MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009881	ACTA	2	8	171638	171645	50 %	25 %	0 %	25 %	157825302
3502	NC_009881	TAA	2	6	171664	171669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825302
3503	NC_009881	ATA	2	6	171690	171695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825302
3504	NC_009881	GCTAA	2	10	171707	171716	40 %	20 %	20 %	20 %	157825302
3505	NC_009881	CT	3	6	171744	171749	0 %	50 %	0 %	50 %	157825302
3506	NC_009881	ATAG	2	8	171755	171762	50 %	25 %	25 %	0 %	157825302
3507	NC_009881	TGA	2	6	171763	171768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825302
3508	NC_009881	TTG	2	6	171780	171785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825302
3509	NC_009881	ATG	2	6	171801	171806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825302
3510	NC_009881	GGT	2	6	171857	171862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825302
3511	NC_009881	TAT	2	6	171877	171882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825302
3512	NC_009881	TGC	2	6	171949	171954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825302
3513	NC_009881	TAA	2	6	171958	171963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825302
3514	NC_009881	CGG	2	6	171973	171978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825302
3515	NC_009881	T	6	6	172026	172031	0 %	100 %	0 %	0 %	157825302
3516	NC_009881	CAC	2	6	172032	172037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825302
3517	NC_009881	ATAGGT	2	12	172049	172060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825302
3518	NC_009881	AAGA	2	8	172106	172113	75 %	0 %	25 %	0 %	157825302
3519	NC_009881	AGTA	2	8	172120	172127	50 %	25 %	25 %	0 %	157825302
3520	NC_009881	GT	3	6	172203	172208	0 %	50 %	50 %	0 %	157825302
3521	NC_009881	TAG	2	6	172209	172214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825302
3522	NC_009881	AAG	2	6	172224	172229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825302
3523	NC_009881	ATA	3	9	172268	172276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825302
3524	NC_009881	A	6	6	172307	172312	100 %	0 %	0 %	0 %	157825302
3525	NC_009881	ATT	2	6	172322	172327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825302
3526	NC_009881	AAG	2	6	172347	172352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825302
3527	NC_009881	TAC	2	6	172365	172370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825302
3528	NC_009881	A	6	6	172376	172381	100 %	0 %	0 %	0 %	157825302
3529	NC_009881	GAA	2	6	172418	172423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825302
3530	NC_009881	AGA	2	6	172441	172446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825302
3531	NC_009881	AGA	2	6	172456	172461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825302
3532	NC_009881	AACA	2	8	172465	172472	75 %	0 %	0 %	25 %	157825302
3533	NC_009881	AAG	2	6	172473	172478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825302
3534	NC_009881	ATA	2	6	172503	172508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825302
3535	NC_009881	A	7	7	172540	172546	100 %	0 %	0 %	0 %	157825302
3536	NC_009881	AGA	2	6	172597	172602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825302
3537	NC_009881	AGT	2	6	172604	172609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825302
3538	NC_009881	TAAG	2	8	172662	172669	50 %	25 %	25 %	0 %	157825302
3539	NC_009881	AGA	2	6	172672	172677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825302
3540	NC_009881	A	6	6	172694	172699	100 %	0 %	0 %	0 %	157825302
3541	NC_009881	TTGA	2	8	172724	172731	25 %	50 %	25 %	0 %	157825302
3542	NC_009881	GT	3	6	172746	172751	0 %	50 %	50 %	0 %	157825302
3543	NC_009881	GGT	2	6	172765	172770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825302
3544	NC_009881	A	6	6	172860	172865	100 %	0 %	0 %	0 %	157825303
3545	NC_009881	AGA	2	6	172900	172905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825303
3546	NC_009881	TTA	2	6	172970	172975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825303
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3550	NC_009881	AAGA	2	8	173129	173136	75 %	0 %	25 %	0 %	157825303
3551	NC_009881	ATTT	2	8	173172	173179	25 %	75 %	0 %	0 %	157825303
3552	NC_009881	AT	3	6	173188	173193	50 %	50 %	0 %	0 %	157825303
3553	NC_009881	CAAAA	2	10	173223	173232	80 %	0 %	0 %	20 %	157825303
3554	NC_009881	AGA	2	6	173340	173345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825303
3555	NC_009881	GGT	2	6	173390	173395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825303
3556	NC_009881	CCA	2	6	173412	173417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825303
3557	NC_009881	CTTA	2	8	173419	173426	25 %	50 %	0 %	25 %	157825303
3558	NC_009881	ATG	2	6	173439	173444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825303
3559	NC_009881	GGT	2	6	173462	173467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825303
3560	NC_009881	AGA	2	6	173482	173487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825303
3561	NC_009881	AAT	2	6	173501	173506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825303
3562	NC_009881	TGA	2	6	173533	173538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825303
3563	NC_009881	AGA	2	6	173540	173545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825303
3564	NC_009881	GAT	2	6	173555	173560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825303
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3566	NC_009881	TAA	2	6	173808	173813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825304
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3569	NC_009881	T	6	6	173902	173907	0 %	100 %	0 %	0 %	157825304
3570	NC_009881	TGGTG	2	10	173921	173930	0 %	40 %	60 %	0 %	157825304
3571	NC_009881	ATA	2	6	173951	173956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825304
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3581	NC_009881	CTAA	2	8	174547	174554	50 %	25 %	0 %	25 %	157825306
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3589	NC_009881	GTA	2	6	174760	174765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825306
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3591	NC_009881	ATA	2	6	174811	174816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825307
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3593	NC_009881	GTA	2	6	174864	174869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825307
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3600	NC_009881	TTAAT	2	10	175317	175326	40 %	60 %	0 %	0 %	157825309
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3602	NC_009881	CAT	2	6	175349	175354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825309
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3606	NC_009881	GAT	2	6	175523	175528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825309
3607	NC_009881	ACA	2	6	175703	175708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825309
3608	NC_009881	TGC	2	6	175744	175749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825309
3609	NC_009881	CAG	2	6	175790	175795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825309
3610	NC_009881	T	6	6	175817	175822	0 %	100 %	0 %	0 %	157825309
3611	NC_009881	GAT	2	6	175892	175897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825309
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3613	NC_009881	AT	3	6	176072	176077	50 %	50 %	0 %	0 %	157825309
3614	NC_009881	GGCT	2	8	176080	176087	0 %	25 %	50 %	25 %	157825309
3615	NC_009881	TTA	2	6	176091	176096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825309
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3618	NC_009881	GGGA	2	8	176404	176411	25 %	0 %	75 %	0 %	157825309
3619	NC_009881	GTA	2	6	176468	176473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825309
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3621	NC_009881	TGG	2	6	176556	176561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825309
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3991	NC_009881	T	6	6	194785	194790	0 %	100 %	0 %	0 %	157825322
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