MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008435	AGGT	2	8	258456	258463	25 %	25 %	50 %	0 %	115522258
6002	NC_008435	AACT	2	8	258664	258671	50 %	25 %	0 %	25 %	115522259
6003	NC_008435	GCC	2	6	258701	258706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522259
6004	NC_008435	GCG	2	6	258718	258723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522259
6005	NC_008435	TCA	2	6	258743	258748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522259
6006	NC_008435	GCG	2	6	258763	258768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522259
6007	NC_008435	CGA	2	6	258818	258823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522259
6008	NC_008435	GC	3	6	258925	258930	0 %	0 %	50 %	50 %	115522259
6009	NC_008435	TCC	2	6	258934	258939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522259
6010	NC_008435	CGA	2	6	258956	258961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522259
6011	NC_008435	CGC	2	6	258971	258976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522259
6012	NC_008435	GTTC	2	8	258977	258984	0 %	50 %	25 %	25 %	115522259
6013	NC_008435	CCA	2	6	258989	258994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522259
6014	NC_008435	CGGCG	2	10	258998	259007	0 %	0 %	60 %	40 %	115522259
6015	NC_008435	GC	4	8	259049	259056	0 %	0 %	50 %	50 %	115522259
6016	NC_008435	CG	4	8	259073	259080	0 %	0 %	50 %	50 %	115522259
6017	NC_008435	CGG	2	6	259113	259118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522259
6018	NC_008435	CGA	2	6	259151	259156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522259
6019	NC_008435	AG	3	6	259186	259191	50 %	0 %	50 %	0 %	115522259
6020	NC_008435	TTGGCG	2	12	259326	259337	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115522260
6021	NC_008435	TCGCC	2	10	259360	259369	0 %	20 %	20 %	60 %	115522260
6022	NC_008435	GGT	2	6	259385	259390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522260
6023	NC_008435	ACC	2	6	259413	259418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522260
6024	NC_008435	CCA	2	6	259471	259476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522260
6025	NC_008435	TCG	2	6	259480	259485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522260
6026	NC_008435	TCG	2	6	259519	259524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522260
6027	NC_008435	CGA	2	6	259541	259546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522260
6028	NC_008435	CAC	2	6	259571	259576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522260
6029	NC_008435	GC	3	6	259617	259622	0 %	0 %	50 %	50 %	115522260
6030	NC_008435	GGC	3	9	259623	259631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522260
6031	NC_008435	CAA	2	6	259673	259678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522260
6032	NC_008435	CGC	3	9	259735	259743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522260
6033	NC_008435	CTGGCG	2	12	259782	259793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522260
6034	NC_008435	CAT	2	6	259805	259810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522260
6035	NC_008435	GGCG	2	8	259826	259833	0 %	0 %	75 %	25 %	115522260
6036	NC_008435	ATCCCG	2	12	259893	259904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522260
6037	NC_008435	CGG	2	6	259910	259915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522260
6038	NC_008435	GTG	2	6	259923	259928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522260
6039	NC_008435	CGA	3	9	259943	259951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522260
6040	NC_008435	ATC	3	9	259953	259961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522260
6041	NC_008435	GTG	2	6	259986	259991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522260
6042	NC_008435	GCC	2	6	260055	260060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522260
6043	NC_008435	GCG	2	6	260061	260066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522260
6044	NC_008435	CGGCCT	2	12	260068	260079	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115522260
6045	NC_008435	CAA	2	6	260099	260104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522260
6046	NC_008435	GC	3	6	260105	260110	0 %	0 %	50 %	50 %	115522260
6047	NC_008435	CGG	3	9	260135	260143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522260
6048	NC_008435	CGC	2	6	260162	260167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522260
6049	NC_008435	GAC	2	6	260196	260201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522260
6050	NC_008435	GC	3	6	260240	260245	0 %	0 %	50 %	50 %	115522260
6051	NC_008435	GGC	2	6	260297	260302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522260
6052	NC_008435	GAA	2	6	260309	260314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522260
6053	NC_008435	GTC	2	6	260328	260333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522260
6054	NC_008435	TCG	2	6	260364	260369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522260
6055	NC_008435	TGC	2	6	260519	260524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522261
6056	NC_008435	A	6	6	260546	260551	100 %	0 %	0 %	0 %	115522261
6057	NC_008435	AC	3	6	260571	260576	50 %	0 %	0 %	50 %	115522261
6058	NC_008435	CGGCG	2	10	260600	260609	0 %	0 %	60 %	40 %	115522261
6059	NC_008435	CAG	2	6	260631	260636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522261
6060	NC_008435	TGT	2	6	260647	260652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522261
6061	NC_008435	ACC	2	6	260661	260666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522261
6062	NC_008435	AAG	2	6	260667	260672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522261
6063	NC_008435	GGT	2	6	260675	260680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522261
6064	NC_008435	GATC	2	8	260681	260688	25 %	25 %	25 %	25 %	115522261
6065	NC_008435	CGG	2	6	260690	260695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522261
6066	NC_008435	CGG	2	6	260783	260788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522261
6067	NC_008435	CGA	2	6	260792	260797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522261
6068	NC_008435	GTG	2	6	260865	260870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522261
6069	NC_008435	GCG	2	6	260896	260901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522261
6070	NC_008435	GTG	2	6	261006	261011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522261
6071	NC_008435	ACG	2	6	261019	261024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522261
6072	NC_008435	TCG	2	6	261040	261045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522261
6073	NC_008435	CGG	2	6	261089	261094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522261
6074	NC_008435	CACGC	2	10	261099	261108	20 %	0 %	20 %	60 %	115522261
6075	NC_008435	CAAA	2	8	261123	261130	75 %	0 %	0 %	25 %	115522261
6076	NC_008435	AGTT	2	8	261236	261243	25 %	50 %	25 %	0 %	115522261
6077	NC_008435	GCG	2	6	261433	261438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522262
6078	NC_008435	ACC	2	6	261473	261478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522262
6079	NC_008435	GCA	2	6	261543	261548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522262
6080	NC_008435	TCG	2	6	261566	261571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522262
6081	NC_008435	CGATAG	2	12	261572	261583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115522262
6082	NC_008435	GCT	2	6	261594	261599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522262
6083	NC_008435	CGC	2	6	261654	261659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522262
6084	NC_008435	CCG	2	6	261668	261673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522262
6085	NC_008435	GCC	2	6	261679	261684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522262
6086	NC_008435	GACCG	2	10	261697	261706	20 %	0 %	40 %	40 %	115522262
6087	NC_008435	GCG	2	6	261707	261712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522262
6088	NC_008435	CG	3	6	261723	261728	0 %	0 %	50 %	50 %	115522262
6089	NC_008435	GCC	2	6	261742	261747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522262
6090	NC_008435	TGA	2	6	261792	261797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522262
6091	NC_008435	ACG	2	6	261817	261822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522262
6092	NC_008435	CGG	2	6	261927	261932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522263
6093	NC_008435	CAG	2	6	261946	261951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522263
6094	NC_008435	CCG	2	6	261961	261966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522263
6095	NC_008435	TCG	2	6	261974	261979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522263
6096	NC_008435	CGG	2	6	262011	262016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522263
6097	NC_008435	GCA	2	6	262017	262022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522263
6098	NC_008435	GGC	2	6	262030	262035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522263
6099	NC_008435	GGC	2	6	262107	262112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522263
6100	NC_008435	CAG	2	6	262144	262149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522263
6101	NC_008435	ATCG	2	8	262150	262157	25 %	25 %	25 %	25 %	115522263
6102	NC_008435	ACC	2	6	262238	262243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522263
6103	NC_008435	CGC	2	6	262245	262250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522263
6104	NC_008435	CAC	2	6	262252	262257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522263
6105	NC_008435	CCA	3	9	262269	262277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522263
6106	NC_008435	CGT	2	6	262347	262352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522263
6107	NC_008435	GTG	2	6	262376	262381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522263
6108	NC_008435	CTG	2	6	262423	262428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522263
6109	NC_008435	ATC	2	6	262442	262447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522263
6110	NC_008435	TGG	2	6	262482	262487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522263
6111	NC_008435	GAA	2	6	262489	262494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522263
6112	NC_008435	GC	4	8	262505	262512	0 %	0 %	50 %	50 %	115522263
6113	NC_008435	CGC	2	6	262536	262541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522263
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6115	NC_008435	TGG	2	6	262623	262628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522263
6116	NC_008435	GCCG	2	8	262638	262645	0 %	0 %	50 %	50 %	115522263
6117	NC_008435	CCG	3	9	262643	262651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522263
6118	NC_008435	GC	3	6	262689	262694	0 %	0 %	50 %	50 %	115522263
6119	NC_008435	GATC	2	8	262755	262762	25 %	25 %	25 %	25 %	115522263
6120	NC_008435	TCC	2	6	262790	262795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522263
6121	NC_008435	TGGC	2	8	262840	262847	0 %	25 %	50 %	25 %	115522263
6122	NC_008435	GC	3	6	262849	262854	0 %	0 %	50 %	50 %	115522263
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6125	NC_008435	GC	3	6	262921	262926	0 %	0 %	50 %	50 %	115522263
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6131	NC_008435	CAGC	2	8	263170	263177	25 %	0 %	25 %	50 %	115522263
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6142	NC_008435	ATG	2	6	263654	263659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522263
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6227	NC_008435	GCG	2	6	266792	266797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522265
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6233	NC_008435	GCA	2	6	267044	267049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522265
6234	NC_008435	CGC	2	6	267079	267084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522265
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6236	NC_008435	GATGC	2	10	267114	267123	20 %	20 %	40 %	20 %	115522265
6237	NC_008435	GGCC	3	12	267137	267148	0 %	0 %	50 %	50 %	115522265
6238	NC_008435	CAG	2	6	267159	267164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522265
6239	NC_008435	GGC	2	6	267213	267218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522265
6240	NC_008435	GAA	2	6	267226	267231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522265
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6242	NC_008435	TGC	2	6	267960	267965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522266
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6362	NC_008435	TCG	2	6	272274	272279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522270
6363	NC_008435	CCA	3	9	272302	272310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522270
6364	NC_008435	CGGT	2	8	272337	272344	0 %	25 %	50 %	25 %	115522270
6365	NC_008435	GCG	2	6	272401	272406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522270
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6375	NC_008435	CTGGAT	2	12	272699	272710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115522270
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6395	NC_008435	CGA	3	9	273497	273505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522271
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6483	NC_008435	GCC	2	6	277983	277988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522274
6484	NC_008435	CGG	2	6	278008	278013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6485	NC_008435	GCC	2	6	278034	278039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522274
6486	NC_008435	CG	3	6	278044	278049	0 %	0 %	50 %	50 %	115522274
6487	NC_008435	GCC	2	6	278051	278056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522274
6488	NC_008435	CCGA	2	8	278061	278068	25 %	0 %	25 %	50 %	115522274
6489	NC_008435	CGCA	2	8	278102	278109	25 %	0 %	25 %	50 %	115522274
6490	NC_008435	CG	3	6	278114	278119	0 %	0 %	50 %	50 %	115522274
6491	NC_008435	GGATC	2	10	278134	278143	20 %	20 %	40 %	20 %	115522274
6492	NC_008435	CGA	2	6	278146	278151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522274
6493	NC_008435	GCG	2	6	278200	278205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6494	NC_008435	CGG	2	6	278239	278244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6495	NC_008435	CAG	2	6	278267	278272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522274
6496	NC_008435	GATC	2	8	278332	278339	25 %	25 %	25 %	25 %	115522274
6497	NC_008435	TGG	2	6	278344	278349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522274
6498	NC_008435	CG	3	6	278362	278367	0 %	0 %	50 %	50 %	115522274
6499	NC_008435	CGG	2	6	278369	278374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6500	NC_008435	GGCCGC	2	12	278426	278437	0 %	0 %	50 %	50 %	115522274

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