MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009523	G	6	6	25939	25944	0 %	0 %	100 %	0 %	148654213
502	NC_009523	TGC	2	6	26129	26134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654213
503	NC_009523	AGG	2	6	26138	26143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654213
504	NC_009523	GGAAG	2	10	26292	26301	40 %	0 %	60 %	0 %	148654213
505	NC_009523	CAC	2	6	26311	26316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654213
506	NC_009523	GGC	2	6	26321	26326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654213
507	NC_009523	TCGC	2	8	26346	26353	0 %	25 %	25 %	50 %	148654213
508	NC_009523	GCC	2	6	26354	26359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
509	NC_009523	CAC	2	6	26377	26382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654213
510	NC_009523	CGG	3	9	26386	26394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654213
511	NC_009523	GCC	2	6	26437	26442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
512	NC_009523	CAG	2	6	26518	26523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654213
513	NC_009523	GAAA	2	8	26559	26566	75 %	0 %	25 %	0 %	148654213
514	NC_009523	CGC	3	9	26569	26577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
515	NC_009523	AAC	2	6	26593	26598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654213
516	NC_009523	CGCCAG	2	12	26617	26628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148654213
517	NC_009523	A	6	6	26638	26643	100 %	0 %	0 %	0 %	148654213
518	NC_009523	CGC	2	6	26644	26649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654213
519	NC_009523	GC	4	8	26692	26699	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
520	NC_009523	GCG	2	6	26712	26717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654213
521	NC_009523	CA	3	6	26741	26746	50 %	0 %	0 %	50 %	148654213
522	NC_009523	CCA	2	6	26775	26780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654213
523	NC_009523	A	6	6	26793	26798	100 %	0 %	0 %	0 %	148654213
524	NC_009523	CGG	2	6	26929	26934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654214
525	NC_009523	TTCGT	2	10	26973	26982	0 %	60 %	20 %	20 %	148654214
526	NC_009523	CGA	2	6	27010	27015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654214
527	NC_009523	CGAA	2	8	27062	27069	50 %	0 %	25 %	25 %	148654214
528	NC_009523	GTCG	2	8	27097	27104	0 %	25 %	50 %	25 %	148654214
529	NC_009523	CG	3	6	27133	27138	0 %	0 %	50 %	50 %	148654214
530	NC_009523	CGC	2	6	27170	27175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654214
531	NC_009523	CCG	2	6	27189	27194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654214
532	NC_009523	CGA	2	6	27220	27225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654214
533	NC_009523	CG	3	6	27238	27243	0 %	0 %	50 %	50 %	148654214
534	NC_009523	TCA	2	6	27298	27303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654214
535	NC_009523	GCAC	2	8	27351	27358	25 %	0 %	25 %	50 %	148654214
536	NC_009523	CCA	2	6	27364	27369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654214
537	NC_009523	AGC	2	6	27405	27410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654214
538	NC_009523	TCG	2	6	27432	27437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
539	NC_009523	CAC	2	6	27445	27450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654214
540	NC_009523	TGC	2	6	27457	27462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
541	NC_009523	CAGC	2	8	27463	27470	25 %	0 %	25 %	50 %	148654214
542	NC_009523	TCA	2	6	27478	27483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654214
543	NC_009523	GAA	2	6	27527	27532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654214
544	NC_009523	CGT	2	6	27582	27587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
545	NC_009523	CCG	2	6	27616	27621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654214
546	NC_009523	TCG	2	6	27624	27629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
547	NC_009523	TTC	2	6	27663	27668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654214
548	NC_009523	CTG	2	6	27686	27691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
549	NC_009523	TGA	2	6	27752	27757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654214
550	NC_009523	AGC	2	6	27764	27769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654214
551	NC_009523	GAA	2	6	27774	27779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654214
552	NC_009523	CGAT	2	8	27795	27802	25 %	25 %	25 %	25 %	148654214
553	NC_009523	TCG	2	6	27975	27980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
554	NC_009523	CGCGG	2	10	28005	28014	0 %	0 %	60 %	40 %	148654214
555	NC_009523	AAC	2	6	28053	28058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654214
556	NC_009523	CTG	2	6	28067	28072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654214
557	NC_009523	C	7	7	28095	28101	0 %	0 %	0 %	100 %	148654214
558	NC_009523	CG	3	6	28150	28155	0 %	0 %	50 %	50 %	148654214
559	NC_009523	CGG	2	6	28204	28209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654214
560	NC_009523	GCATG	2	10	28223	28232	20 %	20 %	40 %	20 %	148654214
561	NC_009523	TCC	2	6	28294	28299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654215
562	NC_009523	GCA	2	6	28319	28324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654215
563	NC_009523	CGG	2	6	28355	28360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654215
564	NC_009523	TCA	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654215
565	NC_009523	ATCG	2	8	28437	28444	25 %	25 %	25 %	25 %	148654215
566	NC_009523	GCA	2	6	28495	28500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654215
567	NC_009523	TCT	2	6	28526	28531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654215
568	NC_009523	CGC	2	6	28536	28541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654215
569	NC_009523	CAG	2	6	28563	28568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654215
570	NC_009523	GAC	2	6	28580	28585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654215
571	NC_009523	GCAC	2	8	28624	28631	25 %	0 %	25 %	50 %	148654215
572	NC_009523	CG	3	6	28657	28662	0 %	0 %	50 %	50 %	148654215
573	NC_009523	GC	3	6	28675	28680	0 %	0 %	50 %	50 %	148654215
574	NC_009523	TTG	2	6	28732	28737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654215
575	NC_009523	AAAGTA	2	12	28740	28751	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148654215
576	NC_009523	GTC	2	6	28788	28793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654215
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578	NC_009523	GGT	2	6	29250	29255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654216
579	NC_009523	GGA	2	6	29303	29308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654216
580	NC_009523	CCG	2	6	29374	29379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654216
581	NC_009523	GC	4	8	29389	29396	0 %	0 %	50 %	50 %	148654216
582	NC_009523	TCA	2	6	29483	29488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654216
583	NC_009523	CGG	2	6	29525	29530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654216
584	NC_009523	ACCG	2	8	29732	29739	25 %	0 %	25 %	50 %	148654216
585	NC_009523	TCG	2	6	29778	29783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654216
586	NC_009523	CCGGT	2	10	29803	29812	0 %	20 %	40 %	40 %	148654216
587	NC_009523	GACGC	2	10	29876	29885	20 %	0 %	40 %	40 %	148654216
588	NC_009523	CGA	2	6	29972	29977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654216
589	NC_009523	CGC	2	6	30013	30018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654216
590	NC_009523	TATG	2	8	30054	30061	25 %	50 %	25 %	0 %	148654216
591	NC_009523	TCA	2	6	30187	30192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654216
592	NC_009523	CTC	2	6	31063	31068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654217
593	NC_009523	G	6	6	31072	31077	0 %	0 %	100 %	0 %	148654217
594	NC_009523	CGACA	2	10	31168	31177	40 %	0 %	20 %	40 %	148654217
595	NC_009523	AGC	2	6	31184	31189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654217
596	NC_009523	CTG	2	6	31200	31205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654217
597	NC_009523	CTC	2	6	31345	31350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654217
598	NC_009523	CGG	2	6	31352	31357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654217
599	NC_009523	TTCG	2	8	31363	31370	0 %	50 %	25 %	25 %	148654217
600	NC_009523	TCC	2	6	31393	31398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654218
601	NC_009523	ATC	2	6	31451	31456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654218
602	NC_009523	ATGC	2	8	31493	31500	25 %	25 %	25 %	25 %	148654218
603	NC_009523	CGA	2	6	31522	31527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654218
604	NC_009523	CCA	2	6	31618	31623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654218
605	NC_009523	GAC	2	6	31754	31759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654218
606	NC_009523	CTG	2	6	31799	31804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654218
607	NC_009523	ACG	2	6	31831	31836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654219
608	NC_009523	ATA	2	6	31982	31987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148654219
609	NC_009523	GCA	2	6	32017	32022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654219
610	NC_009523	CAT	2	6	32101	32106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654219
611	NC_009523	TGC	2	6	32141	32146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654219
612	NC_009523	CAG	2	6	32285	32290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654219
613	NC_009523	GC	3	6	32328	32333	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
614	NC_009523	AAC	2	6	32397	32402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654219
615	NC_009523	GC	3	6	32498	32503	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
616	NC_009523	CGC	2	6	32565	32570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654219
617	NC_009523	GC	5	10	32569	32578	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
618	NC_009523	CAG	2	6	32579	32584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654219
619	NC_009523	TTC	2	6	32612	32617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654219
620	NC_009523	AGC	2	6	32631	32636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654219
621	NC_009523	GC	3	6	32635	32640	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
622	NC_009523	CTG	2	6	32672	32677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654219
623	NC_009523	GTA	2	6	32699	32704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654219
624	NC_009523	GC	3	6	32821	32826	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
625	NC_009523	GTA	2	6	32852	32857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654219
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627	NC_009523	CG	3	6	32912	32917	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
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998	NC_009523	TCT	2	6	50578	50583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654233
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