MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 14905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009900	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964073
2	NC_009900	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964073
3	NC_009900	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964073
4	NC_009900	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964073
5	NC_009900	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964073
6	NC_009900	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964073
7	NC_009900	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964073
8	NC_009900	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964073
9	NC_009900	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964073
10	NC_009900	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964073
11	NC_009900	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964073
12	NC_009900	ATA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964074
13	NC_009900	TGA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964074
14	NC_009900	GTA	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964074
15	NC_009900	CAA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964074
16	NC_009900	TAA	2	6	1448	1453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964074
17	NC_009900	TCT	2	6	1568	1573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964075
18	NC_009900	ATA	3	9	1832	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964075
19	NC_009900	GTA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964075
20	NC_009900	TGA	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964075
21	NC_009900	GAA	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964075
22	NC_009900	AAT	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964075
23	NC_009900	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964075
24	NC_009900	TTA	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964075
25	NC_009900	CAA	3	9	2203	2211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964075
26	NC_009900	CGG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964076
27	NC_009900	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964076
28	NC_009900	ATA	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964076
29	NC_009900	ATA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964076
30	NC_009900	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964076
31	NC_009900	ATG	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964076
32	NC_009900	TAT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964076
33	NC_009900	TTA	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964076
34	NC_009900	CTC	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157964077
35	NC_009900	ATT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
36	NC_009900	ATT	2	6	3154	3159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
37	NC_009900	ATT	2	6	3267	3272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
38	NC_009900	AGA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
39	NC_009900	AGA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
40	NC_009900	AGC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964077
41	NC_009900	TGC	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964077
42	NC_009900	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
43	NC_009900	GAG	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964077
44	NC_009900	TGA	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964077
45	NC_009900	TAT	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
46	NC_009900	GCA	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964077
47	NC_009900	AGA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
48	NC_009900	CTA	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964077
49	NC_009900	TAT	2	6	4188	4193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
50	NC_009900	TTA	2	6	4194	4199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
51	NC_009900	TGT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964077
52	NC_009900	GGA	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964077
53	NC_009900	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
54	NC_009900	GGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964077
55	NC_009900	GCA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964077
56	NC_009900	GGA	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964077
57	NC_009900	GAA	2	6	4782	4787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
58	NC_009900	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
59	NC_009900	AAT	2	6	4824	4829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
60	NC_009900	GAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
61	NC_009900	TAA	2	6	4850	4855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
62	NC_009900	GAG	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964077
63	NC_009900	GTG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964077
64	NC_009900	AAG	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
65	NC_009900	ACG	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964077
66	NC_009900	TAA	2	6	5222	5227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
67	NC_009900	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
68	NC_009900	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
69	NC_009900	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
70	NC_009900	GAT	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964077
71	NC_009900	TGC	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964077
72	NC_009900	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
73	NC_009900	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964077
74	NC_009900	CTA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964077
75	NC_009900	AGT	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964077
76	NC_009900	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964077
77	NC_009900	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964077
78	NC_009900	TTA	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
79	NC_009900	ATA	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
80	NC_009900	TAA	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
81	NC_009900	ATA	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
82	NC_009900	GAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964077
83	NC_009900	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964077
84	NC_009900	ATG	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964077
85	NC_009900	ATT	2	6	6008	6013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964077
86	NC_009900	CTA	3	9	6542	6550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964078
87	NC_009900	ATT	2	6	6589	6594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964078
88	NC_009900	TTC	2	6	6655	6660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964078
89	NC_009900	ATC	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964078
90	NC_009900	ATT	2	6	6860	6865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964078
91	NC_009900	TAC	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964078
92	NC_009900	ATT	2	6	6922	6927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964078
93	NC_009900	ATT	3	9	6973	6981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964078
94	NC_009900	CCG	2	6	7001	7006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964078
95	NC_009900	TAT	2	6	7047	7052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964078
96	NC_009900	TGA	2	6	7117	7122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964078
97	NC_009900	TAC	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964078
98	NC_009900	CAC	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157964078
99	NC_009900	GTA	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964078
100	NC_009900	AAC	2	6	7429	7434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964079
101	NC_009900	CTT	2	6	7506	7511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964079
102	NC_009900	TAG	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964079
103	NC_009900	AGC	2	6	7549	7554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964079
104	NC_009900	CTA	2	6	7695	7700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964079
105	NC_009900	ATA	3	9	7982	7990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964080
106	NC_009900	GCC	2	6	8029	8034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964080
107	NC_009900	ATA	2	6	8192	8197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964080
108	NC_009900	TAG	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964080
109	NC_009900	ATT	2	6	8320	8325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964080
110	NC_009900	ACG	2	6	8426	8431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964080
111	NC_009900	TCG	2	6	8432	8437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964080
112	NC_009900	TGT	2	6	8465	8470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964080
113	NC_009900	TAT	2	6	8535	8540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964080
114	NC_009900	TAA	2	6	8547	8552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964080
115	NC_009900	CAT	2	6	8553	8558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964080
116	NC_009900	CAA	2	6	8616	8621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964080
117	NC_009900	ATT	2	6	8633	8638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964080
118	NC_009900	AGC	3	9	8770	8778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964080
119	NC_009900	AGG	2	6	8893	8898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964080
120	NC_009900	TAC	2	6	8967	8972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964080
121	NC_009900	TAG	2	6	14457	14462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964081
122	NC_009900	TTA	2	6	14562	14567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964081
123	NC_009900	TAC	2	6	14568	14573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964081
124	NC_009900	TAT	3	9	14583	14591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964081
125	NC_009900	TAA	2	6	14640	14645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964081
126	NC_009900	TAA	2	6	14680	14685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964081
127	NC_009900	TTC	2	6	14713	14718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964081
128	NC_009900	TAT	2	6	14772	14777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964081
129	NC_009900	TAA	2	6	14838	14843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964081
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131	NC_009900	TCT	2	6	14948	14953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964081
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