MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008435	CGC	2	6	193288	193293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522198
4502	NC_008435	TCG	2	6	193370	193375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522198
4503	NC_008435	CCA	2	6	193380	193385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522198
4504	NC_008435	CTG	3	9	193495	193503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522198
4505	NC_008435	CGG	2	6	193536	193541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522198
4506	NC_008435	CGA	2	6	193599	193604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522198
4507	NC_008435	CGC	3	9	193626	193634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522198
4508	NC_008435	GCG	2	6	193650	193655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522198
4509	NC_008435	GCC	2	6	193675	193680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522198
4510	NC_008435	CCA	2	6	193683	193688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522198
4511	NC_008435	AGC	2	6	193709	193714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522198
4512	NC_008435	TGAT	2	8	193760	193767	25 %	50 %	25 %	0 %	115522198
4513	NC_008435	CGG	2	6	193797	193802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522198
4514	NC_008435	GC	3	6	193816	193821	0 %	0 %	50 %	50 %	115522198
4515	NC_008435	GCG	2	6	193838	193843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522198
4516	NC_008435	GC	3	6	193895	193900	0 %	0 %	50 %	50 %	115522198
4517	NC_008435	GGCA	2	8	193939	193946	25 %	0 %	50 %	25 %	115522198
4518	NC_008435	GCG	2	6	193988	193993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522198
4519	NC_008435	TGACGA	2	12	193995	194006	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115522198
4520	NC_008435	TCG	2	6	194009	194014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522198
4521	NC_008435	ACA	2	6	194359	194364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522199
4522	NC_008435	ACA	2	6	194393	194398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522199
4523	NC_008435	CGA	2	6	194435	194440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522199
4524	NC_008435	T	6	6	194460	194465	0 %	100 %	0 %	0 %	115522199
4525	NC_008435	ACG	2	6	194471	194476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522199
4526	NC_008435	CGA	2	6	194487	194492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522199
4527	NC_008435	CTG	2	6	194554	194559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522199
4528	NC_008435	ACC	2	6	194563	194568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522199
4529	NC_008435	TGG	2	6	194612	194617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522199
4530	NC_008435	TCGA	2	8	194638	194645	25 %	25 %	25 %	25 %	115522199
4531	NC_008435	AGC	2	6	194678	194683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522199
4532	NC_008435	CGC	2	6	194714	194719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522199
4533	NC_008435	CCG	2	6	194733	194738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522199
4534	NC_008435	CAG	2	6	194755	194760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522199
4535	NC_008435	GCCCTC	2	12	194787	194798	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	115522199
4536	NC_008435	GCCG	2	8	194832	194839	0 %	0 %	50 %	50 %	115522199
4537	NC_008435	CGA	2	6	194847	194852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522199
4538	NC_008435	GAA	2	6	194928	194933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522199
4539	NC_008435	CGGT	2	8	195570	195577	0 %	25 %	50 %	25 %	115522200
4540	NC_008435	GCA	2	6	195628	195633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4541	NC_008435	GC	3	6	195689	195694	0 %	0 %	50 %	50 %	115522200
4542	NC_008435	GATC	2	8	195697	195704	25 %	25 %	25 %	25 %	115522200
4543	NC_008435	GTC	2	6	195725	195730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4544	NC_008435	TCG	2	6	195831	195836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4545	NC_008435	CGA	2	6	195925	195930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4546	NC_008435	AGC	2	6	195963	195968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4547	NC_008435	TCGA	2	8	195972	195979	25 %	25 %	25 %	25 %	115522200
4548	NC_008435	ACC	2	6	195982	195987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522200
4549	NC_008435	GTG	2	6	196002	196007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522200
4550	NC_008435	GAC	2	6	196061	196066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4551	NC_008435	GAT	2	6	196081	196086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522200
4552	NC_008435	CAG	2	6	196139	196144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4553	NC_008435	CCA	2	6	196213	196218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522200
4554	NC_008435	GCG	2	6	196241	196246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522200
4555	NC_008435	GCCGC	2	10	196340	196349	0 %	0 %	40 %	60 %	115522200
4556	NC_008435	GGC	2	6	196358	196363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522200
4557	NC_008435	TCG	2	6	196395	196400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4558	NC_008435	GGCGC	2	10	196414	196423	0 %	0 %	60 %	40 %	115522200
4559	NC_008435	CGC	2	6	196429	196434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522200
4560	NC_008435	CAC	2	6	196475	196480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522200
4561	NC_008435	GTC	2	6	196526	196531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4562	NC_008435	TTC	2	6	196542	196547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522200
4563	NC_008435	CAC	2	6	196550	196555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522200
4564	NC_008435	TTG	2	6	196563	196568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522200
4565	NC_008435	TGCGC	2	10	196615	196624	0 %	20 %	40 %	40 %	115522200
4566	NC_008435	CCT	2	6	196627	196632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522200
4567	NC_008435	TGA	2	6	196633	196638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522200
4568	NC_008435	TCG	2	6	196641	196646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4569	NC_008435	GAT	2	6	196684	196689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522200
4570	NC_008435	CCT	2	6	196735	196740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522200
4571	NC_008435	TGC	2	6	196803	196808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4572	NC_008435	TGC	2	6	196824	196829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4573	NC_008435	CGTT	2	8	196842	196849	0 %	50 %	25 %	25 %	115522200
4574	NC_008435	TTC	2	6	196916	196921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522200
4575	NC_008435	CAG	2	6	196926	196931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522200
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4577	NC_008435	CGAGGC	2	12	196994	197005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522200
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4579	NC_008435	CAG	2	6	197045	197050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522200
4580	NC_008435	GCG	2	6	197061	197066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522200
4581	NC_008435	CGG	2	6	197083	197088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522200
4582	NC_008435	TGG	2	6	197104	197109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522200
4583	NC_008435	GGC	2	6	197159	197164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522200
4584	NC_008435	AGG	2	6	197198	197203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522200
4585	NC_008435	CGG	2	6	197204	197209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522200
4586	NC_008435	CGA	2	6	197472	197477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522201
4587	NC_008435	CGT	2	6	197597	197602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522201
4588	NC_008435	CGC	2	6	197636	197641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522201
4589	NC_008435	CCT	2	6	197663	197668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522201
4590	NC_008435	CCG	2	6	197669	197674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522201
4591	NC_008435	GCT	2	6	197738	197743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522201
4592	NC_008435	GAG	2	6	197771	197776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522202
4593	NC_008435	GCCG	2	8	197782	197789	0 %	0 %	50 %	50 %	115522202
4594	NC_008435	TCGGC	2	10	197792	197801	0 %	20 %	40 %	40 %	115522202
4595	NC_008435	GAC	2	6	197857	197862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522202
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4598	NC_008435	GCG	3	9	197936	197944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522202
4599	NC_008435	GCG	2	6	197958	197963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522202
4600	NC_008435	A	6	6	197995	198000	100 %	0 %	0 %	0 %	115522202
4601	NC_008435	CAG	2	6	198021	198026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522202
4602	NC_008435	GCA	2	6	198053	198058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522202
4603	NC_008435	CGC	2	6	198075	198080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522202
4604	NC_008435	CAG	2	6	198090	198095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522202
4605	NC_008435	CAG	2	6	198099	198104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522202
4606	NC_008435	CGGC	2	8	198133	198140	0 %	0 %	50 %	50 %	115522202
4607	NC_008435	CAG	5	15	198153	198167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522202
4608	NC_008435	CAG	2	6	198183	198188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522202
4609	NC_008435	CAG	2	6	198222	198227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522202
4610	NC_008435	CAT	2	6	198267	198272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522202
4611	NC_008435	CAG	3	9	198306	198314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522202
4612	NC_008435	GAT	2	6	198324	198329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522202
4613	NC_008435	GCGG	2	8	198613	198620	0 %	0 %	75 %	25 %	115522203
4614	NC_008435	CTT	2	6	198659	198664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522203
4615	NC_008435	CGG	2	6	198673	198678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522203
4616	NC_008435	CGC	2	6	198693	198698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522203
4617	NC_008435	TCT	2	6	198713	198718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522203
4618	NC_008435	GCC	2	6	198885	198890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522204
4619	NC_008435	C	6	6	198889	198894	0 %	0 %	0 %	100 %	115522204
4620	NC_008435	CAG	2	6	198901	198906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522204
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4625	NC_008435	GC	3	6	199073	199078	0 %	0 %	50 %	50 %	115522204
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4741	NC_008435	CGG	2	6	203403	203408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522209
4742	NC_008435	GGC	2	6	203416	203421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522209
4743	NC_008435	TCG	2	6	203489	203494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522209
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4745	NC_008435	CGC	2	6	203522	203527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522209
4746	NC_008435	CCAG	2	8	203559	203566	25 %	0 %	25 %	50 %	115522209
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4770	NC_008435	GCCGC	2	10	204567	204576	0 %	0 %	40 %	60 %	115522210
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4781	NC_008435	CTG	2	6	204979	204984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522210
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4825	NC_008435	GCGAG	2	10	207007	207016	20 %	0 %	60 %	20 %	115522212
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4830	NC_008435	CAG	2	6	207206	207211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522212
4831	NC_008435	CGAG	2	8	207220	207227	25 %	0 %	50 %	25 %	115522212
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4837	NC_008435	GATC	2	8	207541	207548	25 %	25 %	25 %	25 %	115522212
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4841	NC_008435	CGC	3	9	207604	207612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522212
4842	NC_008435	GTG	2	6	207642	207647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522212
4843	NC_008435	GCCGG	2	10	207660	207669	0 %	0 %	60 %	40 %	115522212
4844	NC_008435	ACC	2	6	207942	207947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522213
4845	NC_008435	GCAA	2	8	207964	207971	50 %	0 %	25 %	25 %	115522213
4846	NC_008435	TGAT	2	8	208000	208007	25 %	50 %	25 %	0 %	115522213
4847	NC_008435	CTTT	2	8	208045	208052	0 %	75 %	0 %	25 %	115522213
4848	NC_008435	CGC	2	6	208085	208090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522213
4849	NC_008435	CGC	2	6	208139	208144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522213
4850	NC_008435	ATCCT	2	10	208157	208166	20 %	40 %	0 %	40 %	115522213
4851	NC_008435	TGC	2	6	208302	208307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522214
4852	NC_008435	TCT	2	6	208341	208346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522214
4853	NC_008435	CCGA	2	8	208412	208419	25 %	0 %	25 %	50 %	115522214
4854	NC_008435	TCG	2	6	208485	208490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522214
4855	NC_008435	CG	3	6	208489	208494	0 %	0 %	50 %	50 %	115522214
4856	NC_008435	AGAACG	2	12	208531	208542	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	115522214
4857	NC_008435	ATC	2	6	208568	208573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522214
4858	NC_008435	AAG	2	6	208577	208582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522214
4859	NC_008435	GA	3	6	208612	208617	50 %	0 %	50 %	0 %	115522214
4860	NC_008435	CGCGGC	2	12	208630	208641	0 %	0 %	50 %	50 %	115522214
4861	NC_008435	CATC	2	8	208656	208663	25 %	25 %	0 %	50 %	115522214
4862	NC_008435	CGAT	2	8	208771	208778	25 %	25 %	25 %	25 %	115522214
4863	NC_008435	CACC	2	8	208791	208798	25 %	0 %	0 %	75 %	115522214
4864	NC_008435	TCGA	2	8	208825	208832	25 %	25 %	25 %	25 %	115522214
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4867	NC_008435	CGA	2	6	208890	208895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522215
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4982	NC_008435	GGCTTC	2	12	213831	213842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522219
4983	NC_008435	CCT	2	6	213943	213948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522219
4984	NC_008435	GGT	2	6	213962	213967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522219
4985	NC_008435	GC	3	6	214039	214044	0 %	0 %	50 %	50 %	115522219
4986	NC_008435	GAT	2	6	214100	214105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522219
4987	NC_008435	ATC	2	6	214134	214139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522219
4988	NC_008435	CGG	2	6	214192	214197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522219
4989	NC_008435	ATC	3	9	214200	214208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522219
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4991	NC_008435	CAG	2	6	214233	214238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522219
4992	NC_008435	CGC	2	6	214259	214264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522219
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4994	NC_008435	CCA	2	6	214443	214448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522220
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4999	NC_008435	CGGG	2	8	214560	214567	0 %	0 %	75 %	25 %	115522220
5000	NC_008435	GCCG	2	8	214628	214635	0 %	0 %	50 %	50 %	115522220

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