MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009523	TGCCAT	2	12	572631	572642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148654626
11502	NC_009523	GAC	2	6	572728	572733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11503	NC_009523	CAC	2	6	572770	572775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654626
11504	NC_009523	CAG	2	6	572784	572789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11505	NC_009523	CTG	2	6	572807	572812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11506	NC_009523	CCG	2	6	572973	572978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654626
11507	NC_009523	CGT	2	6	573077	573082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11508	NC_009523	AAC	2	6	573112	573117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654626
11509	NC_009523	ACC	2	6	573142	573147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654626
11510	NC_009523	GTC	2	6	573202	573207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11511	NC_009523	GAC	2	6	573255	573260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11512	NC_009523	CCA	2	6	573266	573271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654626
11513	NC_009523	CGA	2	6	573281	573286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11514	NC_009523	ATCC	2	8	573322	573329	25 %	25 %	0 %	50 %	148654626
11515	NC_009523	GAT	2	6	573333	573338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654626
11516	NC_009523	CAG	2	6	573339	573344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11517	NC_009523	CGT	2	6	573354	573359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11518	NC_009523	GATCG	2	10	573390	573399	20 %	20 %	40 %	20 %	148654626
11519	NC_009523	ACG	2	6	573417	573422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11520	NC_009523	CGA	2	6	573470	573475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11521	NC_009523	CAG	2	6	573522	573527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11522	NC_009523	GAAC	2	8	573542	573549	50 %	0 %	25 %	25 %	148654626
11523	NC_009523	CTG	2	6	573591	573596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11524	NC_009523	CTT	2	6	573605	573610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654626
11525	NC_009523	CGT	2	6	573616	573621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11526	NC_009523	TTCGAG	2	12	573639	573650	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148654626
11527	NC_009523	CCG	2	6	573712	573717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654626
11528	NC_009523	AGA	2	6	573759	573764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654626
11529	NC_009523	CGT	2	6	573791	573796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11530	NC_009523	TCG	2	6	573830	573835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11531	NC_009523	GGCG	2	8	573863	573870	0 %	0 %	75 %	25 %	148654626
11532	NC_009523	CG	4	8	573869	573876	0 %	0 %	50 %	50 %	148654626
11533	NC_009523	GC	3	6	573879	573884	0 %	0 %	50 %	50 %	148654626
11534	NC_009523	CCT	2	6	573899	573904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654626
11535	NC_009523	ACG	2	6	573907	573912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11536	NC_009523	GC	3	6	573929	573934	0 %	0 %	50 %	50 %	148654626
11537	NC_009523	GGC	2	6	573937	573942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654626
11538	NC_009523	TCG	2	6	573952	573957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11539	NC_009523	CAT	2	6	573965	573970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654626
11540	NC_009523	GGT	2	6	573981	573986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654626
11541	NC_009523	CGC	2	6	574101	574106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654626
11542	NC_009523	TGC	2	6	574135	574140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11543	NC_009523	GTG	2	6	574158	574163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654626
11544	NC_009523	GCA	2	6	574183	574188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11545	NC_009523	TGC	2	6	574210	574215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11546	NC_009523	CG	3	6	574235	574240	0 %	0 %	50 %	50 %	148654626
11547	NC_009523	CTC	2	6	574254	574259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654626
11548	NC_009523	CGG	2	6	574265	574270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654626
11549	NC_009523	TTG	2	6	574299	574304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654626
11550	NC_009523	CG	3	6	574316	574321	0 %	0 %	50 %	50 %	148654626
11551	NC_009523	GAT	2	6	574353	574358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654626
11552	NC_009523	AGT	2	6	574387	574392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654626
11553	NC_009523	ACG	2	6	574405	574410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11554	NC_009523	CGA	2	6	574424	574429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11555	NC_009523	CTG	2	6	574517	574522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11556	NC_009523	TGT	2	6	574582	574587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654626
11557	NC_009523	CG	3	6	574678	574683	0 %	0 %	50 %	50 %	148654626
11558	NC_009523	CGA	2	6	574691	574696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11559	NC_009523	TGC	2	6	574725	574730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654626
11560	NC_009523	GAT	2	6	574731	574736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654626
11561	NC_009523	TGGC	2	8	575326	575333	0 %	25 %	50 %	25 %	148654627
11562	NC_009523	GGCGCT	2	12	575355	575366	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654627
11563	NC_009523	GCGTCG	2	12	575378	575389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654627
11564	NC_009523	GAC	3	9	575459	575467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654627
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11567	NC_009523	GC	3	6	575497	575502	0 %	0 %	50 %	50 %	148654627
11568	NC_009523	GCCCG	2	10	575504	575513	0 %	0 %	40 %	60 %	148654627
11569	NC_009523	CCGT	2	8	575526	575533	0 %	25 %	25 %	50 %	148654627
11570	NC_009523	ACTG	2	8	575603	575610	25 %	25 %	25 %	25 %	148654627
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11575	NC_009523	GCA	2	6	575675	575680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654627
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11577	NC_009523	GCT	2	6	575792	575797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654627
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11579	NC_009523	GC	3	6	575853	575858	0 %	0 %	50 %	50 %	148654627
11580	NC_009523	GCG	3	9	575889	575897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654627
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11584	NC_009523	GCC	2	6	575990	575995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654627
11585	NC_009523	TGCG	2	8	576059	576066	0 %	25 %	50 %	25 %	148654627
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11589	NC_009523	CGT	2	6	576174	576179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654627
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11592	NC_009523	GC	3	6	576296	576301	0 %	0 %	50 %	50 %	148654627
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11599	NC_009523	AG	3	6	576435	576440	50 %	0 %	50 %	0 %	148654627
11600	NC_009523	GCT	2	6	576479	576484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654627
11601	NC_009523	GCC	2	6	576524	576529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654627
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11603	NC_009523	GCG	2	6	576618	576623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654627
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11616	NC_009523	GTCGGT	2	12	577315	577326	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148654628
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