MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008435	GC	3	6	41535	41540	0 %	0 %	50 %	50 %	115522067
1002	NC_008435	GCC	2	6	41591	41596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522067
1003	NC_008435	GCA	2	6	41648	41653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522067
1004	NC_008435	TCGG	2	8	41707	41714	0 %	25 %	50 %	25 %	115522067
1005	NC_008435	CAT	2	6	41715	41720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522067
1006	NC_008435	CATCGC	2	12	41735	41746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522068
1007	NC_008435	GC	3	6	41745	41750	0 %	0 %	50 %	50 %	115522068
1008	NC_008435	GGC	2	6	41807	41812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522068
1009	NC_008435	CG	3	6	41827	41832	0 %	0 %	50 %	50 %	115522068
1010	NC_008435	CAG	2	6	41984	41989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1011	NC_008435	GCA	2	6	42088	42093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1012	NC_008435	TCG	2	6	42144	42149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1013	NC_008435	TCG	2	6	42189	42194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1014	NC_008435	CAC	2	6	42215	42220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522068
1015	NC_008435	GCG	2	6	42242	42247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522068
1016	NC_008435	CCCATC	2	12	42327	42338	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	115522068
1017	NC_008435	CAC	2	6	42341	42346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522068
1018	NC_008435	GTT	2	6	42362	42367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522068
1019	NC_008435	GCCGA	2	10	42410	42419	20 %	0 %	40 %	40 %	115522068
1020	NC_008435	CCA	2	6	42427	42432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522068
1021	NC_008435	CGA	2	6	42442	42447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1022	NC_008435	CGG	2	6	42454	42459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522068
1023	NC_008435	CTGG	2	8	42524	42531	0 %	25 %	50 %	25 %	115522068
1024	NC_008435	CGGT	2	8	42549	42556	0 %	25 %	50 %	25 %	115522068
1025	NC_008435	GC	4	8	42586	42593	0 %	0 %	50 %	50 %	115522068
1026	NC_008435	CGCC	2	8	42595	42602	0 %	0 %	25 %	75 %	115522068
1027	NC_008435	GCA	2	6	42619	42624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1028	NC_008435	CAC	2	6	42662	42667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522068
1029	NC_008435	GCT	2	6	42778	42783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1030	NC_008435	TGCGC	2	10	42796	42805	0 %	20 %	40 %	40 %	115522068
1031	NC_008435	CGC	3	9	42803	42811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522068
1032	NC_008435	GCC	2	6	42821	42826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522068
1033	NC_008435	T	6	6	42904	42909	0 %	100 %	0 %	0 %	115522068
1034	NC_008435	GCG	2	6	42918	42923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522068
1035	NC_008435	CCG	2	6	43140	43145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522069
1036	NC_008435	CGG	2	6	43247	43252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522069
1037	NC_008435	CGG	2	6	43286	43291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522069
1038	NC_008435	GCC	2	6	43341	43346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522069
1039	NC_008435	ATC	2	6	43390	43395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522069
1040	NC_008435	GAC	2	6	43410	43415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522069
1041	NC_008435	TCGG	2	8	43420	43427	0 %	25 %	50 %	25 %	115522069
1042	NC_008435	CG	3	6	43457	43462	0 %	0 %	50 %	50 %	115522069
1043	NC_008435	CGG	2	6	43470	43475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522069
1044	NC_008435	CGA	3	9	43485	43493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522069
1045	NC_008435	CCG	2	6	43588	43593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522069
1046	NC_008435	AGC	2	6	43596	43601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522069
1047	NC_008435	CGCGGG	2	12	43611	43622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522069
1048	NC_008435	GGC	2	6	43641	43646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522069
1049	NC_008435	GCGCCA	2	12	43652	43663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522069
1050	NC_008435	ATC	2	6	43693	43698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522069
1051	NC_008435	CGC	2	6	43714	43719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522069
1052	NC_008435	CGA	2	6	44062	44067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522070
1053	NC_008435	GCG	3	9	44132	44140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522070
1054	NC_008435	T	6	6	44146	44151	0 %	100 %	0 %	0 %	115522070
1055	NC_008435	TGA	2	6	44160	44165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522070
1056	NC_008435	GCC	2	6	44188	44193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522070
1057	NC_008435	GTG	2	6	44279	44284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522070
1058	NC_008435	GC	4	8	44304	44311	0 %	0 %	50 %	50 %	115522070
1059	NC_008435	CGG	2	6	44328	44333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522070
1060	NC_008435	CGC	2	6	44374	44379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522070
1061	NC_008435	ATC	3	9	44384	44392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522070
1062	NC_008435	GCC	2	6	44468	44473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522070
1063	NC_008435	GCC	2	6	44489	44494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522070
1064	NC_008435	CCT	2	6	44538	44543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522070
1065	NC_008435	CGA	2	6	44545	44550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522070
1066	NC_008435	AGC	2	6	44568	44573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522070
1067	NC_008435	CGG	2	6	44638	44643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522070
1068	NC_008435	ATC	2	6	44657	44662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522070
1069	NC_008435	CGG	2	6	44674	44679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522070
1070	NC_008435	GGC	2	6	44692	44697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522070
1071	NC_008435	CGC	2	6	44743	44748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522070
1072	NC_008435	GCT	2	6	44782	44787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522070
1073	NC_008435	A	6	6	44845	44850	100 %	0 %	0 %	0 %	115522070
1074	NC_008435	CCG	2	6	44883	44888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522070
1075	NC_008435	CCG	2	6	44937	44942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522070
1076	NC_008435	GCCG	2	8	44960	44967	0 %	0 %	50 %	50 %	115522070
1077	NC_008435	CGGCGC	2	12	45261	45272	0 %	0 %	50 %	50 %	115522071
1078	NC_008435	CG	3	6	45288	45293	0 %	0 %	50 %	50 %	115522071
1079	NC_008435	GGTGCT	2	12	45318	45329	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115522071
1080	NC_008435	GC	3	6	45334	45339	0 %	0 %	50 %	50 %	115522071
1081	NC_008435	CGG	2	6	45348	45353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522071
1082	NC_008435	TGCA	2	8	45413	45420	25 %	25 %	25 %	25 %	115522071
1083	NC_008435	CGC	2	6	45447	45452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522071
1084	NC_008435	TCGC	2	8	45474	45481	0 %	25 %	25 %	50 %	115522071
1085	NC_008435	GC	3	6	45480	45485	0 %	0 %	50 %	50 %	115522071
1086	NC_008435	CTG	2	6	45486	45491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522071
1087	NC_008435	CGA	2	6	45525	45530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522071
1088	NC_008435	ACG	2	6	45545	45550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522071
1089	NC_008435	CGG	3	9	45578	45586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522071
1090	NC_008435	GC	3	6	45785	45790	0 %	0 %	50 %	50 %	115522071
1091	NC_008435	CG	3	6	45863	45868	0 %	0 %	50 %	50 %	115522071
1092	NC_008435	CGAT	2	8	46067	46074	25 %	25 %	25 %	25 %	115522071
1093	NC_008435	CGGCAG	2	12	46080	46091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522071
1094	NC_008435	CTT	2	6	46131	46136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522071
1095	NC_008435	CGG	2	6	46137	46142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522071
1096	NC_008435	CGA	2	6	46164	46169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522071
1097	NC_008435	GC	3	6	46178	46183	0 %	0 %	50 %	50 %	115522071
1098	NC_008435	GGC	2	6	46191	46196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522071
1099	NC_008435	CGA	2	6	46200	46205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522071
1100	NC_008435	GCT	2	6	46215	46220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522071
1101	NC_008435	TGGC	2	8	46283	46290	0 %	25 %	50 %	25 %	115522071
1102	NC_008435	CGC	2	6	46341	46346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522071
1103	NC_008435	CGC	2	6	46388	46393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522071
1104	NC_008435	TCT	2	6	46397	46402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522071
1105	NC_008435	GC	3	6	46434	46439	0 %	0 %	50 %	50 %	115522071
1106	NC_008435	GC	3	6	46441	46446	0 %	0 %	50 %	50 %	115522071
1107	NC_008435	CCA	2	6	46469	46474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522071
1108	NC_008435	CCGC	2	8	46566	46573	0 %	0 %	25 %	75 %	115522072
1109	NC_008435	GCG	2	6	46583	46588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522072
1110	NC_008435	CCA	2	6	46606	46611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522072
1111	NC_008435	CGCC	2	8	46639	46646	0 %	0 %	25 %	75 %	115522072
1112	NC_008435	ACC	2	6	46666	46671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522072
1113	NC_008435	CGG	2	6	46672	46677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522072
1114	NC_008435	GCC	2	6	46703	46708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522072
1115	NC_008435	GGT	2	6	46766	46771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522072
1116	NC_008435	CGGC	2	8	46872	46879	0 %	0 %	50 %	50 %	115522073
1117	NC_008435	CGC	2	6	46904	46909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522073
1118	NC_008435	GAC	2	6	46917	46922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522073
1119	NC_008435	CAT	2	6	46946	46951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522073
1120	NC_008435	CCG	2	6	46982	46987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522073
1121	NC_008435	TGG	2	6	46998	47003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522073
1122	NC_008435	GTGCT	2	10	47037	47046	0 %	40 %	40 %	20 %	115522073
1123	NC_008435	GGGCT	2	10	47151	47160	0 %	20 %	60 %	20 %	115522073
1124	NC_008435	CG	3	6	47268	47273	0 %	0 %	50 %	50 %	115522073
1125	NC_008435	CGG	2	6	47276	47281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522073
1126	NC_008435	TGG	2	6	47287	47292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522073
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1129	NC_008435	CGG	2	6	47521	47526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522074
1130	NC_008435	TGG	2	6	47568	47573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522074
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1241	NC_008435	CGGC	2	8	52287	52294	0 %	0 %	50 %	50 %	115522077
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1247	NC_008435	CGC	2	6	52550	52555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522078
1248	NC_008435	CAA	2	6	52559	52564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522078
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1499	NC_008435	ACA	2	6	63431	63436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522090
1500	NC_008435	GC	3	6	63438	63443	0 %	0 %	50 %	50 %	115522090

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