MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009523	CAG	2	6	219703	219708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654356
4502	NC_009523	CGG	2	6	219709	219714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654356
4503	NC_009523	GCC	2	6	219724	219729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654356
4504	NC_009523	CGC	2	6	219749	219754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654356
4505	NC_009523	GTC	2	6	219768	219773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654356
4506	NC_009523	TCG	2	6	219866	219871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654356
4507	NC_009523	GACGT	2	10	219892	219901	20 %	20 %	40 %	20 %	148654356
4508	NC_009523	TGG	2	6	219957	219962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654356
4509	NC_009523	CGGG	2	8	219963	219970	0 %	0 %	75 %	25 %	148654356
4510	NC_009523	G	6	6	219968	219973	0 %	0 %	100 %	0 %	148654356
4511	NC_009523	AACG	2	8	219998	220005	50 %	0 %	25 %	25 %	148654356
4512	NC_009523	GT	3	6	220008	220013	0 %	50 %	50 %	0 %	148654356
4513	NC_009523	ATGG	2	8	220045	220052	25 %	25 %	50 %	0 %	148654356
4514	NC_009523	CGC	3	9	220098	220106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654356
4515	NC_009523	GCC	2	6	220160	220165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654356
4516	NC_009523	CCCTG	2	10	220169	220178	0 %	20 %	20 %	60 %	148654356
4517	NC_009523	GGC	2	6	220202	220207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654356
4518	NC_009523	CGCGC	2	10	220216	220225	0 %	0 %	40 %	60 %	148654356
4519	NC_009523	TGCGC	2	10	220236	220245	0 %	20 %	40 %	40 %	148654356
4520	NC_009523	GCC	2	6	220250	220255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654356
4521	NC_009523	GTC	2	6	220258	220263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654356
4522	NC_009523	CCG	2	6	220323	220328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654356
4523	NC_009523	GAT	2	6	220348	220353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654356
4524	NC_009523	GC	3	6	220359	220364	0 %	0 %	50 %	50 %	148654356
4525	NC_009523	AGCG	2	8	220378	220385	25 %	0 %	50 %	25 %	148654356
4526	NC_009523	ACCAC	2	10	220421	220430	40 %	0 %	0 %	60 %	148654356
4527	NC_009523	GC	3	6	220435	220440	0 %	0 %	50 %	50 %	148654356
4528	NC_009523	TGT	2	6	220464	220469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654356
4529	NC_009523	CGC	2	6	220473	220478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654356
4530	NC_009523	CGC	3	9	220491	220499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654356
4531	NC_009523	CGG	2	6	220605	220610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654356
4532	NC_009523	AC	3	6	220612	220617	50 %	0 %	0 %	50 %	148654356
4533	NC_009523	ATC	2	6	220618	220623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654356
4534	NC_009523	GTC	2	6	220781	220786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4535	NC_009523	CTT	2	6	220789	220794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654357
4536	NC_009523	CCG	2	6	220803	220808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654357
4537	NC_009523	TGCG	2	8	220837	220844	0 %	25 %	50 %	25 %	148654357
4538	NC_009523	TGT	2	6	220867	220872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654357
4539	NC_009523	TGC	2	6	220936	220941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4540	NC_009523	CTGA	2	8	220944	220951	25 %	25 %	25 %	25 %	148654357
4541	NC_009523	TGC	2	6	220976	220981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4542	NC_009523	CT	3	6	221007	221012	0 %	50 %	0 %	50 %	148654357
4543	NC_009523	CTG	2	6	221055	221060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4544	NC_009523	GAC	2	6	221084	221089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4545	NC_009523	TGC	2	6	221095	221100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4546	NC_009523	GCG	2	6	221124	221129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654357
4547	NC_009523	CGC	2	6	221150	221155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654357
4548	NC_009523	CTG	2	6	221157	221162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4549	NC_009523	GC	3	6	221193	221198	0 %	0 %	50 %	50 %	148654357
4550	NC_009523	TGA	2	6	221228	221233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654357
4551	NC_009523	TGA	2	6	221236	221241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654357
4552	NC_009523	GC	4	8	221275	221282	0 %	0 %	50 %	50 %	148654357
4553	NC_009523	ATC	2	6	221283	221288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654357
4554	NC_009523	CGG	2	6	221293	221298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654357
4555	NC_009523	GCC	2	6	221316	221321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654357
4556	NC_009523	CGG	2	6	221375	221380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654357
4557	NC_009523	ATG	2	6	221388	221393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654357
4558	NC_009523	TCG	2	6	221407	221412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4559	NC_009523	CGC	2	6	221413	221418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654357
4560	NC_009523	CGC	2	6	221421	221426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654357
4561	NC_009523	GCA	2	6	221435	221440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4562	NC_009523	CGTGCG	2	12	221474	221485	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654357
4563	NC_009523	TGT	2	6	221488	221493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654357
4564	NC_009523	GC	3	6	221556	221561	0 %	0 %	50 %	50 %	148654357
4565	NC_009523	GCC	2	6	221613	221618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654357
4566	NC_009523	TCG	2	6	221650	221655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4567	NC_009523	GCT	3	9	221708	221716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4568	NC_009523	GGC	2	6	221765	221770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654357
4569	NC_009523	GGGC	2	8	221779	221786	0 %	0 %	75 %	25 %	148654357
4570	NC_009523	TGG	2	6	221872	221877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654357
4571	NC_009523	AGTC	2	8	221885	221892	25 %	25 %	25 %	25 %	148654357
4572	NC_009523	CAG	2	6	221912	221917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4573	NC_009523	GTC	2	6	221949	221954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4574	NC_009523	GAT	2	6	221966	221971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654357
4575	NC_009523	GT	3	6	221978	221983	0 %	50 %	50 %	0 %	148654357
4576	NC_009523	ATCT	2	8	221988	221995	25 %	50 %	0 %	25 %	148654357
4577	NC_009523	CGT	2	6	222009	222014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654357
4578	NC_009523	GCC	2	6	222024	222029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654357
4579	NC_009523	TCC	2	6	222166	222171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654358
4580	NC_009523	CGC	2	6	222176	222181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654358
4581	NC_009523	GCG	2	6	222196	222201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654358
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4583	NC_009523	TGT	2	6	222272	222277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654358
4584	NC_009523	GCG	2	6	222283	222288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654358
4585	NC_009523	GTC	2	6	222291	222296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654358
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4587	NC_009523	GCG	2	6	222525	222530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654358
4588	NC_009523	TCG	2	6	222533	222538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654358
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4591	NC_009523	CCG	2	6	222591	222596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654358
4592	NC_009523	GC	5	10	222612	222621	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4593	NC_009523	GGCGCA	2	12	222632	222643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148654358
4594	NC_009523	CG	3	6	222688	222693	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4595	NC_009523	CGG	2	6	222730	222735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654358
4596	NC_009523	GC	4	8	222752	222759	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4597	NC_009523	AAG	2	6	222817	222822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654358
4598	NC_009523	GC	3	6	222830	222835	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4599	NC_009523	GC	3	6	222897	222902	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4600	NC_009523	GC	4	8	222924	222931	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4601	NC_009523	GCAG	2	8	222953	222960	25 %	0 %	50 %	25 %	148654358
4602	NC_009523	ACG	2	6	222964	222969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654358
4603	NC_009523	CGTG	2	8	222974	222981	0 %	25 %	50 %	25 %	148654358
4604	NC_009523	GC	3	6	223004	223009	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4605	NC_009523	GC	3	6	223025	223030	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4606	NC_009523	GGC	2	6	223169	223174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654358
4607	NC_009523	CAA	2	6	223181	223186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654358
4608	NC_009523	GATCA	2	10	223194	223203	40 %	20 %	20 %	20 %	148654358
4609	NC_009523	CG	3	6	223212	223217	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4610	NC_009523	TCA	2	6	223219	223224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654358
4611	NC_009523	CTG	2	6	223251	223256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654358
4612	NC_009523	GCA	2	6	223301	223306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654358
4613	NC_009523	CG	4	8	223324	223331	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4614	NC_009523	GTG	2	6	223353	223358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654358
4615	NC_009523	CGA	2	6	223369	223374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654358
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4617	NC_009523	CGA	2	6	223393	223398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654358
4618	NC_009523	CG	3	6	223410	223415	0 %	0 %	50 %	50 %	148654358
4619	NC_009523	GGT	2	6	223472	223477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654358
4620	NC_009523	GCC	2	6	223514	223519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654358
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4622	NC_009523	GCG	2	6	223544	223549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654358
4623	NC_009523	TGT	3	9	223553	223561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654358
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4626	NC_009523	CTG	2	6	223717	223722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654359
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4652	NC_009523	CG	4	8	225072	225079	0 %	0 %	50 %	50 %	148654359
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4732	NC_009523	ACTCG	2	10	228166	228175	20 %	20 %	20 %	40 %	148654361
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4742	NC_009523	GCT	2	6	228622	228627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654362
4743	NC_009523	CGCT	2	8	228658	228665	0 %	25 %	25 %	50 %	148654362
4744	NC_009523	TC	3	6	228745	228750	0 %	50 %	0 %	50 %	148654362
4745	NC_009523	CGG	2	6	228805	228810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654362
4746	NC_009523	TGGCG	2	10	228852	228861	0 %	20 %	60 %	20 %	148654362
4747	NC_009523	CATT	2	8	228867	228874	25 %	50 %	0 %	25 %	148654362
4748	NC_009523	CCG	2	6	228921	228926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654362
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4751	NC_009523	AT	3	6	229057	229062	50 %	50 %	0 %	0 %	148654362
4752	NC_009523	GCT	2	6	229069	229074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654362
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4755	NC_009523	GGGA	2	8	229215	229222	25 %	0 %	75 %	0 %	148654362
4756	NC_009523	ATC	2	6	229238	229243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654362
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4984	NC_009523	CGG	2	6	241349	241354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654377
4985	NC_009523	TGGC	2	8	241360	241367	0 %	25 %	50 %	25 %	148654377
4986	NC_009523	AGA	2	6	241385	241390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654377
4987	NC_009523	C	6	6	241502	241507	0 %	0 %	0 %	100 %	148654377
4988	NC_009523	CGA	2	6	241516	241521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654377
4989	NC_009523	AAC	2	6	241536	241541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654377
4990	NC_009523	TCT	2	6	241609	241614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654377
4991	NC_009523	CTC	2	6	241616	241621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654377
4992	NC_009523	GAT	2	6	241655	241660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654377
4993	NC_009523	CG	3	6	241678	241683	0 %	0 %	50 %	50 %	148654377
4994	NC_009523	CCG	2	6	241701	241706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654377
4995	NC_009523	ATC	2	6	241790	241795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654377
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4997	NC_009523	CTGC	2	8	241828	241835	0 %	25 %	25 %	50 %	148654377
4998	NC_009523	CCA	2	6	241861	241866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654377
4999	NC_009523	CAG	2	6	241931	241936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654377
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