MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 2736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009881	TAAT	2	8	587	594	50 %	50 %	0 %	0 %	157825126
2	NC_009881	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	157825126
3	NC_009881	ATTA	2	8	976	983	50 %	50 %	0 %	0 %	157825127
4	NC_009881	TTAT	2	8	2677	2684	25 %	75 %	0 %	0 %	157825129
5	NC_009881	CATT	2	8	2845	2852	25 %	50 %	0 %	25 %	157825129
6	NC_009881	TTAT	2	8	2899	2906	25 %	75 %	0 %	0 %	157825129
7	NC_009881	CTAA	2	8	3284	3291	50 %	25 %	0 %	25 %	157825130
8	NC_009881	TATT	2	8	3670	3677	25 %	75 %	0 %	0 %	157825130
9	NC_009881	AAAT	2	8	5104	5111	75 %	25 %	0 %	0 %	157825130
10	NC_009881	AATA	2	8	5293	5300	75 %	25 %	0 %	0 %	157825130
11	NC_009881	ACCT	2	8	6378	6385	25 %	25 %	0 %	50 %	157825131
12	NC_009881	ACTT	2	8	6853	6860	25 %	50 %	0 %	25 %	157825133
13	NC_009881	ATTT	2	8	7260	7267	25 %	75 %	0 %	0 %	157825134
14	NC_009881	CCTG	2	8	7718	7725	0 %	25 %	25 %	50 %	157825135
15	NC_009881	AAAT	2	8	8979	8986	75 %	25 %	0 %	0 %	157825136
16	NC_009881	ATGG	2	8	9225	9232	25 %	25 %	50 %	0 %	157825136
17	NC_009881	CTTC	2	8	10759	10766	0 %	50 %	0 %	50 %	157825138
18	NC_009881	CTGT	2	8	11030	11037	0 %	50 %	25 %	25 %	157825138
19	NC_009881	GATT	2	8	11390	11397	25 %	50 %	25 %	0 %	157825138
20	NC_009881	CTCA	2	8	11826	11833	25 %	25 %	0 %	50 %	157825138
21	NC_009881	AGCA	2	8	11934	11941	50 %	0 %	25 %	25 %	157825138
22	NC_009881	ATAA	2	8	12016	12023	75 %	25 %	0 %	0 %	157825138
23	NC_009881	TTTA	2	8	12639	12646	25 %	75 %	0 %	0 %	157825138
24	NC_009881	TAAA	2	8	14266	14273	75 %	25 %	0 %	0 %	157825140
25	NC_009881	AGCA	2	8	14372	14379	50 %	0 %	25 %	25 %	157825140
26	NC_009881	AGAT	2	8	14533	14540	50 %	25 %	25 %	0 %	157825141
27	NC_009881	TGCT	2	8	15273	15280	0 %	50 %	25 %	25 %	157825142
28	NC_009881	ATTT	2	8	15836	15843	25 %	75 %	0 %	0 %	157825143
29	NC_009881	AATG	2	8	15858	15865	50 %	25 %	25 %	0 %	157825143
30	NC_009881	GATA	2	8	16240	16247	50 %	25 %	25 %	0 %	157825144
31	NC_009881	AAGA	2	8	16454	16461	75 %	0 %	25 %	0 %	157825144
32	NC_009881	TGGC	2	8	16717	16724	0 %	25 %	50 %	25 %	157825144
33	NC_009881	TGAT	2	8	17109	17116	25 %	50 %	25 %	0 %	157825144
34	NC_009881	CTAT	2	8	17677	17684	25 %	50 %	0 %	25 %	157825145
35	NC_009881	TATT	2	8	17966	17973	25 %	75 %	0 %	0 %	157825146
36	NC_009881	AAAT	2	8	17995	18002	75 %	25 %	0 %	0 %	157825146
37	NC_009881	AAAT	2	8	18890	18897	75 %	25 %	0 %	0 %	157825148
38	NC_009881	ACAT	2	8	19048	19055	50 %	25 %	0 %	25 %	157825148
39	NC_009881	TTCA	2	8	19428	19435	25 %	50 %	0 %	25 %	157825149
40	NC_009881	GCAC	2	8	20146	20153	25 %	0 %	25 %	50 %	157825150
41	NC_009881	TGCT	2	8	20402	20409	0 %	50 %	25 %	25 %	157825151
42	NC_009881	TGCT	2	8	20624	20631	0 %	50 %	25 %	25 %	157825152
43	NC_009881	ATAA	2	8	21476	21483	75 %	25 %	0 %	0 %	157825154
44	NC_009881	GTAA	2	8	21572	21579	50 %	25 %	25 %	0 %	157825154
45	NC_009881	TGCT	2	8	22350	22357	0 %	50 %	25 %	25 %	157825155
46	NC_009881	TTTA	2	8	23011	23018	25 %	75 %	0 %	0 %	157825156
47	NC_009881	AGAA	2	8	23449	23456	75 %	0 %	25 %	0 %	157825156
48	NC_009881	TGGT	2	8	23462	23469	0 %	50 %	50 %	0 %	157825156
49	NC_009881	ATTT	2	8	23488	23495	25 %	75 %	0 %	0 %	157825156
50	NC_009881	GTTT	2	8	23694	23701	0 %	75 %	25 %	0 %	157825157
51	NC_009881	ATAA	2	8	23961	23968	75 %	25 %	0 %	0 %	157825157
52	NC_009881	TTTC	2	8	24003	24010	0 %	75 %	0 %	25 %	157825157
53	NC_009881	TTAA	2	8	24734	24741	50 %	50 %	0 %	0 %	157825159
54	NC_009881	TGCT	2	8	26864	26871	0 %	50 %	25 %	25 %	157825162
55	NC_009881	TGTT	2	8	27584	27591	0 %	75 %	25 %	0 %	157825163
56	NC_009881	TTAC	2	8	28305	28312	25 %	50 %	0 %	25 %	157825164
57	NC_009881	ATAA	2	8	28317	28324	75 %	25 %	0 %	0 %	157825164
58	NC_009881	GGAA	2	8	29631	29638	50 %	0 %	50 %	0 %	157825165
59	NC_009881	AGTT	2	8	29714	29721	25 %	50 %	25 %	0 %	157825165
60	NC_009881	CATG	2	8	29739	29746	25 %	25 %	25 %	25 %	157825165
61	NC_009881	CTAA	2	8	30166	30173	50 %	25 %	0 %	25 %	157825165
62	NC_009881	CTGG	2	8	31048	31055	0 %	25 %	50 %	25 %	157825166
63	NC_009881	ACAT	2	8	31486	31493	50 %	25 %	0 %	25 %	157825166
64	NC_009881	TAAC	2	8	31582	31589	50 %	25 %	0 %	25 %	157825166
65	NC_009881	CATT	2	8	31798	31805	25 %	50 %	0 %	25 %	157825166
66	NC_009881	GCGA	2	8	32216	32223	25 %	0 %	50 %	25 %	157825167
67	NC_009881	AACT	2	8	32432	32439	50 %	25 %	0 %	25 %	157825168
68	NC_009881	AATA	2	8	33783	33790	75 %	25 %	0 %	0 %	157825169
69	NC_009881	AGAA	2	8	34018	34025	75 %	0 %	25 %	0 %	157825169
70	NC_009881	AAGT	2	8	34640	34647	50 %	25 %	25 %	0 %	157825171
71	NC_009881	TGTA	2	8	35158	35165	25 %	50 %	25 %	0 %	157825171
72	NC_009881	AGAC	2	8	35753	35760	50 %	0 %	25 %	25 %	157825173
73	NC_009881	TAAA	2	8	35817	35824	75 %	25 %	0 %	0 %	157825173
74	NC_009881	ATAG	2	8	35861	35868	50 %	25 %	25 %	0 %	157825173
75	NC_009881	AAGA	2	8	35917	35924	75 %	0 %	25 %	0 %	157825173
76	NC_009881	GCAA	2	8	36448	36455	50 %	0 %	25 %	25 %	157825174
77	NC_009881	AAAT	2	8	37631	37638	75 %	25 %	0 %	0 %	157825176
78	NC_009881	TTTA	2	8	38074	38081	25 %	75 %	0 %	0 %	157825177
79	NC_009881	TATT	2	8	38220	38227	25 %	75 %	0 %	0 %	157825177
80	NC_009881	TGAA	2	8	38713	38720	50 %	25 %	25 %	0 %	157825177
81	NC_009881	CTCG	2	8	39406	39413	0 %	25 %	25 %	50 %	157825177
82	NC_009881	TTGT	2	8	39597	39604	0 %	75 %	25 %	0 %	157825177
83	NC_009881	TGAA	2	8	40258	40265	50 %	25 %	25 %	0 %	157825177
84	NC_009881	ATCC	2	8	40470	40477	25 %	25 %	0 %	50 %	157825177
85	NC_009881	CTTT	2	8	41400	41407	0 %	75 %	0 %	25 %	157825177
86	NC_009881	CTGT	2	8	41727	41734	0 %	50 %	25 %	25 %	157825177
87	NC_009881	TTTA	2	8	42370	42377	25 %	75 %	0 %	0 %	157825177
88	NC_009881	TTTA	2	8	43335	43342	25 %	75 %	0 %	0 %	157825178
89	NC_009881	TTTA	2	8	43698	43705	25 %	75 %	0 %	0 %	157825178
90	NC_009881	TGCT	2	8	44211	44218	0 %	50 %	25 %	25 %	157825179
91	NC_009881	TACA	2	8	44796	44803	50 %	25 %	0 %	25 %	157825180
92	NC_009881	TAAA	2	8	44850	44857	75 %	25 %	0 %	0 %	157825180
93	NC_009881	CAAG	2	8	44864	44871	50 %	0 %	25 %	25 %	157825180
94	NC_009881	TAGA	2	8	45255	45262	50 %	25 %	25 %	0 %	157825180
95	NC_009881	TTAC	2	8	45274	45281	25 %	50 %	0 %	25 %	157825180
96	NC_009881	AATT	2	8	46292	46299	50 %	50 %	0 %	0 %	157825181
97	NC_009881	AAGC	2	8	46494	46501	50 %	0 %	25 %	25 %	157825181
98	NC_009881	AAGC	2	8	46641	46648	50 %	0 %	25 %	25 %	157825181
99	NC_009881	TTAA	2	8	46657	46664	50 %	50 %	0 %	0 %	157825181
100	NC_009881	ATTC	2	8	46777	46784	25 %	50 %	0 %	25 %	157825181
101	NC_009881	CTAT	2	8	47047	47054	25 %	50 %	0 %	25 %	157825182
102	NC_009881	AAAC	2	8	47213	47220	75 %	0 %	0 %	25 %	157825182
103	NC_009881	TATT	2	8	47510	47517	25 %	75 %	0 %	0 %	157825183
104	NC_009881	GAAA	2	8	47812	47819	75 %	0 %	25 %	0 %	157825184
105	NC_009881	ATGA	2	8	47947	47954	50 %	25 %	25 %	0 %	157825184
106	NC_009881	TATT	2	8	48225	48232	25 %	75 %	0 %	0 %	157825184
107	NC_009881	TTTC	2	8	48770	48777	0 %	75 %	0 %	25 %	157825185
108	NC_009881	CATG	2	8	49326	49333	25 %	25 %	25 %	25 %	157825185
109	NC_009881	AGCA	2	8	49468	49475	50 %	0 %	25 %	25 %	157825185
110	NC_009881	AACT	2	8	50374	50381	50 %	25 %	0 %	25 %	157825186
111	NC_009881	GTTT	2	8	52298	52305	0 %	75 %	25 %	0 %	157825189
112	NC_009881	AGAA	2	8	52550	52557	75 %	0 %	25 %	0 %	157825189
113	NC_009881	AAAG	2	8	52930	52937	75 %	0 %	25 %	0 %	157825190
114	NC_009881	TAAA	2	8	52997	53004	75 %	25 %	0 %	0 %	157825190
115	NC_009881	AAGA	2	8	54057	54064	75 %	0 %	25 %	0 %	157825192
116	NC_009881	AGTC	2	8	54292	54299	25 %	25 %	25 %	25 %	157825192
117	NC_009881	TAAT	2	8	54564	54571	50 %	50 %	0 %	0 %	157825192
118	NC_009881	ATTA	2	8	54640	54647	50 %	50 %	0 %	0 %	157825192
119	NC_009881	TTAT	2	8	54835	54842	25 %	75 %	0 %	0 %	157825192
120	NC_009881	TTTA	2	8	54925	54932	25 %	75 %	0 %	0 %	157825192
121	NC_009881	GAAT	2	8	55414	55421	50 %	25 %	25 %	0 %	157825193
122	NC_009881	CAAG	2	8	55645	55652	50 %	0 %	25 %	25 %	157825193
123	NC_009881	ATGG	2	8	55968	55975	25 %	25 %	50 %	0 %	157825193
124	NC_009881	TATG	2	8	56696	56703	25 %	50 %	25 %	0 %	157825193
125	NC_009881	ACTT	2	8	56887	56894	25 %	50 %	0 %	25 %	157825193
126	NC_009881	TTAA	2	8	58926	58933	50 %	50 %	0 %	0 %	157825197
127	NC_009881	GGAA	2	8	58982	58989	50 %	0 %	50 %	0 %	157825197
128	NC_009881	TGCT	2	8	59261	59268	0 %	50 %	25 %	25 %	157825197
129	NC_009881	TGCT	2	8	60032	60039	0 %	50 %	25 %	25 %	157825199
130	NC_009881	TTGC	2	8	60113	60120	0 %	50 %	25 %	25 %	157825199
131	NC_009881	GCCA	2	8	60944	60951	25 %	0 %	25 %	50 %	157825199
132	NC_009881	TAAT	2	8	61039	61046	50 %	50 %	0 %	0 %	157825199
133	NC_009881	TTTG	2	8	61717	61724	0 %	75 %	25 %	0 %	157825200
134	NC_009881	TAGA	2	8	61792	61799	50 %	25 %	25 %	0 %	157825200
135	NC_009881	TGTT	2	8	62127	62134	0 %	75 %	25 %	0 %	157825201
136	NC_009881	TTAT	2	8	62263	62270	25 %	75 %	0 %	0 %	157825201
137	NC_009881	AACA	2	8	62986	62993	75 %	0 %	0 %	25 %	157825201
138	NC_009881	GAAT	2	8	63368	63375	50 %	25 %	25 %	0 %	157825202
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