MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_010168	GGC	2	6	293813	293818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839117
5003	NC_010168	ACGC	2	8	293823	293830	25 %	0 %	25 %	50 %	163839117
5004	NC_010168	CAC	2	6	293839	293844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839117
5005	NC_010168	GCC	2	6	293950	293955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839117
5006	NC_010168	TCG	2	6	294006	294011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839117
5007	NC_010168	TCA	2	6	294012	294017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839117
5008	NC_010168	ATC	2	6	294107	294112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839117
5009	NC_010168	CAT	2	6	294130	294135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839117
5010	NC_010168	TTGG	2	8	294152	294159	0 %	50 %	50 %	0 %	163839117
5011	NC_010168	ACA	2	6	294171	294176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839117
5012	NC_010168	ATG	2	6	294233	294238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839117
5013	NC_010168	TGG	2	6	294280	294285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839117
5014	NC_010168	TGA	2	6	294360	294365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839117
5015	NC_010168	TGG	2	6	294376	294381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839117
5016	NC_010168	TGC	2	6	294397	294402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839117
5017	NC_010168	TCA	2	6	294408	294413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839117
5018	NC_010168	GTT	2	6	294434	294439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839117
5019	NC_010168	AAGA	2	8	294530	294537	75 %	0 %	25 %	0 %	163839117
5020	NC_010168	AGC	2	6	294547	294552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839117
5021	NC_010168	CTG	2	6	294593	294598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839117
5022	NC_010168	TCA	2	6	294796	294801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839118
5023	NC_010168	CAT	2	6	294839	294844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839118
5024	NC_010168	CGA	2	6	294871	294876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839118
5025	NC_010168	CGGT	2	8	295045	295052	0 %	25 %	50 %	25 %	163839118
5026	NC_010168	ACGA	2	8	295146	295153	50 %	0 %	25 %	25 %	163839118
5027	NC_010168	TGC	2	6	295174	295179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839118
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5032	NC_010168	TACT	2	8	295320	295327	25 %	50 %	0 %	25 %	163839118
5033	NC_010168	TTCG	2	8	295419	295426	0 %	50 %	25 %	25 %	163839118
5034	NC_010168	TGC	2	6	295454	295459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839118
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5038	NC_010168	TGA	2	6	295654	295659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839118
5039	NC_010168	GAT	3	9	295676	295684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839118
5040	NC_010168	CGA	2	6	295738	295743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839118
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5065	NC_010168	GAAGC	2	10	297117	297126	40 %	0 %	40 %	20 %	163839118
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5118	NC_010168	GAG	2	6	300538	300543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839122
5119	NC_010168	GCT	2	6	300591	300596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839122
5120	NC_010168	CGC	2	6	300597	300602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839122
5121	NC_010168	CGT	2	6	300618	300623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839122
5122	NC_010168	C	6	6	300680	300685	0 %	0 %	0 %	100 %	163839122
5123	NC_010168	CGGC	2	8	300798	300805	0 %	0 %	50 %	50 %	163839123
5124	NC_010168	CT	3	6	300824	300829	0 %	50 %	0 %	50 %	163839123
5125	NC_010168	GATGC	2	10	300836	300845	20 %	20 %	40 %	20 %	163839123
5126	NC_010168	CAG	2	6	300852	300857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839123
5127	NC_010168	AGA	2	6	300953	300958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839124
5128	NC_010168	GGC	2	6	301037	301042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839124
5129	NC_010168	ATT	2	6	301109	301114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839124
5130	NC_010168	TGC	2	6	301189	301194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839124
5131	NC_010168	CGG	2	6	301241	301246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839124
5132	NC_010168	CGAT	2	8	301274	301281	25 %	25 %	25 %	25 %	163839124
5133	NC_010168	GAA	2	6	301307	301312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839124
5134	NC_010168	GGC	2	6	301326	301331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839124
5135	NC_010168	TGA	2	6	301355	301360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839124
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5137	NC_010168	GAT	2	6	301433	301438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839124
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5139	NC_010168	GGC	2	6	301598	301603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839124
5140	NC_010168	GCG	2	6	301630	301635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839124
5141	NC_010168	GAT	2	6	301653	301658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839124
5142	NC_010168	CCCG	2	8	301733	301740	0 %	0 %	25 %	75 %	163839124
5143	NC_010168	GCC	2	6	301755	301760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839124
5144	NC_010168	CGC	2	6	301769	301774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839124
5145	NC_010168	GCA	2	6	301784	301789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839124
5146	NC_010168	CGA	2	6	301968	301973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839125
5147	NC_010168	TAC	2	6	301982	301987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839125
5148	NC_010168	ACGAA	2	10	301993	302002	60 %	0 %	20 %	20 %	163839125
5149	NC_010168	GCGCC	2	10	302047	302056	0 %	0 %	40 %	60 %	163839125
5150	NC_010168	CCA	2	6	302121	302126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839125
5151	NC_010168	TGC	2	6	302145	302150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839125
5152	NC_010168	CCA	2	6	302169	302174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839125
5153	NC_010168	GCA	2	6	302194	302199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839125
5154	NC_010168	ACG	2	6	302211	302216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839125
5155	NC_010168	ACG	2	6	302235	302240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839125
5156	NC_010168	ATT	2	6	302290	302295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839125
5157	NC_010168	CGT	2	6	302477	302482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839125
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5166	NC_010168	TGG	2	6	302793	302798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839126
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5174	NC_010168	CGT	3	9	303223	303231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839126
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5181	NC_010168	TGC	2	6	303460	303465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839126
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5188	NC_010168	CGA	2	6	303941	303946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839127
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5192	NC_010168	GCC	2	6	304104	304109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839127
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5194	NC_010168	CGA	2	6	304190	304195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839127
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5199	NC_010168	AATA	2	8	304455	304462	75 %	25 %	0 %	0 %	163839127
5200	NC_010168	GATC	2	8	304496	304503	25 %	25 %	25 %	25 %	163839127
5201	NC_010168	TGA	2	6	304567	304572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839128
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5212	NC_010168	GGTCCA	8	48	305332	305379	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163839129
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5220	NC_010168	ATG	2	6	305946	305951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839130
5221	NC_010168	GTC	2	6	305955	305960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839130
5222	NC_010168	GTA	2	6	306009	306014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839130
5223	NC_010168	GCC	2	6	306031	306036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839130
5224	NC_010168	GAC	2	6	306069	306074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839130
5225	NC_010168	CGC	2	6	306077	306082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839130
5226	NC_010168	CGG	2	6	306092	306097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839130
5227	NC_010168	CGTC	2	8	306149	306156	0 %	25 %	25 %	50 %	163839130
5228	NC_010168	CGG	2	6	306158	306163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839130
5229	NC_010168	AGT	2	6	306191	306196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839130
5230	NC_010168	TCC	2	6	306202	306207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839130
5231	NC_010168	GCG	2	6	306403	306408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839130
5232	NC_010168	GC	3	6	306428	306433	0 %	0 %	50 %	50 %	163839130
5233	NC_010168	GCC	2	6	306450	306455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839130
5234	NC_010168	GCT	2	6	306462	306467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839130
5235	NC_010168	CGC	2	6	306563	306568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839130
5236	NC_010168	GT	3	6	306679	306684	0 %	50 %	50 %	0 %	163839130
5237	NC_010168	GCC	2	6	306717	306722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839130
5238	NC_010168	CGG	2	6	306879	306884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839131
5239	NC_010168	AGC	2	6	307007	307012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839131
5240	NC_010168	CGT	2	6	307059	307064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839131
5241	NC_010168	GCG	2	6	307175	307180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839131
5242	NC_010168	AATCA	2	10	307234	307243	60 %	20 %	0 %	20 %	163839131
5243	NC_010168	CGC	2	6	307305	307310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839131
5244	NC_010168	GCG	2	6	307388	307393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839131
5245	NC_010168	CGG	2	6	307423	307428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839131
5246	NC_010168	CTG	2	6	307760	307765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839132
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5248	NC_010168	GTA	2	6	307980	307985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839133
5249	NC_010168	TGG	2	6	308004	308009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839133
5250	NC_010168	GGT	2	6	308039	308044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839133
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5252	NC_010168	AGG	2	6	308234	308239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839133
5253	NC_010168	TGA	3	9	308260	308268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839133
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5255	NC_010168	ACCC	2	8	308416	308423	25 %	0 %	0 %	75 %	163839133
5256	NC_010168	CGG	2	6	308491	308496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839133
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5259	NC_010168	TCA	2	6	308713	308718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839133
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5261	NC_010168	GTA	2	6	308757	308762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839133
5262	NC_010168	GGT	2	6	308772	308777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839133
5263	NC_010168	TCGAC	2	10	308809	308818	20 %	20 %	20 %	40 %	163839133
5264	NC_010168	ATT	2	6	308834	308839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839134
5265	NC_010168	A	6	6	308908	308913	100 %	0 %	0 %	0 %	163839134
5266	NC_010168	TCAGC	2	10	308948	308957	20 %	20 %	20 %	40 %	163839134
5267	NC_010168	GTT	2	6	309001	309006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839134
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5302	NC_010168	CTT	2	6	311008	311013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839138
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5322	NC_010168	GATC	2	8	311643	311650	25 %	25 %	25 %	25 %	163839138
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5324	NC_010168	GCG	2	6	311679	311684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839138
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5330	NC_010168	CTC	2	6	311857	311862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839138
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5359	NC_010168	GCC	2	6	313399	313404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839140
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5362	NC_010168	CG	3	6	313477	313482	0 %	0 %	50 %	50 %	163839140
5363	NC_010168	GAT	2	6	313483	313488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839140
5364	NC_010168	ATC	2	6	313549	313554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839140
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5447	NC_010168	GAT	2	6	318931	318936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839147
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5459	NC_010168	CCCG	2	8	319813	319820	0 %	0 %	25 %	75 %	163839150
5460	NC_010168	CGA	2	6	319844	319849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839150
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5464	NC_010168	AGA	2	6	319976	319981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839150
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5466	NC_010168	GCAGC	2	10	320163	320172	20 %	0 %	40 %	40 %	163839150
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5472	NC_010168	AGA	2	6	320673	320678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839151
5473	NC_010168	CGT	2	6	320701	320706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839151
5474	NC_010168	AGT	2	6	320715	320720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839151
5475	NC_010168	TTG	2	6	320832	320837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839152
5476	NC_010168	AGCGAA	2	12	320848	320859	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	163839152
5477	NC_010168	TGT	2	6	320867	320872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839152
5478	NC_010168	TGGC	2	8	320878	320885	0 %	25 %	50 %	25 %	163839152
5479	NC_010168	GTA	2	6	321002	321007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839152
5480	NC_010168	TCG	2	6	321111	321116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839152
5481	NC_010168	CTG	2	6	321178	321183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839152
5482	NC_010168	GTG	2	6	321201	321206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839152
5483	NC_010168	CGT	2	6	321227	321232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839152
5484	NC_010168	ACCA	2	8	321265	321272	50 %	0 %	0 %	50 %	163839152
5485	NC_010168	TCA	2	6	321354	321359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839152
5486	NC_010168	CAG	2	6	321439	321444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839152
5487	NC_010168	CAA	2	6	321448	321453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839152
5488	NC_010168	CGC	2	6	321547	321552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839152
5489	NC_010168	GTA	2	6	321573	321578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839152
5490	NC_010168	ATG	2	6	321582	321587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839152
5491	NC_010168	TAGG	2	8	321764	321771	25 %	25 %	50 %	0 %	163839152
5492	NC_010168	CGG	2	6	321772	321777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839152
5493	NC_010168	TCG	2	6	321807	321812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839152
5494	NC_010168	TCG	2	6	321925	321930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839153
5495	NC_010168	TGT	2	6	321994	321999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839153
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5498	NC_010168	TTGCT	2	10	322174	322183	0 %	60 %	20 %	20 %	163839153
5499	NC_010168	GA	3	6	322256	322261	50 %	0 %	50 %	0 %	163839153
5500	NC_010168	CGT	2	6	322268	322273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839153

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