MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_009881	T	6	6	1220842	1220847	0 %	100 %	0 %	0 %	157826372
23502	NC_009881	ATC	2	6	1220853	1220858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826372
23503	NC_009881	TCA	2	6	1220938	1220943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826372
23504	NC_009881	AAAT	2	8	1221063	1221070	75 %	25 %	0 %	0 %	157826372
23505	NC_009881	ACC	2	6	1221129	1221134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157826372
23506	NC_009881	GCA	2	6	1221202	1221207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826372
23507	NC_009881	TCA	2	6	1221265	1221270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826372
23508	NC_009881	TG	3	6	1221282	1221287	0 %	50 %	50 %	0 %	157826372
23509	NC_009881	ATACCG	2	12	1221322	1221333	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157826372
23510	NC_009881	AAT	2	6	1221342	1221347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826372
23511	NC_009881	ATA	2	6	1221376	1221381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826372
23512	NC_009881	TAC	2	6	1221392	1221397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826372
23513	NC_009881	TAC	2	6	1221429	1221434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826372
23514	NC_009881	GCA	2	6	1221463	1221468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826372
23515	NC_009881	GAAA	2	8	1221490	1221497	75 %	0 %	25 %	0 %	157826372
23516	NC_009881	TAC	2	6	1221532	1221537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826373
23517	NC_009881	T	7	7	1221558	1221564	0 %	100 %	0 %	0 %	157826373
23518	NC_009881	TATC	2	8	1221568	1221575	25 %	50 %	0 %	25 %	157826373
23519	NC_009881	TAAA	2	8	1221578	1221585	75 %	25 %	0 %	0 %	157826373
23520	NC_009881	AGATAC	2	12	1221623	1221634	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157826373
23521	NC_009881	AGC	2	6	1221777	1221782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826374
23522	NC_009881	ATA	2	6	1221809	1221814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826374
23523	NC_009881	AAT	2	6	1222479	1222484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826375
23524	NC_009881	AC	3	6	1222519	1222524	50 %	0 %	0 %	50 %	157826375
23525	NC_009881	GAA	2	6	1222575	1222580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157826375
23526	NC_009881	A	6	6	1222620	1222625	100 %	0 %	0 %	0 %	157826375
23527	NC_009881	TGA	2	6	1222637	1222642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826375
23528	NC_009881	TGA	2	6	1222670	1222675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826375
23529	NC_009881	CAT	2	6	1222681	1222686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826375
23530	NC_009881	GGC	2	6	1222716	1222721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157826375
23531	NC_009881	AGT	2	6	1222732	1222737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826375
23532	NC_009881	A	10	10	1222860	1222869	100 %	0 %	0 %	0 %	157826376
23533	NC_009881	GAA	2	6	1222888	1222893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157826376
23534	NC_009881	A	6	6	1222906	1222911	100 %	0 %	0 %	0 %	157826376
23535	NC_009881	ATTT	2	8	1222922	1222929	25 %	75 %	0 %	0 %	157826376
23536	NC_009881	AGTT	2	8	1222962	1222969	25 %	50 %	25 %	0 %	157826376
23537	NC_009881	AGGT	2	8	1223056	1223063	25 %	25 %	50 %	0 %	157826377
23538	NC_009881	AGT	2	6	1223075	1223080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826377
23539	NC_009881	TGA	2	6	1223102	1223107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826377
23540	NC_009881	TTC	2	6	1223113	1223118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826377
23541	NC_009881	A	7	7	1223119	1223125	100 %	0 %	0 %	0 %	157826377
23542	NC_009881	CAAAAT	2	12	1223161	1223172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157826377
23543	NC_009881	A	6	6	1223183	1223188	100 %	0 %	0 %	0 %	157826377
23544	NC_009881	TACA	2	8	1223217	1223224	50 %	25 %	0 %	25 %	157826377
23545	NC_009881	AGA	2	6	1223239	1223244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157826378
23546	NC_009881	T	7	7	1224652	1224658	0 %	100 %	0 %	0 %	157826379
23547	NC_009881	T	6	6	1224712	1224717	0 %	100 %	0 %	0 %	157826379
23548	NC_009881	ATT	2	6	1224723	1224728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826379
23549	NC_009881	T	8	8	1224736	1224743	0 %	100 %	0 %	0 %	157826379
23550	NC_009881	TAT	2	6	1224826	1224831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826379
23551	NC_009881	GATA	2	8	1224846	1224853	50 %	25 %	25 %	0 %	157826379
23552	NC_009881	TAA	2	6	1224871	1224876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826379
23553	NC_009881	GTG	2	6	1225000	1225005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157826379
23554	NC_009881	TAT	2	6	1225124	1225129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826379
23555	NC_009881	TTA	2	6	1225273	1225278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826379
23556	NC_009881	TAG	2	6	1225352	1225357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826379
23557	NC_009881	TAT	2	6	1225395	1225400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826379
23558	NC_009881	GAT	2	6	1225463	1225468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826379
23559	NC_009881	CGG	2	6	1225484	1225489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157826379
23560	NC_009881	TTG	2	6	1225528	1225533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157826379
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23563	NC_009881	TA	3	6	1225656	1225661	50 %	50 %	0 %	0 %	157826379
23564	NC_009881	GCAATA	2	12	1225725	1225736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157826379
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23577	NC_009881	AT	3	6	1226099	1226104	50 %	50 %	0 %	0 %	157826380
23578	NC_009881	TA	3	6	1226248	1226253	50 %	50 %	0 %	0 %	157826380
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23585	NC_009881	AAGT	2	8	1226553	1226560	50 %	25 %	25 %	0 %	157826380
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23587	NC_009881	AATTT	2	10	1226624	1226633	40 %	60 %	0 %	0 %	157826380
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23590	NC_009881	AATA	2	8	1227063	1227070	75 %	25 %	0 %	0 %	157826381
23591	NC_009881	T	6	6	1227089	1227094	0 %	100 %	0 %	0 %	157826381
23592	NC_009881	TTC	2	6	1227139	1227144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826381
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23598	NC_009881	AT	3	6	1228530	1228535	50 %	50 %	0 %	0 %	157826382
23599	NC_009881	AAG	2	6	1228548	1228553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157826382
23600	NC_009881	ATAG	2	8	1228601	1228608	50 %	25 %	25 %	0 %	157826382
23601	NC_009881	TTA	2	6	1228628	1228633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826383
23602	NC_009881	ACT	2	6	1228691	1228696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826383
23603	NC_009881	AT	3	6	1228738	1228743	50 %	50 %	0 %	0 %	157826383
23604	NC_009881	TAA	2	6	1228756	1228761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826383
23605	NC_009881	CTA	2	6	1228846	1228851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826383
23606	NC_009881	T	9	9	1228899	1228907	0 %	100 %	0 %	0 %	157826383
23607	NC_009881	CTACT	2	10	1228966	1228975	20 %	40 %	0 %	40 %	157826383
23608	NC_009881	TAT	2	6	1229075	1229080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826383
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23614	NC_009881	A	6	6	1229232	1229237	100 %	0 %	0 %	0 %	157826383
23615	NC_009881	GAT	2	6	1229247	1229252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826383
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