MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 23966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009900	TGC	2	6	32439	32444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964092
502	NC_009900	CTT	2	6	32486	32491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964092
503	NC_009900	CATATA	2	12	32534	32545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157964092
504	NC_009900	GTTA	2	8	32628	32635	25 %	50 %	25 %	0 %	157964092
505	NC_009900	A	6	6	32682	32687	100 %	0 %	0 %	0 %	157964092
506	NC_009900	ATT	2	6	32697	32702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964092
507	NC_009900	TGA	2	6	32734	32739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964092
508	NC_009900	ATA	2	6	32741	32746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964092
509	NC_009900	AT	3	6	32782	32787	50 %	50 %	0 %	0 %	157964092
510	NC_009900	CTG	2	6	32828	32833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964092
511	NC_009900	GAT	2	6	32894	32899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964092
512	NC_009900	T	7	7	32899	32905	0 %	100 %	0 %	0 %	157964092
513	NC_009900	ATA	2	6	32993	32998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964092
514	NC_009900	TGA	2	6	33059	33064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964092
515	NC_009900	TAT	2	6	33176	33181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964092
516	NC_009900	CTT	2	6	33248	33253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964092
517	NC_009900	TCA	2	6	33310	33315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964092
518	NC_009900	T	6	6	33349	33354	0 %	100 %	0 %	0 %	157964092
519	NC_009900	T	7	7	33374	33380	0 %	100 %	0 %	0 %	157964092
520	NC_009900	TCA	2	6	33595	33600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964092
521	NC_009900	TTA	2	6	33610	33615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964092
522	NC_009900	A	6	6	34151	34156	100 %	0 %	0 %	0 %	157964093
523	NC_009900	GTC	2	6	34181	34186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964093
524	NC_009900	TTAG	2	8	34230	34237	25 %	50 %	25 %	0 %	157964093
525	NC_009900	ATT	2	6	34266	34271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964093
526	NC_009900	AGT	2	6	34383	34388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964093
527	NC_009900	GTT	2	6	34394	34399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964093
528	NC_009900	TAA	2	6	34423	34428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964093
529	NC_009900	TTC	2	6	34442	34447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964093
530	NC_009900	T	6	6	34459	34464	0 %	100 %	0 %	0 %	157964093
531	NC_009900	CAA	2	6	34468	34473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964093
532	NC_009900	TGC	2	6	34530	34535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964093
533	NC_009900	ATT	2	6	34559	34564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964093
534	NC_009900	AAT	2	6	34601	34606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964093
535	NC_009900	ATC	2	6	34619	34624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964093
536	NC_009900	TCT	2	6	34632	34637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964093
537	NC_009900	TC	3	6	34652	34657	0 %	50 %	0 %	50 %	157964093
538	NC_009900	ACTA	2	8	34679	34686	50 %	25 %	0 %	25 %	157964093
539	NC_009900	TCT	2	6	34736	34741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964093
540	NC_009900	ACTGCT	2	12	34745	34756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157964093
541	NC_009900	TTCC	2	8	34765	34772	0 %	50 %	0 %	50 %	157964093
542	NC_009900	ATT	2	6	34817	34822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964093
543	NC_009900	GGT	2	6	34880	34885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964093
544	NC_009900	TCT	2	6	34938	34943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964093
545	NC_009900	AT	3	6	34954	34959	50 %	50 %	0 %	0 %	157964093
546	NC_009900	ATT	2	6	35055	35060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964093
547	NC_009900	TAT	2	6	35065	35070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964093
548	NC_009900	AGT	2	6	37984	37989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964094
549	NC_009900	T	7	7	38009	38015	0 %	100 %	0 %	0 %	157964094
550	NC_009900	T	6	6	38040	38045	0 %	100 %	0 %	0 %	157964094
551	NC_009900	GCC	2	6	38085	38090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964094
552	NC_009900	TAA	2	6	38217	38222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964094
553	NC_009900	TTA	2	6	38290	38295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964094
554	NC_009900	AAT	2	6	38330	38335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964094
555	NC_009900	TAA	2	6	38430	38435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964094
556	NC_009900	AGCA	2	8	38487	38494	50 %	0 %	25 %	25 %	157964094
557	NC_009900	TTC	2	6	38517	38522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964094
558	NC_009900	TTC	2	6	38535	38540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964094
559	NC_009900	T	7	7	38621	38627	0 %	100 %	0 %	0 %	157964094
560	NC_009900	ATT	2	6	38646	38651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964094
561	NC_009900	ATA	2	6	41698	41703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964095
562	NC_009900	TAT	2	6	41717	41722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964095
563	NC_009900	ATA	2	6	41757	41762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964095
564	NC_009900	TTC	2	6	41774	41779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964095
565	NC_009900	AAG	2	6	41863	41868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964095
566	NC_009900	GAAA	2	8	41869	41876	75 %	0 %	25 %	0 %	157964095
567	NC_009900	ATTT	2	8	41913	41920	25 %	75 %	0 %	0 %	157964095
568	NC_009900	TAC	2	6	41924	41929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964095
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570	NC_009900	TAT	2	6	41972	41977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964095
571	NC_009900	GAA	2	6	41987	41992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964095
572	NC_009900	AGT	2	6	42011	42016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964095
573	NC_009900	TTA	2	6	42019	42024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964095
574	NC_009900	A	7	7	42059	42065	100 %	0 %	0 %	0 %	157964095
575	NC_009900	A	6	6	42073	42078	100 %	0 %	0 %	0 %	157964095
576	NC_009900	GAT	2	6	42081	42086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964095
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579	NC_009900	ACA	2	6	42200	42205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964095
580	NC_009900	ATT	2	6	42253	42258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964095
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582	NC_009900	TCA	2	6	42329	42334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964096
583	NC_009900	AAAT	2	8	42387	42394	75 %	25 %	0 %	0 %	157964096
584	NC_009900	TTA	2	6	42398	42403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964096
585	NC_009900	TTC	3	9	42436	42444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964096
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587	NC_009900	AAT	2	6	42569	42574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964096
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591	NC_009900	AT	3	6	42640	42645	50 %	50 %	0 %	0 %	157964096
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594	NC_009900	A	6	6	42688	42693	100 %	0 %	0 %	0 %	157964096
595	NC_009900	CTT	2	6	42747	42752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964096
596	NC_009900	GT	3	6	42755	42760	0 %	50 %	50 %	0 %	157964096
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599	NC_009900	T	6	6	42941	42946	0 %	100 %	0 %	0 %	157964097
600	NC_009900	TAT	2	6	42964	42969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964097
601	NC_009900	TTA	2	6	43035	43040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964097
602	NC_009900	T	6	6	43060	43065	0 %	100 %	0 %	0 %	157964097
603	NC_009900	AT	3	6	43072	43077	50 %	50 %	0 %	0 %	157964097
604	NC_009900	AT	3	6	43096	43101	50 %	50 %	0 %	0 %	157964097
605	NC_009900	AAT	2	6	43120	43125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964097
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608	NC_009900	GTA	2	6	43349	43354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964097
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611	NC_009900	AAT	2	6	43496	43501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964097
612	NC_009900	CT	3	6	43510	43515	0 %	50 %	0 %	50 %	157964097
613	NC_009900	GAT	2	6	43538	43543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964097
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615	NC_009900	AGAAA	2	10	47016	47025	80 %	0 %	20 %	0 %	157964098
616	NC_009900	AAG	2	6	47093	47098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964098
617	NC_009900	AT	3	6	47115	47120	50 %	50 %	0 %	0 %	157964098
618	NC_009900	TTG	2	6	47175	47180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964098
619	NC_009900	CTT	2	6	47216	47221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964098
620	NC_009900	TTTTTA	2	12	47233	47244	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	157964098
621	NC_009900	AT	3	6	47311	47316	50 %	50 %	0 %	0 %	157964098
622	NC_009900	ATT	2	6	47349	47354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964098
623	NC_009900	TA	4	8	47384	47391	50 %	50 %	0 %	0 %	157964098
624	NC_009900	GTTTC	2	10	47456	47465	0 %	60 %	20 %	20 %	157964098
625	NC_009900	TAT	2	6	47526	47531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964098
626	NC_009900	T	6	6	47536	47541	0 %	100 %	0 %	0 %	157964098
627	NC_009900	TGCC	2	8	47605	47612	0 %	25 %	25 %	50 %	157964098
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