MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_009881	TGA	2	6	26775	26780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825162
503	NC_009881	AGA	2	6	26805	26810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825162
504	NC_009881	GAA	2	6	26818	26823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825162
505	NC_009881	GAA	2	6	26836	26841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825162
506	NC_009881	TGCT	2	8	26864	26871	0 %	50 %	25 %	25 %	157825162
507	NC_009881	TTA	2	6	26923	26928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825162
508	NC_009881	ATT	2	6	27023	27028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825162
509	NC_009881	TAA	2	6	27063	27068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825162
510	NC_009881	TAA	2	6	27137	27142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825162
511	NC_009881	AGG	2	6	27237	27242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825162
512	NC_009881	A	6	6	27256	27261	100 %	0 %	0 %	0 %	157825162
513	NC_009881	GGC	2	6	27268	27273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825162
514	NC_009881	TTA	2	6	27308	27313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825162
515	NC_009881	A	6	6	27313	27318	100 %	0 %	0 %	0 %	157825162
516	NC_009881	A	7	7	27343	27349	100 %	0 %	0 %	0 %	157825162
517	NC_009881	ATA	2	6	27568	27573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825163
518	NC_009881	TGTT	2	8	27584	27591	0 %	75 %	25 %	0 %	157825163
519	NC_009881	TATCGA	2	12	27647	27658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157825163
520	NC_009881	CA	3	6	27668	27673	50 %	0 %	0 %	50 %	157825163
521	NC_009881	AT	3	6	27675	27680	50 %	50 %	0 %	0 %	157825163
522	NC_009881	ATT	2	6	27684	27689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825163
523	NC_009881	TA	5	10	27700	27709	50 %	50 %	0 %	0 %	157825163
524	NC_009881	A	6	6	27722	27727	100 %	0 %	0 %	0 %	157825163
525	NC_009881	A	6	6	27731	27736	100 %	0 %	0 %	0 %	157825163
526	NC_009881	ACAATA	2	12	27825	27836	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157825163
527	NC_009881	ATT	2	6	27865	27870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825163
528	NC_009881	TTG	2	6	28246	28251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825164
529	NC_009881	TGA	2	6	28295	28300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825164
530	NC_009881	TTAC	2	8	28305	28312	25 %	50 %	0 %	25 %	157825164
531	NC_009881	ATAA	2	8	28317	28324	75 %	25 %	0 %	0 %	157825164
532	NC_009881	ATG	2	6	28330	28335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825164
533	NC_009881	T	6	6	28343	28348	0 %	100 %	0 %	0 %	157825164
534	NC_009881	ATA	2	6	29333	29338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825165
535	NC_009881	AAT	2	6	29343	29348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825165
536	NC_009881	GTT	2	6	29400	29405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825165
537	NC_009881	AT	3	6	29444	29449	50 %	50 %	0 %	0 %	157825165
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540	NC_009881	TAA	2	6	29580	29585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825165
541	NC_009881	GTATG	2	10	29606	29615	20 %	40 %	40 %	0 %	157825165
542	NC_009881	GGAA	2	8	29631	29638	50 %	0 %	50 %	0 %	157825165
543	NC_009881	AGA	2	6	29662	29667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825165
544	NC_009881	AGTT	2	8	29714	29721	25 %	50 %	25 %	0 %	157825165
545	NC_009881	CATG	2	8	29739	29746	25 %	25 %	25 %	25 %	157825165
546	NC_009881	AGA	2	6	29766	29771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825165
547	NC_009881	GAT	2	6	29779	29784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825165
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549	NC_009881	TAA	2	6	29838	29843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825165
550	NC_009881	GCA	2	6	29868	29873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825165
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553	NC_009881	TTA	2	6	29975	29980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825165
554	NC_009881	AAG	2	6	30000	30005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825165
555	NC_009881	ACT	2	6	30015	30020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825165
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557	NC_009881	CTAA	2	8	30166	30173	50 %	25 %	0 %	25 %	157825165
558	NC_009881	T	6	6	30247	30252	0 %	100 %	0 %	0 %	157825165
559	NC_009881	AT	3	6	30584	30589	50 %	50 %	0 %	0 %	157825166
560	NC_009881	TAA	2	6	30602	30607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825166
561	NC_009881	ATG	2	6	30616	30621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825166
562	NC_009881	TCC	2	6	30632	30637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825166
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565	NC_009881	A	6	6	30863	30868	100 %	0 %	0 %	0 %	157825166
566	NC_009881	TGA	2	6	30902	30907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825166
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570	NC_009881	ATG	3	9	31080	31088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825166
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573	NC_009881	ATT	2	6	31217	31222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825166
574	NC_009881	TAC	2	6	31246	31251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825166
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609	NC_009881	CTA	2	6	32739	32744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825168
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611	NC_009881	TGT	2	6	32921	32926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825168
612	NC_009881	TAT	2	6	33127	33132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825169
613	NC_009881	AGT	2	6	33138	33143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825169
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623	NC_009881	A	6	6	33528	33533	100 %	0 %	0 %	0 %	157825169
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