MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB2

Total Repeats: 1285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008387	CGT	2	6	27508	27513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345660
502	NC_008387	CTA	2	6	27529	27534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345660
503	NC_008387	CAT	2	6	27782	27787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345661
504	NC_008387	ATC	2	6	27821	27826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345661
505	NC_008387	GAA	2	6	27828	27833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345661
506	NC_008387	GGCG	2	8	27875	27882	0 %	0 %	75 %	25 %	115345661
507	NC_008387	TCG	2	6	27898	27903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345661
508	NC_008387	CTG	2	6	27954	27959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345661
509	NC_008387	ACA	2	6	27985	27990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345661
510	NC_008387	ATG	2	6	28039	28044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345661
511	NC_008387	CAT	2	6	28055	28060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345661
512	NC_008387	GAA	2	6	28095	28100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345661
513	NC_008387	TGA	2	6	28139	28144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345661
514	NC_008387	ATG	2	6	28201	28206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345661
515	NC_008387	GCT	2	6	28346	28351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345661
516	NC_008387	GAC	2	6	28413	28418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345661
517	NC_008387	TGG	2	6	28450	28455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345661
518	NC_008387	TGC	3	9	28489	28497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345661
519	NC_008387	GAA	2	6	28515	28520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345661
520	NC_008387	GGC	2	6	28562	28567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345661
521	NC_008387	TGA	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345661
522	NC_008387	GGC	2	6	28631	28636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345661
523	NC_008387	CGC	2	6	28652	28657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345661
524	NC_008387	GAA	3	9	28665	28673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345661
525	NC_008387	CAT	2	6	28706	28711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345661
526	NC_008387	CAT	2	6	28739	28744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345661
527	NC_008387	TTGCCC	2	12	28804	28815	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	115345661
528	NC_008387	ATG	2	6	28818	28823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345661
529	NC_008387	GC	3	6	28846	28851	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
530	NC_008387	GAA	2	6	28863	28868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345661
531	NC_008387	CGC	2	6	28895	28900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345661
532	NC_008387	CCT	2	6	28915	28920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345661
533	NC_008387	CAA	2	6	28955	28960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345661
534	NC_008387	AGA	2	6	29156	29161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345661
535	NC_008387	GCT	2	6	29165	29170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345661
536	NC_008387	CCCTG	2	10	29171	29180	0 %	20 %	20 %	60 %	115345661
537	NC_008387	C	6	6	29188	29193	0 %	0 %	0 %	100 %	115345661
538	NC_008387	TCA	2	6	29266	29271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345661
539	NC_008387	CGG	2	6	29299	29304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345661
540	NC_008387	CA	3	6	29315	29320	50 %	0 %	0 %	50 %	115345661
541	NC_008387	GC	4	8	29341	29348	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
542	NC_008387	CCG	2	6	29458	29463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345661
543	NC_008387	GC	3	6	29464	29469	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
544	NC_008387	GCC	2	6	29544	29549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345661
545	NC_008387	GCC	2	6	29610	29615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345661
546	NC_008387	CTGG	2	8	29621	29628	0 %	25 %	50 %	25 %	115345661
547	NC_008387	GCC	2	6	29667	29672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345661
548	NC_008387	GTC	2	6	29679	29684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345661
549	NC_008387	CTG	2	6	29844	29849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345661
550	NC_008387	CCG	2	6	29900	29905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345661
551	NC_008387	CGGCG	2	10	29961	29970	0 %	0 %	60 %	40 %	115345661
552	NC_008387	CGC	2	6	30002	30007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345661
553	NC_008387	GAT	2	6	30126	30131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345661
554	NC_008387	GC	4	8	30134	30141	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
555	NC_008387	GC	3	6	30153	30158	0 %	0 %	50 %	50 %	115345661
556	NC_008387	GCTGGT	3	18	30402	30419	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115345662
557	NC_008387	CAG	2	6	30495	30500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345662
558	NC_008387	GC	3	6	30564	30569	0 %	0 %	50 %	50 %	115345662
559	NC_008387	CCGCA	2	10	30576	30585	20 %	0 %	20 %	60 %	115345662
560	NC_008387	ACC	2	6	30607	30612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345662
561	NC_008387	GCT	2	6	30667	30672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345662
562	NC_008387	GCG	2	6	30688	30693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345662
563	NC_008387	CAC	2	6	30765	30770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345662
564	NC_008387	TTG	2	6	30772	30777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345662
565	NC_008387	GCC	2	6	30814	30819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345662
566	NC_008387	CGT	2	6	30870	30875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345662
567	NC_008387	GC	3	6	31044	31049	0 %	0 %	50 %	50 %	115345663
568	NC_008387	C	6	6	31100	31105	0 %	0 %	0 %	100 %	115345663
569	NC_008387	GAT	2	6	31175	31180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345663
570	NC_008387	GAA	2	6	31271	31276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345663
571	NC_008387	CAC	2	6	31363	31368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345663
572	NC_008387	GAT	2	6	31412	31417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345663
573	NC_008387	GACC	2	8	31576	31583	25 %	0 %	25 %	50 %	115345663
574	NC_008387	GCA	2	6	31584	31589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345663
575	NC_008387	GATC	2	8	31621	31628	25 %	25 %	25 %	25 %	115345663
576	NC_008387	CAT	2	6	31633	31638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345663
577	NC_008387	ACC	2	6	31700	31705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345663
578	NC_008387	CTG	2	6	31724	31729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345663
579	NC_008387	C	6	6	31737	31742	0 %	0 %	0 %	100 %	115345663
580	NC_008387	TGA	2	6	31792	31797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345663
581	NC_008387	CG	3	6	31910	31915	0 %	0 %	50 %	50 %	115345663
582	NC_008387	CGC	2	6	31949	31954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345663
583	NC_008387	GGC	2	6	31976	31981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345663
584	NC_008387	CAG	2	6	31996	32001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345663
585	NC_008387	TGG	2	6	32013	32018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345663
586	NC_008387	ACC	2	6	32114	32119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345663
587	NC_008387	CAA	2	6	32146	32151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345663
588	NC_008387	GAT	2	6	32213	32218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345663
589	NC_008387	GC	3	6	32219	32224	0 %	0 %	50 %	50 %	115345663
590	NC_008387	GT	3	6	32286	32291	0 %	50 %	50 %	0 %	115345663
591	NC_008387	GAC	2	6	32321	32326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345663
592	NC_008387	GTCA	2	8	32419	32426	25 %	25 %	25 %	25 %	115345664
593	NC_008387	CAG	2	6	32454	32459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345664
594	NC_008387	CTG	2	6	32518	32523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345664
595	NC_008387	CGG	2	6	32602	32607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345664
596	NC_008387	G	7	7	32693	32699	0 %	0 %	100 %	0 %	115345664
597	NC_008387	TCA	2	6	32712	32717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345664
598	NC_008387	GCG	2	6	32744	32749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345664
599	NC_008387	CGG	2	6	32806	32811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345664
600	NC_008387	GCT	2	6	32827	32832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345664
601	NC_008387	ATGT	2	8	32906	32913	25 %	50 %	25 %	0 %	115345664
602	NC_008387	GCT	2	6	32938	32943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345664
603	NC_008387	CTG	2	6	32966	32971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345664
604	NC_008387	TGG	2	6	32993	32998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345664
605	NC_008387	CCT	2	6	33064	33069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345664
606	NC_008387	TG	3	6	33194	33199	0 %	50 %	50 %	0 %	115345665
607	NC_008387	CGGG	2	8	33282	33289	0 %	0 %	75 %	25 %	115345665
608	NC_008387	CGGTC	2	10	33309	33318	0 %	20 %	40 %	40 %	115345665
609	NC_008387	CG	4	8	33327	33334	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
610	NC_008387	TGA	2	6	33342	33347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345665
611	NC_008387	AGGCA	2	10	33388	33397	40 %	0 %	40 %	20 %	115345665
612	NC_008387	CGC	2	6	33442	33447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345665
613	NC_008387	GC	4	8	33532	33539	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
614	NC_008387	CTG	2	6	33615	33620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345665
615	NC_008387	CCCTG	2	10	33686	33695	0 %	20 %	20 %	60 %	115345665
616	NC_008387	CAG	2	6	33757	33762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345665
617	NC_008387	AGGT	2	8	33788	33795	25 %	25 %	50 %	0 %	115345665
618	NC_008387	ATA	2	6	33805	33810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115345665
619	NC_008387	CG	3	6	33838	33843	0 %	0 %	50 %	50 %	115345665
620	NC_008387	GTT	2	6	33847	33852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345665
621	NC_008387	CCA	2	6	33907	33912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345665
622	NC_008387	GCC	2	6	33918	33923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345665
623	NC_008387	AGC	2	6	33962	33967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345665
624	NC_008387	ATT	2	6	33979	33984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345665
625	NC_008387	TTG	2	6	34004	34009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345665
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627	NC_008387	TCGC	2	8	34049	34056	0 %	25 %	25 %	50 %	115345665
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