MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 23966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009900	A	6	6	316593	316598	100 %	0 %	0 %	0 %	157964291
5502	NC_009900	TAT	2	6	316599	316604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964291
5503	NC_009900	TAA	2	6	316611	316616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964291
5504	NC_009900	ACA	2	6	316687	316692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964291
5505	NC_009900	GCA	2	6	316772	316777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964291
5506	NC_009900	GCT	2	6	316793	316798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964291
5507	NC_009900	A	7	7	316816	316822	100 %	0 %	0 %	0 %	157964291
5508	NC_009900	TTA	2	6	316830	316835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964291
5509	NC_009900	AGA	2	6	316916	316921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964291
5510	NC_009900	GCT	2	6	316922	316927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964291
5511	NC_009900	ATT	2	6	317005	317010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964291
5512	NC_009900	AAGT	2	8	317016	317023	50 %	25 %	25 %	0 %	157964291
5513	NC_009900	AC	3	6	317045	317050	50 %	0 %	0 %	50 %	157964291
5514	NC_009900	GAT	2	6	317063	317068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964291
5515	NC_009900	ATA	2	6	317082	317087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964291
5516	NC_009900	TAC	3	9	317095	317103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964291
5517	NC_009900	GAGG	2	8	317132	317139	25 %	0 %	75 %	0 %	157964291
5518	NC_009900	GGGA	2	8	317244	317251	25 %	0 %	75 %	0 %	157964291
5519	NC_009900	AGC	2	6	317257	317262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964291
5520	NC_009900	TTG	2	6	317274	317279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964291
5521	NC_009900	TGC	2	6	317299	317304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964291
5522	NC_009900	ATG	2	6	317316	317321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964291
5523	NC_009900	GAA	2	6	317378	317383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964291
5524	NC_009900	GAA	2	6	317516	317521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964291
5525	NC_009900	AGA	2	6	317603	317608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964292
5526	NC_009900	TAA	2	6	317632	317637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964292
5527	NC_009900	GAA	3	9	317706	317714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964292
5528	NC_009900	CTG	2	6	317734	317739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964292
5529	NC_009900	AGGT	2	8	317743	317750	25 %	25 %	50 %	0 %	157964292
5530	NC_009900	ATA	3	9	317797	317805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964292
5531	NC_009900	GAA	2	6	317826	317831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964292
5532	NC_009900	GCTTG	2	10	317865	317874	0 %	40 %	40 %	20 %	157964292
5533	NC_009900	TAG	2	6	317905	317910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964292
5534	NC_009900	AAAT	2	8	318144	318151	75 %	25 %	0 %	0 %	157964293
5535	NC_009900	TAA	2	6	318156	318161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964293
5536	NC_009900	TAAA	2	8	318174	318181	75 %	25 %	0 %	0 %	157964293
5537	NC_009900	ATT	2	6	318193	318198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964293
5538	NC_009900	T	6	6	318197	318202	0 %	100 %	0 %	0 %	157964293
5539	NC_009900	TTA	2	6	318212	318217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964293
5540	NC_009900	GCC	2	6	318253	318258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964293
5541	NC_009900	T	7	7	318322	318328	0 %	100 %	0 %	0 %	157964293
5542	NC_009900	T	6	6	318344	318349	0 %	100 %	0 %	0 %	157964293
5543	NC_009900	A	6	6	318358	318363	100 %	0 %	0 %	0 %	157964293
5544	NC_009900	AGC	2	6	318403	318408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964293
5545	NC_009900	AAG	2	6	318414	318419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964293
5546	NC_009900	AGCT	2	8	318426	318433	25 %	25 %	25 %	25 %	157964293
5547	NC_009900	AGT	2	6	318542	318547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964293
5548	NC_009900	GAA	2	6	318659	318664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964293
5549	NC_009900	AT	3	6	318800	318805	50 %	50 %	0 %	0 %	157964293
5550	NC_009900	ACCA	2	8	318808	318815	50 %	0 %	0 %	50 %	157964293
5551	NC_009900	GCC	2	6	318820	318825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964293
5552	NC_009900	CCT	2	6	318854	318859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157964293
5553	NC_009900	TAA	2	6	318865	318870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964293
5554	NC_009900	GAA	2	6	318875	318880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964293
5555	NC_009900	CCG	2	6	318947	318952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964293
5556	NC_009900	TAC	2	6	318964	318969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964293
5557	NC_009900	ACA	2	6	318986	318991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964293
5558	NC_009900	CCT	2	6	318995	319000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157964293
5559	NC_009900	TAC	2	6	319093	319098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964293
5560	NC_009900	AGT	2	6	319108	319113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964293
5561	NC_009900	TTC	2	6	319126	319131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964293
5562	NC_009900	A	6	6	319174	319179	100 %	0 %	0 %	0 %	157964293
5563	NC_009900	GTT	2	6	319208	319213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964293
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5565	NC_009900	AAT	2	6	319274	319279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964293
5566	NC_009900	ATA	2	6	319332	319337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964293
5567	NC_009900	AAT	2	6	319343	319348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964293
5568	NC_009900	TGA	3	9	319408	319416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964293
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5570	NC_009900	AAG	2	6	319497	319502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964293
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5572	NC_009900	AG	3	6	319537	319542	50 %	0 %	50 %	0 %	157964293
5573	NC_009900	TTA	2	6	319545	319550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964293
5574	NC_009900	ATGATA	2	12	319554	319565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157964293
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5576	NC_009900	AAGA	2	8	319574	319581	75 %	0 %	25 %	0 %	157964293
5577	NC_009900	ATCT	2	8	319593	319600	25 %	50 %	0 %	25 %	157964293
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5580	NC_009900	TGCG	2	8	319659	319666	0 %	25 %	50 %	25 %	157964293
5581	NC_009900	AAT	2	6	319799	319804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964293
5582	NC_009900	AT	3	6	320097	320102	50 %	50 %	0 %	0 %	157964294
5583	NC_009900	AAAGA	2	10	320125	320134	80 %	0 %	20 %	0 %	157964294
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5587	NC_009900	CAT	2	6	320332	320337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964294
5588	NC_009900	ATC	3	9	320384	320392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964294
5589	NC_009900	ACT	2	6	320431	320436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964294
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5592	NC_009900	GTA	2	6	320509	320514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964294
5593	NC_009900	TA	3	6	320564	320569	50 %	50 %	0 %	0 %	157964294
5594	NC_009900	GAA	2	6	320614	320619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964294
5595	NC_009900	GAAGTA	2	12	320770	320781	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157964294
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5603	NC_009900	GTAA	2	8	321199	321206	50 %	25 %	25 %	0 %	157964294
5604	NC_009900	ATA	2	6	321220	321225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964294
5605	NC_009900	TAG	2	6	321249	321254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964294
5606	NC_009900	CTA	2	6	321269	321274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964294
5607	NC_009900	A	7	7	321329	321335	100 %	0 %	0 %	0 %	157964294
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5610	NC_009900	A	6	6	321610	321615	100 %	0 %	0 %	0 %	157964294
5611	NC_009900	A	6	6	321632	321637	100 %	0 %	0 %	0 %	157964294
5612	NC_009900	ATT	2	6	321640	321645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964294
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5614	NC_009900	T	8	8	321700	321707	0 %	100 %	0 %	0 %	157964294
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