MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_009881	T	6	6	102394	102399	0 %	100 %	0 %	0 %	157825242
2003	NC_009881	TTC	2	6	102405	102410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2004	NC_009881	TCT	2	6	102418	102423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2005	NC_009881	TGTT	2	8	102444	102451	0 %	75 %	25 %	0 %	157825242
2006	NC_009881	TCT	2	6	102454	102459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2007	NC_009881	GCT	2	6	102463	102468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825242
2008	NC_009881	CTT	2	6	102503	102508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2009	NC_009881	TCT	2	6	102547	102552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2010	NC_009881	TCT	2	6	102580	102585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2011	NC_009881	TCT	2	6	102649	102654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2012	NC_009881	TCT	2	6	102679	102684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2013	NC_009881	TCT	2	6	102727	102732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2014	NC_009881	TTC	2	6	102771	102776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2015	NC_009881	TCT	2	6	102847	102852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2016	NC_009881	TCT	2	6	102895	102900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2017	NC_009881	TCT	2	6	102994	102999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2018	NC_009881	TCT	2	6	103042	103047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2019	NC_009881	TTC	2	6	103086	103091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2020	NC_009881	TCT	2	6	103162	103167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2021	NC_009881	TCT	2	6	103210	103215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2022	NC_009881	TTC	2	6	103254	103259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2023	NC_009881	TCT	2	6	103330	103335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2024	NC_009881	TCT	2	6	103378	103383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
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2030	NC_009881	TTC	2	6	103737	103742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
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2032	NC_009881	TCT	2	6	103861	103866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2033	NC_009881	TTC	2	6	103905	103910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2034	NC_009881	TCT	2	6	103981	103986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2035	NC_009881	TCT	2	6	104029	104034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
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2037	NC_009881	TGC	3	9	104088	104096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825242
2038	NC_009881	TTG	2	6	104100	104105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825242
2039	NC_009881	T	8	8	104143	104150	0 %	100 %	0 %	0 %	157825242
2040	NC_009881	TCT	2	6	104164	104169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2041	NC_009881	TCT	2	6	104176	104181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2042	NC_009881	TTGTTT	2	12	104187	104198	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	157825242
2043	NC_009881	CTT	2	6	104210	104215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
2044	NC_009881	TTTGT	2	10	104216	104225	0 %	80 %	20 %	0 %	157825242
2045	NC_009881	ATC	3	9	104241	104249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825242
2046	NC_009881	TCA	3	9	104254	104262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825242
2047	NC_009881	T	6	6	104343	104348	0 %	100 %	0 %	0 %	157825242
2048	NC_009881	GCT	2	6	104351	104356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825242
2049	NC_009881	TCTT	2	8	104419	104426	0 %	75 %	0 %	25 %	157825242
2050	NC_009881	GTT	2	6	104446	104451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825242
2051	NC_009881	TTG	2	6	104520	104525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825242
2052	NC_009881	T	6	6	104540	104545	0 %	100 %	0 %	0 %	157825242
2053	NC_009881	AGT	2	6	104557	104562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825242
2054	NC_009881	GT	3	6	104561	104566	0 %	50 %	50 %	0 %	157825242
2055	NC_009881	TGT	2	6	104575	104580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825242
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2057	NC_009881	TAT	2	6	104682	104687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825242
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2059	NC_009881	ATC	2	6	104718	104723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825242
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2061	NC_009881	TAT	2	6	104748	104753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825242
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2063	NC_009881	ATTGT	2	10	104863	104872	20 %	60 %	20 %	0 %	157825242
2064	NC_009881	TTG	2	6	104906	104911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825242
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2081	NC_009881	T	7	7	105552	105558	0 %	100 %	0 %	0 %	157825242
2082	NC_009881	T	6	6	105574	105579	0 %	100 %	0 %	0 %	157825242
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2092	NC_009881	TTG	2	6	105935	105940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825242
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2094	NC_009881	TTG	2	6	106014	106019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825242
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2097	NC_009881	TA	3	6	106158	106163	50 %	50 %	0 %	0 %	157825242
2098	NC_009881	T	8	8	106190	106197	0 %	100 %	0 %	0 %	157825242
2099	NC_009881	TCT	2	6	106216	106221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825242
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2108	NC_009881	TGA	2	6	106452	106457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825242
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2121	NC_009881	TTAAC	2	10	107160	107169	40 %	40 %	0 %	20 %	157825243
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2123	NC_009881	T	6	6	107234	107239	0 %	100 %	0 %	0 %	157825243
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2493	NC_009881	GTA	2	6	122938	122943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825253
2494	NC_009881	TCA	2	6	123011	123016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825253
2495	NC_009881	CGAT	2	8	123056	123063	25 %	25 %	25 %	25 %	157825253
2496	NC_009881	TGA	2	6	123091	123096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825253
2497	NC_009881	AATT	2	8	123198	123205	50 %	50 %	0 %	0 %	157825253
2498	NC_009881	A	6	6	123227	123232	100 %	0 %	0 %	0 %	157825254
2499	NC_009881	TTA	2	6	123233	123238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825254
2500	NC_009881	GTTTAT	2	12	123242	123253	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157825254

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