MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009523	CG	3	6	170349	170354	0 %	0 %	50 %	50 %	148654319
3502	NC_009523	GTC	2	6	170368	170373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654319
3503	NC_009523	GCT	2	6	170377	170382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654319
3504	NC_009523	GCG	2	6	170383	170388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654319
3505	NC_009523	GGC	2	6	170393	170398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654319
3506	NC_009523	CAGAT	2	10	170408	170417	40 %	20 %	20 %	20 %	148654319
3507	NC_009523	GC	3	6	170421	170426	0 %	0 %	50 %	50 %	148654319
3508	NC_009523	TGC	2	6	170550	170555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654319
3509	NC_009523	CTT	2	6	170599	170604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654319
3510	NC_009523	TTG	2	6	170773	170778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654320
3511	NC_009523	ACTCG	2	10	170813	170822	20 %	20 %	20 %	40 %	148654320
3512	NC_009523	TGT	2	6	170840	170845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654320
3513	NC_009523	CGG	2	6	170864	170869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654320
3514	NC_009523	CGG	2	6	170941	170946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654320
3515	NC_009523	CGC	2	6	170949	170954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654320
3516	NC_009523	GCG	2	6	170981	170986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654320
3517	NC_009523	CGCT	2	8	171076	171083	0 %	25 %	25 %	50 %	148654320
3518	NC_009523	CCG	2	6	171093	171098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654320
3519	NC_009523	CTG	2	6	171117	171122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654320
3520	NC_009523	AAC	2	6	171179	171184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654320
3521	NC_009523	TTTC	2	8	171233	171240	0 %	75 %	0 %	25 %	148654320
3522	NC_009523	CGG	2	6	171251	171256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654320
3523	NC_009523	GCA	2	6	171330	171335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654320
3524	NC_009523	GCATG	2	10	171347	171356	20 %	20 %	40 %	20 %	148654320
3525	NC_009523	AAC	2	6	171370	171375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654320
3526	NC_009523	GCGG	2	8	171445	171452	0 %	0 %	75 %	25 %	148654320
3527	NC_009523	GAA	2	6	171480	171485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654320
3528	NC_009523	GGT	3	9	171500	171508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654320
3529	NC_009523	CGCCA	2	10	171509	171518	20 %	0 %	20 %	60 %	148654320
3530	NC_009523	GCG	2	6	171528	171533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654320
3531	NC_009523	CGG	2	6	171590	171595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654320
3532	NC_009523	CGC	2	6	171635	171640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654320
3533	NC_009523	CGCCC	2	10	171695	171704	0 %	0 %	20 %	80 %	148654320
3534	NC_009523	GTC	2	6	171706	171711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654320
3535	NC_009523	TGA	2	6	171752	171757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654320
3536	NC_009523	TC	3	6	171761	171766	0 %	50 %	0 %	50 %	148654320
3537	NC_009523	CG	3	6	171768	171773	0 %	0 %	50 %	50 %	148654320
3538	NC_009523	GCG	2	6	171788	171793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654320
3539	NC_009523	CGCTG	2	10	171812	171821	0 %	20 %	40 %	40 %	148654320
3540	NC_009523	GCG	2	6	171822	171827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654320
3541	NC_009523	AGC	2	6	171966	171971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654320
3542	NC_009523	TGC	2	6	171977	171982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654320
3543	NC_009523	GAT	2	6	171983	171988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654320
3544	NC_009523	GGCA	2	8	172027	172034	25 %	0 %	50 %	25 %	148654320
3545	NC_009523	GC	3	6	172202	172207	0 %	0 %	50 %	50 %	148654321
3546	NC_009523	GCC	2	6	172236	172241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654321
3547	NC_009523	TCG	2	6	172245	172250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654321
3548	NC_009523	GCG	2	6	172276	172281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654321
3549	NC_009523	TCA	2	6	172299	172304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654321
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3551	NC_009523	GTC	2	6	172408	172413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654321
3552	NC_009523	GCA	2	6	172414	172419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654321
3553	NC_009523	GTC	2	6	172436	172441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654321
3554	NC_009523	GCAAC	2	10	172477	172486	40 %	0 %	20 %	40 %	148654321
3555	NC_009523	GC	3	6	172490	172495	0 %	0 %	50 %	50 %	148654321
3556	NC_009523	CGTG	2	8	172497	172504	0 %	25 %	50 %	25 %	148654321
3557	NC_009523	GTTCCT	2	12	172537	172548	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148654321
3558	NC_009523	CAGC	2	8	172633	172640	25 %	0 %	25 %	50 %	148654321
3559	NC_009523	CACG	2	8	172649	172656	25 %	0 %	25 %	50 %	148654321
3560	NC_009523	ATG	2	6	172658	172663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654321
3561	NC_009523	ACGC	2	8	172678	172685	25 %	0 %	25 %	50 %	148654321
3562	NC_009523	GAT	2	6	172796	172801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654321
3563	NC_009523	GCG	2	6	172878	172883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654321
3564	NC_009523	ACA	2	6	172885	172890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654321
3565	NC_009523	CAC	2	6	172904	172909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654321
3566	NC_009523	CTG	2	6	172917	172922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654321
3567	NC_009523	CCG	2	6	172923	172928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654321
3568	NC_009523	CGG	2	6	172955	172960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654321
3569	NC_009523	CAT	2	6	173015	173020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654321
3570	NC_009523	CAT	2	6	173050	173055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654321
3571	NC_009523	GCG	2	6	173163	173168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654321
3572	NC_009523	CG	3	6	173206	173211	0 %	0 %	50 %	50 %	148654321
3573	NC_009523	TCC	2	6	173298	173303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654321
3574	NC_009523	TTC	2	6	173321	173326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654321
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3579	NC_009523	CAG	3	9	173564	173572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654321
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3581	NC_009523	CGG	2	6	173761	173766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654321
3582	NC_009523	GGT	2	6	173818	173823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654321
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3585	NC_009523	TCG	2	6	173958	173963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654321
3586	NC_009523	GAAC	2	8	173996	174003	50 %	0 %	25 %	25 %	148654321
3587	NC_009523	GACCGA	2	12	174037	174048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654321
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3589	NC_009523	CGC	2	6	174067	174072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654321
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3591	NC_009523	CGAG	2	8	174142	174149	25 %	0 %	50 %	25 %	148654321
3592	NC_009523	GTCCG	2	10	174188	174197	0 %	20 %	40 %	40 %	148654321
3593	NC_009523	TCG	2	6	174228	174233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654321
3594	NC_009523	AG	3	6	174234	174239	50 %	0 %	50 %	0 %	148654321
3595	NC_009523	AGC	2	6	174351	174356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654322
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3599	NC_009523	CG	3	6	174487	174492	0 %	0 %	50 %	50 %	148654322
3600	NC_009523	GC	3	6	174510	174515	0 %	0 %	50 %	50 %	148654322
3601	NC_009523	GATC	2	8	174530	174537	25 %	25 %	25 %	25 %	148654322
3602	NC_009523	TGCG	2	8	174564	174571	0 %	25 %	50 %	25 %	148654322
3603	NC_009523	GC	3	6	174604	174609	0 %	0 %	50 %	50 %	148654322
3604	NC_009523	CAT	2	6	174719	174724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654322
3605	NC_009523	CA	3	6	174736	174741	50 %	0 %	0 %	50 %	148654322
3606	NC_009523	CG	3	6	174749	174754	0 %	0 %	50 %	50 %	148654322
3607	NC_009523	CAG	2	6	174755	174760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654322
3608	NC_009523	TGC	2	6	174802	174807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654322
3609	NC_009523	ACC	2	6	174874	174879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654322
3610	NC_009523	ATG	2	6	174895	174900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654322
3611	NC_009523	GCGCCA	2	12	174911	174922	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148654322
3612	NC_009523	GCCAGC	2	12	174934	174945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148654322
3613	NC_009523	CGG	3	9	175009	175017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654322
3614	NC_009523	GCT	2	6	175018	175023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654322
3615	NC_009523	GCG	3	9	175075	175083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654322
3616	NC_009523	AGCGC	2	10	175138	175147	20 %	0 %	40 %	40 %	148654322
3617	NC_009523	CGA	2	6	175196	175201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654322
3618	NC_009523	GGGC	2	8	175204	175211	0 %	0 %	75 %	25 %	148654322
3619	NC_009523	GTC	2	6	175263	175268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654322
3620	NC_009523	GA	3	6	175278	175283	50 %	0 %	50 %	0 %	148654322
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3622	NC_009523	T	6	6	175571	175576	0 %	100 %	0 %	0 %	148654323
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3984	NC_009523	TCG	2	6	192916	192921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654333
3985	NC_009523	GTC	2	6	193043	193048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654333
3986	NC_009523	GAT	2	6	193595	193600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654334
3987	NC_009523	GGCGCA	2	12	193603	193614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148654334
3988	NC_009523	CGG	2	6	193645	193650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654334
3989	NC_009523	GTC	2	6	193667	193672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654334
3990	NC_009523	GTA	2	6	193712	193717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654334
3991	NC_009523	CCG	2	6	193794	193799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654334
3992	NC_009523	GA	3	6	193845	193850	50 %	0 %	50 %	0 %	148654334
3993	NC_009523	GGGT	2	8	193857	193864	0 %	25 %	75 %	0 %	148654334
3994	NC_009523	GATGC	2	10	193900	193909	20 %	20 %	40 %	20 %	148654334
3995	NC_009523	TGC	2	6	193916	193921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654334
3996	NC_009523	TGAGCC	2	12	193945	193956	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148654334
3997	NC_009523	CG	3	6	193960	193965	0 %	0 %	50 %	50 %	148654334
3998	NC_009523	TGC	2	6	194057	194062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654334
3999	NC_009523	TATC	2	8	194113	194120	25 %	50 %	0 %	25 %	148654334
4000	NC_009523	CTG	2	6	194148	194153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654334

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