MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009881	ATG	2	6	250351	250356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825371
5003	NC_009881	TCC	2	6	250372	250377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825371
5004	NC_009881	GCT	2	6	250430	250435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825371
5005	NC_009881	T	6	6	250437	250442	0 %	100 %	0 %	0 %	157825371
5006	NC_009881	CAT	2	6	250458	250463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825371
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5008	NC_009881	AGT	2	6	250510	250515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825371
5009	NC_009881	GAT	2	6	250521	250526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825371
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5011	NC_009881	TAA	2	6	250601	250606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825371
5012	NC_009881	TAATT	2	10	250617	250626	40 %	60 %	0 %	0 %	157825371
5013	NC_009881	CTT	2	6	250809	250814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825372
5014	NC_009881	CTA	2	6	250838	250843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825372
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5017	NC_009881	TCTTT	2	10	250946	250955	0 %	80 %	0 %	20 %	157825372
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5020	NC_009881	CAG	2	6	251012	251017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825372
5021	NC_009881	TCT	2	6	251026	251031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825372
5022	NC_009881	GAT	2	6	251032	251037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825372
5023	NC_009881	TAAAC	2	10	251077	251086	60 %	20 %	0 %	20 %	157825372
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5028	NC_009881	AGG	2	6	251316	251321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825372
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5033	NC_009881	CGAT	2	8	251467	251474	25 %	25 %	25 %	25 %	157825372
5034	NC_009881	CGC	2	6	251489	251494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825372
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5037	NC_009881	CCCT	2	8	251568	251575	0 %	25 %	0 %	75 %	157825372
5038	NC_009881	AGC	2	6	251580	251585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825372
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5041	NC_009881	CTT	2	6	251654	251659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825372
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5045	NC_009881	ATC	2	6	251775	251780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825372
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5050	NC_009881	T	6	6	251970	251975	0 %	100 %	0 %	0 %	157825372
5051	NC_009881	CGC	2	6	252020	252025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825372
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5053	NC_009881	CCG	2	6	252103	252108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825372
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5058	NC_009881	T	6	6	252326	252331	0 %	100 %	0 %	0 %	157825372
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5061	NC_009881	TCTT	2	8	252439	252446	0 %	75 %	0 %	25 %	157825372
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5111	NC_009881	AAAC	2	8	254767	254774	75 %	0 %	0 %	25 %	157825374
5112	NC_009881	TA	3	6	254786	254791	50 %	50 %	0 %	0 %	157825374
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5494	NC_009881	CTA	2	6	273511	273516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825401
5495	NC_009881	AATT	2	8	273524	273531	50 %	50 %	0 %	0 %	157825401
5496	NC_009881	AT	3	6	273556	273561	50 %	50 %	0 %	0 %	157825401
5497	NC_009881	ATT	2	6	273566	273571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825401
5498	NC_009881	T	7	7	273605	273611	0 %	100 %	0 %	0 %	157825401
5499	NC_009881	TTA	2	6	273651	273656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825401
5500	NC_009881	TAC	2	6	273674	273679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825401

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