MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009881	ATCT	2	8	195197	195204	25 %	50 %	0 %	25 %	157825322
4003	NC_009881	ATCT	2	8	195287	195294	25 %	50 %	0 %	25 %	157825322
4004	NC_009881	TCC	2	6	195332	195337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825322
4005	NC_009881	T	6	6	195338	195343	0 %	100 %	0 %	0 %	157825322
4006	NC_009881	TTAA	2	8	195387	195394	50 %	50 %	0 %	0 %	157825322
4007	NC_009881	TTTG	2	8	195402	195409	0 %	75 %	25 %	0 %	157825322
4008	NC_009881	TCA	2	6	195414	195419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825322
4009	NC_009881	TCC	2	6	195431	195436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825322
4010	NC_009881	ATGT	2	8	195511	195518	25 %	50 %	25 %	0 %	157825322
4011	NC_009881	CAA	2	6	195520	195525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825322
4012	NC_009881	TTC	2	6	195545	195550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825322
4013	NC_009881	T	6	6	195554	195559	0 %	100 %	0 %	0 %	157825322
4014	NC_009881	ATAC	2	8	195562	195569	50 %	25 %	0 %	25 %	157825322
4015	NC_009881	CTG	3	9	195595	195603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825322
4016	NC_009881	TCA	2	6	195606	195611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825322
4017	NC_009881	T	7	7	195628	195634	0 %	100 %	0 %	0 %	157825322
4018	NC_009881	TCT	2	6	195652	195657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825322
4019	NC_009881	ATA	2	6	195748	195753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825322
4020	NC_009881	GCG	2	6	195790	195795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825322
4021	NC_009881	TCC	2	6	195810	195815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825322
4022	NC_009881	TGAA	2	8	196091	196098	50 %	25 %	25 %	0 %	157825323
4023	NC_009881	ATC	2	6	196101	196106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825323
4024	NC_009881	TAG	2	6	196121	196126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
4025	NC_009881	TGA	2	6	196134	196139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
4026	NC_009881	CAA	2	6	196177	196182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825323
4027	NC_009881	AGGTG	2	10	196275	196284	20 %	20 %	60 %	0 %	157825323
4028	NC_009881	ATA	2	6	196294	196299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825323
4029	NC_009881	GAA	2	6	196315	196320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825323
4030	NC_009881	CTA	2	6	196391	196396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825323
4031	NC_009881	TAG	2	6	196422	196427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
4032	NC_009881	CTT	2	6	196478	196483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825323
4033	NC_009881	AAG	2	6	196514	196519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825323
4034	NC_009881	ATA	2	6	196559	196564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825323
4035	NC_009881	ATT	2	6	196581	196586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825323
4036	NC_009881	A	6	6	196594	196599	100 %	0 %	0 %	0 %	157825323
4037	NC_009881	T	6	6	196618	196623	0 %	100 %	0 %	0 %	157825323
4038	NC_009881	AT	3	6	196631	196636	50 %	50 %	0 %	0 %	157825323
4039	NC_009881	GATGTT	2	12	196714	196725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	157825323
4040	NC_009881	TAG	2	6	196805	196810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
4041	NC_009881	GGC	2	6	196825	196830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825323
4042	NC_009881	ATT	2	6	196846	196851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825323
4043	NC_009881	TGGT	2	8	196856	196863	0 %	50 %	50 %	0 %	157825323
4044	NC_009881	GCA	2	6	196948	196953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825323
4045	NC_009881	ACT	2	6	197071	197076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825323
4046	NC_009881	GTA	2	6	197225	197230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
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4049	NC_009881	TAA	2	6	197276	197281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825323
4050	NC_009881	AAG	2	6	197291	197296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825323
4051	NC_009881	ATG	2	6	197327	197332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825323
4052	NC_009881	GCT	2	6	197395	197400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825323
4053	NC_009881	TGC	2	6	197412	197417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825323
4054	NC_009881	TAA	2	6	197490	197495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825323
4055	NC_009881	AT	3	6	197565	197570	50 %	50 %	0 %	0 %	157825323
4056	NC_009881	AATA	2	8	197763	197770	75 %	25 %	0 %	0 %	157825324
4057	NC_009881	TA	3	6	197776	197781	50 %	50 %	0 %	0 %	157825324
4058	NC_009881	CTG	2	6	197823	197828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825324
4059	NC_009881	ATA	2	6	197839	197844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825324
4060	NC_009881	GTA	2	6	197869	197874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825324
4061	NC_009881	CAAGG	2	10	197891	197900	40 %	0 %	40 %	20 %	157825324
4062	NC_009881	TA	3	6	197933	197938	50 %	50 %	0 %	0 %	157825324
4063	NC_009881	CAA	2	6	197941	197946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825324
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4069	NC_009881	TGAT	2	8	198065	198072	25 %	50 %	25 %	0 %	157825324
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4071	NC_009881	AAT	2	6	198174	198179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825324
4072	NC_009881	ATG	2	6	198188	198193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825324
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4078	NC_009881	AT	3	6	198403	198408	50 %	50 %	0 %	0 %	157825324
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4087	NC_009881	GTA	2	6	198825	198830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825325
4088	NC_009881	GTA	2	6	198867	198872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825325
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4090	NC_009881	GTTA	2	8	198907	198914	25 %	50 %	25 %	0 %	157825325
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4102	NC_009881	TTA	2	6	199494	199499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825326
4103	NC_009881	T	6	6	199543	199548	0 %	100 %	0 %	0 %	157825326
4104	NC_009881	ATA	3	9	199572	199580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825326
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4106	NC_009881	TGA	2	6	199620	199625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825326
4107	NC_009881	AGAT	2	8	199837	199844	50 %	25 %	25 %	0 %	157825326
4108	NC_009881	ATTT	2	8	199932	199939	25 %	75 %	0 %	0 %	157825326
4109	NC_009881	TCGT	2	8	199977	199984	0 %	50 %	25 %	25 %	157825326
4110	NC_009881	TAT	2	6	200044	200049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825326
4111	NC_009881	GTGC	2	8	200126	200133	0 %	25 %	50 %	25 %	157825326
4112	NC_009881	TTC	2	6	200171	200176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825326
4113	NC_009881	GCA	2	6	200284	200289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825326
4114	NC_009881	T	6	6	200339	200344	0 %	100 %	0 %	0 %	157825326
4115	NC_009881	A	6	6	200354	200359	100 %	0 %	0 %	0 %	157825326
4116	NC_009881	GAA	2	6	200480	200485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825326
4117	NC_009881	GATT	2	8	200494	200501	25 %	50 %	25 %	0 %	157825326
4118	NC_009881	GGT	2	6	200531	200536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825326
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4121	NC_009881	TTGT	2	8	200604	200611	0 %	75 %	25 %	0 %	157825326
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4253	NC_009881	CTA	2	6	206743	206748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825332
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4493	NC_009881	CTTT	2	8	220325	220332	0 %	75 %	0 %	25 %	157825345
4494	NC_009881	TAA	2	6	220435	220440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825345
4495	NC_009881	TAC	2	6	220503	220508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825345
4496	NC_009881	TA	3	6	220528	220533	50 %	50 %	0 %	0 %	157825345
4497	NC_009881	CTA	2	6	220551	220556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825345
4498	NC_009881	AGT	2	6	220567	220572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825345
4499	NC_009881	AGA	2	6	220662	220667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825345
4500	NC_009881	AAT	2	6	220684	220689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825346

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