MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008435	CCG	2	6	127741	127746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522141
3002	NC_008435	GCG	2	6	127781	127786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522141
3003	NC_008435	TCC	2	6	127828	127833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522141
3004	NC_008435	GC	3	6	127870	127875	0 %	0 %	50 %	50 %	115522141
3005	NC_008435	ACC	2	6	127882	127887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522141
3006	NC_008435	GAA	2	6	127932	127937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522141
3007	NC_008435	TCC	2	6	127963	127968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522141
3008	NC_008435	GCA	2	6	128006	128011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522141
3009	NC_008435	AGC	2	6	128047	128052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522141
3010	NC_008435	GC	3	6	128057	128062	0 %	0 %	50 %	50 %	115522141
3011	NC_008435	GCG	2	6	128171	128176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522141
3012	NC_008435	AGC	2	6	128185	128190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522141
3013	NC_008435	AAC	2	6	128366	128371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522142
3014	NC_008435	CGA	2	6	128386	128391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3015	NC_008435	GCGAA	2	10	128399	128408	40 %	0 %	40 %	20 %	115522142
3016	NC_008435	CGC	2	6	128531	128536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522142
3017	NC_008435	CGA	2	6	128567	128572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3018	NC_008435	CGG	3	9	128624	128632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522142
3019	NC_008435	GCT	2	6	128635	128640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3020	NC_008435	TAT	2	6	128643	128648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115522142
3021	NC_008435	AAC	2	6	128655	128660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522142
3022	NC_008435	CGA	2	6	128668	128673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3023	NC_008435	GAC	2	6	128726	128731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3024	NC_008435	CGG	2	6	128735	128740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522142
3025	NC_008435	T	6	6	128747	128752	0 %	100 %	0 %	0 %	115522142
3026	NC_008435	CG	3	6	128769	128774	0 %	0 %	50 %	50 %	115522142
3027	NC_008435	CGA	2	6	128819	128824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3028	NC_008435	GATTCG	2	12	128889	128900	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115522142
3029	NC_008435	CGA	2	6	128915	128920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3030	NC_008435	GC	3	6	128925	128930	0 %	0 %	50 %	50 %	115522142
3031	NC_008435	TGC	3	9	128944	128952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3032	NC_008435	TCG	2	6	128959	128964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3033	NC_008435	CGA	2	6	128969	128974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3034	NC_008435	CGA	2	6	128996	129001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3035	NC_008435	GC	3	6	129013	129018	0 %	0 %	50 %	50 %	115522142
3036	NC_008435	GC	4	8	129062	129069	0 %	0 %	50 %	50 %	115522142
3037	NC_008435	CGG	2	6	129112	129117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522142
3038	NC_008435	CGA	2	6	129125	129130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3039	NC_008435	GGC	2	6	129152	129157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522142
3040	NC_008435	CGG	2	6	129200	129205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522142
3041	NC_008435	GGA	2	6	129227	129232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522142
3042	NC_008435	GC	3	6	129255	129260	0 %	0 %	50 %	50 %	115522142
3043	NC_008435	GC	3	6	129271	129276	0 %	0 %	50 %	50 %	115522142
3044	NC_008435	CGC	2	6	129317	129322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522142
3045	NC_008435	GGA	2	6	129377	129382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522142
3046	NC_008435	TCC	2	6	129403	129408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522142
3047	NC_008435	GC	3	6	129429	129434	0 %	0 %	50 %	50 %	115522142
3048	NC_008435	CTG	2	6	129441	129446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522142
3049	NC_008435	GC	3	6	129487	129492	0 %	0 %	50 %	50 %	115522143
3050	NC_008435	TCG	2	6	129494	129499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3051	NC_008435	TCGA	2	8	129517	129524	25 %	25 %	25 %	25 %	115522143
3052	NC_008435	CGC	2	6	129644	129649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522143
3053	NC_008435	AACG	2	8	129664	129671	50 %	0 %	25 %	25 %	115522143
3054	NC_008435	CGA	2	6	129696	129701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3055	NC_008435	TGA	2	6	129719	129724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522143
3056	NC_008435	GTCAG	2	10	129725	129734	20 %	20 %	40 %	20 %	115522143
3057	NC_008435	CGA	2	6	129744	129749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3058	NC_008435	CGGCG	2	10	129760	129769	0 %	0 %	60 %	40 %	115522143
3059	NC_008435	GCCT	2	8	129805	129812	0 %	25 %	25 %	50 %	115522143
3060	NC_008435	GCC	2	6	129826	129831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522143
3061	NC_008435	CGG	2	6	129861	129866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522143
3062	NC_008435	GCA	2	6	129893	129898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3063	NC_008435	GCC	2	6	129991	129996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522143
3064	NC_008435	GGC	2	6	129997	130002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522143
3065	NC_008435	GCCG	2	8	130025	130032	0 %	0 %	50 %	50 %	115522143
3066	NC_008435	CGA	2	6	130092	130097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3067	NC_008435	ATCGCG	2	12	130099	130110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3068	NC_008435	GCT	2	6	130188	130193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3069	NC_008435	CAA	2	6	130209	130214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522143
3070	NC_008435	CGC	2	6	130215	130220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522143
3071	NC_008435	CGC	2	6	130224	130229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522143
3072	NC_008435	GCA	2	6	130251	130256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3073	NC_008435	CCGG	2	8	130260	130267	0 %	0 %	50 %	50 %	115522143
3074	NC_008435	CGG	3	9	130271	130279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522143
3075	NC_008435	CGC	2	6	130290	130295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522143
3076	NC_008435	CACGA	2	10	130312	130321	40 %	0 %	20 %	40 %	115522143
3077	NC_008435	GTG	2	6	130342	130347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522143
3078	NC_008435	GTG	2	6	130366	130371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522143
3079	NC_008435	CGA	2	6	130437	130442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3080	NC_008435	GTGCTG	2	12	130447	130458	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115522143
3081	NC_008435	CG	3	6	130466	130471	0 %	0 %	50 %	50 %	115522143
3082	NC_008435	CGA	2	6	130482	130487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3083	NC_008435	TCG	2	6	130490	130495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3084	NC_008435	TGC	2	6	130533	130538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3085	NC_008435	CG	3	6	130578	130583	0 %	0 %	50 %	50 %	115522143
3086	NC_008435	CGA	2	6	130619	130624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522143
3087	NC_008435	GCC	2	6	130670	130675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522143
3088	NC_008435	CGG	2	6	130689	130694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522143
3089	NC_008435	CGGG	2	8	130738	130745	0 %	0 %	75 %	25 %	115522143
3090	NC_008435	TTC	2	6	130756	130761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522143
3091	NC_008435	CAT	2	6	130862	130867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522144
3092	NC_008435	CTG	2	6	130890	130895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522144
3093	NC_008435	GCT	2	6	130979	130984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522144
3094	NC_008435	CGC	2	6	131009	131014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522144
3095	NC_008435	CGC	2	6	131048	131053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522144
3096	NC_008435	GGC	3	9	131079	131087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522144
3097	NC_008435	GTG	2	6	131097	131102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522144
3098	NC_008435	GTG	3	9	131307	131315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522144
3099	NC_008435	CGGCCG	2	12	131317	131328	0 %	0 %	50 %	50 %	115522144
3100	NC_008435	TCGG	2	8	131331	131338	0 %	25 %	50 %	25 %	115522144
3101	NC_008435	TCG	2	6	131344	131349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522144
3102	NC_008435	CGG	2	6	131393	131398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522144
3103	NC_008435	CGC	2	6	131441	131446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522144
3104	NC_008435	GGC	2	6	131489	131494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522144
3105	NC_008435	CGG	2	6	131528	131533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522144
3106	NC_008435	GCCT	2	8	131547	131554	0 %	25 %	25 %	50 %	115522144
3107	NC_008435	CTG	2	6	131585	131590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522144
3108	NC_008435	GC	3	6	131614	131619	0 %	0 %	50 %	50 %	115522144
3109	NC_008435	CG	3	6	131635	131640	0 %	0 %	50 %	50 %	115522144
3110	NC_008435	GTG	2	6	131658	131663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522144
3111	NC_008435	CG	3	6	131718	131723	0 %	0 %	50 %	50 %	115522144
3112	NC_008435	CGC	2	6	131800	131805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522144
3113	NC_008435	TCA	2	6	132131	132136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522145
3114	NC_008435	CTG	2	6	132140	132145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3115	NC_008435	GGC	2	6	132164	132169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3116	NC_008435	TCT	2	6	132186	132191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522145
3117	NC_008435	GC	3	6	132198	132203	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3118	NC_008435	GCC	2	6	132222	132227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3119	NC_008435	TCG	2	6	132231	132236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3120	NC_008435	TGA	2	6	132322	132327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522145
3121	NC_008435	GAA	2	6	132389	132394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522145
3122	NC_008435	GCC	2	6	132431	132436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3123	NC_008435	CCG	2	6	132452	132457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3124	NC_008435	GCA	2	6	132580	132585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3125	NC_008435	CAG	2	6	132590	132595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3126	NC_008435	GGT	2	6	132625	132630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522145
3127	NC_008435	GCA	2	6	132631	132636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3128	NC_008435	GAT	2	6	132650	132655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522145
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3130	NC_008435	CCG	3	9	133000	133008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
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3132	NC_008435	CGT	2	6	133056	133061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3133	NC_008435	CGG	3	9	133096	133104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3134	NC_008435	GCA	2	6	133126	133131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
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3139	NC_008435	CCGG	2	8	133357	133364	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3140	NC_008435	GAA	2	6	133406	133411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522145
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3143	NC_008435	CGT	2	6	133528	133533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
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3145	NC_008435	CTTG	2	8	133576	133583	0 %	50 %	25 %	25 %	115522145
3146	NC_008435	GGCA	2	8	133655	133662	25 %	0 %	50 %	25 %	115522145
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3149	NC_008435	GCCGA	2	10	133770	133779	20 %	0 %	40 %	40 %	115522145
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3152	NC_008435	AGAT	2	8	133962	133969	50 %	25 %	25 %	0 %	115522145
3153	NC_008435	TCG	2	6	133977	133982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3154	NC_008435	TCG	2	6	133995	134000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3155	NC_008435	CGC	2	6	134005	134010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
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3160	NC_008435	CGT	2	6	134134	134139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
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3162	NC_008435	TCG	3	9	134181	134189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
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3228	NC_008435	GTT	2	6	136740	136745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522148
3229	NC_008435	TCG	2	6	136804	136809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522148
3230	NC_008435	CG	3	6	136808	136813	0 %	0 %	50 %	50 %	115522148
3231	NC_008435	CAC	3	9	136827	136835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522148
3232	NC_008435	GGCCTC	2	12	136872	136883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115522148
3233	NC_008435	GGA	2	6	136890	136895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522148
3234	NC_008435	TCG	2	6	137251	137256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522149
3235	NC_008435	CCAT	2	8	137302	137309	25 %	25 %	0 %	50 %	115522149
3236	NC_008435	GCG	3	9	137395	137403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522149
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3239	NC_008435	CG	3	6	137560	137565	0 %	0 %	50 %	50 %	115522149
3240	NC_008435	CGC	2	6	137579	137584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522149
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3242	NC_008435	CTCGGC	2	12	137721	137732	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115522149
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3360	NC_008435	CGC	2	6	142477	142482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522153
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3362	NC_008435	GC	3	6	142514	142519	0 %	0 %	50 %	50 %	115522153
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3364	NC_008435	GGA	2	6	142552	142557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522153
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3366	NC_008435	CCG	2	6	142656	142661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522153
3367	NC_008435	GTG	2	6	142730	142735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522153
3368	NC_008435	CAT	2	6	142856	142861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522154
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3377	NC_008435	GC	4	8	143195	143202	0 %	0 %	50 %	50 %	115522154
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3485	NC_008435	CAG	2	6	148047	148052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522157
3486	NC_008435	GAT	2	6	148068	148073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522157
3487	NC_008435	GGA	2	6	148077	148082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522157
3488	NC_008435	TGG	2	6	148127	148132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522157
3489	NC_008435	CGCCGG	2	12	148151	148162	0 %	0 %	50 %	50 %	115522157
3490	NC_008435	CG	4	8	148579	148586	0 %	0 %	50 %	50 %	115522158
3491	NC_008435	CGG	2	6	148596	148601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522158
3492	NC_008435	GCC	2	6	148633	148638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522158
3493	NC_008435	CCAG	2	8	148698	148705	25 %	0 %	25 %	50 %	115522158
3494	NC_008435	GGCCG	2	10	148798	148807	0 %	0 %	60 %	40 %	115522158
3495	NC_008435	GGC	2	6	148894	148899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522158
3496	NC_008435	GCA	2	6	148944	148949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522158
3497	NC_008435	CGC	2	6	148974	148979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522158
3498	NC_008435	GGC	2	6	149021	149026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522158
3499	NC_008435	GCC	3	9	149053	149061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522158
3500	NC_008435	CTT	2	6	149089	149094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522158

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