MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_009881	AAC	2	6	1197682	1197687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157826344
23003	NC_009881	TCCT	2	8	1197734	1197741	0 %	50 %	0 %	50 %	157826344
23004	NC_009881	CTC	2	6	1197790	1197795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157826344
23005	NC_009881	ATC	2	6	1197824	1197829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826344
23006	NC_009881	GTA	2	6	1197831	1197836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826344
23007	NC_009881	TCT	3	9	1197846	1197854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826344
23008	NC_009881	TTC	2	6	1197899	1197904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826344
23009	NC_009881	ATC	3	9	1197929	1197937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826344
23010	NC_009881	CTT	2	6	1197988	1197993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826344
23011	NC_009881	ATC	2	6	1198043	1198048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826344
23012	NC_009881	T	6	6	1198079	1198084	0 %	100 %	0 %	0 %	157826344
23013	NC_009881	CTAT	2	8	1198092	1198099	25 %	50 %	0 %	25 %	157826344
23014	NC_009881	TATTGC	2	12	1198120	1198131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157826344
23015	NC_009881	TAAT	2	8	1198176	1198183	50 %	50 %	0 %	0 %	157826345
23016	NC_009881	TAA	2	6	1198196	1198201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826345
23017	NC_009881	T	6	6	1198248	1198253	0 %	100 %	0 %	0 %	157826345
23018	NC_009881	TTG	2	6	1198314	1198319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157826345
23019	NC_009881	ATA	2	6	1198332	1198337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826345
23020	NC_009881	ATA	2	6	1198358	1198363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826345
23021	NC_009881	ATT	2	6	1198377	1198382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826345
23022	NC_009881	TTA	2	6	1198384	1198389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826345
23023	NC_009881	ATA	3	9	1198424	1198432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826345
23024	NC_009881	A	7	7	1198432	1198438	100 %	0 %	0 %	0 %	157826345
23025	NC_009881	A	6	6	1198443	1198448	100 %	0 %	0 %	0 %	157826345
23026	NC_009881	T	6	6	1198454	1198459	0 %	100 %	0 %	0 %	157826345
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23029	NC_009881	TAT	2	6	1198544	1198549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826345
23030	NC_009881	ATTTAA	2	12	1198554	1198565	50 %	50 %	0 %	0 %	157826345
23031	NC_009881	TTC	2	6	1198587	1198592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826345
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23033	NC_009881	TCT	2	6	1198709	1198714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826345
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23035	NC_009881	TAA	2	6	1198759	1198764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826345
23036	NC_009881	TCT	2	6	1198834	1198839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826345
23037	NC_009881	CAA	2	6	1198919	1198924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157826345
23038	NC_009881	TTTA	2	8	1198938	1198945	25 %	75 %	0 %	0 %	157826345
23039	NC_009881	TAA	2	6	1198979	1198984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826345
23040	NC_009881	TTTTC	2	10	1198991	1199000	0 %	80 %	0 %	20 %	157826345
23041	NC_009881	TAA	2	6	1199006	1199011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826345
23042	NC_009881	ATA	2	6	1199075	1199080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826345
23043	NC_009881	CTA	2	6	1199201	1199206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826345
23044	NC_009881	T	8	8	1199218	1199225	0 %	100 %	0 %	0 %	157826345
23045	NC_009881	T	6	6	1199270	1199275	0 %	100 %	0 %	0 %	157826345
23046	NC_009881	TA	3	6	1199402	1199407	50 %	50 %	0 %	0 %	157826345
23047	NC_009881	A	6	6	1199478	1199483	100 %	0 %	0 %	0 %	157826345
23048	NC_009881	TAT	2	6	1199495	1199500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826345
23049	NC_009881	A	6	6	1199598	1199603	100 %	0 %	0 %	0 %	157826345
23050	NC_009881	TTA	2	6	1199605	1199610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826345
23051	NC_009881	TTC	2	6	1199643	1199648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826345
23052	NC_009881	TTCT	2	8	1199655	1199662	0 %	75 %	0 %	25 %	157826345
23053	NC_009881	GCT	2	6	1199773	1199778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157826345
23054	NC_009881	ACT	2	6	1199890	1199895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826345
23055	NC_009881	TTA	2	6	1200087	1200092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826346
23056	NC_009881	TAA	4	12	1200093	1200104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826346
23057	NC_009881	TAT	2	6	1200111	1200116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826346
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23078	NC_009881	AG	3	6	1201317	1201322	50 %	0 %	50 %	0 %	157826347
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23105	NC_009881	AGC	2	6	1202602	1202607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826349
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23112	NC_009881	T	8	8	1202873	1202880	0 %	100 %	0 %	0 %	157826349
23113	NC_009881	TA	3	6	1202893	1202898	50 %	50 %	0 %	0 %	157826349
23114	NC_009881	ATA	2	6	1202919	1202924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826349
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23116	NC_009881	T	7	7	1202944	1202950	0 %	100 %	0 %	0 %	157826349
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23118	NC_009881	AAT	2	6	1203022	1203027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826349
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23477	NC_009881	AATT	2	8	1219926	1219933	50 %	50 %	0 %	0 %	157826372
23478	NC_009881	TA	3	6	1220021	1220026	50 %	50 %	0 %	0 %	157826372
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23480	NC_009881	CTA	2	6	1220078	1220083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826372
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