MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 6107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009430	CAC	2	6	19436	19441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279996
502	NC_009430	GCA	2	6	19468	19473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
503	NC_009430	CG	3	6	19492	19497	0 %	0 %	50 %	50 %	146279996
504	NC_009430	AGG	2	6	19543	19548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279996
505	NC_009430	AGG	2	6	19570	19575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279996
506	NC_009430	ACG	2	6	19599	19604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
507	NC_009430	CAG	2	6	19682	19687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
508	NC_009430	GCA	2	6	19711	19716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
509	NC_009430	CAG	2	6	19718	19723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
510	NC_009430	GCC	2	6	19747	19752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279996
511	NC_009430	AGC	2	6	19758	19763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
512	NC_009430	CG	3	6	19774	19779	0 %	0 %	50 %	50 %	146279996
513	NC_009430	CGGGC	2	10	19781	19790	0 %	0 %	60 %	40 %	146279996
514	NC_009430	C	6	6	19798	19803	0 %	0 %	0 %	100 %	146279996
515	NC_009430	GC	3	6	19822	19827	0 %	0 %	50 %	50 %	146279996
516	NC_009430	GAT	2	6	19844	19849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279996
517	NC_009430	CATCG	2	10	19889	19898	20 %	20 %	20 %	40 %	146279996
518	NC_009430	AGC	2	6	19926	19931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
519	NC_009430	CCA	2	6	19978	19983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279996
520	NC_009430	GCG	2	6	19994	19999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
521	NC_009430	TCC	2	6	20016	20021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279996
522	NC_009430	GCG	2	6	20029	20034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
523	NC_009430	GCGG	2	8	20058	20065	0 %	0 %	75 %	25 %	146279996
524	NC_009430	CGG	2	6	20069	20074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
525	NC_009430	CGG	2	6	20098	20103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
526	NC_009430	GCC	2	6	20136	20141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279996
527	NC_009430	CCG	2	6	20146	20151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279996
528	NC_009430	GGC	2	6	20164	20169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
529	NC_009430	GCA	2	6	20194	20199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
530	NC_009430	CAC	2	6	20228	20233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279996
531	NC_009430	CGG	2	6	20290	20295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
532	NC_009430	CGA	2	6	20314	20319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
533	NC_009430	CAG	2	6	20330	20335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
534	NC_009430	CGC	2	6	20372	20377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279996
535	NC_009430	CGGTC	2	10	20392	20401	0 %	20 %	40 %	40 %	146279996
536	NC_009430	CG	3	6	20425	20430	0 %	0 %	50 %	50 %	146279996
537	NC_009430	GC	3	6	20462	20467	0 %	0 %	50 %	50 %	146279996
538	NC_009430	CCA	2	6	20548	20553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279996
539	NC_009430	CGATCA	2	12	20575	20586	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146279996
540	NC_009430	GC	3	6	20602	20607	0 %	0 %	50 %	50 %	146279996
541	NC_009430	AGC	2	6	20616	20621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
542	NC_009430	CGCC	2	8	20639	20646	0 %	0 %	25 %	75 %	146279996
543	NC_009430	CCG	2	6	20663	20668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279996
544	NC_009430	TGG	2	6	20707	20712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279996
545	NC_009430	CAG	2	6	20726	20731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
546	NC_009430	TCG	2	6	20784	20789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279996
547	NC_009430	GCG	2	6	20841	20846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
548	NC_009430	GGGCG	2	10	20909	20918	0 %	0 %	80 %	20 %	146279996
549	NC_009430	TCC	2	6	20925	20930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279996
550	NC_009430	GCC	2	6	20931	20936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279996
551	NC_009430	GCGCG	2	10	20971	20980	0 %	0 %	60 %	40 %	146279996
552	NC_009430	GGC	2	6	20981	20986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
553	NC_009430	TCG	2	6	20988	20993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279996
554	NC_009430	GCA	2	6	20995	21000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279996
555	NC_009430	GCG	3	9	21012	21020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
556	NC_009430	GCC	2	6	21045	21050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279996
557	NC_009430	GGGC	2	8	21079	21086	0 %	0 %	75 %	25 %	146279996
558	NC_009430	AAG	2	6	21116	21121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279996
559	NC_009430	GCG	2	6	21129	21134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279996
560	NC_009430	TCT	2	6	21146	21151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279996
561	NC_009430	GGC	2	6	21689	21694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279997
562	NC_009430	TCA	2	6	21705	21710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279997
563	NC_009430	AGA	2	6	21753	21758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279997
564	NC_009430	GCA	2	6	21771	21776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279997
565	NC_009430	CTT	2	6	21796	21801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279997
566	NC_009430	GAT	2	6	21826	21831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279997
567	NC_009430	TCA	2	6	21911	21916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279997
568	NC_009430	GAA	2	6	21980	21985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279997
569	NC_009430	GC	3	6	22075	22080	0 %	0 %	50 %	50 %	146279997
570	NC_009430	AGA	2	6	22146	22151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279997
571	NC_009430	CGC	2	6	22171	22176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279997
572	NC_009430	ATC	2	6	22200	22205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279997
573	NC_009430	AAG	2	6	22375	22380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279998
574	NC_009430	A	8	8	22384	22391	100 %	0 %	0 %	0 %	146279998
575	NC_009430	AGCC	2	8	22458	22465	25 %	0 %	25 %	50 %	146279998
576	NC_009430	GAT	2	6	22504	22509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279998
577	NC_009430	AAT	2	6	22726	22731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146279998
578	NC_009430	CAG	2	6	22777	22782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279998
579	NC_009430	CTG	2	6	22787	22792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279998
580	NC_009430	A	6	6	22884	22889	100 %	0 %	0 %	0 %	146279998
581	NC_009430	GTT	2	6	22927	22932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146279998
582	NC_009430	GGC	2	6	22940	22945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279998
583	NC_009430	GCA	2	6	22950	22955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279998
584	NC_009430	GAAA	2	8	22957	22964	75 %	0 %	25 %	0 %	146279998
585	NC_009430	AGT	2	6	22976	22981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279998
586	NC_009430	GCA	2	6	23058	23063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279998
587	NC_009430	AG	3	6	23066	23071	50 %	0 %	50 %	0 %	146279998
588	NC_009430	TCA	2	6	23114	23119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279998
589	NC_009430	GAAC	2	8	23244	23251	50 %	0 %	25 %	25 %	146279999
590	NC_009430	CTT	2	6	23270	23275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279999
591	NC_009430	CCA	2	6	23281	23286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279999
592	NC_009430	GAC	2	6	23288	23293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279999
593	NC_009430	TGA	2	6	23306	23311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279999
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595	NC_009430	GCC	2	6	23421	23426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279999
596	NC_009430	TCTCCT	8	48	23442	23489	0 %	50 %	0 %	50 %	146279999
597	NC_009430	TCGCG	2	10	23557	23566	0 %	20 %	40 %	40 %	146279999
598	NC_009430	CCA	2	6	23571	23576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279999
599	NC_009430	TCG	2	6	23629	23634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279999
600	NC_009430	TGG	2	6	23680	23685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279999
601	NC_009430	CGA	2	6	23687	23692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279999
602	NC_009430	TC	3	6	23774	23779	0 %	50 %	0 %	50 %	146279999
603	NC_009430	CCGGC	2	10	23794	23803	0 %	0 %	40 %	60 %	146279999
604	NC_009430	TTCA	2	8	23829	23836	25 %	50 %	0 %	25 %	146279999
605	NC_009430	CGA	2	6	23925	23930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279999
606	NC_009430	GA	3	6	23935	23940	50 %	0 %	50 %	0 %	146279999
607	NC_009430	TCG	2	6	23950	23955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279999
608	NC_009430	ACC	2	6	23994	23999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279999
609	NC_009430	CGA	2	6	24068	24073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279999
610	NC_009430	GAT	2	6	24083	24088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279999
611	NC_009430	TTG	2	6	24214	24219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146279999
612	NC_009430	GCG	2	6	24282	24287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279999
613	NC_009430	ACC	2	6	24315	24320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279999
614	NC_009430	GCG	2	6	24353	24358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279999
615	NC_009430	AAC	2	6	24373	24378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146279999
616	NC_009430	G	6	6	24410	24415	0 %	0 %	100 %	0 %	146279999
617	NC_009430	TCGA	2	8	24478	24485	25 %	25 %	25 %	25 %	146279999
618	NC_009430	AG	3	6	24616	24621	50 %	0 %	50 %	0 %	146279999
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621	NC_009430	CTC	2	6	24654	24659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279999
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623	NC_009430	GCG	2	6	24983	24988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280000
624	NC_009430	TTC	2	6	25104	25109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280000
625	NC_009430	ATAC	2	8	25160	25167	50 %	25 %	0 %	25 %	146280000
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627	NC_009430	CAT	2	6	25257	25262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280000
628	NC_009430	GGC	2	6	25289	25294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280000
629	NC_009430	CTA	2	6	25335	25340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280000
630	NC_009430	CGA	2	6	25341	25346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280000
631	NC_009430	CAT	2	6	25366	25371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280000
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733	NC_009430	TCTGG	2	10	30875	30884	0 %	40 %	40 %	20 %	146280004
734	NC_009430	ACG	2	6	30951	30956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280004
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747	NC_009430	CCG	2	6	31724	31729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280004
748	NC_009430	TCCG	2	8	31754	31761	0 %	25 %	25 %	50 %	146280004
749	NC_009430	GGC	2	6	31817	31822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280004
750	NC_009430	CGG	2	6	31844	31849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280004
751	NC_009430	GCC	2	6	31859	31864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280004
752	NC_009430	CGC	2	6	31907	31912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280004
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754	NC_009430	CTC	3	9	31959	31967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280004
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