MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008435	GCC	2	6	577087	577092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522556
13502	NC_008435	GC	3	6	577119	577124	0 %	0 %	50 %	50 %	115522556
13503	NC_008435	TGC	2	6	577133	577138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522556
13504	NC_008435	CGG	2	6	577170	577175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522556
13505	NC_008435	TGGCGC	2	12	577190	577201	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522556
13506	NC_008435	TGC	2	6	577226	577231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522556
13507	NC_008435	CGA	2	6	577236	577241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522556
13508	NC_008435	CTCG	2	8	577251	577258	0 %	25 %	25 %	50 %	115522556
13509	NC_008435	CGC	2	6	577299	577304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522556
13510	NC_008435	GTG	2	6	577327	577332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522556
13511	NC_008435	CGC	2	6	577350	577355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522556
13512	NC_008435	GC	3	6	577354	577359	0 %	0 %	50 %	50 %	115522556
13513	NC_008435	GCG	2	6	577399	577404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522556
13514	NC_008435	GCG	3	9	577481	577489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522556
13515	NC_008435	TGC	2	6	577499	577504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522556
13516	NC_008435	CGC	2	6	577512	577517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522556
13517	NC_008435	GC	3	6	577523	577528	0 %	0 %	50 %	50 %	115522557
13518	NC_008435	GGCG	2	8	577544	577551	0 %	0 %	75 %	25 %	115522557
13519	NC_008435	GCCGC	2	10	577578	577587	0 %	0 %	40 %	60 %	115522557
13520	NC_008435	TGA	2	6	577630	577635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522557
13521	NC_008435	CCG	2	6	577647	577652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522557
13522	NC_008435	CTGG	2	8	577697	577704	0 %	25 %	50 %	25 %	115522557
13523	NC_008435	CCG	2	6	577705	577710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522557
13524	NC_008435	TGC	2	6	577759	577764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522557
13525	NC_008435	TGG	2	6	577774	577779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522557
13526	NC_008435	GC	3	6	577799	577804	0 %	0 %	50 %	50 %	115522557
13527	NC_008435	AGC	2	6	577822	577827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522557
13528	NC_008435	GTG	2	6	577854	577859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522557
13529	NC_008435	CGA	2	6	577871	577876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522557
13530	NC_008435	GGC	2	6	577901	577906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522557
13531	NC_008435	CCGCG	2	10	577925	577934	0 %	0 %	40 %	60 %	115522557
13532	NC_008435	GC	3	6	577971	577976	0 %	0 %	50 %	50 %	115522557
13533	NC_008435	TGC	2	6	578005	578010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522557
13534	NC_008435	GGC	2	6	578017	578022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522557
13535	NC_008435	GGGCA	2	10	578037	578046	20 %	0 %	60 %	20 %	115522557
13536	NC_008435	CTG	2	6	578058	578063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522557
13537	NC_008435	CAT	2	6	578138	578143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522557
13538	NC_008435	CGG	2	6	578177	578182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522557
13539	NC_008435	GCT	3	9	578210	578218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522557
13540	NC_008435	ATC	2	6	578262	578267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522557
13541	NC_008435	GCG	3	9	578287	578295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522557
13542	NC_008435	CTG	2	6	578319	578324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522557
13543	NC_008435	GCGCC	2	10	578522	578531	0 %	0 %	40 %	60 %	115522558
13544	NC_008435	CGA	2	6	578541	578546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522558
13545	NC_008435	CGGC	2	8	578547	578554	0 %	0 %	50 %	50 %	115522558
13546	NC_008435	GCA	2	6	578661	578666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522558
13547	NC_008435	GCA	2	6	578682	578687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522558
13548	NC_008435	CGC	2	6	578690	578695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522558
13549	NC_008435	GTG	2	6	578703	578708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522558
13550	NC_008435	TCGA	2	8	578740	578747	25 %	25 %	25 %	25 %	115522558
13551	NC_008435	CCG	2	6	578785	578790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522558
13552	NC_008435	GCCCG	2	10	578847	578856	0 %	0 %	40 %	60 %	115522558
13553	NC_008435	GCC	2	6	578929	578934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522558
13554	NC_008435	CGC	2	6	579012	579017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522558
13555	NC_008435	GC	3	6	579033	579038	0 %	0 %	50 %	50 %	115522558
13556	NC_008435	AAT	2	6	579136	579141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522558
13557	NC_008435	CG	3	6	579156	579161	0 %	0 %	50 %	50 %	115522558
13558	NC_008435	TGG	2	6	579304	579309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522559
13559	NC_008435	CGAT	2	8	579319	579326	25 %	25 %	25 %	25 %	115522559
13560	NC_008435	GACG	2	8	579329	579336	25 %	0 %	50 %	25 %	115522559
13561	NC_008435	ACGCGC	2	12	579340	579351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522559
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13564	NC_008435	CGC	2	6	579401	579406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522559
13565	NC_008435	TCG	2	6	579430	579435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522559
13566	NC_008435	CGT	2	6	579488	579493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522559
13567	NC_008435	GC	3	6	579531	579536	0 %	0 %	50 %	50 %	115522559
13568	NC_008435	GCC	2	6	579544	579549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522559
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13571	NC_008435	GCG	2	6	579589	579594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522559
13572	NC_008435	GCCT	2	8	579600	579607	0 %	25 %	25 %	50 %	115522559
13573	NC_008435	GCT	2	6	579650	579655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522559
13574	NC_008435	CGG	2	6	579656	579661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522559
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13577	NC_008435	GGCG	2	8	579752	579759	0 %	0 %	75 %	25 %	115522559
13578	NC_008435	GCC	2	6	579815	579820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522559
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13580	NC_008435	GCCG	2	8	579911	579918	0 %	0 %	50 %	50 %	115522559
13581	NC_008435	CG	3	6	579921	579926	0 %	0 %	50 %	50 %	115522559
13582	NC_008435	GCT	2	6	579938	579943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522559
13583	NC_008435	CG	3	6	579950	579955	0 %	0 %	50 %	50 %	115522559
13584	NC_008435	GCG	2	6	579985	579990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522559
13585	NC_008435	CTG	2	6	580014	580019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522559
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13587	NC_008435	GATC	2	8	580202	580209	25 %	25 %	25 %	25 %	115522559
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13589	NC_008435	CGA	2	6	580316	580321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522559
13590	NC_008435	GAT	2	6	580367	580372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522559
13591	NC_008435	CGG	2	6	580394	580399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522559
13592	NC_008435	CCT	2	6	580408	580413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522559
13593	NC_008435	GTG	2	6	580437	580442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522559
13594	NC_008435	TGC	2	6	580453	580458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522559
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13596	NC_008435	CACG	2	8	580507	580514	25 %	0 %	25 %	50 %	115522559
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13600	NC_008435	CGA	2	6	580767	580772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522560
13601	NC_008435	GGC	2	6	580786	580791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522560
13602	NC_008435	A	6	6	580820	580825	100 %	0 %	0 %	0 %	115522560
13603	NC_008435	GGC	2	6	580885	580890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522560
13604	NC_008435	CGC	2	6	580902	580907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522560
13605	NC_008435	CA	3	6	580909	580914	50 %	0 %	0 %	50 %	115522560
13606	NC_008435	GAA	2	6	580927	580932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522560
13607	NC_008435	GC	4	8	580946	580953	0 %	0 %	50 %	50 %	115522560
13608	NC_008435	CGC	2	6	580955	580960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522560
13609	NC_008435	TCC	2	6	580963	580968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522560
13610	NC_008435	GCT	2	6	580995	581000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522560
13611	NC_008435	CG	4	8	581046	581053	0 %	0 %	50 %	50 %	115522560
13612	NC_008435	CG	3	6	581122	581127	0 %	0 %	50 %	50 %	115522560
13613	NC_008435	GCGACG	2	12	581132	581143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522560
13614	NC_008435	TCA	2	6	581150	581155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522560
13615	NC_008435	T	6	6	581201	581206	0 %	100 %	0 %	0 %	115522560
13616	NC_008435	AAG	2	6	581233	581238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522560
13617	NC_008435	ACG	2	6	581240	581245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522560
13618	NC_008435	CAC	2	6	581286	581291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522560
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13620	NC_008435	CTG	2	6	581413	581418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522560
13621	NC_008435	GC	3	6	581427	581432	0 %	0 %	50 %	50 %	115522560
13622	NC_008435	GAT	2	6	581433	581438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522560
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13976	NC_008435	GCG	2	6	594575	594580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522571
13977	NC_008435	GAT	2	6	594618	594623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522571
13978	NC_008435	CCT	2	6	594662	594667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522571
13979	NC_008435	TGG	2	6	594686	594691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522571
13980	NC_008435	GC	3	6	594787	594792	0 %	0 %	50 %	50 %	115522571
13981	NC_008435	GTC	2	6	594793	594798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522571
13982	NC_008435	GCA	2	6	594821	594826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522571
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13991	NC_008435	CTG	2	6	595125	595130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522571
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13993	NC_008435	GCGCC	2	10	595392	595401	0 %	0 %	40 %	60 %	115522572
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14000	NC_008435	CGA	2	6	595672	595677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522572

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