MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 113938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009767	TTGC	2	8	246141	246148	0 %	50 %	25 %	25 %	156740223
5002	NC_009767	TCG	3	9	246150	246158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5003	NC_009767	GC	3	6	246175	246180	0 %	0 %	50 %	50 %	156740223
5004	NC_009767	TCG	2	6	246238	246243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5005	NC_009767	GGC	2	6	246249	246254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740223
5006	NC_009767	CCG	2	6	246279	246284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740223
5007	NC_009767	TCG	2	6	246309	246314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5008	NC_009767	GCA	2	6	246381	246386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5009	NC_009767	CGC	2	6	246412	246417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740223
5010	NC_009767	GCG	2	6	246439	246444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740223
5011	NC_009767	CAGC	2	8	246476	246483	25 %	0 %	25 %	50 %	156740223
5012	NC_009767	GGGA	2	8	246518	246525	25 %	0 %	75 %	0 %	156740223
5013	NC_009767	CAC	2	6	246644	246649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740223
5014	NC_009767	TGC	2	6	246650	246655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5015	NC_009767	TCG	2	6	246676	246681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5016	NC_009767	CCG	2	6	246726	246731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740223
5017	NC_009767	TGG	2	6	246763	246768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740223
5018	NC_009767	TCG	2	6	246802	246807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5019	NC_009767	TCG	2	6	246829	246834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5020	NC_009767	TCG	2	6	246856	246861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5021	NC_009767	TCG	2	6	246883	246888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5022	NC_009767	TCG	2	6	246910	246915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5023	NC_009767	TCG	2	6	246937	246942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5024	NC_009767	CGG	2	6	246947	246952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740223
5025	NC_009767	CGG	2	6	247004	247009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740223
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5032	NC_009767	GC	3	6	247414	247419	0 %	0 %	50 %	50 %	156740223
5033	NC_009767	CGA	2	6	247423	247428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5034	NC_009767	CCG	2	6	247557	247562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740223
5035	NC_009767	GC	3	6	247689	247694	0 %	0 %	50 %	50 %	156740223
5036	NC_009767	CTG	2	6	247817	247822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740223
5037	NC_009767	CGACG	2	10	247828	247837	20 %	0 %	40 %	40 %	156740223
5038	NC_009767	CGG	2	6	247838	247843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740223
5039	NC_009767	AACGAT	2	12	247868	247879	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	156740223
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5041	NC_009767	GAC	2	6	248878	248883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740224
5042	NC_009767	ACG	2	6	248914	248919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740224
5043	NC_009767	TCA	2	6	248950	248955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740224
5044	NC_009767	GGA	2	6	248963	248968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156740224
5045	NC_009767	CGA	2	6	248975	248980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740224
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5050	NC_009767	CGC	2	6	249122	249127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740224
5051	NC_009767	TCT	2	6	249145	249150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740224
5052	NC_009767	CG	3	6	249178	249183	0 %	0 %	50 %	50 %	156740224
5053	NC_009767	CTG	2	6	249192	249197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740224
5054	NC_009767	ACG	2	6	249211	249216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740224
5055	NC_009767	ATC	2	6	249273	249278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740224
5056	NC_009767	CAC	2	6	249291	249296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740224
5057	NC_009767	TTC	2	6	249501	249506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740224
5058	NC_009767	TGG	2	6	249552	249557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740224
5059	NC_009767	TCG	2	6	249599	249604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740224
5060	NC_009767	AGC	2	6	249607	249612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740224
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5062	NC_009767	CG	4	8	249719	249726	0 %	0 %	50 %	50 %	156740225
5063	NC_009767	TGG	2	6	249778	249783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740225
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5065	NC_009767	CGG	2	6	249830	249835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740225
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5068	NC_009767	CG	3	6	250014	250019	0 %	0 %	50 %	50 %	156740225
5069	NC_009767	CAA	2	6	250163	250168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740225
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5079	NC_009767	CGGCT	2	10	250596	250605	0 %	20 %	40 %	40 %	156740225
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5087	NC_009767	GGC	2	6	251289	251294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740226
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5089	NC_009767	TAC	2	6	251367	251372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740226
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5092	NC_009767	CGC	2	6	251469	251474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740226
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5095	NC_009767	CG	3	6	251686	251691	0 %	0 %	50 %	50 %	156740226
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5100	NC_009767	ACTGAT	2	12	251857	251868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156740226
5101	NC_009767	GGCA	2	8	252153	252160	25 %	0 %	50 %	25 %	156740227
5102	NC_009767	ATGG	2	8	252189	252196	25 %	25 %	50 %	0 %	156740227
5103	NC_009767	TG	3	6	252209	252214	0 %	50 %	50 %	0 %	156740227
5104	NC_009767	TTA	2	6	252221	252226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156740227
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5107	NC_009767	GACA	2	8	252435	252442	50 %	0 %	25 %	25 %	156740227
5108	NC_009767	CTC	2	6	252446	252451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740227
5109	NC_009767	TGC	2	6	252530	252535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740227
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5112	NC_009767	TGA	2	6	252704	252709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740227
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5114	NC_009767	CG	3	6	252734	252739	0 %	0 %	50 %	50 %	156740227
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5116	NC_009767	TGGA	2	8	252870	252877	25 %	25 %	50 %	0 %	156740227
5117	NC_009767	GCT	2	6	252888	252893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740227
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5119	NC_009767	CGC	2	6	253040	253045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740227
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5242	NC_009767	TCA	2	6	259171	259176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740231
5243	NC_009767	GC	3	6	259188	259193	0 %	0 %	50 %	50 %	156740231
5244	NC_009767	ACC	2	6	259195	259200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740231
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5247	NC_009767	GCC	2	6	259361	259366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740231
5248	NC_009767	CTG	2	6	259434	259439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740231
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5251	NC_009767	TGC	2	6	259522	259527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740231
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5254	NC_009767	CGC	3	9	259612	259620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740231
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5265	NC_009767	TCG	2	6	260072	260077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740232
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5349	NC_009767	GC	3	6	264337	264342	0 %	0 %	50 %	50 %	156740235
5350	NC_009767	CTG	2	6	264365	264370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740235
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5352	NC_009767	CGA	2	6	264430	264435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740235
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5354	NC_009767	GGCG	2	8	264601	264608	0 %	0 %	75 %	25 %	156740235
5355	NC_009767	GC	3	6	264629	264634	0 %	0 %	50 %	50 %	156740235
5356	NC_009767	GCC	2	6	264650	264655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740235
5357	NC_009767	GCAC	2	8	264711	264718	25 %	0 %	25 %	50 %	156740235
5358	NC_009767	GCT	2	6	264735	264740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740235
5359	NC_009767	TCA	2	6	264816	264821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740236
5360	NC_009767	CGGCAT	2	12	264823	264834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	156740236
5361	NC_009767	ATC	2	6	264904	264909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740236
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5363	NC_009767	GGC	2	6	264949	264954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740236
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