MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 113938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009767	GC	3	6	54726	54731	0 %	0 %	50 %	50 %	156740068
1003	NC_009767	CGC	2	6	54751	54756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740068
1004	NC_009767	CGT	2	6	54768	54773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740068
1005	NC_009767	CGC	2	6	54797	54802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740068
1006	NC_009767	GT	3	6	54838	54843	0 %	50 %	50 %	0 %	156740068
1007	NC_009767	CGT	2	6	54852	54857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740068
1008	NC_009767	GCT	2	6	54905	54910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740068
1009	NC_009767	GC	3	6	54923	54928	0 %	0 %	50 %	50 %	156740068
1010	NC_009767	CGT	2	6	54936	54941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740068
1011	NC_009767	GCT	2	6	54976	54981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740068
1012	NC_009767	GATC	2	8	54984	54991	25 %	25 %	25 %	25 %	156740068
1013	NC_009767	CG	3	6	55003	55008	0 %	0 %	50 %	50 %	156740068
1014	NC_009767	CGG	2	6	55017	55022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740068
1015	NC_009767	GTC	2	6	55036	55041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740068
1016	NC_009767	GC	3	6	55043	55048	0 %	0 %	50 %	50 %	156740068
1017	NC_009767	GGC	2	6	55049	55054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740068
1018	NC_009767	TGAG	2	8	55082	55089	25 %	25 %	50 %	0 %	156740068
1019	NC_009767	GATG	2	8	55092	55099	25 %	25 %	50 %	0 %	156740068
1020	NC_009767	CTGGCG	2	12	55138	55149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	156740068
1021	NC_009767	GAA	2	6	55243	55248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740068
1022	NC_009767	CGA	2	6	55320	55325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740068
1023	NC_009767	GCG	3	9	55391	55399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740068
1024	NC_009767	CG	5	10	55398	55407	0 %	0 %	50 %	50 %	156740068
1025	NC_009767	CAA	2	6	55445	55450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740068
1026	NC_009767	CG	3	6	55520	55525	0 %	0 %	50 %	50 %	156740068
1027	NC_009767	CA	3	6	55550	55555	50 %	0 %	0 %	50 %	156740068
1028	NC_009767	CGATC	2	10	55556	55565	20 %	20 %	20 %	40 %	156740068
1029	NC_009767	GC	3	6	55575	55580	0 %	0 %	50 %	50 %	156740068
1030	NC_009767	GC	3	6	55604	55609	0 %	0 %	50 %	50 %	156740068
1031	NC_009767	TGC	2	6	55613	55618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740068
1032	NC_009767	TCG	2	6	55622	55627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740068
1033	NC_009767	CTT	2	6	55716	55721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740068
1034	NC_009767	TG	3	6	55773	55778	0 %	50 %	50 %	0 %	156740068
1035	NC_009767	GCG	2	6	55852	55857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740069
1036	NC_009767	GGCG	2	8	55909	55916	0 %	0 %	75 %	25 %	156740069
1037	NC_009767	CAA	2	6	55919	55924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740069
1038	NC_009767	GCC	2	6	55980	55985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740069
1039	NC_009767	GC	4	8	55987	55994	0 %	0 %	50 %	50 %	156740069
1040	NC_009767	CGG	2	6	56066	56071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740069
1041	NC_009767	CTG	2	6	56157	56162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740069
1042	NC_009767	ACC	2	6	56244	56249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740069
1043	NC_009767	GCAGCC	2	12	56251	56262	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156740069
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1045	NC_009767	GC	3	6	56424	56429	0 %	0 %	50 %	50 %	156740069
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1047	NC_009767	AAT	2	6	56480	56485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156740069
1048	NC_009767	ACG	2	6	56491	56496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740069
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1053	NC_009767	CA	3	6	56659	56664	50 %	0 %	0 %	50 %	156740069
1054	NC_009767	GC	3	6	57083	57088	0 %	0 %	50 %	50 %	156740070
1055	NC_009767	GCT	2	6	57091	57096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740070
1056	NC_009767	CGAA	2	8	57097	57104	50 %	0 %	25 %	25 %	156740070
1057	NC_009767	GC	3	6	57143	57148	0 %	0 %	50 %	50 %	156740070
1058	NC_009767	GTC	2	6	57245	57250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740070
1059	NC_009767	GC	3	6	57303	57308	0 %	0 %	50 %	50 %	156740070
1060	NC_009767	GC	3	6	57355	57360	0 %	0 %	50 %	50 %	156740070
1061	NC_009767	CTC	2	6	57458	57463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740070
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1063	NC_009767	CA	3	6	57635	57640	50 %	0 %	0 %	50 %	156740070
1064	NC_009767	TGA	2	6	57702	57707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740070
1065	NC_009767	GCG	2	6	57708	57713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740070
1066	NC_009767	ATC	2	6	57773	57778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740070
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1068	NC_009767	TGC	2	6	57859	57864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740070
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1074	NC_009767	ATGGC	2	10	58162	58171	20 %	20 %	40 %	20 %	156740071
1075	NC_009767	CTGCG	2	10	58242	58251	0 %	20 %	40 %	40 %	156740071
1076	NC_009767	GCT	2	6	58259	58264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740071
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1078	NC_009767	GCCG	2	8	58302	58309	0 %	0 %	50 %	50 %	156740071
1079	NC_009767	CG	3	6	58308	58313	0 %	0 %	50 %	50 %	156740071
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1084	NC_009767	GC	3	6	58496	58501	0 %	0 %	50 %	50 %	156740071
1085	NC_009767	GCAC	2	8	58577	58584	25 %	0 %	25 %	50 %	156740071
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1087	NC_009767	CG	3	6	58630	58635	0 %	0 %	50 %	50 %	156740071
1088	NC_009767	TC	3	6	58651	58656	0 %	50 %	0 %	50 %	156740071
1089	NC_009767	CGG	2	6	58673	58678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740071
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1091	NC_009767	C	6	6	58792	58797	0 %	0 %	0 %	100 %	156740071
1092	NC_009767	CTC	2	6	58827	58832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740071
1093	NC_009767	TAC	2	6	58902	58907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740071
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1097	NC_009767	GAT	2	6	59403	59408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740072
1098	NC_009767	CAA	2	6	59439	59444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740072
1099	NC_009767	GTC	2	6	59446	59451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740072
1100	NC_009767	CATCAC	2	12	59565	59576	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	156740072
1101	NC_009767	AC	3	6	59575	59580	50 %	0 %	0 %	50 %	156740072
1102	NC_009767	AAC	2	6	59612	59617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740072
1103	NC_009767	TGCC	2	8	59670	59677	0 %	25 %	25 %	50 %	156740072
1104	NC_009767	GC	3	6	59691	59696	0 %	0 %	50 %	50 %	156740072
1105	NC_009767	GTC	2	6	59716	59721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740072
1106	NC_009767	AAC	2	6	59742	59747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740072
1107	NC_009767	GTC	2	6	59827	59832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740072
1108	NC_009767	CG	3	6	59870	59875	0 %	0 %	50 %	50 %	156740072
1109	NC_009767	GT	3	6	59904	59909	0 %	50 %	50 %	0 %	156740072
1110	NC_009767	CAC	2	6	60046	60051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740072
1111	NC_009767	AGA	2	6	60075	60080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740072
1112	NC_009767	TAC	2	6	60085	60090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740072
1113	NC_009767	TGAG	2	8	60140	60147	25 %	25 %	50 %	0 %	156740072
1114	NC_009767	GCT	2	6	60150	60155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740072
1115	NC_009767	GTG	2	6	60172	60177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740072
1116	NC_009767	CCG	2	6	60218	60223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740072
1117	NC_009767	CGCA	2	8	60235	60242	25 %	0 %	25 %	50 %	156740072
1118	NC_009767	CAG	2	6	60277	60282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740072
1119	NC_009767	ACG	2	6	60433	60438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740073
1120	NC_009767	CACCGT	2	12	60506	60517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	156740073
1121	NC_009767	GGC	2	6	60577	60582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740073
1122	NC_009767	TCG	2	6	60609	60614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740073
1123	NC_009767	GAAA	2	8	60625	60632	75 %	0 %	25 %	0 %	156740073
1124	NC_009767	GCG	2	6	60650	60655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740073
1125	NC_009767	GCA	2	6	60745	60750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740073
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