MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	GCC	2	6	199	204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654694
2	NC_009008	CTG	2	6	262	267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
3	NC_009008	CGT	2	6	291	296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
4	NC_009008	ACG	2	6	323	328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654694
5	NC_009008	GCC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654694
6	NC_009008	GCT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
7	NC_009008	CGG	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654694
8	NC_009008	GCG	2	6	480	485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654694
9	NC_009008	TGC	2	6	497	502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
10	NC_009008	GAC	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654694
11	NC_009008	GCT	2	6	825	830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654695
12	NC_009008	CGC	2	6	893	898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
13	NC_009008	GGC	2	6	930	935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654695
14	NC_009008	GCT	2	6	978	983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654695
15	NC_009008	GCC	2	6	1004	1009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
16	NC_009008	GCT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654695
17	NC_009008	GTG	2	6	1126	1131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654695
18	NC_009008	TGG	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654695
19	NC_009008	GGT	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654695
20	NC_009008	CAC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654695
21	NC_009008	CCT	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654695
22	NC_009008	CCG	2	6	1614	1619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
23	NC_009008	TCG	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
24	NC_009008	ATC	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
25	NC_009008	CCT	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654696
26	NC_009008	CGT	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
27	NC_009008	GAT	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
28	NC_009008	GCC	2	6	2272	2277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
29	NC_009008	CCG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
30	NC_009008	CTG	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
31	NC_009008	GCC	2	6	2341	2346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
32	NC_009008	TGA	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
33	NC_009008	GCC	2	6	2502	2507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
34	NC_009008	GGC	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654696
35	NC_009008	CAT	2	6	2541	2546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
36	NC_009008	CGC	2	6	2582	2587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
37	NC_009008	CAT	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
38	NC_009008	ATC	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
39	NC_009008	GGT	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654696
40	NC_009008	TGA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
41	NC_009008	TCG	2	6	2795	2800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
42	NC_009008	CGC	2	6	2862	2867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
43	NC_009008	CGG	2	6	2880	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654696
44	NC_009008	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
45	NC_009008	GGC	2	6	2945	2950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654696
46	NC_009008	CTG	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
47	NC_009008	TCG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
48	NC_009008	GTC	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
49	NC_009008	TCG	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
50	NC_009008	CAT	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
51	NC_009008	GTC	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
52	NC_009008	TCC	3	9	3112	3120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654696
53	NC_009008	GTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654696
54	NC_009008	TGC	2	6	3191	3196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
55	NC_009008	TCT	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654696
56	NC_009008	CGC	2	6	3213	3218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
57	NC_009008	GCC	2	6	3328	3333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
58	NC_009008	CCG	2	6	3438	3443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
59	NC_009008	TCG	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
60	NC_009008	TGG	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654697
61	NC_009008	CTG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654697
62	NC_009008	GCC	2	6	3687	3692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654697
63	NC_009008	GCC	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654697
64	NC_009008	GCC	2	6	3845	3850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654697
65	NC_009008	TGG	2	6	3933	3938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654697
66	NC_009008	CCT	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654697
67	NC_009008	TGG	2	6	4068	4073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654697
68	NC_009008	CGG	2	6	4081	4086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654697
69	NC_009008	GGC	2	6	4117	4122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654697
70	NC_009008	GAG	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654697
71	NC_009008	GCT	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654697
72	NC_009008	GGC	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654697
73	NC_009008	CCT	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654697
74	NC_009008	ATC	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654697
75	NC_009008	ACC	3	9	4361	4369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654697
76	NC_009008	CGC	2	6	4579	4584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654698
77	NC_009008	GAG	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654698
78	NC_009008	TCG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654698
79	NC_009008	AGG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654698
80	NC_009008	CCA	2	6	4765	4770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654698
81	NC_009008	CAG	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654698
82	NC_009008	GCC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654698
83	NC_009008	GCA	2	6	5080	5085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654699
84	NC_009008	AAT	2	6	5090	5095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125654699
85	NC_009008	CTT	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654699
86	NC_009008	GCG	2	6	5165	5170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654699
87	NC_009008	CTG	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654699
88	NC_009008	CGC	2	6	5301	5306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
89	NC_009008	TGG	2	6	5466	5471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654699
90	NC_009008	AGA	2	6	5478	5483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654699
91	NC_009008	GAT	2	6	5494	5499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654699
92	NC_009008	GCC	2	6	5554	5559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
93	NC_009008	CTG	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654699
94	NC_009008	CAC	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654699
95	NC_009008	CGC	2	6	5918	5923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
96	NC_009008	CCG	2	6	5991	5996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
97	NC_009008	CGA	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654700
98	NC_009008	CGC	2	6	6485	6490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654700
99	NC_009008	GGC	2	6	6519	6524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654700
100	NC_009008	TGA	2	6	7034	7039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654701
101	NC_009008	GCA	2	6	7046	7051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654701
102	NC_009008	CAC	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654701
103	NC_009008	GAC	2	6	7380	7385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654702
104	NC_009008	CGG	2	6	7470	7475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654702
105	NC_009008	TGC	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654702
106	NC_009008	GCC	2	6	7521	7526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654702
107	NC_009008	ATC	2	6	7543	7548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654702
108	NC_009008	CGC	2	6	7643	7648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654702
109	NC_009008	ATG	2	6	7782	7787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654702
110	NC_009008	GGC	2	6	7860	7865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654702
111	NC_009008	TGG	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654702
112	NC_009008	CGG	2	6	7987	7992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654702
113	NC_009008	CGG	2	6	8083	8088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654702
114	NC_009008	CGT	2	6	8420	8425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654703
115	NC_009008	CGC	2	6	8554	8559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654703
116	NC_009008	CGC	2	6	8575	8580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654703
117	NC_009008	CCG	2	6	8591	8596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654703
118	NC_009008	GCG	2	6	8645	8650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654703
119	NC_009008	CGC	2	6	8665	8670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654703
120	NC_009008	TTG	2	6	8679	8684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125654703
121	NC_009008	CGT	2	6	8855	8860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654703
122	NC_009008	CGG	3	9	9053	9061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654704
123	NC_009008	GTG	2	6	9100	9105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654704
124	NC_009008	CTT	2	6	9328	9333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654704
125	NC_009008	TCT	2	6	9350	9355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654704
126	NC_009008	GGT	2	6	9396	9401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654704
127	NC_009008	CTC	2	6	9520	9525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654704
128	NC_009008	CTG	2	6	9568	9573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654704
129	NC_009008	GCG	2	6	9579	9584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654704
130	NC_009008	GGC	2	6	9642	9647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654705
131	NC_009008	GGC	2	6	9654	9659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654705
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255	NC_009008	AGC	2	6	19218	19223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654710
256	NC_009008	GCC	2	6	19477	19482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654711
257	NC_009008	GAT	2	6	19487	19492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654711
258	NC_009008	GCT	2	6	19715	19720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654711
259	NC_009008	GCC	2	6	19776	19781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654711
260	NC_009008	TCC	2	6	19783	19788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654711
261	NC_009008	AGC	2	6	19789	19794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654711
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272	NC_009008	GGC	2	6	20402	20407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654712
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275	NC_009008	TCG	2	6	20610	20615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654712
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.