MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009881	AAAT	2	8	220704	220711	75 %	25 %	0 %	0 %	157825346
4502	NC_009881	A	6	6	220732	220737	100 %	0 %	0 %	0 %	157825346
4503	NC_009881	TCT	2	6	220747	220752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825346
4504	NC_009881	ACT	2	6	220836	220841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825346
4505	NC_009881	TTG	2	6	220886	220891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825346
4506	NC_009881	AGC	2	6	220899	220904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825346
4507	NC_009881	ATA	2	6	220952	220957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825346
4508	NC_009881	AAT	2	6	220963	220968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825346
4509	NC_009881	AAT	2	6	220971	220976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825346
4510	NC_009881	TAT	2	6	221004	221009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825346
4511	NC_009881	GAGTT	2	10	221012	221021	20 %	40 %	40 %	0 %	157825346
4512	NC_009881	T	6	6	221035	221040	0 %	100 %	0 %	0 %	157825346
4513	NC_009881	GAA	2	6	221041	221046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825346
4514	NC_009881	GAA	2	6	221053	221058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825346
4515	NC_009881	ATT	2	6	221062	221067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825346
4516	NC_009881	ATT	2	6	221253	221258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825346
4517	NC_009881	AAGTG	2	10	221264	221273	40 %	20 %	40 %	0 %	157825346
4518	NC_009881	AT	3	6	221332	221337	50 %	50 %	0 %	0 %	157825346
4519	NC_009881	TAAA	2	8	221348	221355	75 %	25 %	0 %	0 %	157825346
4520	NC_009881	A	6	6	221353	221358	100 %	0 %	0 %	0 %	157825346
4521	NC_009881	GAT	2	6	221410	221415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825347
4522	NC_009881	GTT	2	6	221433	221438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825347
4523	NC_009881	ATT	2	6	221477	221482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825347
4524	NC_009881	AT	3	6	221483	221488	50 %	50 %	0 %	0 %	157825347
4525	NC_009881	GTTTCA	2	12	221508	221519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157825347
4526	NC_009881	TA	3	6	221530	221535	50 %	50 %	0 %	0 %	157825347
4527	NC_009881	T	8	8	221538	221545	0 %	100 %	0 %	0 %	157825347
4528	NC_009881	TGTTTC	2	12	221576	221587	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157825347
4529	NC_009881	ATC	2	6	221591	221596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825347
4530	NC_009881	TAT	2	6	221663	221668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825347
4531	NC_009881	ATG	2	6	221743	221748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825347
4532	NC_009881	TGT	2	6	221774	221779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825347
4533	NC_009881	GAA	2	6	221788	221793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825347
4534	NC_009881	ATT	2	6	221796	221801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825347
4535	NC_009881	TTA	2	6	221817	221822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825347
4536	NC_009881	TA	3	6	221851	221856	50 %	50 %	0 %	0 %	157825347
4537	NC_009881	TAGC	2	8	221869	221876	25 %	25 %	25 %	25 %	157825347
4538	NC_009881	GTT	2	6	221889	221894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825347
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4540	NC_009881	AGGT	2	8	221981	221988	25 %	25 %	50 %	0 %	157825347
4541	NC_009881	AT	3	6	222023	222028	50 %	50 %	0 %	0 %	157825347
4542	NC_009881	AT	3	6	222060	222065	50 %	50 %	0 %	0 %	157825347
4543	NC_009881	TTTA	2	8	222074	222081	25 %	75 %	0 %	0 %	157825347
4544	NC_009881	GCC	2	6	222083	222088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825347
4545	NC_009881	ATTA	2	8	222095	222102	50 %	50 %	0 %	0 %	157825347
4546	NC_009881	AGTT	2	8	222128	222135	25 %	50 %	25 %	0 %	157825347
4547	NC_009881	TAG	2	6	222136	222141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825347
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4549	NC_009881	GTC	2	6	222167	222172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825347
4550	NC_009881	AT	3	6	222184	222189	50 %	50 %	0 %	0 %	157825347
4551	NC_009881	CTT	2	6	222220	222225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825347
4552	NC_009881	TTTA	2	8	222233	222240	25 %	75 %	0 %	0 %	157825347
4553	NC_009881	ATC	2	6	222368	222373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825347
4554	NC_009881	TA	3	6	222398	222403	50 %	50 %	0 %	0 %	157825347
4555	NC_009881	TTTA	2	8	222461	222468	25 %	75 %	0 %	0 %	157825347
4556	NC_009881	ATT	2	6	222610	222615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825348
4557	NC_009881	GTAA	2	8	222632	222639	50 %	25 %	25 %	0 %	157825348
4558	NC_009881	TTAC	2	8	222648	222655	25 %	50 %	0 %	25 %	157825348
4559	NC_009881	AGCAAA	2	12	222667	222678	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157825348
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4563	NC_009881	CTG	2	6	222926	222931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825349
4564	NC_009881	AT	3	6	222966	222971	50 %	50 %	0 %	0 %	157825349
4565	NC_009881	ATA	2	6	222991	222996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825349
4566	NC_009881	TGG	2	6	223062	223067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825349
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4569	NC_009881	TTCT	2	8	223163	223170	0 %	75 %	0 %	25 %	157825349
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4574	NC_009881	AAG	2	6	223352	223357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825349
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4581	NC_009881	TAA	2	6	223618	223623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825350
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4587	NC_009881	CAT	2	6	223834	223839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825350
4588	NC_009881	GGTAA	2	10	224017	224026	40 %	20 %	40 %	0 %	157825350
4589	NC_009881	ATG	2	6	224044	224049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825350
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4593	NC_009881	CTTTTG	2	12	224135	224146	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157825351
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4595	NC_009881	AT	3	6	224291	224296	50 %	50 %	0 %	0 %	157825351
4596	NC_009881	TAT	3	9	224294	224302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825351
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4599	NC_009881	A	6	6	224537	224542	100 %	0 %	0 %	0 %	157825352
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4602	NC_009881	ATT	2	6	224643	224648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825352
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4604	NC_009881	AGA	2	6	224831	224836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825352
4605	NC_009881	TCA	2	6	224856	224861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825352
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4607	NC_009881	TAT	3	9	224882	224890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825352
4608	NC_009881	GGAG	2	8	224897	224904	25 %	0 %	75 %	0 %	157825352
4609	NC_009881	ATG	2	6	224914	224919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825352
4610	NC_009881	CTT	2	6	224928	224933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825352
4611	NC_009881	AT	3	6	224974	224979	50 %	50 %	0 %	0 %	157825352
4612	NC_009881	CAG	2	6	224992	224997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825352
4613	NC_009881	TAA	2	6	224998	225003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825352
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4617	NC_009881	A	7	7	225078	225084	100 %	0 %	0 %	0 %	157825352
4618	NC_009881	CTA	2	6	225745	225750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825353
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