602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839157
5544	NC_010168	GC	3	6	325608	325613	0 %	0 %	50 %	50 %	163839157
5545	NC_010168	GTA	2	6	325621	325626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839157
5546	NC_010168	AAG	2	6	325718	325723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839157
5547	NC_010168	GGC	2	6	325734	325739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839157
5548	NC_010168	AGC	2	6	325742	325747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839157
5549	NC_010168	CTG	2	6	325751	325756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839157
5550	NC_010168	CAC	2	6	325818	325823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839158
5551	NC_010168	CGCT	3	12	325885	325896	0 %	25 %	25 %	50 %	163839158
5552	NC_010168	GCA	2	6	325904	325909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5553	NC_010168	CGT	2	6	325933	325938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5554	NC_010168	TCC	2	6	325946	325951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839158
5555	NC_010168	GC	3	6	326009	326014	0 %	0 %	50 %	50 %	163839158
5556	NC_010168	GTG	2	6	326078	326083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839158
5557	NC_010168	CCA	2	6	326103	326108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839158
5558	NC_010168	TTCCA	2	10	326113	326122	20 %	40 %	0 %	40 %	163839158
5559	NC_010168	CGA	2	6	326341	326346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5560	NC_010168	GCT	2	6	326369	326374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5561	NC_010168	GGC	3	9	326375	326383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839158
5562	NC_010168	TGC	2	6	326412	326417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5563	NC_010168	CTT	2	6	326427	326432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839158
5564	NC_010168	TGC	2	6	326445	326450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5565	NC_010168	TCG	2	6	326493	326498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5566	NC_010168	CGC	3	9	326563	326571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839158
5567	NC_010168	GTG	2	6	326594	326599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839158
5568	NC_010168	ATT	2	6	326606	326611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839158
5569	NC_010168	GAT	2	6	326629	326634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839158
5570	NC_010168	ACG	3	9	326693	326701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5571	NC_010168	CCA	2	6	326724	326729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839158
5572	NC_010168	GC	3	6	326763	326768	0 %	0 %	50 %	50 %	163839158
5573	NC_010168	TGGC	2	8	326803	326810	0 %	25 %	50 %	25 %	163839158
5574	NC_010168	GAT	2	6	326947	326952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839158
5575	NC_010168	GCTT	2	8	326955	326962	0 %	50 %	25 %	25 %	163839158
5576	NC_010168	CTG	2	6	327089	327094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5577	NC_010168	CTG	2	6	327119	327124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839158
5578	NC_010168	ATC	2	6	327128	327133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839158
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5580	NC_010168	TTG	2	6	327330	327335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839158
5581	NC_010168	T	6	6	327342	327347	0 %	100 %	0 %	0 %	163839158
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5583	NC_010168	GTG	2	6	327746	327751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839159
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5585	NC_010168	ATTG	2	8	327943	327950	25 %	50 %	25 %	0 %	163839159
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5588	NC_010168	GC	3	6	328254	328259	0 %	0 %	50 %	50 %	163839159
5589	NC_010168	GC	3	6	328344	328349	0 %	0 %	50 %	50 %	163839159
5590	NC_010168	ACT	2	6	328454	328459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839159
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5592	NC_010168	GCACC	2	10	328512	328521	20 %	0 %	20 %	60 %	163839159
5593	NC_010168	TTGC	2	8	328528	328535	0 %	50 %	25 %	25 %	163839159
5594	NC_010168	CGC	2	6	328668	328673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839159
5595	NC_010168	TGT	2	6	328692	328697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839159
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5599	NC_010168	CAA	2	6	328965	328970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839159
5600	NC_010168	TTG	2	6	328987	328992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839159
5601	NC_010168	ACG	2	6	329054	329059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839159
5602	NC_010168	GCA	2	6	329067	329072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839159
5603	NC_010168	ACA	2	6	329142	329147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839160
5604	NC_010168	TAC	2	6	329190	329195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839160
5605	NC_010168	CCG	2	6	329316	329321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839160
5606	NC_010168	AAAG	2	8	329363	329370	75 %	0 %	25 %	0 %	163839160
5607	NC_010168	TCT	2	6	329432	329437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839160
5608	NC_010168	GC	3	6	329456	329461	0 %	0 %	50 %	50 %	163839160
5609	NC_010168	CGG	2	6	329467	329472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839160
5610	NC_010168	GC	3	6	329490	329495	0 %	0 %	50 %	50 %	163839160
5611	NC_010168	CTT	2	6	329514	329519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839160
5612	NC_010168	GTT	2	6	329535	329540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839160
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5617	NC_010168	CGAA	2	8	329818	329825	50 %	0 %	25 %	25 %	163839160
5618	NC_010168	GCG	3	9	329877	329885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839160
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5620	NC_010168	TGG	2	6	329913	329918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839160
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5622	NC_010168	TG	3	6	330082	330087	0 %	50 %	50 %	0 %	163839160
5623	NC_010168	GCA	2	6	330149	330154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839160
5624	NC_010168	GGC	2	6	330163	330168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839160
5625	NC_010168	GACC	2	8	330173	330180	25 %	0 %	25 %	50 %	163839160
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5632	NC_010168	GCA	2	6	330521	330526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839161
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5645	NC_010168	GCC	2	6	331432	331437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839162
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5653	NC_010168	CGC	2	6	331801	331806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839162
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5723	NC_010168	TCA	2	6	336327	336332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839168
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5740	NC_010168	GAAGC	2	10	337455	337464	40 %	0 %	40 %	20 %	163839169
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5985	NC_010168	TGG	2	6	353098	353103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839185
5986	NC_010168	GC	3	6	353123	353128	0 %	0 %	50 %	50 %	163839185
5987	NC_010168	A	6	6	353132	353137	100 %	0 %	0 %	0 %	163839185
5988	NC_010168	ACA	2	6	353196	353201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839185
5989	NC_010168	CGT	2	6	353247	353252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839185
5990	NC_010168	TTC	2	6	353279	353284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839185
5991	NC_010168	TGA	2	6	353373	353378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839185
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5997	NC_010168	GCC	2	6	353497	353502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839186
5998	NC_010168	GC	4	8	353550	353557	0 %	0 %	50 %	50 %	163839186
5999	NC_010168	GCT	2	6	353562	353567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839186
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