MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 plasmid pRSPH01

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009040	GCCGA	2	10	599	608	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
2	NC_009040	GCCGA	2	10	839	848	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
3	NC_009040	GCCGA	2	10	935	944	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
4	NC_009040	GCCGA	2	10	1415	1424	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
5	NC_009040	GCCGA	2	10	1631	1640	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
6	NC_009040	GCCGA	2	10	2087	2096	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
7	NC_009040	GCCGA	2	10	2231	2240	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
8	NC_009040	GCCGA	2	10	2447	2456	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
9	NC_009040	GCCGA	2	10	2567	2576	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
10	NC_009040	GCCGA	2	10	2807	2816	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
11	NC_009040	CCGAG	2	10	3384	3393	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
12	NC_009040	GCCGA	2	10	3959	3968	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
13	NC_009040	GCCGA	2	10	4199	4208	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
14	NC_009040	GCCGA	2	10	4535	4544	20 %	0 %	40 %	40 %	126464806
15	NC_009040	CCCGG	2	10	5521	5530	0 %	0 %	40 %	60 %	126464807
16	NC_009040	TGCGG	2	10	5568	5577	0 %	20 %	60 %	20 %	126464807
17	NC_009040	CGGCT	2	10	5711	5720	0 %	20 %	40 %	40 %	126464807
18	NC_009040	GCTGC	2	10	7080	7089	0 %	20 %	40 %	40 %	126464808
19	NC_009040	GCGGG	2	10	7161	7170	0 %	0 %	80 %	20 %	126464808
20	NC_009040	GCCCT	2	10	7261	7270	0 %	20 %	20 %	60 %	126464808
21	NC_009040	CGGGG	2	10	9164	9173	0 %	0 %	80 %	20 %	126464809
22	NC_009040	GCCGC	2	10	9511	9520	0 %	0 %	40 %	60 %	126464809
23	NC_009040	CCGCC	2	10	10825	10834	0 %	0 %	20 %	80 %	126464810
24	NC_009040	GCGCG	2	10	12326	12335	0 %	0 %	60 %	40 %	126464812
25	NC_009040	CGGGC	2	10	15146	15155	0 %	0 %	60 %	40 %	126464815
26	NC_009040	GCCCG	2	10	16502	16511	0 %	0 %	40 %	60 %	126464816
27	NC_009040	GCCGA	2	10	16737	16746	20 %	0 %	40 %	40 %	126464816
28	NC_009040	GCGCG	2	10	16823	16832	0 %	0 %	60 %	40 %	126464817
29	NC_009040	CGGCG	2	10	17515	17524	0 %	0 %	60 %	40 %	126464818
30	NC_009040	GGGCA	2	10	19322	19331	20 %	0 %	60 %	20 %	126464819
31	NC_009040	TTCGA	2	10	21101	21110	20 %	40 %	20 %	20 %	126464820
32	NC_009040	CGGCC	2	10	21686	21695	0 %	0 %	40 %	60 %	126464821
33	NC_009040	GCGCT	2	10	22329	22338	0 %	20 %	40 %	40 %	126464821
34	NC_009040	GCCGG	2	10	23070	23079	0 %	0 %	60 %	40 %	126464822
35	NC_009040	GCCGC	2	10	24974	24983	0 %	0 %	40 %	60 %	126464823
36	NC_009040	GCGGT	2	10	28298	28307	0 %	20 %	60 %	20 %	126464825
37	NC_009040	CGAGC	2	10	28723	28732	20 %	0 %	40 %	40 %	126464825
38	NC_009040	ATGGA	2	10	28988	28997	40 %	20 %	40 %	0 %	126464826
39	NC_009040	GGGGC	2	10	32252	32261	0 %	0 %	80 %	20 %	126464828
40	NC_009040	CGGGC	2	10	32472	32481	0 %	0 %	60 %	40 %	126464828
41	NC_009040	GGACG	2	10	33001	33010	20 %	0 %	60 %	20 %	126464828
42	NC_009040	GGCGG	2	10	33738	33747	0 %	0 %	80 %	20 %	126464829
43	NC_009040	CGGCT	2	10	33786	33795	0 %	20 %	40 %	40 %	126464829
44	NC_009040	GGGGC	3	15	33962	33976	0 %	0 %	80 %	20 %	126464829
45	NC_009040	GCGGG	2	10	34099	34108	0 %	0 %	80 %	20 %	126464829
46	NC_009040	ACGGA	2	10	36345	36354	40 %	0 %	40 %	20 %	126464831
47	NC_009040	GCCAC	2	10	36505	36514	20 %	0 %	20 %	60 %	126464831
48	NC_009040	CGATC	2	10	37256	37265	20 %	20 %	20 %	40 %	126464832
49	NC_009040	GACAG	2	10	39397	39406	40 %	0 %	40 %	20 %	126464834
50	NC_009040	CCCCG	2	10	40990	40999	0 %	0 %	20 %	80 %	126464835
51	NC_009040	GGCGG	2	10	41728	41737	0 %	0 %	80 %	20 %	126464835
52	NC_009040	CCGCC	2	10	42514	42523	0 %	0 %	20 %	80 %	126464837
53	NC_009040	CCGGA	2	10	42535	42544	20 %	0 %	40 %	40 %	126464837
54	NC_009040	GGCGG	2	10	42641	42650	0 %	0 %	80 %	20 %	126464837
55	NC_009040	CCGGG	2	10	43330	43339	0 %	0 %	60 %	40 %	126464838
56	NC_009040	GCGCC	2	10	44413	44422	0 %	0 %	40 %	60 %	126464840
57	NC_009040	GGCGG	2	10	45869	45878	0 %	0 %	80 %	20 %	126464841
58	NC_009040	CGGAC	2	10	52493	52502	20 %	0 %	40 %	40 %	126464846
59	NC_009040	GCACC	2	10	52777	52786	20 %	0 %	20 %	60 %	126464846
60	NC_009040	CGGCG	2	10	54181	54190	0 %	0 %	60 %	40 %	126464846
61	NC_009040	ACGGC	2	10	54477	54486	20 %	0 %	40 %	40 %	126464846
62	NC_009040	GCACC	2	10	55402	55411	20 %	0 %	20 %	60 %	126464846
63	NC_009040	GGGCG	2	10	55933	55942	0 %	0 %	80 %	20 %	126464846
64	NC_009040	CTTGC	2	10	59683	59692	0 %	40 %	20 %	40 %	126464850
65	NC_009040	GCTCG	2	10	61149	61158	0 %	20 %	40 %	40 %	126464852
66	NC_009040	GCGCC	2	10	61464	61473	0 %	0 %	40 %	60 %	126464852
67	NC_009040	CGACG	2	10	62141	62150	20 %	0 %	40 %	40 %	126464853
68	NC_009040	GCGCT	2	10	64028	64037	0 %	20 %	40 %	40 %	126464855
69	NC_009040	GGCGC	2	10	64771	64780	0 %	0 %	60 %	40 %	126464855
70	NC_009040	CTCGG	2	10	65234	65243	0 %	20 %	40 %	40 %	126464855
71	NC_009040	TCCTC	2	10	65923	65932	0 %	40 %	0 %	60 %	126464856
72	NC_009040	CGTCG	2	10	66664	66673	0 %	20 %	40 %	40 %	126464856
73	NC_009040	CGGCG	2	10	67654	67663	0 %	0 %	60 %	40 %	126464857
74	NC_009040	GCCTT	2	10	68025	68034	0 %	40 %	20 %	40 %	126464857
75	NC_009040	GGCCT	2	10	68623	68632	0 %	20 %	40 %	40 %	126464857
76	NC_009040	ACCCG	2	10	73072	73081	20 %	0 %	20 %	60 %	126464861
77	NC_009040	CAGCA	2	10	74014	74023	40 %	0 %	20 %	40 %	126464862
78	NC_009040	CGGCA	2	10	74481	74490	20 %	0 %	40 %	40 %	126464863
79	NC_009040	AACGA	2	10	74742	74751	60 %	0 %	20 %	20 %	126464863
80	NC_009040	CAAGC	2	10	75130	75139	40 %	0 %	20 %	40 %	126464865
81	NC_009040	GCCGA	2	10	76717	76726	20 %	0 %	40 %	40 %	126464867
82	NC_009040	AACGG	2	10	77290	77299	40 %	0 %	40 %	20 %	126464868
83	NC_009040	GCACG	2	10	77336	77345	20 %	0 %	40 %	40 %	126464868
84	NC_009040	AGCCG	2	10	77995	78004	20 %	0 %	40 %	40 %	126464868
85	NC_009040	TGTCC	2	10	78182	78191	0 %	40 %	20 %	40 %	126464869
86	NC_009040	CCCGG	2	10	81551	81560	0 %	0 %	40 %	60 %	126464872
87	NC_009040	TCGCG	2	10	81589	81598	0 %	20 %	40 %	40 %	126464872
88	NC_009040	AGCGC	2	10	81634	81643	20 %	0 %	40 %	40 %	126464872
89	NC_009040	CCGAC	2	10	82623	82632	20 %	0 %	20 %	60 %	126464873
90	NC_009040	ACCGG	2	10	86211	86220	20 %	0 %	40 %	40 %	126464875
91	NC_009040	GCGCT	2	10	86735	86744	0 %	20 %	40 %	40 %	126464876
92	NC_009040	TGCGC	2	10	87232	87241	0 %	20 %	40 %	40 %	126464876
93	NC_009040	CGGCC	2	10	87512	87521	0 %	0 %	40 %	60 %	126464877
94	NC_009040	TTTCG	2	10	88867	88876	0 %	60 %	20 %	20 %	126464878
95	NC_009040	TGGCC	2	10	91207	91216	0 %	20 %	40 %	40 %	126464880
96	NC_009040	CCGGA	2	10	93125	93134	20 %	0 %	40 %	40 %	126464882
97	NC_009040	CCGGG	2	10	93718	93727	0 %	0 %	60 %	40 %	126464882
98	NC_009040	CGCGC	2	10	94697	94706	0 %	0 %	40 %	60 %	126464883
99	NC_009040	GATCA	2	10	94778	94787	40 %	20 %	20 %	20 %	126464883
100	NC_009040	CCCTT	2	10	95483	95492	0 %	40 %	0 %	60 %	126464884
101	NC_009040	GCGCC	2	10	96231	96240	0 %	0 %	40 %	60 %	126464884
102	NC_009040	GGGCC	2	10	97834	97843	0 %	0 %	60 %	40 %	126464886
103	NC_009040	GTCCT	2	10	97947	97956	0 %	40 %	20 %	40 %	126464886
104	NC_009040	TCGCG	2	10	98853	98862	0 %	20 %	40 %	40 %	126464887
105	NC_009040	GCCCG	2	10	98956	98965	0 %	0 %	40 %	60 %	126464887
106	NC_009040	CGCGG	2	10	102848	102857	0 %	0 %	60 %	40 %	126464892
107	NC_009040	GCACC	2	10	104627	104636	20 %	0 %	20 %	60 %	126464894
108	NC_009040	GGGCG	2	10	104789	104798	0 %	0 %	80 %	20 %	126464894
109	NC_009040	GCCCC	2	10	104967	104976	0 %	0 %	20 %	80 %	126464894
110	NC_009040	CGGGC	2	10	106467	106476	0 %	0 %	60 %	40 %	126464896
111	NC_009040	GAGGG	2	10	109920	109929	20 %	0 %	80 %	0 %	126464900
112	NC_009040	GTCCC	2	10	109942	109951	0 %	20 %	20 %	60 %	126464900
113	NC_009040	CTGCC	2	10	111467	111476	0 %	20 %	20 %	60 %	126464902
114	NC_009040	GTCGG	2	10	112054	112063	0 %	20 %	60 %	20 %	126464903
115	NC_009040	ACCAG	2	10	112635	112644	40 %	0 %	20 %	40 %	126464904
116	NC_009040	CCTCC	2	10	112800	112809	0 %	20 %	0 %	80 %	126464904
117	NC_009040	GCCGC	2	10	112880	112889	0 %	0 %	40 %	60 %	126464904
118	NC_009040	CGGTG	2	10	116253	116262	0 %	20 %	60 %	20 %	126464907
119	NC_009040	CCCGG	2	10	117981	117990	0 %	0 %	40 %	60 %	126464910
120	NC_009040	CCGGC	2	10	118577	118586	0 %	0 %	40 %	60 %	126464911
121	NC_009040	GCCCC	2	10	118846	118855	0 %	0 %	20 %	80 %	126464911

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.