MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_009523	CGC	2	6	267704	267709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654402
5503	NC_009523	GGACG	2	10	267721	267730	20 %	0 %	60 %	20 %	148654402
5504	NC_009523	TGC	2	6	267791	267796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654402
5505	NC_009523	GCT	2	6	267885	267890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654402
5506	NC_009523	GGT	2	6	267900	267905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654402
5507	NC_009523	AGC	2	6	267907	267912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654402
5508	NC_009523	GCC	2	6	267958	267963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654402
5509	NC_009523	GCG	2	6	268061	268066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654402
5510	NC_009523	GAG	2	6	268068	268073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654402
5511	NC_009523	CGAA	2	8	268091	268098	50 %	0 %	25 %	25 %	148654402
5512	NC_009523	GCC	2	6	268102	268107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654402
5513	NC_009523	CAG	2	6	268113	268118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654402
5514	NC_009523	GT	3	6	269244	269249	0 %	50 %	50 %	0 %	148654403
5515	NC_009523	GCA	2	6	269301	269306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654403
5516	NC_009523	GC	3	6	269414	269419	0 %	0 %	50 %	50 %	148654403
5517	NC_009523	CTGT	2	8	269496	269503	0 %	50 %	25 %	25 %	148654403
5518	NC_009523	CTA	2	6	269505	269510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654403
5519	NC_009523	GGC	2	6	269569	269574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654403
5520	NC_009523	AGA	2	6	269585	269590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654403
5521	NC_009523	TCG	2	6	269591	269596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654403
5522	NC_009523	CGG	3	9	269634	269642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654403
5523	NC_009523	GC	3	6	269675	269680	0 %	0 %	50 %	50 %	148654403
5524	NC_009523	CGA	2	6	269727	269732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654403
5525	NC_009523	TC	3	6	269808	269813	0 %	50 %	0 %	50 %	148654403
5526	NC_009523	GAT	2	6	269832	269837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654403
5527	NC_009523	GCT	2	6	269851	269856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654403
5528	NC_009523	GC	3	6	269909	269914	0 %	0 %	50 %	50 %	148654403
5529	NC_009523	TGC	2	6	269957	269962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654403
5530	NC_009523	TTG	2	6	270020	270025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654403
5531	NC_009523	GC	3	6	270084	270089	0 %	0 %	50 %	50 %	148654403
5532	NC_009523	TCG	2	6	270248	270253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654403
5533	NC_009523	CTG	2	6	270254	270259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654403
5534	NC_009523	GGA	2	6	270261	270266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654403
5535	NC_009523	ACT	2	6	270275	270280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654403
5536	NC_009523	GC	4	8	270349	270356	0 %	0 %	50 %	50 %	148654403
5537	NC_009523	GAC	2	6	270405	270410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654403
5538	NC_009523	ATG	2	6	270446	270451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654403
5539	NC_009523	GC	3	6	270456	270461	0 %	0 %	50 %	50 %	148654403
5540	NC_009523	AGC	2	6	270462	270467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654403
5541	NC_009523	GGC	2	6	270471	270476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654403
5542	NC_009523	GAG	2	6	270481	270486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654403
5543	NC_009523	TGGC	2	8	270501	270508	0 %	25 %	50 %	25 %	148654403
5544	NC_009523	GCC	2	6	270535	270540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654403
5545	NC_009523	GC	3	6	270627	270632	0 %	0 %	50 %	50 %	148654403
5546	NC_009523	GC	3	6	270655	270660	0 %	0 %	50 %	50 %	148654403
5547	NC_009523	CGC	2	6	270696	270701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654403
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5550	NC_009523	GTA	2	6	270759	270764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654403
5551	NC_009523	CGC	2	6	270809	270814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654404
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5553	NC_009523	GC	3	6	270879	270884	0 %	0 %	50 %	50 %	148654404
5554	NC_009523	CT	3	6	270935	270940	0 %	50 %	0 %	50 %	148654404
5555	NC_009523	CGG	2	6	271004	271009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654404
5556	NC_009523	CGA	2	6	271012	271017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
5557	NC_009523	ATC	2	6	271019	271024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654404
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5559	NC_009523	GAC	2	6	271091	271096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
5560	NC_009523	ATC	2	6	271128	271133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654404
5561	NC_009523	ATC	2	6	271188	271193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654404
5562	NC_009523	CAGGCG	2	12	271224	271235	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148654404
5563	NC_009523	GC	3	6	271284	271289	0 %	0 %	50 %	50 %	148654404
5564	NC_009523	ACG	2	6	271306	271311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
5565	NC_009523	A	7	7	271315	271321	100 %	0 %	0 %	0 %	148654404
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5570	NC_009523	CGA	2	6	271448	271453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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5572	NC_009523	GCG	2	6	271502	271507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654404
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5578	NC_009523	GCGCC	2	10	271832	271841	0 %	0 %	40 %	60 %	148654404
5579	NC_009523	GCA	2	6	271880	271885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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5587	NC_009523	CTG	2	6	272244	272249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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5602	NC_009523	GC	3	6	272820	272825	0 %	0 %	50 %	50 %	148654404
5603	NC_009523	GGC	2	6	272841	272846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654404
5604	NC_009523	CAACC	2	10	272931	272940	40 %	0 %	0 %	60 %	148654404
5605	NC_009523	TGC	2	6	272956	272961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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5611	NC_009523	TGC	2	6	273158	273163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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5619	NC_009523	GC	3	6	273440	273445	0 %	0 %	50 %	50 %	148654404
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5621	NC_009523	GATCC	2	10	273507	273516	20 %	20 %	20 %	40 %	148654404
5622	NC_009523	GAC	2	6	273530	273535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
5623	NC_009523	GCG	2	6	273546	273551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654404
5624	NC_009523	GAC	2	6	273555	273560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654404
5625	NC_009523	GCT	2	6	273573	273578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654404
5626	NC_009523	CTT	2	6	273596	273601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654404
5627	NC_009523	TCCG	2	8	273616	273623	0 %	25 %	25 %	50 %	148654404
5628	NC_009523	TGC	2	6	273634	273639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654404
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5630	NC_009523	GCC	2	6	273800	273805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654404
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5633	NC_009523	CTGG	2	8	274007	274014	0 %	25 %	50 %	25 %	148654404
5634	NC_009523	GC	3	6	274066	274071	0 %	0 %	50 %	50 %	148654404
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5653	NC_009523	CAT	2	6	274601	274606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654404
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5694	NC_009523	CGGCG	2	10	276306	276315	0 %	0 %	60 %	40 %	148654405
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5701	NC_009523	TGC	2	6	276615	276620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654405
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5712	NC_009523	CGT	2	6	277099	277104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654405
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5738	NC_009523	GCA	2	6	278220	278225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654406
5739	NC_009523	G	6	6	278298	278303	0 %	0 %	100 %	0 %	148654406
5740	NC_009523	CTGACG	2	12	278320	278331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148654406
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5985	NC_009523	GCA	2	6	289228	289233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654415
5986	NC_009523	GCC	2	6	289247	289252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654415
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