MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA05

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009433	CCG	2	6	164	169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280385
2	NC_009433	CGC	2	6	211	216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280385
3	NC_009433	GC	3	6	224	229	0 %	0 %	50 %	50 %	146280385
4	NC_009433	CAC	2	6	273	278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280385
5	NC_009433	AGA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280385
6	NC_009433	T	6	6	344	349	0 %	100 %	0 %	0 %	146280385
7	NC_009433	CTA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280385
8	NC_009433	CGG	2	6	403	408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
9	NC_009433	TCG	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280385
10	NC_009433	GAT	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280385
11	NC_009433	TGA	2	6	473	478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280385
12	NC_009433	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
13	NC_009433	TTC	2	6	496	501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280385
14	NC_009433	GCG	2	6	521	526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
15	NC_009433	CCGC	2	8	550	557	0 %	0 %	25 %	75 %	146280385
16	NC_009433	CG	3	6	704	709	0 %	0 %	50 %	50 %	146280385
17	NC_009433	GCG	2	6	727	732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
18	NC_009433	TTC	3	9	763	771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280385
19	NC_009433	ATC	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280386
20	NC_009433	GGC	2	6	2231	2236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280386
21	NC_009433	GCC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280386
22	NC_009433	TCG	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280386
23	NC_009433	GAC	2	6	2291	2296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280386
24	NC_009433	GC	3	6	2318	2323	0 %	0 %	50 %	50 %	146280386
25	NC_009433	TGT	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280386
26	NC_009433	GGC	3	9	2358	2366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280386
27	NC_009433	G	6	6	2378	2383	0 %	0 %	100 %	0 %	146280386
28	NC_009433	GTC	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280386
29	NC_009433	GGA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280386
30	NC_009433	A	7	7	2530	2536	100 %	0 %	0 %	0 %	146280386
31	NC_009433	CG	3	6	2548	2553	0 %	0 %	50 %	50 %	146280386
32	NC_009433	CGC	2	6	2556	2561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280386
33	NC_009433	GCAAG	2	10	2634	2643	40 %	0 %	40 %	20 %	146280387
34	NC_009433	CGG	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280387
35	NC_009433	GC	3	6	2716	2721	0 %	0 %	50 %	50 %	146280387
36	NC_009433	CGG	2	6	2737	2742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280387
37	NC_009433	CTG	3	9	2833	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280387
38	NC_009433	ACG	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280387
39	NC_009433	CTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280387
40	NC_009433	TCA	2	6	2972	2977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280387
41	NC_009433	ATC	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280387
42	NC_009433	GC	3	6	3009	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	146280387
43	NC_009433	GTG	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280387
44	NC_009433	CAT	2	6	3054	3059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280387
45	NC_009433	CGC	2	6	3076	3081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280387
46	NC_009433	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280387
47	NC_009433	CGCC	2	8	3165	3172	0 %	0 %	25 %	75 %	146280387
48	NC_009433	ACC	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280387
49	NC_009433	AACCGC	2	12	3396	3407	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146280387
50	NC_009433	CATGG	2	10	3709	3718	20 %	20 %	40 %	20 %	146280388
51	NC_009433	GCG	2	6	3726	3731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280388
52	NC_009433	AGC	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280388
53	NC_009433	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280388
54	NC_009433	GGA	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280388
55	NC_009433	GCC	2	6	3818	3823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280388
56	NC_009433	CTG	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280388
57	NC_009433	GAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280388
58	NC_009433	AGC	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280388
59	NC_009433	CGG	2	6	4089	4094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280388
60	NC_009433	GCGG	2	8	4185	4192	0 %	0 %	75 %	25 %	146280388
61	NC_009433	TC	3	6	4280	4285	0 %	50 %	0 %	50 %	146280388
62	NC_009433	TTTG	2	8	4361	4368	0 %	75 %	25 %	0 %	146280389
63	NC_009433	CTT	3	9	4378	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280389
64	NC_009433	GGC	2	6	4404	4409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280389
65	NC_009433	GGA	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280389
66	NC_009433	TTGC	2	8	4474	4481	0 %	50 %	25 %	25 %	146280389
67	NC_009433	CCG	2	6	4505	4510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280389
68	NC_009433	CTGG	2	8	4518	4525	0 %	25 %	50 %	25 %	146280389
69	NC_009433	GAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280389
70	NC_009433	GCAGGT	2	12	4579	4590	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146280389
71	NC_009433	TTG	2	6	4622	4627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280389
72	NC_009433	TC	3	6	4757	4762	0 %	50 %	0 %	50 %	146280390
73	NC_009433	CTG	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
74	NC_009433	TTC	2	6	4810	4815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280390
75	NC_009433	CGT	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
76	NC_009433	GCC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280390
77	NC_009433	CAT	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280390
78	NC_009433	C	6	6	4960	4965	0 %	0 %	0 %	100 %	146280390
79	NC_009433	GGA	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280390
80	NC_009433	CGT	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
81	NC_009433	TCT	2	6	5039	5044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280390
82	NC_009433	CGT	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
83	NC_009433	CCT	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280390
84	NC_009433	GGC	2	6	5244	5249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280390
85	NC_009433	GCG	2	6	5301	5306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280390
86	NC_009433	GGCG	2	8	5345	5352	0 %	0 %	75 %	25 %	146280390
87	NC_009433	GCG	2	6	5364	5369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
88	NC_009433	GCA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
89	NC_009433	GGC	2	6	5522	5527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
90	NC_009433	GC	3	6	5526	5531	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
91	NC_009433	CCG	2	6	5535	5540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
92	NC_009433	GC	3	6	5722	5727	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
93	NC_009433	TGC	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280391
94	NC_009433	GCG	2	6	5799	5804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
95	NC_009433	GAA	2	6	5936	5941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280391
96	NC_009433	CAA	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280391
97	NC_009433	CGC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
98	NC_009433	CCCGG	2	10	6083	6092	0 %	0 %	40 %	60 %	146280391
99	NC_009433	ACC	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280391
100	NC_009433	CGG	2	6	6119	6124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
101	NC_009433	GTC	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280391
102	NC_009433	GCC	2	6	6185	6190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
103	NC_009433	AGC	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
104	NC_009433	GTG	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280391
105	NC_009433	TCG	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280391
106	NC_009433	CAG	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
107	NC_009433	CAG	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
108	NC_009433	GGCC	2	8	6421	6428	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
109	NC_009433	CG	3	6	6433	6438	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
110	NC_009433	GGCGCC	2	12	6453	6464	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
111	NC_009433	TCT	2	6	6472	6477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280391
112	NC_009433	CAC	2	6	6536	6541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280391
113	NC_009433	GCA	2	6	6593	6598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
114	NC_009433	ACC	2	6	6621	6626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280391
115	NC_009433	CG	3	6	6634	6639	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
116	NC_009433	TCG	2	6	6697	6702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280391
117	NC_009433	TCT	2	6	6703	6708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280391
118	NC_009433	CGG	4	12	6727	6738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
119	NC_009433	CTC	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280391
120	NC_009433	AGC	2	6	6822	6827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
121	NC_009433	ATC	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280391
122	NC_009433	ACC	2	6	6873	6878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280391
123	NC_009433	GC	4	8	6879	6886	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
124	NC_009433	GCC	2	6	6909	6914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
125	NC_009433	GC	3	6	6921	6926	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
126	NC_009433	TCT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280392
127	NC_009433	CAG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280392
128	NC_009433	GAGCT	2	10	7085	7094	20 %	20 %	40 %	20 %	146280392
129	NC_009433	GTG	2	6	7119	7124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280392
130	NC_009433	CAG	2	6	7196	7201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280392
131	NC_009433	AGA	2	6	7234	7239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280392
132	NC_009433	CGC	2	6	7243	7248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280392
133	NC_009433	CTG	2	6	7271	7276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280392
134	NC_009433	GCGA	2	8	7287	7294	25 %	0 %	50 %	25 %	146280392
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.