MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 4005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009523	TGGCG	2	10	525	534	0 %	20 %	60 %	20 %	148654189
2	NC_009523	GTGAT	2	10	2328	2337	20 %	40 %	40 %	0 %	148654190
3	NC_009523	GGGCG	2	10	2607	2616	0 %	0 %	80 %	20 %	148654190
4	NC_009523	GATGG	2	10	2624	2633	20 %	20 %	60 %	0 %	148654190
5	NC_009523	CGCAA	2	10	3674	3683	40 %	0 %	20 %	40 %	148654191
6	NC_009523	GAGCG	2	10	4215	4224	20 %	0 %	60 %	20 %	148654192
7	NC_009523	TGCAC	2	10	4439	4448	20 %	20 %	20 %	40 %	148654192
8	NC_009523	GGTCG	2	10	4650	4659	0 %	20 %	60 %	20 %	148654192
9	NC_009523	GCGAT	2	10	6633	6642	20 %	20 %	40 %	20 %	148654193
10	NC_009523	TTCGG	2	10	7270	7279	0 %	40 %	40 %	20 %	148654194
11	NC_009523	GACGC	2	10	9686	9695	20 %	0 %	40 %	40 %	148654197
12	NC_009523	ATGCG	2	10	10360	10369	20 %	20 %	40 %	20 %	148654197
13	NC_009523	GACGG	2	10	12569	12578	20 %	0 %	60 %	20 %	148654198
14	NC_009523	GGTGA	2	10	13426	13435	20 %	20 %	60 %	0 %	148654199
15	NC_009523	ACCCG	2	10	14698	14707	20 %	0 %	20 %	60 %	148654200
16	NC_009523	TGTTC	2	10	17350	17359	0 %	60 %	20 %	20 %	148654202
17	NC_009523	CGATA	2	10	23472	23481	40 %	20 %	20 %	20 %	148654211
18	NC_009523	GGAAG	2	10	26292	26301	40 %	0 %	60 %	0 %	148654213
19	NC_009523	TTCGT	2	10	26973	26982	0 %	60 %	20 %	20 %	148654214
20	NC_009523	CGCGG	2	10	28005	28014	0 %	0 %	60 %	40 %	148654214
21	NC_009523	GCATG	2	10	28223	28232	20 %	20 %	40 %	20 %	148654214
22	NC_009523	CCGGT	2	10	29803	29812	0 %	20 %	40 %	40 %	148654216
23	NC_009523	GACGC	2	10	29876	29885	20 %	0 %	40 %	40 %	148654216
24	NC_009523	CGACA	2	10	31168	31177	40 %	0 %	20 %	40 %	148654217
25	NC_009523	GCGCC	2	10	34215	34224	0 %	0 %	40 %	60 %	148654220
26	NC_009523	ACGCC	2	10	37346	37355	20 %	0 %	20 %	60 %	148654222
27	NC_009523	CTGCG	2	10	39190	39199	0 %	20 %	40 %	40 %	148654224
28	NC_009523	ATCGG	2	10	39293	39302	20 %	20 %	40 %	20 %	148654224
29	NC_009523	GCTGG	2	10	39591	39600	0 %	20 %	60 %	20 %	148654224
30	NC_009523	ACCCG	2	10	40349	40358	20 %	0 %	20 %	60 %	148654225
31	NC_009523	GCCGC	2	10	40995	41004	0 %	0 %	40 %	60 %	148654225
32	NC_009523	CGCAG	2	10	43616	43625	20 %	0 %	40 %	40 %	148654228
33	NC_009523	AGACA	2	10	46908	46917	60 %	0 %	20 %	20 %	148654230
34	NC_009523	CGACC	2	10	47834	47843	20 %	0 %	20 %	60 %	148654231
35	NC_009523	GCGCG	2	10	50470	50479	0 %	0 %	60 %	40 %	148654233
36	NC_009523	ATCGT	2	10	50730	50739	20 %	40 %	20 %	20 %	148654233
37	NC_009523	TCAAT	2	10	50788	50797	40 %	40 %	0 %	20 %	148654233
38	NC_009523	TTCAT	2	10	51021	51030	20 %	60 %	0 %	20 %	148654233
39	NC_009523	GCAAC	2	10	51757	51766	40 %	0 %	20 %	40 %	148654233
40	NC_009523	GCTGC	2	10	52354	52363	0 %	20 %	40 %	40 %	148654234
41	NC_009523	CGCGG	2	10	53885	53894	0 %	0 %	60 %	40 %	148654235
42	NC_009523	CAGTT	2	10	54394	54403	20 %	40 %	20 %	20 %	148654235
43	NC_009523	ACATC	2	10	55558	55567	40 %	20 %	0 %	40 %	148654236
44	NC_009523	ACGCC	2	10	56929	56938	20 %	0 %	20 %	60 %	148654237
45	NC_009523	GTCCA	2	10	57447	57456	20 %	20 %	20 %	40 %	148654238
46	NC_009523	CGGAT	2	10	57560	57569	20 %	20 %	40 %	20 %	148654238
47	NC_009523	ACGGT	2	10	58139	58148	20 %	20 %	40 %	20 %	148654238
48	NC_009523	CCTGC	2	10	58300	58309	0 %	20 %	20 %	60 %	148654238
49	NC_009523	GCGGT	2	10	63329	63338	0 %	20 %	60 %	20 %	148654243
50	NC_009523	GGGTC	2	10	63420	63429	0 %	20 %	60 %	20 %	148654243
51	NC_009523	GATCA	2	10	65223	65232	40 %	20 %	20 %	20 %	148654244
52	NC_009523	TGGCG	2	10	65694	65703	0 %	20 %	60 %	20 %	148654244
53	NC_009523	CAGGT	2	10	65989	65998	20 %	20 %	40 %	20 %	148654244
54	NC_009523	GTTGC	2	10	67537	67546	0 %	40 %	40 %	20 %	148654245
55	NC_009523	CGGCG	2	10	73738	73747	0 %	0 %	60 %	40 %	148654250
56	NC_009523	GCGCG	2	10	73764	73773	0 %	0 %	60 %	40 %	148654250
57	NC_009523	GTCCG	2	10	74916	74925	0 %	20 %	40 %	40 %	148654251
58	NC_009523	TCCAG	2	10	75401	75410	20 %	20 %	20 %	40 %	148654251
59	NC_009523	CCGAT	2	10	75679	75688	20 %	20 %	20 %	40 %	148654251
60	NC_009523	GGCGC	2	10	78575	78584	0 %	0 %	60 %	40 %	148654252
61	NC_009523	CGGCG	2	10	79214	79223	0 %	0 %	60 %	40 %	148654252
62	NC_009523	TCGCC	2	10	80356	80365	0 %	20 %	20 %	60 %	148654252
63	NC_009523	CCTTC	2	10	80459	80468	0 %	40 %	0 %	60 %	148654252
64	NC_009523	GGTTG	2	10	81494	81503	0 %	40 %	60 %	0 %	148654252
65	NC_009523	GAGCA	2	10	81798	81807	40 %	0 %	40 %	20 %	148654252
66	NC_009523	GCACC	2	10	85446	85455	20 %	0 %	20 %	60 %	148654255
67	NC_009523	TTGCG	2	10	86700	86709	0 %	40 %	40 %	20 %	148654256
68	NC_009523	TCCAG	2	10	90045	90054	20 %	20 %	20 %	40 %	148654262
69	NC_009523	CGGCG	2	10	90810	90819	0 %	0 %	60 %	40 %	148654262
70	NC_009523	GTATG	2	10	94136	94145	20 %	40 %	40 %	0 %	148654264
71	NC_009523	GCGCC	2	10	94858	94867	0 %	0 %	40 %	60 %	148654266
72	NC_009523	GGCGC	2	10	96967	96976	0 %	0 %	60 %	40 %	148654268
73	NC_009523	ACAGC	2	10	99136	99145	40 %	0 %	20 %	40 %	148654271
74	NC_009523	GCCAT	2	10	100926	100935	20 %	20 %	20 %	40 %	148654274
75	NC_009523	ACGGC	2	10	101121	101130	20 %	0 %	40 %	40 %	148654274
76	NC_009523	CCCCA	2	10	101479	101488	20 %	0 %	0 %	80 %	148654275
77	NC_009523	TCGCG	2	10	105499	105508	0 %	20 %	40 %	40 %	148654277
78	NC_009523	GGATG	2	10	106075	106084	20 %	20 %	60 %	0 %	148654277
79	NC_009523	TCGAT	2	10	109225	109234	20 %	40 %	20 %	20 %	148654278
80	NC_009523	GACGT	2	10	109287	109296	20 %	20 %	40 %	20 %	148654278
81	NC_009523	GCACT	2	10	109899	109908	20 %	20 %	20 %	40 %	148654279
82	NC_009523	ACGGG	2	10	111654	111663	20 %	0 %	60 %	20 %	148654280
83	NC_009523	TGCGC	2	10	112980	112989	0 %	20 %	40 %	40 %	148654281
84	NC_009523	GGCGT	2	10	113619	113628	0 %	20 %	60 %	20 %	148654281
85	NC_009523	TGGGG	2	10	113890	113899	0 %	20 %	80 %	0 %	148654281
86	NC_009523	GCACC	2	10	114806	114815	20 %	0 %	20 %	60 %	148654282
87	NC_009523	GCGCA	2	10	115422	115431	20 %	0 %	40 %	40 %	148654282
88	NC_009523	TGCGC	2	10	115571	115580	0 %	20 %	40 %	40 %	148654282
89	NC_009523	TCGCC	2	10	122587	122596	0 %	20 %	20 %	60 %	148654287
90	NC_009523	GTTTT	2	10	122734	122743	0 %	80 %	20 %	0 %	148654287
91	NC_009523	CGCTT	2	10	124334	124343	0 %	40 %	20 %	40 %	148654289
92	NC_009523	GACGC	2	10	124349	124358	20 %	0 %	40 %	40 %	148654289
93	NC_009523	ACCGA	2	10	124470	124479	40 %	0 %	20 %	40 %	148654289
94	NC_009523	GCATG	2	10	125158	125167	20 %	20 %	40 %	20 %	148654290
95	NC_009523	GCGCA	2	10	126791	126800	20 %	0 %	40 %	40 %	148654293
96	NC_009523	GCGCA	2	10	128791	128800	20 %	0 %	40 %	40 %	148654295
97	NC_009523	CGCCA	2	10	129510	129519	20 %	0 %	20 %	60 %	148654295
98	NC_009523	AACGA	2	10	132337	132346	60 %	0 %	20 %	20 %	148654297
99	NC_009523	AGCGC	2	10	133690	133699	20 %	0 %	40 %	40 %	148654298
100	NC_009523	ATCGC	2	10	136041	136050	20 %	20 %	20 %	40 %	148654300
101	NC_009523	CTGCG	2	10	137089	137098	0 %	20 %	40 %	40 %	148654301
102	NC_009523	CGCAG	2	10	139665	139674	20 %	0 %	40 %	40 %	148654304
103	NC_009523	TGGCG	2	10	142678	142687	0 %	20 %	60 %	20 %	148654305
104	NC_009523	CAGCG	2	10	143004	143013	20 %	0 %	40 %	40 %	148654305
105	NC_009523	CTGCT	2	10	144391	144400	0 %	40 %	20 %	40 %	148654306
106	NC_009523	GCGCC	2	10	145783	145792	0 %	0 %	40 %	60 %	148654307
107	NC_009523	GACGC	2	10	150319	150328	20 %	0 %	40 %	40 %	148654311
108	NC_009523	GCTGC	2	10	153655	153664	0 %	20 %	40 %	40 %	148654313
109	NC_009523	ACCTG	2	10	153840	153849	20 %	20 %	20 %	40 %	148654313
110	NC_009523	GCGCA	2	10	155674	155683	20 %	0 %	40 %	40 %	148654313
111	NC_009523	AGCGC	2	10	157964	157973	20 %	0 %	40 %	40 %	148654314
112	NC_009523	AGCGC	2	10	160274	160283	20 %	0 %	40 %	40 %	148654314
113	NC_009523	GGATC	2	10	160753	160762	20 %	20 %	40 %	20 %	148654315
114	NC_009523	GGCGA	2	10	161033	161042	20 %	0 %	60 %	20 %	148654315
115	NC_009523	GCTCT	2	10	163270	163279	0 %	40 %	20 %	40 %	148654317
116	NC_009523	CGCAG	2	10	169500	169509	20 %	0 %	40 %	40 %	148654318
117	NC_009523	CAGTC	2	10	170248	170257	20 %	20 %	20 %	40 %	148654319
118	NC_009523	CAGAT	2	10	170408	170417	40 %	20 %	20 %	20 %	148654319
119	NC_009523	ACTCG	2	10	170813	170822	20 %	20 %	20 %	40 %	148654320
120	NC_009523	GCATG	2	10	171347	171356	20 %	20 %	40 %	20 %	148654320
121	NC_009523	CGCCA	2	10	171509	171518	20 %	0 %	20 %	60 %	148654320
122	NC_009523	CGCCC	2	10	171695	171704	0 %	0 %	20 %	80 %	148654320
123	NC_009523	CGCTG	2	10	171812	171821	0 %	20 %	40 %	40 %	148654320
124	NC_009523	GCAAC	2	10	172477	172486	40 %	0 %	20 %	40 %	148654321
125	NC_009523	GTCCG	2	10	174188	174197	0 %	20 %	40 %	40 %	148654321
126	NC_009523	AGCGC	2	10	175138	175147	20 %	0 %	40 %	40 %	148654322
127	NC_009523	CACCG	2	10	175830	175839	20 %	0 %	20 %	60 %	148654323
128	NC_009523	GCAGG	2	10	176320	176329	20 %	0 %	60 %	20 %	148654323
129	NC_009523	GCTCG	2	10	177385	177394	0 %	20 %	40 %	40 %	148654324
130	NC_009523	GCTCT	2	10	177881	177890	0 %	40 %	20 %	40 %	148654324
131	NC_009523	ACGCG	2	10	180684	180693	20 %	0 %	40 %	40 %	148654325
132	NC_009523	CCGAT	2	10	183998	184007	20 %	20 %	20 %	40 %	148654330
133	NC_009523	CTGCG	2	10	184463	184472	0 %	20 %	40 %	40 %	148654330
134	NC_009523	GGTTC	2	10	185119	185128	0 %	40 %	40 %	20 %	148654330
135	NC_009523	GATGT	2	10	187328	187337	20 %	40 %	40 %	0 %	148654331
136	NC_009523	CTGCG	2	10	189660	189669	0 %	20 %	40 %	40 %	148654331
137	NC_009523	ATGGT	2	10	192216	192225	20 %	40 %	40 %	0 %	148654333
138	NC_009523	GATGC	2	10	193900	193909	20 %	20 %	40 %	20 %	148654334
139	NC_009523	CGGCT	2	10	194805	194814	0 %	20 %	40 %	40 %	148654334
140	NC_009523	GGAGC	2	10	197064	197073	20 %	0 %	60 %	20 %	148654335
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142	NC_009523	AAAAC	2	10	200640	200649	80 %	0 %	0 %	20 %	148654338
143	NC_009523	GGCGA	2	10	200787	200796	20 %	0 %	60 %	20 %	148654338
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146	NC_009523	TGATC	2	10	208600	208609	20 %	40 %	20 %	20 %	148654345
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149	NC_009523	GCGCA	2	10	213998	214007	20 %	0 %	40 %	40 %	148654351
150	NC_009523	CCGGC	2	10	215300	215309	0 %	0 %	40 %	60 %	148654352
151	NC_009523	ACGGG	2	10	217115	217124	20 %	0 %	60 %	20 %	148654352
152	NC_009523	CGACG	2	10	217401	217410	20 %	0 %	40 %	40 %	148654352
153	NC_009523	GCACA	2	10	217994	218003	40 %	0 %	20 %	40 %	148654353
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155	NC_009523	CCCTG	2	10	220169	220178	0 %	20 %	20 %	60 %	148654356
156	NC_009523	CGCGC	2	10	220216	220225	0 %	0 %	40 %	60 %	148654356
157	NC_009523	TGCGC	2	10	220236	220245	0 %	20 %	40 %	40 %	148654356
158	NC_009523	ACCAC	2	10	220421	220430	40 %	0 %	0 %	60 %	148654356
159	NC_009523	GATCA	2	10	223194	223203	40 %	20 %	20 %	20 %	148654358
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164	NC_009523	ACTCG	2	10	228166	228175	20 %	20 %	20 %	40 %	148654361
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166	NC_009523	TCCCA	2	10	229190	229199	20 %	20 %	0 %	60 %	148654362
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168	NC_009523	TGCCG	2	10	229716	229725	0 %	20 %	40 %	40 %	148654363
169	NC_009523	TCACC	2	10	232206	232215	20 %	20 %	0 %	60 %	148654366
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174	NC_009523	GCCGC	2	10	243513	243522	0 %	0 %	40 %	60 %	148654378
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244	NC_009523	TCGAC	2	10	348180	348189	20 %	20 %	20 %	40 %	148654455
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248	NC_009523	CGCGA	2	10	358362	358371	20 %	0 %	40 %	40 %	148654458
249	NC_009523	CGCAG	2	10	358771	358780	20 %	0 %	40 %	40 %	148654458
250	NC_009523	GAGAC	2	10	359400	359409	40 %	0 %	40 %	20 %	148654458
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252	NC_009523	AGCGC	2	10	360430	360439	20 %	0 %	40 %	40 %	148654459
253	NC_009523	CGGCG	2	10	360719	360728	0 %	0 %	60 %	40 %	148654460
254	NC_009523	AGCGC	2	10	361675	361684	20 %	0 %	40 %	40 %	148654460
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259	NC_009523	GAAGA	2	10	364723	364732	60 %	0 %	40 %	0 %	148654463
260	NC_009523	GGGGA	2	10	365259	365268	20 %	0 %	80 %	0 %	148654463
261	NC_009523	CTGCG	2	10	365478	365487	0 %	20 %	40 %	40 %	148654463
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382	NC_009523	GGCAA	2	10	528726	528735	40 %	0 %	40 %	20 %	148654589
383	NC_009523	CCGAA	2	10	532643	532652	40 %	0 %	20 %	40 %	148654592
384	NC_009523	GGTGC	2	10	532848	532857	0 %	20 %	60 %	20 %	148654592
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388	NC_009523	GCGAT	2	10	534947	534956	20 %	20 %	40 %	20 %	148654594
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