MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 23966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009900	GAT	2	6	143391	143396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964172
2502	NC_009900	GCA	2	6	143404	143409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964172
2503	NC_009900	GATT	2	8	143484	143491	25 %	50 %	25 %	0 %	157964172
2504	NC_009900	TTA	2	6	143502	143507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964172
2505	NC_009900	TAA	2	6	143583	143588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964172
2506	NC_009900	T	6	6	143665	143670	0 %	100 %	0 %	0 %	157964172
2507	NC_009900	TTA	2	6	143705	143710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964172
2508	NC_009900	GCA	2	6	143716	143721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964172
2509	NC_009900	TTA	2	6	143765	143770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964172
2510	NC_009900	ATT	2	6	143774	143779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964172
2511	NC_009900	AT	3	6	143811	143816	50 %	50 %	0 %	0 %	157964172
2512	NC_009900	ATTC	2	8	143826	143833	25 %	50 %	0 %	25 %	157964172
2513	NC_009900	GTAT	2	8	143884	143891	25 %	50 %	25 %	0 %	157964172
2514	NC_009900	TAA	2	6	143939	143944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964172
2515	NC_009900	TATG	2	8	143946	143953	25 %	50 %	25 %	0 %	157964172
2516	NC_009900	CGG	2	6	144045	144050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964172
2517	NC_009900	TGT	2	6	144162	144167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964172
2518	NC_009900	T	6	6	144212	144217	0 %	100 %	0 %	0 %	157964172
2519	NC_009900	AAAG	2	8	144318	144325	75 %	0 %	25 %	0 %	157964172
2520	NC_009900	AGC	2	6	144327	144332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964172
2521	NC_009900	GCC	2	6	144369	144374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964172
2522	NC_009900	AGC	2	6	144419	144424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964172
2523	NC_009900	TTA	2	6	144484	144489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964173
2524	NC_009900	TAG	2	6	144512	144517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964173
2525	NC_009900	GCA	2	6	144541	144546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964173
2526	NC_009900	GCT	2	6	144581	144586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964173
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2528	NC_009900	TAATGC	2	12	144648	144659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157964173
2529	NC_009900	TAG	2	6	144755	144760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964173
2530	NC_009900	GGTC	2	8	144789	144796	0 %	25 %	50 %	25 %	157964173
2531	NC_009900	TA	3	6	144817	144822	50 %	50 %	0 %	0 %	157964173
2532	NC_009900	TC	3	6	144923	144928	0 %	50 %	0 %	50 %	157964173
2533	NC_009900	TAA	2	6	144929	144934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964173
2534	NC_009900	A	6	6	144942	144947	100 %	0 %	0 %	0 %	157964173
2535	NC_009900	AATG	2	8	144949	144956	50 %	25 %	25 %	0 %	157964173
2536	NC_009900	ACT	2	6	145090	145095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964173
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2538	NC_009900	GAT	2	6	145333	145338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964173
2539	NC_009900	GAC	2	6	145363	145368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964173
2540	NC_009900	ATT	2	6	145377	145382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964173
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2543	NC_009900	AAAGAT	2	12	145471	145482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157964173
2544	NC_009900	AGG	2	6	145572	145577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964173
2545	NC_009900	AT	3	6	145597	145602	50 %	50 %	0 %	0 %	157964173
2546	NC_009900	ATGA	2	8	145606	145613	50 %	25 %	25 %	0 %	157964173
2547	NC_009900	TGT	2	6	145665	145670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964173
2548	NC_009900	TAAAGA	2	12	145695	145706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157964173
2549	NC_009900	TA	3	6	145718	145723	50 %	50 %	0 %	0 %	157964173
2550	NC_009900	TA	4	8	145728	145735	50 %	50 %	0 %	0 %	157964173
2551	NC_009900	A	6	6	145760	145765	100 %	0 %	0 %	0 %	157964173
2552	NC_009900	TAG	2	6	145806	145811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964173
2553	NC_009900	GGA	2	6	145822	145827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964173
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2555	NC_009900	TA	3	6	146029	146034	50 %	50 %	0 %	0 %	157964173
2556	NC_009900	TAA	2	6	146061	146066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964173
2557	NC_009900	GCT	2	6	146194	146199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964173
2558	NC_009900	T	6	6	146260	146265	0 %	100 %	0 %	0 %	157964173
2559	NC_009900	TGA	2	6	146297	146302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964173
2560	NC_009900	T	6	6	146416	146421	0 %	100 %	0 %	0 %	157964173
2561	NC_009900	ATT	2	6	146464	146469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964173
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2602	NC_009900	GAAA	2	8	148285	148292	75 %	0 %	25 %	0 %	157964174
2603	NC_009900	TAAT	2	8	148400	148407	50 %	50 %	0 %	0 %	157964174
2604	NC_009900	TGCT	2	8	148443	148450	0 %	50 %	25 %	25 %	157964174
2605	NC_009900	GAT	2	6	148470	148475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964174
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2608	NC_009900	GCG	2	6	148571	148576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964174
2609	NC_009900	T	6	6	148713	148718	0 %	100 %	0 %	0 %	157964174
2610	NC_009900	GAT	2	6	148737	148742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964174
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2614	NC_009900	TAGT	2	8	148946	148953	25 %	50 %	25 %	0 %	157964174
2615	NC_009900	ATATA	2	10	148994	149003	60 %	40 %	0 %	0 %	157964174
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2617	NC_009900	TGCAG	2	10	149082	149091	20 %	20 %	40 %	20 %	157964174
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2994	NC_009900	ATGA	2	8	171386	171393	50 %	25 %	25 %	0 %	157964192
2995	NC_009900	A	6	6	171393	171398	100 %	0 %	0 %	0 %	157964192
2996	NC_009900	AGA	2	6	171433	171438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964192
2997	NC_009900	TTA	2	6	171503	171508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964192
2998	NC_009900	GAA	2	6	171569	171574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964192
2999	NC_009900	AAAT	2	8	171612	171619	75 %	25 %	0 %	0 %	157964192
3000	NC_009900	AAGA	2	8	171662	171669	75 %	0 %	25 %	0 %	157964192

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