MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 113938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009767	CAG	3	9	31018	31026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740052
502	NC_009767	GAA	2	6	31056	31061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740052
503	NC_009767	CGA	2	6	31185	31190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740052
504	NC_009767	GGC	2	6	31205	31210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740052
505	NC_009767	CGA	2	6	31272	31277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740052
506	NC_009767	GGA	2	6	31296	31301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740052
507	NC_009767	GAG	2	6	31357	31362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740052
508	NC_009767	GGC	2	6	31485	31490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740052
509	NC_009767	CCG	2	6	31513	31518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740052
510	NC_009767	G	6	6	31603	31608	0 %	0 %	100 %	0 %	156740052
511	NC_009767	ATG	2	6	31620	31625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740053
512	NC_009767	CTG	2	6	31647	31652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740053
513	NC_009767	CTGCG	2	10	31684	31693	0 %	20 %	40 %	40 %	156740053
514	NC_009767	ATC	2	6	31696	31701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740053
515	NC_009767	ACC	2	6	31729	31734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740053
516	NC_009767	GAA	2	6	31767	31772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740053
517	NC_009767	TCTCA	2	10	31833	31842	20 %	40 %	0 %	40 %	156740053
518	NC_009767	CGC	2	6	31860	31865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740053
519	NC_009767	GGC	2	6	31938	31943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740053
520	NC_009767	GGTC	2	8	31958	31965	0 %	25 %	50 %	25 %	156740053
521	NC_009767	AC	3	6	31993	31998	50 %	0 %	0 %	50 %	156740053
522	NC_009767	TGGC	2	8	32007	32014	0 %	25 %	50 %	25 %	156740053
523	NC_009767	GGT	2	6	32018	32023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740053
524	NC_009767	GCT	3	9	32090	32098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740053
525	NC_009767	GGC	2	6	32099	32104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740053
526	NC_009767	GCT	2	6	32117	32122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740053
527	NC_009767	TCG	2	6	32139	32144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740053
528	NC_009767	GCT	2	6	32339	32344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740054
529	NC_009767	TCCCA	2	10	32390	32399	20 %	20 %	0 %	60 %	156740054
530	NC_009767	GCG	2	6	32401	32406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740054
531	NC_009767	CA	3	6	32417	32422	50 %	0 %	0 %	50 %	156740054
532	NC_009767	CCGT	2	8	32423	32430	0 %	25 %	25 %	50 %	156740054
533	NC_009767	GC	3	6	32431	32436	0 %	0 %	50 %	50 %	156740054
534	NC_009767	GC	3	6	32449	32454	0 %	0 %	50 %	50 %	156740054
535	NC_009767	TCCG	2	8	32455	32462	0 %	25 %	25 %	50 %	156740054
536	NC_009767	GC	3	6	32477	32482	0 %	0 %	50 %	50 %	156740054
537	NC_009767	CCGC	2	8	32486	32493	0 %	0 %	25 %	75 %	156740054
538	NC_009767	CACG	2	8	32522	32529	25 %	0 %	25 %	50 %	156740054
539	NC_009767	GC	3	6	32532	32537	0 %	0 %	50 %	50 %	156740054
540	NC_009767	TGC	2	6	32594	32599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740054
541	NC_009767	AAC	2	6	32612	32617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740054
542	NC_009767	GTC	2	6	33619	33624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740055
543	NC_009767	GC	3	6	33669	33674	0 %	0 %	50 %	50 %	156740055
544	NC_009767	GGAG	2	8	33706	33713	25 %	0 %	75 %	0 %	156740055
545	NC_009767	TCGGCT	2	12	33770	33781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740055
546	NC_009767	GAT	2	6	33811	33816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740055
547	NC_009767	CG	3	6	33909	33914	0 %	0 %	50 %	50 %	156740055
548	NC_009767	CTT	2	6	33919	33924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740055
549	NC_009767	CGT	2	6	34042	34047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740055
550	NC_009767	CTA	3	9	34430	34438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740056
551	NC_009767	ACGGTG	2	12	34506	34517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	156740056
552	NC_009767	CGAGA	2	10	34548	34557	40 %	0 %	40 %	20 %	156740056
553	NC_009767	CG	3	6	34595	34600	0 %	0 %	50 %	50 %	156740056
554	NC_009767	GAT	2	6	34613	34618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740056
555	NC_009767	ATG	2	6	34663	34668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740056
556	NC_009767	TGG	2	6	34705	34710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740056
557	NC_009767	CG	3	6	34722	34727	0 %	0 %	50 %	50 %	156740056
558	NC_009767	CAT	2	6	34752	34757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740056
559	NC_009767	CGG	2	6	34783	34788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740056
560	NC_009767	TCG	2	6	34795	34800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740056
561	NC_009767	GC	3	6	34802	34807	0 %	0 %	50 %	50 %	156740056
562	NC_009767	TCC	2	6	34819	34824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740056
563	NC_009767	GCG	2	6	34830	34835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740056
564	NC_009767	CCG	2	6	34929	34934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740056
565	NC_009767	GCC	3	9	34965	34973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740056
566	NC_009767	CTG	2	6	35055	35060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740056
567	NC_009767	CGC	2	6	35081	35086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740056
568	NC_009767	CGT	2	6	35126	35131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740056
569	NC_009767	ACG	2	6	35134	35139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740056
570	NC_009767	GCCA	2	8	35155	35162	25 %	0 %	25 %	50 %	156740056
571	NC_009767	GCA	2	6	35174	35179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740056
572	NC_009767	CCTT	2	8	35191	35198	0 %	50 %	0 %	50 %	156740056
573	NC_009767	ATG	2	6	35277	35282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740056
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579	NC_009767	TTGG	2	8	35528	35535	0 %	50 %	50 %	0 %	156740056
580	NC_009767	GC	4	8	35565	35572	0 %	0 %	50 %	50 %	156740056
581	NC_009767	GCC	2	6	35575	35580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740056
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584	NC_009767	CGA	2	6	35629	35634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740056
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589	NC_009767	ACA	2	6	35977	35982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740056
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593	NC_009767	TGG	2	6	36117	36122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740056
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599	NC_009767	GC	3	6	36465	36470	0 %	0 %	50 %	50 %	156740056
600	NC_009767	ATC	2	6	36475	36480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740056
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608	NC_009767	CGTT	2	8	36813	36820	0 %	50 %	25 %	25 %	156740057
609	NC_009767	TGC	2	6	36888	36893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740057
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611	NC_009767	TGT	2	6	36918	36923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156740057
612	NC_009767	AGC	2	6	36941	36946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740057
613	NC_009767	TGGC	2	8	37007	37014	0 %	25 %	50 %	25 %	156740057
614	NC_009767	CTT	2	6	37024	37029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740057
615	NC_009767	GAA	2	6	37079	37084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740057
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617	NC_009767	CTG	2	6	37127	37132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740057
618	NC_009767	CGG	2	6	37180	37185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740057
619	NC_009767	CGA	2	6	37186	37191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740057
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621	NC_009767	TTC	2	6	37283	37288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740057
622	NC_009767	AAT	2	6	37319	37324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156740057
623	NC_009767	GC	3	6	37336	37341	0 %	0 %	50 %	50 %	156740057
624	NC_009767	GCG	2	6	37410	37415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740057
625	NC_009767	GCC	2	6	37418	37423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740057
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