MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009523	GAG	2	6	194213	194218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654334
4002	NC_009523	ACC	2	6	194241	194246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654334
4003	NC_009523	ATC	2	6	194298	194303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654334
4004	NC_009523	CGC	2	6	194311	194316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654334
4005	NC_009523	GAT	2	6	194354	194359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654334
4006	NC_009523	GTT	2	6	194362	194367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654334
4007	NC_009523	CAG	2	6	194408	194413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654334
4008	NC_009523	CTT	2	6	194434	194439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654334
4009	NC_009523	CTC	2	6	194453	194458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654334
4010	NC_009523	GCC	2	6	194463	194468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654334
4011	NC_009523	TGC	2	6	194475	194480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654334
4012	NC_009523	GAA	2	6	194503	194508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654334
4013	NC_009523	CGG	2	6	194534	194539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654334
4014	NC_009523	CG	3	6	194540	194545	0 %	0 %	50 %	50 %	148654334
4015	NC_009523	GAA	2	6	194566	194571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654334
4016	NC_009523	GTG	2	6	194574	194579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654334
4017	NC_009523	GTT	2	6	194586	194591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654334
4018	NC_009523	CCG	2	6	194629	194634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654334
4019	NC_009523	CCA	2	6	194677	194682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654334
4020	NC_009523	GGC	2	6	194691	194696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654334
4021	NC_009523	CCG	2	6	194754	194759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654334
4022	NC_009523	CGGCT	2	10	194805	194814	0 %	20 %	40 %	40 %	148654334
4023	NC_009523	CGA	2	6	194815	194820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654334
4024	NC_009523	CCG	2	6	194851	194856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654334
4025	NC_009523	GTC	2	6	194897	194902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654334
4026	NC_009523	CAT	2	6	194912	194917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654334
4027	NC_009523	GAT	2	6	195000	195005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654335
4028	NC_009523	GC	4	8	195012	195019	0 %	0 %	50 %	50 %	148654335
4029	NC_009523	GC	3	6	195037	195042	0 %	0 %	50 %	50 %	148654335
4030	NC_009523	CTT	2	6	195084	195089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654335
4031	NC_009523	CTG	2	6	195093	195098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4032	NC_009523	TGC	2	6	195131	195136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4033	NC_009523	TGC	2	6	195210	195215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4034	NC_009523	ATGCCG	2	12	195240	195251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4035	NC_009523	AATC	2	8	195292	195299	50 %	25 %	0 %	25 %	148654335
4036	NC_009523	TCA	2	6	195320	195325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654335
4037	NC_009523	CAT	2	6	195330	195335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654335
4038	NC_009523	CGATCA	2	12	195336	195347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148654335
4039	NC_009523	CGG	2	6	195367	195372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654335
4040	NC_009523	CGT	2	6	195412	195417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4041	NC_009523	GCA	2	6	195422	195427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4042	NC_009523	ACA	2	6	195432	195437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654335
4043	NC_009523	GCA	2	6	195453	195458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4044	NC_009523	CAT	2	6	195474	195479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654335
4045	NC_009523	TTG	2	6	195491	195496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654335
4046	NC_009523	AGG	2	6	195500	195505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654335
4047	NC_009523	GCC	2	6	195526	195531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654335
4048	NC_009523	CAA	2	6	195586	195591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654335
4049	NC_009523	TGC	2	6	195599	195604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4050	NC_009523	GCG	2	6	195611	195616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654335
4051	NC_009523	GC	3	6	195635	195640	0 %	0 %	50 %	50 %	148654335
4052	NC_009523	GGTT	2	8	195718	195725	0 %	50 %	50 %	0 %	148654335
4053	NC_009523	GAGTGC	2	12	195742	195753	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148654335
4054	NC_009523	CAA	2	6	195761	195766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654335
4055	NC_009523	ACA	2	6	195782	195787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654335
4056	NC_009523	GC	3	6	195793	195798	0 %	0 %	50 %	50 %	148654335
4057	NC_009523	TAT	2	6	195802	195807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654335
4058	NC_009523	CT	3	6	195850	195855	0 %	50 %	0 %	50 %	148654335
4059	NC_009523	ATTC	2	8	195897	195904	25 %	50 %	0 %	25 %	148654335
4060	NC_009523	CATC	2	8	196167	196174	25 %	25 %	0 %	50 %	148654335
4061	NC_009523	AGT	2	6	196179	196184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654335
4062	NC_009523	CTG	2	6	196236	196241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4063	NC_009523	CAG	2	6	196294	196299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4064	NC_009523	CG	3	6	196333	196338	0 %	0 %	50 %	50 %	148654335
4065	NC_009523	GTA	2	6	196339	196344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654335
4066	NC_009523	GC	3	6	196441	196446	0 %	0 %	50 %	50 %	148654335
4067	NC_009523	TCC	2	6	196451	196456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654335
4068	NC_009523	CTT	2	6	196470	196475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654335
4069	NC_009523	T	6	6	196474	196479	0 %	100 %	0 %	0 %	148654335
4070	NC_009523	CGG	2	6	196488	196493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654335
4071	NC_009523	CGA	2	6	196506	196511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654335
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4073	NC_009523	GAA	2	6	196651	196656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654335
4074	NC_009523	CAG	2	6	196676	196681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4075	NC_009523	TCC	2	6	196784	196789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654335
4076	NC_009523	CGTC	2	8	196830	196837	0 %	25 %	25 %	50 %	148654335
4077	NC_009523	CGG	2	6	196846	196851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654335
4078	NC_009523	TGC	3	9	196890	196898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654335
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4080	NC_009523	GGT	2	6	196972	196977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654335
4081	NC_009523	GGAGC	2	10	197064	197073	20 %	0 %	60 %	20 %	148654335
4082	NC_009523	TCT	2	6	197078	197083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654335
4083	NC_009523	AGA	2	6	197106	197111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654335
4084	NC_009523	GAA	2	6	197131	197136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654335
4085	NC_009523	CAGG	2	8	197218	197225	25 %	0 %	50 %	25 %	148654335
4086	NC_009523	TGA	2	6	197235	197240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654335
4087	NC_009523	AG	3	6	197256	197261	50 %	0 %	50 %	0 %	148654335
4088	NC_009523	CAG	2	6	197263	197268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654335
4089	NC_009523	ATC	2	6	198228	198233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654336
4090	NC_009523	GAC	2	6	198333	198338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654336
4091	NC_009523	CGTT	2	8	198352	198359	0 %	50 %	25 %	25 %	148654336
4092	NC_009523	GAA	2	6	198403	198408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654336
4093	NC_009523	CGC	2	6	198435	198440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654336
4094	NC_009523	TGA	2	6	198587	198592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654336
4095	NC_009523	CAG	2	6	198793	198798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654337
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4100	NC_009523	GCC	2	6	198937	198942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654337
4101	NC_009523	TGTGC	2	10	198960	198969	0 %	40 %	40 %	20 %	148654337
4102	NC_009523	GCC	2	6	199007	199012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654337
4103	NC_009523	AGC	2	6	199052	199057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654337
4104	NC_009523	TCG	2	6	199124	199129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654337
4105	NC_009523	GCGCAC	2	12	199158	199169	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148654337
4106	NC_009523	CAAT	2	8	199187	199194	50 %	25 %	0 %	25 %	148654337
4107	NC_009523	TGC	2	6	199196	199201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654337
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4109	NC_009523	CAG	2	6	199288	199293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654337
4110	NC_009523	GC	3	6	199307	199312	0 %	0 %	50 %	50 %	148654337
4111	NC_009523	CGTC	2	8	199317	199324	0 %	25 %	25 %	50 %	148654337
4112	NC_009523	TGG	2	6	199328	199333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654337
4113	NC_009523	GCG	2	6	199335	199340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654337
4114	NC_009523	CGGT	2	8	199385	199392	0 %	25 %	50 %	25 %	148654337
4115	NC_009523	GC	3	6	199424	199429	0 %	0 %	50 %	50 %	148654337
4116	NC_009523	AGCC	2	8	199461	199468	25 %	0 %	25 %	50 %	148654337
4117	NC_009523	CCG	2	6	199502	199507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654337
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4119	NC_009523	CGC	2	6	200508	200513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654338
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4121	NC_009523	CGC	2	6	200591	200596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654338
4122	NC_009523	ACA	2	6	200602	200607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654338
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4147	NC_009523	CCTG	2	8	201194	201201	0 %	25 %	25 %	50 %	148654338
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4226	NC_009523	GCA	2	6	206097	206102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654340
4227	NC_009523	GC	3	6	206103	206108	0 %	0 %	50 %	50 %	148654340
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4230	NC_009523	CTG	2	6	206229	206234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654341
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4234	NC_009523	ATC	2	6	206369	206374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654341
4235	NC_009523	AG	3	6	206417	206422	50 %	0 %	50 %	0 %	148654341
4236	NC_009523	CAT	2	6	206425	206430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654341
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4238	NC_009523	CGA	2	6	206471	206476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654341
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4240	NC_009523	TC	3	6	206535	206540	0 %	50 %	0 %	50 %	148654341
4241	NC_009523	GAC	2	6	206603	206608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654341
4242	NC_009523	AGCA	2	8	206840	206847	50 %	0 %	25 %	25 %	148654342
4243	NC_009523	TCG	2	6	206878	206883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654342
4244	NC_009523	CTG	2	6	206922	206927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654342
4245	NC_009523	ATC	2	6	206943	206948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654342
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4247	NC_009523	GC	3	6	207066	207071	0 %	0 %	50 %	50 %	148654342
4248	NC_009523	GTGC	2	8	207099	207106	0 %	25 %	50 %	25 %	148654342
4249	NC_009523	CGC	2	6	207134	207139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654342
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4261	NC_009523	GATC	2	8	207600	207607	25 %	25 %	25 %	25 %	148654343
4262	NC_009523	GCGA	2	8	207649	207656	25 %	0 %	50 %	25 %	148654343
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4270	NC_009523	CGA	2	6	207928	207933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654344
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4272	NC_009523	ATC	2	6	207974	207979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654344
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4275	NC_009523	TGT	2	6	208360	208365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654345
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4317	NC_009523	TGGT	2	8	210624	210631	0 %	50 %	50 %	0 %	148654348
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4345	NC_009523	AGC	2	6	211751	211756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654349
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4358	NC_009523	GCA	2	6	212395	212400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654349
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4363	NC_009523	TGCA	2	8	212576	212583	25 %	25 %	25 %	25 %	148654349
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4461	NC_009523	CGACG	2	10	217401	217410	20 %	0 %	40 %	40 %	148654352
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4464	NC_009523	GCACA	2	10	217994	218003	40 %	0 %	20 %	40 %	148654353
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4475	NC_009523	GTG	2	6	218801	218806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654355
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4477	NC_009523	CGG	2	6	218915	218920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654355
4478	NC_009523	G	6	6	218927	218932	0 %	0 %	100 %	0 %	148654355
4479	NC_009523	CAC	2	6	218937	218942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654355
4480	NC_009523	CGC	2	6	218963	218968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654355
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4482	NC_009523	ATG	2	6	219034	219039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654355
4483	NC_009523	CAG	2	6	219047	219052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654355
4484	NC_009523	GCCGAT	2	12	219072	219083	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148654355
4485	NC_009523	TCA	2	6	219098	219103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654355
4486	NC_009523	GCC	2	6	219169	219174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654355
4487	NC_009523	CGC	2	6	219192	219197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654355
4488	NC_009523	TGA	2	6	219236	219241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654355
4489	NC_009523	GCC	2	6	219318	219323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654355
4490	NC_009523	GCC	2	6	219400	219405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654355
4491	NC_009523	CGC	2	6	219410	219415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654355
4492	NC_009523	CAG	2	6	219417	219422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654355
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4496	NC_009523	GGC	2	6	219540	219545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654355
4497	NC_009523	GAT	2	6	219552	219557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654355
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4499	NC_009523	TGA	2	6	219665	219670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654355
4500	NC_009523	CTC	2	6	219685	219690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654356

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