MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 plasmid pRSPH01

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009040	AG	3	6	78	83	50 %	0 %	50 %	0 %	126464806
2	NC_009040	GC	3	6	441	446	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
3	NC_009040	GC	3	6	585	590	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
4	NC_009040	GA	3	6	2549	2554	50 %	0 %	50 %	0 %	126464806
5	NC_009040	GC	3	6	3033	3038	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
6	NC_009040	GC	3	6	3465	3470	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
7	NC_009040	GC	3	6	3513	3518	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
8	NC_009040	GC	3	6	3705	3710	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
9	NC_009040	GC	3	6	4041	4046	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
10	NC_009040	GC	3	6	4089	4094	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
11	NC_009040	GC	3	6	4221	4226	0 %	0 %	50 %	50 %	126464806
12	NC_009040	TC	3	6	5049	5054	0 %	50 %	0 %	50 %	126464807
13	NC_009040	TC	3	6	5722	5727	0 %	50 %	0 %	50 %	126464807
14	NC_009040	GC	4	8	5845	5852	0 %	0 %	50 %	50 %	126464807
15	NC_009040	GC	3	6	5973	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	126464807
16	NC_009040	GC	3	6	6963	6968	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
17	NC_009040	GC	3	6	7208	7213	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
18	NC_009040	CG	4	8	7380	7387	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
19	NC_009040	CG	3	6	7692	7697	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
20	NC_009040	GC	3	6	7959	7964	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
21	NC_009040	GC	3	6	8339	8344	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
22	NC_009040	GC	3	6	8670	8675	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
23	NC_009040	CG	5	10	8790	8799	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
24	NC_009040	GC	3	6	8843	8848	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
25	NC_009040	GC	3	6	8946	8951	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
26	NC_009040	CG	3	6	9350	9355	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
27	NC_009040	CG	3	6	9428	9433	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
28	NC_009040	CG	3	6	9483	9488	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
29	NC_009040	GC	4	8	9588	9595	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
30	NC_009040	GC	3	6	9630	9635	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
31	NC_009040	CG	3	6	9710	9715	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
32	NC_009040	CG	3	6	9777	9782	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
33	NC_009040	GC	3	6	9863	9868	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
34	NC_009040	CG	3	6	9905	9910	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
35	NC_009040	GC	4	8	9923	9930	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
36	NC_009040	CG	3	6	10054	10059	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
37	NC_009040	GC	3	6	11213	11218	0 %	0 %	50 %	50 %	126464811
38	NC_009040	CG	3	6	11278	11283	0 %	0 %	50 %	50 %	126464811
39	NC_009040	CG	3	6	11547	11552	0 %	0 %	50 %	50 %	126464811
40	NC_009040	GC	3	6	12265	12270	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
41	NC_009040	GC	3	6	12383	12388	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
42	NC_009040	GC	3	6	12603	12608	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
43	NC_009040	CG	3	6	12828	12833	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
44	NC_009040	CG	3	6	13603	13608	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
45	NC_009040	GC	3	6	13649	13654	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
46	NC_009040	CG	3	6	13741	13746	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
47	NC_009040	CG	3	6	13802	13807	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
48	NC_009040	GC	3	6	13914	13919	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
49	NC_009040	GC	3	6	13999	14004	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
50	NC_009040	GC	3	6	14346	14351	0 %	0 %	50 %	50 %	126464814
51	NC_009040	GC	3	6	14679	14684	0 %	0 %	50 %	50 %	126464814
52	NC_009040	GA	3	6	15121	15126	50 %	0 %	50 %	0 %	126464815
53	NC_009040	CG	3	6	15164	15169	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
54	NC_009040	CG	3	6	15248	15253	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
55	NC_009040	CG	3	6	15345	15350	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
56	NC_009040	CG	3	6	15621	15626	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
57	NC_009040	CG	3	6	15704	15709	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
58	NC_009040	GC	4	8	15787	15794	0 %	0 %	50 %	50 %	126464816
59	NC_009040	GC	3	6	16278	16283	0 %	0 %	50 %	50 %	126464816
60	NC_009040	GC	3	6	16636	16641	0 %	0 %	50 %	50 %	126464816
61	NC_009040	CG	4	8	16829	16836	0 %	0 %	50 %	50 %	126464817
62	NC_009040	CT	3	6	16973	16978	0 %	50 %	0 %	50 %	126464817
63	NC_009040	GC	3	6	17590	17595	0 %	0 %	50 %	50 %	126464818
64	NC_009040	CG	3	6	18596	18601	0 %	0 %	50 %	50 %	126464819
65	NC_009040	GC	3	6	19125	19130	0 %	0 %	50 %	50 %	126464819
66	NC_009040	GC	3	6	20123	20128	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
67	NC_009040	TC	3	6	20163	20168	0 %	50 %	0 %	50 %	126464820
68	NC_009040	GC	3	6	20238	20243	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
69	NC_009040	GC	3	6	20264	20269	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
70	NC_009040	GC	3	6	20455	20460	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
71	NC_009040	CG	3	6	20819	20824	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
72	NC_009040	GC	3	6	20871	20876	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
73	NC_009040	GC	5	10	21176	21185	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
74	NC_009040	GC	3	6	21223	21228	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
75	NC_009040	GC	5	10	22184	22193	0 %	0 %	50 %	50 %	126464821
76	NC_009040	CG	3	6	22314	22319	0 %	0 %	50 %	50 %	126464821
77	NC_009040	CG	4	8	22704	22711	0 %	0 %	50 %	50 %	126464821
78	NC_009040	CG	4	8	23349	23356	0 %	0 %	50 %	50 %	126464822
79	NC_009040	CG	3	6	23785	23790	0 %	0 %	50 %	50 %	126464822
80	NC_009040	GC	3	6	24441	24446	0 %	0 %	50 %	50 %	126464823
81	NC_009040	CG	3	6	24693	24698	0 %	0 %	50 %	50 %	126464823
82	NC_009040	CG	3	6	27637	27642	0 %	0 %	50 %	50 %	126464825
83	NC_009040	GC	3	6	27874	27879	0 %	0 %	50 %	50 %	126464825
84	NC_009040	CG	3	6	28483	28488	0 %	0 %	50 %	50 %	126464825
85	NC_009040	GC	3	6	28638	28643	0 %	0 %	50 %	50 %	126464825
86	NC_009040	TC	3	6	29455	29460	0 %	50 %	0 %	50 %	126464826
87	NC_009040	CG	3	6	30869	30874	0 %	0 %	50 %	50 %	126464827
88	NC_009040	CG	3	6	30895	30900	0 %	0 %	50 %	50 %	126464827
89	NC_009040	CG	4	8	30917	30924	0 %	0 %	50 %	50 %	126464827
90	NC_009040	GC	3	6	30971	30976	0 %	0 %	50 %	50 %	126464827
91	NC_009040	GC	3	6	32739	32744	0 %	0 %	50 %	50 %	126464828
92	NC_009040	GC	3	6	32772	32777	0 %	0 %	50 %	50 %	126464828
93	NC_009040	CG	3	6	32907	32912	0 %	0 %	50 %	50 %	126464828
94	NC_009040	TC	3	6	33445	33450	0 %	50 %	0 %	50 %	126464829
95	NC_009040	GC	3	6	33493	33498	0 %	0 %	50 %	50 %	126464829
96	NC_009040	CG	3	6	34654	34659	0 %	0 %	50 %	50 %	126464830
97	NC_009040	CG	3	6	34800	34805	0 %	0 %	50 %	50 %	126464830
98	NC_009040	AT	3	6	35079	35084	50 %	50 %	0 %	0 %	126464830
99	NC_009040	CG	3	6	35381	35386	0 %	0 %	50 %	50 %	126464830
100	NC_009040	CG	3	6	36055	36060	0 %	0 %	50 %	50 %	126464831
101	NC_009040	CG	3	6	36479	36484	0 %	0 %	50 %	50 %	126464831
102	NC_009040	CT	3	6	36682	36687	0 %	50 %	0 %	50 %	126464832
103	NC_009040	GA	3	6	37395	37400	50 %	0 %	50 %	0 %	126464832
104	NC_009040	CG	3	6	37581	37586	0 %	0 %	50 %	50 %	126464832
105	NC_009040	CG	3	6	37889	37894	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
106	NC_009040	CG	3	6	38054	38059	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
107	NC_009040	GC	3	6	38442	38447	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
108	NC_009040	GC	3	6	38681	38686	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
109	NC_009040	CG	3	6	40973	40978	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
110	NC_009040	CG	3	6	41017	41022	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
111	NC_009040	CG	3	6	41205	41210	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
112	NC_009040	GC	4	8	41298	41305	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
113	NC_009040	CG	3	6	41448	41453	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
114	NC_009040	GC	3	6	41518	41523	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
115	NC_009040	GC	5	10	42014	42023	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
116	NC_009040	GC	3	6	42032	42037	0 %	0 %	50 %	50 %	126464835
117	NC_009040	GC	3	6	42261	42266	0 %	0 %	50 %	50 %	126464836
118	NC_009040	CG	3	6	42375	42380	0 %	0 %	50 %	50 %	126464836
119	NC_009040	CG	3	6	42448	42453	0 %	0 %	50 %	50 %	126464836
120	NC_009040	CG	3	6	42671	42676	0 %	0 %	50 %	50 %	126464837
121	NC_009040	CG	3	6	43489	43494	0 %	0 %	50 %	50 %	126464838
122	NC_009040	CG	3	6	44213	44218	0 %	0 %	50 %	50 %	126464840
123	NC_009040	GC	3	6	44263	44268	0 %	0 %	50 %	50 %	126464840
124	NC_009040	GC	4	8	44354	44361	0 %	0 %	50 %	50 %	126464840
125	NC_009040	GC	3	6	44539	44544	0 %	0 %	50 %	50 %	126464840
126	NC_009040	GC	3	6	44872	44877	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
127	NC_009040	GC	3	6	45245	45250	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
128	NC_009040	CG	3	6	45389	45394	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
129	NC_009040	CG	3	6	45563	45568	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
130	NC_009040	GC	3	6	45853	45858	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
131	NC_009040	GC	4	8	45953	45960	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
132	NC_009040	GC	3	6	45966	45971	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
133	NC_009040	GC	3	6	45985	45990	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
134	NC_009040	GC	3	6	46063	46068	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
135	NC_009040	CG	3	6	46188	46193	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
136	NC_009040	CG	4	8	46215	46222	0 %	0 %	50 %	50 %	126464841
137	NC_009040	AT	3	6	49023	49028	50 %	50 %	0 %	0 %	126464843
138	NC_009040	GC	3	6	49161	49166	0 %	0 %	50 %	50 %	126464843
139	NC_009040	GC	3	6	49295	49300	0 %	0 %	50 %	50 %	126464843
140	NC_009040	CG	4	8	50776	50783	0 %	0 %	50 %	50 %	126464844
141	NC_009040	GC	3	6	51538	51543	0 %	0 %	50 %	50 %	126464845
142	NC_009040	CG	3	6	53419	53424	0 %	0 %	50 %	50 %	126464846
143	NC_009040	GC	3	6	53450	53455	0 %	0 %	50 %	50 %	126464846
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.