MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009523	TAT	2	6	50648	50653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654233
1002	NC_009523	CG	3	6	50691	50696	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1003	NC_009523	ATCGT	2	10	50730	50739	20 %	40 %	20 %	20 %	148654233
1004	NC_009523	TCAAT	2	10	50788	50797	40 %	40 %	0 %	20 %	148654233
1005	NC_009523	CG	3	6	50804	50809	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1006	NC_009523	GC	3	6	50836	50841	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1007	NC_009523	CAA	2	6	50926	50931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654233
1008	NC_009523	GCG	2	6	50934	50939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654233
1009	NC_009523	GC	3	6	50941	50946	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1010	NC_009523	ATC	2	6	50963	50968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654233
1011	NC_009523	GTA	2	6	50999	51004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654233
1012	NC_009523	TTCAT	2	10	51021	51030	20 %	60 %	0 %	20 %	148654233
1013	NC_009523	GACA	2	8	51034	51041	50 %	0 %	25 %	25 %	148654233
1014	NC_009523	GC	3	6	51047	51052	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1015	NC_009523	CGG	2	6	51061	51066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654233
1016	NC_009523	GC	3	6	51069	51074	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1017	NC_009523	CGA	2	6	51172	51177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654233
1018	NC_009523	ACC	2	6	51222	51227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654233
1019	NC_009523	TGCCGG	2	12	51259	51270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654233
1020	NC_009523	AAT	2	6	51326	51331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148654233
1021	NC_009523	AGG	2	6	51386	51391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654233
1022	NC_009523	TTC	2	6	51392	51397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654233
1023	NC_009523	GC	3	6	51414	51419	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1024	NC_009523	GGC	2	6	51434	51439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654233
1025	NC_009523	CG	3	6	51451	51456	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1026	NC_009523	GCTC	2	8	51462	51469	0 %	25 %	25 %	50 %	148654233
1027	NC_009523	GCA	2	6	51490	51495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654233
1028	NC_009523	TCG	2	6	51507	51512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654233
1029	NC_009523	GCA	2	6	51538	51543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654233
1030	NC_009523	CAG	2	6	51578	51583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654233
1031	NC_009523	CGA	2	6	51584	51589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654233
1032	NC_009523	TGC	2	6	51590	51595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654233
1033	NC_009523	CGTTCG	2	12	51645	51656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654233
1034	NC_009523	GCG	2	6	51688	51693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654233
1035	NC_009523	TCC	2	6	51711	51716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654233
1036	NC_009523	TCT	2	6	51732	51737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654233
1037	NC_009523	CGC	2	6	51744	51749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654233
1038	NC_009523	GCAAC	2	10	51757	51766	40 %	0 %	20 %	40 %	148654233
1039	NC_009523	CG	3	6	51814	51819	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1040	NC_009523	TGC	2	6	51962	51967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654233
1041	NC_009523	GC	3	6	52013	52018	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
1042	NC_009523	ATC	2	6	52306	52311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654234
1043	NC_009523	GCTGC	2	10	52354	52363	0 %	20 %	40 %	40 %	148654234
1044	NC_009523	AC	3	6	52487	52492	50 %	0 %	0 %	50 %	148654234
1045	NC_009523	CTG	2	6	52510	52515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654234
1046	NC_009523	CAGA	2	8	52528	52535	50 %	0 %	25 %	25 %	148654234
1047	NC_009523	TGA	2	6	52556	52561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654234
1048	NC_009523	GGT	2	6	52629	52634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654234
1049	NC_009523	GCT	2	6	52659	52664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654234
1050	NC_009523	TGGT	2	8	52721	52728	0 %	50 %	50 %	0 %	148654234
1051	NC_009523	GCA	2	6	52729	52734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654234
1052	NC_009523	GTG	2	6	52739	52744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654234
1053	NC_009523	CGC	2	6	52821	52826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654234
1054	NC_009523	CTG	2	6	52870	52875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654234
1055	NC_009523	ATC	2	6	52930	52935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654234
1056	NC_009523	TGA	2	6	52976	52981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654234
1057	NC_009523	GC	3	6	52998	53003	0 %	0 %	50 %	50 %	148654234
1058	NC_009523	GGT	2	6	53022	53027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654234
1059	NC_009523	CGT	2	6	53046	53051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654234
1060	NC_009523	CAG	2	6	53123	53128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654234
1061	NC_009523	GCG	3	9	53137	53145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654234
1062	NC_009523	GGC	3	9	53175	53183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654234
1063	NC_009523	CGT	2	6	53212	53217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654234
1064	NC_009523	TGAG	2	8	53219	53226	25 %	25 %	50 %	0 %	148654234
1065	NC_009523	GAC	2	6	53376	53381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1066	NC_009523	ACG	2	6	53414	53419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1067	NC_009523	CGC	2	6	53458	53463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654235
1068	NC_009523	CCGA	2	8	53485	53492	25 %	0 %	25 %	50 %	148654235
1069	NC_009523	GTC	2	6	53524	53529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1070	NC_009523	GC	3	6	53559	53564	0 %	0 %	50 %	50 %	148654235
1071	NC_009523	GAC	2	6	53565	53570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1072	NC_009523	CGA	2	6	53613	53618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1073	NC_009523	GGT	2	6	53673	53678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654235
1074	NC_009523	TGC	2	6	53687	53692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1075	NC_009523	TGGCGT	2	12	53745	53756	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148654235
1076	NC_009523	CGG	2	6	53759	53764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654235
1077	NC_009523	ACT	2	6	53822	53827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654235
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1079	NC_009523	CGCGG	2	10	53885	53894	0 %	0 %	60 %	40 %	148654235
1080	NC_009523	ACG	2	6	53920	53925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1081	NC_009523	ATT	2	6	53926	53931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654235
1082	NC_009523	CAA	2	6	53991	53996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654235
1083	NC_009523	TTG	2	6	54014	54019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654235
1084	NC_009523	CAA	2	6	54087	54092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654235
1085	NC_009523	AAC	2	6	54113	54118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654235
1086	NC_009523	TCG	2	6	54137	54142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654235
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1089	NC_009523	CAA	2	6	54222	54227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654235
1090	NC_009523	GC	3	6	54292	54297	0 %	0 %	50 %	50 %	148654235
1091	NC_009523	GCT	2	6	54306	54311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1092	NC_009523	GAT	2	6	54340	54345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654235
1093	NC_009523	CGG	2	6	54362	54367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654235
1094	NC_009523	CAGTT	2	10	54394	54403	20 %	40 %	20 %	20 %	148654235
1095	NC_009523	GCG	2	6	54433	54438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654235
1096	NC_009523	GAG	2	6	54487	54492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654235
1097	NC_009523	GCG	2	6	54507	54512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654235
1098	NC_009523	ATC	2	6	54514	54519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654235
1099	NC_009523	GCG	3	9	54532	54540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654235
1100	NC_009523	GC	3	6	54577	54582	0 %	0 %	50 %	50 %	148654235
1101	NC_009523	GC	3	6	54646	54651	0 %	0 %	50 %	50 %	148654235
1102	NC_009523	TTG	2	6	54665	54670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654235
1103	NC_009523	CAA	2	6	54789	54794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654235
1104	NC_009523	CTT	2	6	54933	54938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654235
1105	NC_009523	CCG	2	6	54991	54996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654235
1106	NC_009523	CGA	2	6	55097	55102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1107	NC_009523	GCA	2	6	55135	55140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1108	NC_009523	GAC	2	6	55152	55157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1109	NC_009523	CTG	2	6	55177	55182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654235
1110	NC_009523	GCC	2	6	55251	55256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654235
1111	NC_009523	TTCA	2	8	55267	55274	25 %	50 %	0 %	25 %	148654235
1112	NC_009523	ACGC	2	8	55276	55283	25 %	0 %	25 %	50 %	148654235
1113	NC_009523	ACATC	2	10	55558	55567	40 %	20 %	0 %	40 %	148654236
1114	NC_009523	AC	3	6	55629	55634	50 %	0 %	0 %	50 %	148654236
1115	NC_009523	AC	3	6	55692	55697	50 %	0 %	0 %	50 %	148654236
1116	NC_009523	ATG	2	6	55722	55727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654236
1117	NC_009523	CTT	2	6	55790	55795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654236
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1120	NC_009523	AGC	2	6	55872	55877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654236
1121	NC_009523	GCC	2	6	55901	55906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654236
1122	NC_009523	CGTC	2	8	55911	55918	0 %	25 %	25 %	50 %	148654236
1123	NC_009523	ACTG	2	8	55928	55935	25 %	25 %	25 %	25 %	148654236
1124	NC_009523	GGA	2	6	55975	55980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654236
1125	NC_009523	GC	3	6	55982	55987	0 %	0 %	50 %	50 %	148654236
1126	NC_009523	GCA	2	6	56019	56024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654236
1127	NC_009523	GCG	2	6	56029	56034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654236
1128	NC_009523	TGA	2	6	56056	56061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654236
1129	NC_009523	GCA	2	6	56106	56111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654236
1130	NC_009523	GTC	2	6	56479	56484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654237
1131	NC_009523	GCCA	2	8	56496	56503	25 %	0 %	25 %	50 %	148654237
1132	NC_009523	GATC	2	8	56530	56537	25 %	25 %	25 %	25 %	148654237
1133	NC_009523	CCG	2	6	56622	56627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654237
1134	NC_009523	C	7	7	56630	56636	0 %	0 %	0 %	100 %	148654237
1135	NC_009523	GCA	2	6	56673	56678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654237
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1137	NC_009523	GAT	2	6	56816	56821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654237
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1139	NC_009523	AGC	2	6	56906	56911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654237
1140	NC_009523	ACGCC	2	10	56929	56938	20 %	0 %	20 %	60 %	148654237
1141	NC_009523	ACGG	2	8	56942	56949	25 %	0 %	50 %	25 %	148654237
1142	NC_009523	GCTG	2	8	57026	57033	0 %	25 %	50 %	25 %	148654237
1143	NC_009523	GCA	2	6	57063	57068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654237
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1146	NC_009523	CCAC	2	8	57205	57212	25 %	0 %	0 %	75 %	148654237
1147	NC_009523	CCA	2	6	57226	57231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654237
1148	NC_009523	CG	3	6	57295	57300	0 %	0 %	50 %	50 %	148654237
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1152	NC_009523	GTCCA	2	10	57447	57456	20 %	20 %	20 %	40 %	148654238
1153	NC_009523	TGA	2	6	57532	57537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654238
1154	NC_009523	GC	3	6	57545	57550	0 %	0 %	50 %	50 %	148654238
1155	NC_009523	CGGAT	2	10	57560	57569	20 %	20 %	40 %	20 %	148654238
1156	NC_009523	CTG	2	6	57626	57631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654238
1157	NC_009523	GGC	2	6	57662	57667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654238
1158	NC_009523	TCA	2	6	57675	57680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654238
1159	NC_009523	TGA	2	6	57690	57695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654238
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1163	NC_009523	AGCG	2	8	58025	58032	25 %	0 %	50 %	25 %	148654238
1164	NC_009523	AGG	2	6	58061	58066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654238
1165	NC_009523	TGC	2	6	58117	58122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654238
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1233	NC_009523	TGC	2	6	62698	62703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654242
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1237	NC_009523	CGG	2	6	62870	62875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654243
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1239	NC_009523	TCT	2	6	63033	63038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654243
1240	NC_009523	GGAT	2	8	63113	63120	25 %	25 %	50 %	0 %	148654243
1241	NC_009523	GAC	2	6	63175	63180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654243
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1243	NC_009523	GCG	2	6	63222	63227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654243
1244	NC_009523	GAT	2	6	63259	63264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654243
1245	NC_009523	TCA	3	9	63269	63277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654243
1246	NC_009523	GCGGT	2	10	63329	63338	0 %	20 %	60 %	20 %	148654243
1247	NC_009523	CGC	2	6	63404	63409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654243
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1249	NC_009523	TGA	2	6	63471	63476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654243
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1254	NC_009523	TGA	2	6	63843	63848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654243
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1499	NC_009523	CTG	2	6	75106	75111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654251
1500	NC_009523	CGGCAG	2	12	75143	75154	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148654251

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