MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 2419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009007	CTT	2	6	36199	36204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654632
1002	NC_009007	GGT	2	6	36229	36234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654632
1003	NC_009007	GCC	2	6	36237	36242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654632
1004	NC_009007	GCC	2	6	36260	36265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654632
1005	NC_009007	GCCC	2	8	36295	36302	0 %	0 %	25 %	75 %	125654632
1006	NC_009007	CAGC	2	8	36313	36320	25 %	0 %	25 %	50 %	125654632
1007	NC_009007	TCG	2	6	36330	36335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654632
1008	NC_009007	CG	3	6	36352	36357	0 %	0 %	50 %	50 %	125654632
1009	NC_009007	GCG	2	6	36455	36460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654632
1010	NC_009007	AGC	2	6	36483	36488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654632
1011	NC_009007	GCCT	2	8	36628	36635	0 %	25 %	25 %	50 %	125654633
1012	NC_009007	CGG	2	6	36646	36651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654633
1013	NC_009007	CTC	2	6	36668	36673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654633
1014	NC_009007	GGC	2	6	36674	36679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654633
1015	NC_009007	GCG	2	6	36699	36704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654633
1016	NC_009007	CGG	2	6	36721	36726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654633
1017	NC_009007	AGA	2	6	36781	36786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654633
1018	NC_009007	TCG	2	6	36822	36827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654633
1019	NC_009007	GGCAG	2	10	36865	36874	20 %	0 %	60 %	20 %	125654633
1020	NC_009007	ATC	2	6	36894	36899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654633
1021	NC_009007	GCTC	2	8	36907	36914	0 %	25 %	25 %	50 %	125654633
1022	NC_009007	CAG	2	6	36941	36946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654633
1023	NC_009007	GCC	2	6	36950	36955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654633
1024	NC_009007	CG	3	6	36964	36969	0 %	0 %	50 %	50 %	125654633
1025	NC_009007	CGG	2	6	37071	37076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654633
1026	NC_009007	TCC	2	6	37089	37094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654633
1027	NC_009007	TCT	2	6	37129	37134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654633
1028	NC_009007	GC	3	6	37696	37701	0 %	0 %	50 %	50 %	125654634
1029	NC_009007	GCG	2	6	37712	37717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654634
1030	NC_009007	GCG	2	6	37729	37734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654634
1031	NC_009007	TGC	2	6	37776	37781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654634
1032	NC_009007	CCG	2	6	37788	37793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654634
1033	NC_009007	ACC	2	6	37839	37844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654634
1034	NC_009007	GTG	2	6	37884	37889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654634
1035	NC_009007	TCT	2	6	37912	37917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654634
1036	NC_009007	GGC	2	6	37925	37930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654634
1037	NC_009007	GGC	2	6	37947	37952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654634
1038	NC_009007	GCC	2	6	37957	37962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654634
1039	NC_009007	TTCA	2	8	37967	37974	25 %	50 %	0 %	25 %	125654634
1040	NC_009007	GC	5	10	38245	38254	0 %	0 %	50 %	50 %	125654635
1041	NC_009007	GC	3	6	38276	38281	0 %	0 %	50 %	50 %	125654635
1042	NC_009007	CCCCT	2	10	38286	38295	0 %	20 %	0 %	80 %	125654635
1043	NC_009007	AGA	2	6	38347	38352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654635
1044	NC_009007	CGA	2	6	38354	38359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654635
1045	NC_009007	CGA	2	6	38366	38371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654635
1046	NC_009007	GCC	2	6	38391	38396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654635
1047	NC_009007	TGA	2	6	38542	38547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654635
1048	NC_009007	GAG	2	6	38565	38570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654635
1049	NC_009007	GCG	2	6	38605	38610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654635
1050	NC_009007	GCG	2	6	38628	38633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654635
1051	NC_009007	CTG	2	6	38645	38650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654635
1052	NC_009007	CGC	2	6	38660	38665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654635
1053	NC_009007	CCG	2	6	38881	38886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654636
1054	NC_009007	GACGAG	2	12	38903	38914	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	125654636
1055	NC_009007	CGC	2	6	38939	38944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654636
1056	NC_009007	GGC	2	6	38957	38962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654636
1057	NC_009007	ACC	2	6	39099	39104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654636
1058	NC_009007	CGG	2	6	39162	39167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654636
1059	NC_009007	TGA	2	6	39169	39174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654636
1060	NC_009007	ATC	2	6	39207	39212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654636
1061	NC_009007	CGA	2	6	39340	39345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654636
1062	NC_009007	AGG	2	6	39524	39529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654637
1063	NC_009007	GCCG	2	8	39593	39600	0 %	0 %	50 %	50 %	125654637
1064	NC_009007	AGCG	2	8	39622	39629	25 %	0 %	50 %	25 %	125654637
1065	NC_009007	GC	3	6	39639	39644	0 %	0 %	50 %	50 %	125654637
1066	NC_009007	AGC	2	6	39646	39651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654637
1067	NC_009007	GCA	2	6	39722	39727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654637
1068	NC_009007	GCG	2	6	39749	39754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654637
1069	NC_009007	GCG	2	6	39800	39805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654637
1070	NC_009007	GCC	3	9	39855	39863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654637
1071	NC_009007	TCGGCC	2	12	39886	39897	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	125654637
1072	NC_009007	CGC	2	6	39904	39909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654637
1073	NC_009007	GC	3	6	39920	39925	0 %	0 %	50 %	50 %	125654637
1074	NC_009007	CGC	2	6	39990	39995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654637
1075	NC_009007	CAC	2	6	39996	40001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654637
1076	NC_009007	GGT	2	6	40026	40031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654637
1077	NC_009007	TCG	2	6	40090	40095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654637
1078	NC_009007	TCG	2	6	40138	40143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654637
1079	NC_009007	AGG	2	6	40168	40173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654637
1080	NC_009007	GCT	2	6	40214	40219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654637
1081	NC_009007	CGC	2	6	40223	40228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654637
1082	NC_009007	CCG	2	6	40237	40242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654637
1083	NC_009007	GC	3	6	40248	40253	0 %	0 %	50 %	50 %	125654637
1084	NC_009007	ACC	2	6	40282	40287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654637
1085	NC_009007	CGC	2	6	40303	40308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654637
1086	NC_009007	CGG	3	9	40399	40407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654637
1087	NC_009007	GGC	2	6	40411	40416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654637
1088	NC_009007	AGG	2	6	40486	40491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654637
1089	NC_009007	GGT	2	6	40512	40517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654637
1090	NC_009007	GCCCGA	2	12	40521	40532	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	125654637
1091	NC_009007	TGC	2	6	40603	40608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654637
1092	NC_009007	TCA	2	6	41320	41325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654638
1093	NC_009007	GCC	3	9	41360	41368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654638
1094	NC_009007	GC	3	6	41373	41378	0 %	0 %	50 %	50 %	125654638
1095	NC_009007	GAA	2	6	41389	41394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654638
1096	NC_009007	CAG	2	6	41425	41430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654638
1097	NC_009007	CCGG	2	8	41462	41469	0 %	0 %	50 %	50 %	125654638
1098	NC_009007	CAC	2	6	41479	41484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654638
1099	NC_009007	CGG	2	6	41502	41507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654638
1100	NC_009007	CGAGCG	2	12	41553	41564	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	125654638
1101	NC_009007	CG	3	6	41566	41571	0 %	0 %	50 %	50 %	125654638
1102	NC_009007	CGAG	2	8	41628	41635	25 %	0 %	50 %	25 %	125654638
1103	NC_009007	GAG	2	6	41698	41703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654638
1104	NC_009007	GCCCG	2	10	41719	41728	0 %	0 %	40 %	60 %	125654638
1105	NC_009007	C	6	6	41745	41750	0 %	0 %	0 %	100 %	125654638
1106	NC_009007	CACGAG	2	12	41761	41772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654638
1107	NC_009007	AGA	2	6	41783	41788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654638
1108	NC_009007	CGG	2	6	41792	41797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654638
1109	NC_009007	TCCA	2	8	41834	41841	25 %	25 %	0 %	50 %	125654638
1110	NC_009007	CGGC	2	8	41868	41875	0 %	0 %	50 %	50 %	125654638
1111	NC_009007	GAT	2	6	41884	41889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654638
1112	NC_009007	GCC	2	6	41945	41950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654638
1113	NC_009007	GGC	3	9	41992	42000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654638
1114	NC_009007	CGG	2	6	42018	42023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654638
1115	NC_009007	CCG	2	6	42024	42029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654638
1116	NC_009007	GGC	2	6	42040	42045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654638
1117	NC_009007	GAG	2	6	42055	42060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654638
1118	NC_009007	GCG	2	6	42076	42081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654638
1119	NC_009007	GGA	2	6	42655	42660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654639
1120	NC_009007	TGA	2	6	42663	42668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654639
1121	NC_009007	TCG	2	6	42680	42685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654639
1122	NC_009007	TCC	2	6	42704	42709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654639
1123	NC_009007	TGA	2	6	42735	42740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654639
1124	NC_009007	GCC	2	6	42745	42750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654639
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1126	NC_009007	CGGGG	2	10	43206	43215	0 %	0 %	80 %	20 %	125654640
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1255	NC_009007	TGA	2	6	49235	49240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654646
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1257	NC_009007	CGG	2	6	49360	49365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654646
1258	NC_009007	CTG	2	6	49429	49434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654646
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1378	NC_009007	CGA	2	6	54438	54443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654651
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1381	NC_009007	CGC	2	6	54507	54512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654651
1382	NC_009007	GAG	2	6	54521	54526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654651
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1485	NC_009007	TCTGGA	2	12	58442	58453	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	125654654
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1488	NC_009007	ACC	2	6	58503	58508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654654
1489	NC_009007	TC	3	6	58523	58528	0 %	50 %	0 %	50 %	125654654
1490	NC_009007	CGG	2	6	58529	58534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654654
1491	NC_009007	GA	3	6	58549	58554	50 %	0 %	50 %	0 %	125654654
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1494	NC_009007	GCCA	2	8	59151	59158	25 %	0 %	25 %	50 %	125654655
1495	NC_009007	GGC	2	6	59231	59236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654655
1496	NC_009007	CGAAA	2	10	59324	59333	60 %	0 %	20 %	20 %	125654655
1497	NC_009007	CCG	2	6	59365	59370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654655
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1499	NC_009007	ACC	2	6	59421	59426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654655
1500	NC_009007	CGC	2	6	59456	59461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654655

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