MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. McKiel

Total Repeats: 2590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009879	ATTT	2	8	1384	1391	25 %	75 %	0 %	0 %	157803192
2	NC_009879	GGCA	2	8	2326	2333	25 %	0 %	50 %	25 %	157803193
3	NC_009879	TTAT	2	8	2833	2840	25 %	75 %	0 %	0 %	157803193
4	NC_009879	TTAT	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	157803193
5	NC_009879	AATA	2	8	5327	5334	75 %	25 %	0 %	0 %	157803194
6	NC_009879	AAGG	2	8	5399	5406	50 %	0 %	50 %	0 %	157803194
7	NC_009879	TCAC	2	8	5554	5561	25 %	25 %	0 %	50 %	157803194
8	NC_009879	TAGT	2	8	6018	6025	25 %	50 %	25 %	0 %	157803194
9	NC_009879	ACCT	2	8	6690	6697	25 %	25 %	0 %	50 %	157803195
10	NC_009879	ATAA	2	8	6781	6788	75 %	25 %	0 %	0 %	157803195
11	NC_009879	ATAA	2	8	6945	6952	75 %	25 %	0 %	0 %	157803195
12	NC_009879	TCAA	2	8	8294	8301	50 %	25 %	0 %	25 %	157803197
13	NC_009879	ATGA	2	8	9123	9130	50 %	25 %	25 %	0 %	157803198
14	NC_009879	CAAA	2	8	9309	9316	75 %	0 %	0 %	25 %	157803198
15	NC_009879	GATC	2	8	9578	9585	25 %	25 %	25 %	25 %	157803198
16	NC_009879	TTGG	2	8	9718	9725	0 %	50 %	50 %	0 %	157803198
17	NC_009879	GTTT	2	8	10510	10517	0 %	75 %	25 %	0 %	157803199
18	NC_009879	GTTT	2	8	11027	11034	0 %	75 %	25 %	0 %	157803200
19	NC_009879	TTAA	2	8	11069	11076	50 %	50 %	0 %	0 %	157803200
20	NC_009879	AATT	2	8	11434	11441	50 %	50 %	0 %	0 %	157803200
21	NC_009879	ATGT	2	8	11684	11691	25 %	50 %	25 %	0 %	157803200
22	NC_009879	CGCA	2	8	12903	12910	25 %	0 %	25 %	50 %	157803201
23	NC_009879	CTTG	2	8	12924	12931	0 %	50 %	25 %	25 %	157803201
24	NC_009879	CTAC	2	8	13850	13857	25 %	25 %	0 %	50 %	157803202
25	NC_009879	AAAG	2	8	15383	15390	75 %	0 %	25 %	0 %	157803204
26	NC_009879	AGAA	2	8	15987	15994	75 %	0 %	25 %	0 %	157803204
27	NC_009879	AGTA	2	8	16053	16060	50 %	25 %	25 %	0 %	157803204
28	NC_009879	AATG	2	8	16131	16138	50 %	25 %	25 %	0 %	157803204
29	NC_009879	GGAT	2	8	16391	16398	25 %	25 %	50 %	0 %	157803204
30	NC_009879	AGAA	2	8	16623	16630	75 %	0 %	25 %	0 %	157803204
31	NC_009879	TTAG	2	8	16762	16769	25 %	50 %	25 %	0 %	157803204
32	NC_009879	TAAG	2	8	18230	18237	50 %	25 %	25 %	0 %	157803204
33	NC_009879	GTAT	2	8	18338	18345	25 %	50 %	25 %	0 %	157803204
34	NC_009879	AATA	2	8	18960	18967	75 %	25 %	0 %	0 %	157803204
35	NC_009879	TAAA	2	8	19106	19113	75 %	25 %	0 %	0 %	157803204
36	NC_009879	TTAT	2	8	19819	19826	25 %	75 %	0 %	0 %	157803205
37	NC_009879	ATAA	2	8	19919	19926	75 %	25 %	0 %	0 %	157803205
38	NC_009879	ACTT	2	8	19974	19981	25 %	50 %	0 %	25 %	157803205
39	NC_009879	AATT	2	8	22077	22084	50 %	50 %	0 %	0 %	157803206
40	NC_009879	CGTT	2	8	22217	22224	0 %	50 %	25 %	25 %	157803206
41	NC_009879	TTTA	2	8	22541	22548	25 %	75 %	0 %	0 %	157803207
42	NC_009879	CTAT	2	8	22632	22639	25 %	50 %	0 %	25 %	157803207
43	NC_009879	ATTT	2	8	22675	22682	25 %	75 %	0 %	0 %	157803207
44	NC_009879	TGTC	2	8	22739	22746	0 %	50 %	25 %	25 %	157803207
45	NC_009879	TAAA	2	8	22788	22795	75 %	25 %	0 %	0 %	157803207
46	NC_009879	CATA	2	8	23055	23062	50 %	25 %	0 %	25 %	157803208
47	NC_009879	ATAC	2	8	23314	23321	50 %	25 %	0 %	25 %	157803209
48	NC_009879	ATAA	2	8	23738	23745	75 %	25 %	0 %	0 %	157803209
49	NC_009879	ACTT	2	8	23833	23840	25 %	50 %	0 %	25 %	157803209
50	NC_009879	TGAA	2	8	24184	24191	50 %	25 %	25 %	0 %	157803210
51	NC_009879	TATT	2	8	24703	24710	25 %	75 %	0 %	0 %	157803211
52	NC_009879	ACGA	2	8	24834	24841	50 %	0 %	25 %	25 %	157803211
53	NC_009879	ATTT	2	8	25134	25141	25 %	75 %	0 %	0 %	157803211
54	NC_009879	ACTA	2	8	26175	26182	50 %	25 %	0 %	25 %	157803213
55	NC_009879	AAGC	2	8	27019	27026	50 %	0 %	25 %	25 %	157803213
56	NC_009879	TTTG	2	8	27768	27775	0 %	75 %	25 %	0 %	157803213
57	NC_009879	TTAG	2	8	28108	28115	25 %	50 %	25 %	0 %	157803214
58	NC_009879	AATT	2	8	28260	28267	50 %	50 %	0 %	0 %	157803214
59	NC_009879	TTCC	2	8	28643	28650	0 %	50 %	0 %	50 %	157803214
60	NC_009879	AGCA	2	8	29544	29551	50 %	0 %	25 %	25 %	157803215
61	NC_009879	ATGA	2	8	29891	29898	50 %	25 %	25 %	0 %	157803216
62	NC_009879	ACTT	2	8	31415	31422	25 %	50 %	0 %	25 %	157803217
63	NC_009879	AAAT	2	8	31439	31446	75 %	25 %	0 %	0 %	157803217
64	NC_009879	ATAA	2	8	31915	31922	75 %	25 %	0 %	0 %	157803217
65	NC_009879	AGTA	2	8	32407	32414	50 %	25 %	25 %	0 %	157803218
66	NC_009879	ATCA	2	8	33761	33768	50 %	25 %	0 %	25 %	157803220
67	NC_009879	TTAA	2	8	34653	34660	50 %	50 %	0 %	0 %	157803220
68	NC_009879	TAAA	2	8	36872	36879	75 %	25 %	0 %	0 %	157803222
69	NC_009879	AGCA	2	8	36951	36958	50 %	0 %	25 %	25 %	157803222
70	NC_009879	ATTG	2	8	37281	37288	25 %	50 %	25 %	0 %	157803222
71	NC_009879	TTAT	2	8	37495	37502	25 %	75 %	0 %	0 %	157803222
72	NC_009879	TGCT	2	8	37577	37584	0 %	50 %	25 %	25 %	157803222
73	NC_009879	GTGA	2	8	37684	37691	25 %	25 %	50 %	0 %	157803222
74	NC_009879	GGCA	2	8	38057	38064	25 %	0 %	50 %	25 %	157803222
75	NC_009879	GTTC	2	8	38462	38469	0 %	50 %	25 %	25 %	157803222
76	NC_009879	TAAG	2	8	39509	39516	50 %	25 %	25 %	0 %	157803223
77	NC_009879	ATAA	2	8	40196	40203	75 %	25 %	0 %	0 %	157803224
78	NC_009879	GTAC	2	8	40437	40444	25 %	25 %	25 %	25 %	157803224
79	NC_009879	CTTT	2	8	40896	40903	0 %	75 %	0 %	25 %	157803224
80	NC_009879	ATTA	2	8	41106	41113	50 %	50 %	0 %	0 %	157803225
81	NC_009879	ATAA	2	8	41726	41733	75 %	25 %	0 %	0 %	157803225
82	NC_009879	ATAA	2	8	41780	41787	75 %	25 %	0 %	0 %	157803225
83	NC_009879	CCAA	2	8	41909	41916	50 %	0 %	0 %	50 %	157803225
84	NC_009879	CATC	2	8	41917	41924	25 %	25 %	0 %	50 %	157803225
85	NC_009879	ATTT	3	12	42093	42104	25 %	75 %	0 %	0 %	157803225
86	NC_009879	CAAA	2	8	42213	42220	75 %	0 %	0 %	25 %	157803225
87	NC_009879	AGAA	2	8	43472	43479	75 %	0 %	25 %	0 %	157803226
88	NC_009879	AAAG	2	8	43852	43859	75 %	0 %	25 %	0 %	157803227
89	NC_009879	TAAA	2	8	43919	43926	75 %	25 %	0 %	0 %	157803227
90	NC_009879	AAGA	2	8	45253	45260	75 %	0 %	25 %	0 %	157803229
91	NC_009879	TTTG	2	8	45361	45368	0 %	75 %	25 %	0 %	157803229
92	NC_009879	TAAT	2	8	45760	45767	50 %	50 %	0 %	0 %	157803229
93	NC_009879	GAAT	2	8	46654	46661	50 %	25 %	25 %	0 %	157803230
94	NC_009879	AAGT	2	8	46889	46896	50 %	25 %	25 %	0 %	157803230
95	NC_009879	ATGG	2	8	47211	47218	25 %	25 %	50 %	0 %	157803230
96	NC_009879	AAGA	2	8	47496	47503	75 %	0 %	25 %	0 %	157803230
97	NC_009879	GAAA	2	8	47582	47589	75 %	0 %	25 %	0 %	157803230
98	NC_009879	GAGG	2	8	47610	47617	25 %	0 %	75 %	0 %	157803230
99	NC_009879	TATG	2	8	47939	47946	25 %	50 %	25 %	0 %	157803230
100	NC_009879	GCTA	2	8	48077	48084	25 %	25 %	25 %	25 %	157803230
101	NC_009879	TTAA	2	8	48453	48460	50 %	50 %	0 %	0 %	157803231
102	NC_009879	GCAT	2	8	48561	48568	25 %	25 %	25 %	25 %	157803231
103	NC_009879	TGCT	2	8	50134	50141	0 %	50 %	25 %	25 %	157803232
104	NC_009879	TATT	2	8	50220	50227	25 %	75 %	0 %	0 %	157803232
105	NC_009879	ATTT	2	8	50230	50237	25 %	75 %	0 %	0 %	157803232
106	NC_009879	TTTG	2	8	51011	51018	0 %	75 %	25 %	0 %	157803232
107	NC_009879	TGAT	2	8	51089	51096	25 %	50 %	25 %	0 %	157803232
108	NC_009879	TTTG	2	8	51771	51778	0 %	75 %	25 %	0 %	157803233
109	NC_009879	TTAT	2	8	52334	52341	25 %	75 %	0 %	0 %	157803234
110	NC_009879	AACT	2	8	52720	52727	50 %	25 %	0 %	25 %	157803234
111	NC_009879	TATC	2	8	52998	53005	25 %	50 %	0 %	25 %	157803234
112	NC_009879	GAAT	2	8	53497	53504	50 %	25 %	25 %	0 %	157803235
113	NC_009879	TTGG	2	8	53557	53564	0 %	50 %	50 %	0 %	157803235
114	NC_009879	TTAG	2	8	53877	53884	25 %	50 %	25 %	0 %	157803235
115	NC_009879	ATTT	2	8	53968	53975	25 %	75 %	0 %	0 %	157803235
116	NC_009879	TATT	2	8	54030	54037	25 %	75 %	0 %	0 %	157803235
117	NC_009879	GGTT	2	8	54510	54517	0 %	50 %	50 %	0 %	157803235
118	NC_009879	ATAG	2	8	54687	54694	50 %	25 %	25 %	0 %	157803235
119	NC_009879	TCTA	2	8	55139	55146	25 %	50 %	0 %	25 %	157803235
120	NC_009879	TAAT	2	8	55175	55182	50 %	50 %	0 %	0 %	157803235
121	NC_009879	TAGT	2	8	55491	55498	25 %	50 %	25 %	0 %	157803236
122	NC_009879	TTAT	2	8	58674	58681	25 %	75 %	0 %	0 %	157803239
123	NC_009879	GATG	2	8	58723	58730	25 %	25 %	50 %	0 %	157803239
124	NC_009879	TTAC	2	8	59082	59089	25 %	50 %	0 %	25 %	157803239
125	NC_009879	TAAA	2	8	59464	59471	75 %	25 %	0 %	0 %	157803239
126	NC_009879	TTGG	2	8	59767	59774	0 %	50 %	50 %	0 %	157803240
127	NC_009879	TGTT	2	8	60337	60344	0 %	75 %	25 %	0 %	157803240
128	NC_009879	TTCT	2	8	60607	60614	0 %	75 %	0 %	25 %	157803240
129	NC_009879	GGAT	2	8	60759	60766	25 %	25 %	50 %	0 %	157803240
130	NC_009879	AATA	2	8	62671	62678	75 %	25 %	0 %	0 %	157803242
131	NC_009879	ATTT	2	8	62838	62845	25 %	75 %	0 %	0 %	157803242
132	NC_009879	AGCA	2	8	62967	62974	50 %	0 %	25 %	25 %	157803242
133	NC_009879	ATTT	2	8	62982	62989	25 %	75 %	0 %	0 %	157803242
134	NC_009879	ATTT	2	8	63152	63159	25 %	75 %	0 %	0 %	157803242
135	NC_009879	TAAA	2	8	63807	63814	75 %	25 %	0 %	0 %	157803243
136	NC_009879	ATCT	2	8	63987	63994	25 %	50 %	0 %	25 %	157803243
137	NC_009879	GAAA	2	8	64054	64061	75 %	0 %	25 %	0 %	157803243
138	NC_009879	TGGT	2	8	65652	65659	0 %	50 %	50 %	0 %	157803245
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