MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 649

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009008	CGC	2	6	26817	26822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
502	NC_009008	GCC	2	6	26823	26828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
503	NC_009008	C	6	6	26848	26853	0 %	0 %	0 %	100 %	125654718
504	NC_009008	CGC	2	6	26858	26863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
505	NC_009008	CAG	2	6	26865	26870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654718
506	NC_009008	CG	3	6	26884	26889	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
507	NC_009008	TCT	2	6	26897	26902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654718
508	NC_009008	GC	3	6	26960	26965	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
509	NC_009008	GGC	2	6	26979	26984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
510	NC_009008	CCG	3	9	27005	27013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
511	NC_009008	CCG	2	6	27031	27036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
512	NC_009008	CGA	2	6	27059	27064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654718
513	NC_009008	AAG	2	6	27184	27189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654718
514	NC_009008	GC	3	6	27213	27218	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
515	NC_009008	TGC	2	6	27338	27343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
516	NC_009008	GGTGC	2	10	27351	27360	0 %	20 %	60 %	20 %	125654718
517	NC_009008	CGC	3	9	27378	27386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
518	NC_009008	CG	3	6	27415	27420	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
519	NC_009008	CGC	2	6	27480	27485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
520	NC_009008	TGC	2	6	27530	27535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
521	NC_009008	GC	3	6	27554	27559	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
522	NC_009008	GGC	2	6	27687	27692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
523	NC_009008	CTG	2	6	27738	27743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
524	NC_009008	GGC	2	6	27771	27776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
525	NC_009008	CGC	2	6	27812	27817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
526	NC_009008	GCT	2	6	27845	27850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
527	NC_009008	GGC	3	9	27954	27962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
528	NC_009008	CGC	2	6	28055	28060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
529	NC_009008	CAA	2	6	28074	28079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125654718
530	NC_009008	GAT	2	6	28146	28151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654718
531	NC_009008	ACC	2	6	28210	28215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654718
532	NC_009008	TGG	2	6	28220	28225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654718
533	NC_009008	GCCGT	2	10	28276	28285	0 %	20 %	40 %	40 %	125654718
534	NC_009008	AG	3	6	28288	28293	50 %	0 %	50 %	0 %	125654718
535	NC_009008	GCG	2	6	28405	28410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
536	NC_009008	GTC	2	6	28423	28428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
537	NC_009008	GTCG	2	8	28467	28474	0 %	25 %	50 %	25 %	125654718
538	NC_009008	GCGCC	2	10	28571	28580	0 %	0 %	40 %	60 %	125654718
539	NC_009008	GTG	3	9	28636	28644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654718
540	NC_009008	CGG	2	6	28664	28669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
541	NC_009008	GCC	2	6	28755	28760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
542	NC_009008	CAC	2	6	28785	28790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654718
543	NC_009008	TGA	2	6	28901	28906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654718
544	NC_009008	TCGC	2	8	29059	29066	0 %	25 %	25 %	50 %	125654718
545	NC_009008	CAT	2	6	29148	29153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654718
546	NC_009008	GC	3	6	29161	29166	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
547	NC_009008	GCC	3	9	29232	29240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
548	NC_009008	GC	3	6	29307	29312	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
549	NC_009008	CG	3	6	29338	29343	0 %	0 %	50 %	50 %	125654718
550	NC_009008	CCG	2	6	29344	29349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
551	NC_009008	CAGG	2	8	29364	29371	25 %	0 %	50 %	25 %	125654718
552	NC_009008	AGG	2	6	29471	29476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654718
553	NC_009008	CCGA	2	8	29485	29492	25 %	0 %	25 %	50 %	125654718
554	NC_009008	CGAC	2	8	29495	29502	25 %	0 %	25 %	50 %	125654718
555	NC_009008	GGTCTT	2	12	29577	29588	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	125654718
556	NC_009008	GCCCGC	2	12	29604	29615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
557	NC_009008	GGT	2	6	29631	29636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654718
558	NC_009008	GGC	2	6	29637	29642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
559	NC_009008	CGT	2	6	29682	29687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
560	NC_009008	GCT	2	6	29793	29798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
561	NC_009008	GCT	2	6	29811	29816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
562	NC_009008	CTGC	2	8	29852	29859	0 %	25 %	25 %	50 %	125654718
563	NC_009008	GCC	2	6	29877	29882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
564	NC_009008	CGC	2	6	29883	29888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
565	NC_009008	CGT	2	6	29907	29912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
566	NC_009008	TGTTCA	2	12	29921	29932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	125654718
567	NC_009008	AGG	2	6	29972	29977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654718
568	NC_009008	CCA	2	6	30011	30016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654718
569	NC_009008	GAA	2	6	30054	30059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654718
570	NC_009008	GGC	2	6	30069	30074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
571	NC_009008	GCC	2	6	30084	30089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
572	NC_009008	CGT	2	6	30113	30118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
573	NC_009008	GTT	2	6	30132	30137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125654718
574	NC_009008	GCC	2	6	30204	30209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
575	NC_009008	CGC	2	6	30251	30256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
576	NC_009008	CCGGT	2	10	30257	30266	0 %	20 %	40 %	40 %	125654718
577	NC_009008	CGGG	2	8	30288	30295	0 %	0 %	75 %	25 %	125654718
578	NC_009008	CGT	2	6	30345	30350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
579	NC_009008	CGA	2	6	30380	30385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654718
580	NC_009008	CGT	2	6	30387	30392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
581	NC_009008	CGAGGC	2	12	30396	30407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	125654718
582	NC_009008	TGGT	2	8	30436	30443	0 %	50 %	50 %	0 %	125654718
583	NC_009008	GCC	2	6	30516	30521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
584	NC_009008	GCA	2	6	30617	30622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654718
585	NC_009008	GATC	2	8	30678	30685	25 %	25 %	25 %	25 %	125654718
586	NC_009008	CGT	2	6	30686	30691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654718
587	NC_009008	GCA	2	6	30698	30703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654718
588	NC_009008	CGC	3	9	30719	30727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654718
589	NC_009008	GCG	2	6	30740	30745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
590	NC_009008	GAC	2	6	30747	30752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654718
591	NC_009008	CGG	2	6	30869	30874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654718
592	NC_009008	CGA	2	6	30875	30880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654718
593	NC_009008	CAGCCC	2	12	30892	30903	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	125654718
594	NC_009008	ACC	2	6	31006	31011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654718
595	NC_009008	CGA	2	6	31086	31091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654718
596	NC_009008	GC	3	6	31219	31224	0 %	0 %	50 %	50 %	125654719
597	NC_009008	GCC	2	6	31400	31405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654719
598	NC_009008	CGC	2	6	31459	31464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654719
599	NC_009008	CGA	3	9	31466	31474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654719
600	NC_009008	GCCT	2	8	31514	31521	0 %	25 %	25 %	50 %	125654719
601	NC_009008	CGG	2	6	31582	31587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654719
602	NC_009008	GCG	2	6	31668	31673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654719
603	NC_009008	CGG	2	6	31702	31707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654719
604	NC_009008	CATCA	2	10	33146	33155	40 %	20 %	0 %	40 %	125654720
605	NC_009008	CCG	2	6	33160	33165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654720
606	NC_009008	ACC	2	6	33181	33186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654720
607	NC_009008	GCCA	2	8	33189	33196	25 %	0 %	25 %	50 %	125654720
608	NC_009008	GCC	2	6	33235	33240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654720
609	NC_009008	CGG	2	6	33361	33366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654720
610	NC_009008	TCT	2	6	33380	33385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654720
611	NC_009008	CTC	2	6	33402	33407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654720
612	NC_009008	GTT	2	6	33510	33515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125654720
613	NC_009008	GCA	2	6	33576	33581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654720
614	NC_009008	GC	3	6	33596	33601	0 %	0 %	50 %	50 %	125654720
615	NC_009008	CCAG	2	8	33680	33687	25 %	0 %	25 %	50 %	125654720
616	NC_009008	GGC	3	9	33700	33708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654720
617	NC_009008	AT	3	6	33734	33739	50 %	50 %	0 %	0 %	125654720
618	NC_009008	GTGC	2	8	33783	33790	0 %	25 %	50 %	25 %	125654720
619	NC_009008	GAAG	2	8	33816	33823	50 %	0 %	50 %	0 %	125654720
620	NC_009008	CGA	2	6	33835	33840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654720
621	NC_009008	CGA	2	6	33847	33852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654720
622	NC_009008	CGGA	2	8	34874	34881	25 %	0 %	50 %	25 %	125654721
623	NC_009008	CG	3	6	34939	34944	0 %	0 %	50 %	50 %	125654721
624	NC_009008	TC	3	6	34948	34953	0 %	50 %	0 %	50 %	125654721
625	NC_009008	AT	3	6	34993	34998	50 %	50 %	0 %	0 %	125654721
626	NC_009008	GGCG	2	8	35038	35045	0 %	0 %	75 %	25 %	125654721
627	NC_009008	TGA	2	6	35083	35088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654721
628	NC_009008	GCA	2	6	35095	35100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654721
629	NC_009008	GTC	2	6	35325	35330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654721
630	NC_009008	GGC	2	6	35338	35343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654721
631	NC_009008	ATGGG	2	10	35612	35621	20 %	20 %	60 %	0 %	125654722
632	NC_009008	TGA	2	6	35625	35630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654722
633	NC_009008	GGA	2	6	35679	35684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654722
634	NC_009008	GAC	3	9	35686	35694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654722
635	NC_009008	CTG	2	6	35708	35713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654722
636	NC_009008	CTG	2	6	35741	35746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654722
637	NC_009008	CGGCG	2	10	35764	35773	0 %	0 %	60 %	40 %	125654722
638	NC_009008	ACC	2	6	35808	35813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654722
639	NC_009008	GCG	2	6	36013	36018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654722
640	NC_009008	ATC	2	6	36057	36062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654722
641	NC_009008	GCT	2	6	36094	36099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654722
642	NC_009008	CGA	2	6	36109	36114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654722
643	NC_009008	CGA	2	6	36117	36122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654722
644	NC_009008	CGGCA	2	10	36200	36209	20 %	0 %	40 %	40 %	125654722
645	NC_009008	CG	3	6	36265	36270	0 %	0 %	50 %	50 %	125654722
646	NC_009008	CTC	2	6	36340	36345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654722
647	NC_009008	GGGCA	2	10	36416	36425	20 %	0 %	60 %	20 %	125654722
648	NC_009008	CGG	2	6	36569	36574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654722
649	NC_009008	TCA	2	6	36580	36585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654722

< Previous 12Next >