MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008435	CAA	2	6	149194	149199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522158
3502	NC_008435	C	7	7	149209	149215	0 %	0 %	0 %	100 %	115522158
3503	NC_008435	CGG	2	6	149223	149228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522158
3504	NC_008435	AAT	3	9	149229	149237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522158
3505	NC_008435	ACC	2	6	149273	149278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522158
3506	NC_008435	GCC	2	6	149342	149347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522158
3507	NC_008435	CAGC	2	8	149352	149359	25 %	0 %	25 %	50 %	115522158
3508	NC_008435	CGG	2	6	149394	149399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522158
3509	NC_008435	AGG	2	6	149403	149408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522158
3510	NC_008435	ACG	2	6	149435	149440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522158
3511	NC_008435	TG	3	6	149450	149455	0 %	50 %	50 %	0 %	115522158
3512	NC_008435	CAT	2	6	149457	149462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522158
3513	NC_008435	GTCG	2	8	149943	149950	0 %	25 %	50 %	25 %	115522159
3514	NC_008435	GAA	3	9	150039	150047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522159
3515	NC_008435	CGC	2	6	150063	150068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522159
3516	NC_008435	GCTGGT	2	12	150386	150397	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115522160
3517	NC_008435	CTC	2	6	150417	150422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522160
3518	NC_008435	CTA	2	6	150425	150430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522160
3519	NC_008435	CGC	2	6	150491	150496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3520	NC_008435	TCG	2	6	150655	150660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3521	NC_008435	CGC	2	6	150668	150673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3522	NC_008435	ATC	2	6	150699	150704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522160
3523	NC_008435	CCG	2	6	150709	150714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3524	NC_008435	CGG	2	6	150716	150721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3525	NC_008435	CGCGG	2	10	150793	150802	0 %	0 %	60 %	40 %	115522160
3526	NC_008435	AAGG	2	8	150819	150826	50 %	0 %	50 %	0 %	115522160
3527	NC_008435	CT	3	6	150931	150936	0 %	50 %	0 %	50 %	115522160
3528	NC_008435	TCA	2	6	150970	150975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522160
3529	NC_008435	GGC	2	6	151023	151028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3530	NC_008435	TCA	2	6	151042	151047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522160
3531	NC_008435	CGG	2	6	151075	151080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3532	NC_008435	ATCC	2	8	151081	151088	25 %	25 %	0 %	50 %	115522160
3533	NC_008435	TGA	2	6	151186	151191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522160
3534	NC_008435	GC	3	6	151204	151209	0 %	0 %	50 %	50 %	115522160
3535	NC_008435	CGG	2	6	151244	151249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3536	NC_008435	GTG	2	6	151263	151268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522160
3537	NC_008435	CGG	3	9	151331	151339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3538	NC_008435	CGC	2	6	151340	151345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3539	NC_008435	CG	4	8	151414	151421	0 %	0 %	50 %	50 %	115522160
3540	NC_008435	CGG	3	9	151463	151471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3541	NC_008435	CCG	2	6	151513	151518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3542	NC_008435	CCG	2	6	151534	151539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3543	NC_008435	CGA	2	6	151547	151552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3544	NC_008435	CGC	2	6	151556	151561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3545	NC_008435	GC	3	6	151560	151565	0 %	0 %	50 %	50 %	115522160
3546	NC_008435	CAA	2	6	151586	151591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522160
3547	NC_008435	GGT	2	6	151616	151621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522160
3548	NC_008435	CGG	2	6	151663	151668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3549	NC_008435	CGAT	2	8	151687	151694	25 %	25 %	25 %	25 %	115522160
3550	NC_008435	CGC	2	6	151750	151755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3551	NC_008435	CGC	2	6	151771	151776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3552	NC_008435	TGC	2	6	151777	151782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3553	NC_008435	GC	3	6	151781	151786	0 %	0 %	50 %	50 %	115522160
3554	NC_008435	GTC	2	6	151800	151805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3555	NC_008435	CGGC	2	8	151868	151875	0 %	0 %	50 %	50 %	115522160
3556	NC_008435	GAGC	2	8	151967	151974	25 %	0 %	50 %	25 %	115522160
3557	NC_008435	CAT	2	6	151988	151993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522160
3558	NC_008435	GATC	2	8	152021	152028	25 %	25 %	25 %	25 %	115522160
3559	NC_008435	GGCA	2	8	152100	152107	25 %	0 %	50 %	25 %	115522160
3560	NC_008435	TCT	2	6	152122	152127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522160
3561	NC_008435	ATCGA	2	10	152172	152181	40 %	20 %	20 %	20 %	115522160
3562	NC_008435	CCG	2	6	152225	152230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3563	NC_008435	ACG	2	6	152281	152286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3564	NC_008435	TTC	2	6	152304	152309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522160
3565	NC_008435	CAG	2	6	152340	152345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3566	NC_008435	AGA	2	6	152359	152364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522160
3567	NC_008435	ATCG	2	8	152369	152376	25 %	25 %	25 %	25 %	115522160
3568	NC_008435	CGG	2	6	152387	152392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3569	NC_008435	CAA	2	6	152408	152413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522160
3570	NC_008435	CCGG	2	8	152468	152475	0 %	0 %	50 %	50 %	115522160
3571	NC_008435	GCC	2	6	152508	152513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3572	NC_008435	GCAA	2	8	152557	152564	50 %	0 %	25 %	25 %	115522160
3573	NC_008435	CTG	2	6	152619	152624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3574	NC_008435	CGAC	2	8	152625	152632	25 %	0 %	25 %	50 %	115522160
3575	NC_008435	TCG	2	6	152689	152694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3576	NC_008435	ACGC	2	8	152737	152744	25 %	0 %	25 %	50 %	115522160
3577	NC_008435	GGC	2	6	152760	152765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3578	NC_008435	ACGCTG	2	12	152766	152777	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3579	NC_008435	GAT	2	6	152792	152797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522160
3580	NC_008435	GGCGAG	2	12	152823	152834	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	115522160
3581	NC_008435	TCACCG	2	12	152854	152865	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522160
3582	NC_008435	TTC	2	6	152916	152921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522160
3583	NC_008435	ACC	2	6	152922	152927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522160
3584	NC_008435	TCA	2	6	152977	152982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522160
3585	NC_008435	CGG	2	6	152990	152995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3586	NC_008435	TCACA	2	10	152996	153005	40 %	20 %	0 %	40 %	115522160
3587	NC_008435	ATCT	2	8	153042	153049	25 %	50 %	0 %	25 %	115522160
3588	NC_008435	GC	3	6	153069	153074	0 %	0 %	50 %	50 %	115522160
3589	NC_008435	GGC	2	6	153114	153119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3590	NC_008435	GTC	2	6	153135	153140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3591	NC_008435	GAC	2	6	153144	153149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3592	NC_008435	GGC	3	9	153206	153214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3593	NC_008435	GCC	2	6	153219	153224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3594	NC_008435	GGCGT	2	10	153249	153258	0 %	20 %	60 %	20 %	115522160
3595	NC_008435	CTG	2	6	153264	153269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3596	NC_008435	GCG	2	6	153332	153337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3597	NC_008435	CAA	2	6	153392	153397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522160
3598	NC_008435	CTG	2	6	153417	153422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3599	NC_008435	GAT	2	6	153458	153463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522160
3600	NC_008435	CGG	3	9	153508	153516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3601	NC_008435	AGC	2	6	153519	153524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3602	NC_008435	GCA	3	9	153642	153650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522161
3603	NC_008435	ATC	2	6	153662	153667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522161
3604	NC_008435	GTC	2	6	153676	153681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522161
3605	NC_008435	AGC	2	6	153791	153796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522161
3606	NC_008435	GC	3	6	153795	153800	0 %	0 %	50 %	50 %	115522161
3607	NC_008435	GCC	2	6	153825	153830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522161
3608	NC_008435	CGC	2	6	153888	153893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522161
3609	NC_008435	GCG	2	6	153905	153910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522161
3610	NC_008435	CCGG	2	8	153950	153957	0 %	0 %	50 %	50 %	115522161
3611	NC_008435	GCC	2	6	153964	153969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522161
3612	NC_008435	CAG	2	6	154024	154029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522161
3613	NC_008435	GCC	2	6	154044	154049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522161
3614	NC_008435	CCA	2	6	154062	154067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522161
3615	NC_008435	TTG	2	6	154082	154087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522161
3616	NC_008435	GCAG	2	8	154106	154113	25 %	0 %	50 %	25 %	115522161
3617	NC_008435	CAC	2	6	154120	154125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522161
3618	NC_008435	CGC	2	6	154128	154133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522161
3619	NC_008435	GC	3	6	154132	154137	0 %	0 %	50 %	50 %	115522161
3620	NC_008435	CGC	2	6	154206	154211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522161
3621	NC_008435	CGAGCG	2	12	154215	154226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522161
3622	NC_008435	GCC	2	6	154245	154250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522161
3623	NC_008435	GCC	2	6	154289	154294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522161
3624	NC_008435	CGC	3	9	154320	154328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522161
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3641	NC_008435	TAG	2	6	155075	155080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522162
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3740	NC_008435	TGA	2	6	159982	159987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522167
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3742	NC_008435	GCTC	2	8	160162	160169	0 %	25 %	25 %	50 %	115522167
3743	NC_008435	GCG	2	6	160170	160175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522167
3744	NC_008435	GCC	2	6	160186	160191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522167
3745	NC_008435	TCG	2	6	160242	160247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522167
3746	NC_008435	TGC	2	6	160267	160272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522167
3747	NC_008435	GCC	2	6	160277	160282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522167
3748	NC_008435	GC	3	6	160337	160342	0 %	0 %	50 %	50 %	115522167
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3750	NC_008435	GC	3	6	160450	160455	0 %	0 %	50 %	50 %	115522167
3751	NC_008435	CGA	2	6	160495	160500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522167
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3753	NC_008435	GGA	2	6	160571	160576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522167
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3755	NC_008435	AAG	2	6	160718	160723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522168
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3757	NC_008435	GCT	2	6	160891	160896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522168
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3764	NC_008435	CCA	2	6	161249	161254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522169
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3772	NC_008435	GCG	2	6	161471	161476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522169
3773	NC_008435	ATGC	2	8	161580	161587	25 %	25 %	25 %	25 %	115522169
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3806	NC_008435	GC	3	6	163220	163225	0 %	0 %	50 %	50 %	115522170
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3849	NC_008435	TCG	2	6	165411	165416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522173
3850	NC_008435	CG	3	6	165517	165522	0 %	0 %	50 %	50 %	115522173
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3853	NC_008435	GAG	2	6	165578	165583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522173
3854	NC_008435	GCCGAC	2	12	165629	165640	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522173
3855	NC_008435	GCGCC	2	10	165661	165670	0 %	0 %	40 %	60 %	115522173
3856	NC_008435	CGC	2	6	165700	165705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522173
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3859	NC_008435	CG	3	6	165771	165776	0 %	0 %	50 %	50 %	115522173
3860	NC_008435	TCG	2	6	165795	165800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522173
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3984	NC_008435	GCA	3	9	170664	170672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522176
3985	NC_008435	GCT	2	6	170715	170720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522176
3986	NC_008435	TCG	2	6	170723	170728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522176
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3988	NC_008435	GTC	2	6	170797	170802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522176
3989	NC_008435	GAT	2	6	170815	170820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522176
3990	NC_008435	TCG	2	6	170837	170842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522176
3991	NC_008435	TCG	2	6	170861	170866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522176
3992	NC_008435	TCC	2	6	170900	170905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522176
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