MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 113938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_009767	GC	4	8	100324	100331	0 %	0 %	50 %	50 %	156740104
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2004	NC_009767	TCG	2	6	100446	100451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740104
2005	NC_009767	ATG	2	6	100455	100460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740104
2006	NC_009767	CTGAT	2	10	100545	100554	20 %	40 %	20 %	20 %	156740105
2007	NC_009767	CTG	2	6	100564	100569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740105
2008	NC_009767	TGC	2	6	100641	100646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740105
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2012	NC_009767	ATG	2	6	100740	100745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740105
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2022	NC_009767	GGCA	2	8	101374	101381	25 %	0 %	50 %	25 %	156740106
2023	NC_009767	GCTC	2	8	101425	101432	0 %	25 %	25 %	50 %	156740106
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2243	NC_009767	GCA	2	6	111609	111614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740116
2244	NC_009767	GCG	2	6	111618	111623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740116
2245	NC_009767	GCC	2	6	111626	111631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740116
2246	NC_009767	GCC	2	6	111635	111640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740116
2247	NC_009767	GC	4	8	111657	111664	0 %	0 %	50 %	50 %	156740116
2248	NC_009767	CGG	2	6	111678	111683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740116
2249	NC_009767	TGC	2	6	111756	111761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740116
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2253	NC_009767	ATG	2	6	111884	111889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740116
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2259	NC_009767	CTG	2	6	112132	112137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740116
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2317	NC_009767	GAC	2	6	114831	114836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740118
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2332	NC_009767	TGCCG	2	10	115533	115542	0 %	20 %	40 %	40 %	156740119
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2345	NC_009767	CTG	2	6	116215	116220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740119
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2347	NC_009767	GCC	2	6	116247	116252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740119
2348	NC_009767	GAC	2	6	116266	116271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740119
2349	NC_009767	ACGC	2	8	116280	116287	25 %	0 %	25 %	50 %	156740119
2350	NC_009767	AAG	2	6	116296	116301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740119
2351	NC_009767	GGGC	2	8	116311	116318	0 %	0 %	75 %	25 %	156740119
2352	NC_009767	GC	3	6	116317	116322	0 %	0 %	50 %	50 %	156740119
2353	NC_009767	GCG	2	6	116347	116352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740119
2354	NC_009767	CGA	2	6	116361	116366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740119
2355	NC_009767	GTG	2	6	116380	116385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740119
2356	NC_009767	CGAC	2	8	116405	116412	25 %	0 %	25 %	50 %	156740119
2357	NC_009767	GAAC	2	8	116522	116529	50 %	0 %	25 %	25 %	156740120
2358	NC_009767	GAA	2	6	116532	116537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740120
2359	NC_009767	TCA	2	6	116587	116592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740120
2360	NC_009767	ACT	2	6	116596	116601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740120
2361	NC_009767	CATA	2	8	116727	116734	50 %	25 %	0 %	25 %	156740120
2362	NC_009767	GAG	2	6	116739	116744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740120
2363	NC_009767	CAG	2	6	116751	116756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740120
2364	NC_009767	TAC	2	6	116781	116786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740120
2365	NC_009767	GTACAA	2	12	116953	116964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156740121
2366	NC_009767	CGA	2	6	117040	117045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740121
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2487	NC_009767	CGA	2	6	122407	122412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740126
2488	NC_009767	TCG	2	6	122469	122474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740126
2489	NC_009767	TCC	2	6	122520	122525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740126
2490	NC_009767	G	7	7	122553	122559	0 %	0 %	100 %	0 %	156740126
2491	NC_009767	CG	3	6	122583	122588	0 %	0 %	50 %	50 %	156740126
2492	NC_009767	CGC	2	6	122609	122614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740126
2493	NC_009767	CGT	2	6	122679	122684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740126
2494	NC_009767	CAT	2	6	122711	122716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740126
2495	NC_009767	CGC	2	6	122780	122785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740127
2496	NC_009767	GCG	2	6	122835	122840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740127
2497	NC_009767	CAG	2	6	122853	122858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740127
2498	NC_009767	CAG	2	6	122905	122910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740127
2499	NC_009767	TTC	2	6	122965	122970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740127
2500	NC_009767	GTGCA	2	10	122978	122987	20 %	20 %	40 %	20 %	156740127

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